Оценка частоты внутрикаллусной изменчивости андрогенных удвоенных гаплоидов риса (Oryza sativa L.) по генам устойчивости к пирикуляриозу

Автор: Илюшко М.В., Ромашова М.В., Гученко С.С.

Журнал: Сельскохозяйственная биология @agrobiology

Рубрика: Культуры in vitro

Статья в выпуске: 3 т.58, 2023 года.

Бесплатный доступ

Культивирование in vitro клеток и тканей сельскохозяйственных культур по назначению условно можно разделить на две группы: для получения генетически измененного исходного селекционного материала и для массового клонирования уже существующих форм и сортов. Андрогенез in vitro позволяет направить развитие микроспоры с гаметофитного пути на спорофитный с формированием удвоенных гаплоидов (doubled haploids, DHs) у диплоидных видов либо фиксацией дигаплоидов (полигаплоидов) у тетраплоидных видов, которые широко применяются в селекции растений. Вариабельность растений, полученных в культуре пыльников или микроспор с одного растения-донора, в большей степени изучена на геномном и хромосомном уровне, поскольку исследователей и селекционеров в первую очередь интересует спонтанное удвоение хромосом и, как следствие, полностью гомозиготное фертильное потомство. В настоящей работе впервые выявлена частота внутрикаллусной генетической изменчивости удвоенных гаплоидов риса Oryza sativa L . , полученных в андрогенезе in vitro гибридных растений, с использованием генов устойчивости к пирикуляриозу семейства Pi (по двум и трем генам). Показано отсутствие значительного возрастания внутрикаллусной генетической изменчивости при увеличении числа детектированных генов. Мы изучили частоту возникновения внутрикаллусной изменчивости в андрогенезе in vitro у риса с целью определения степени генетической однородности удвоенных гаплоидов (DHs) от одного пыльника. Исследования проведены на удвоенных гаплоидах, полученных в андрогенезе in vitro у 13 гибридов F1 и одного гибрида F2 риса O. sativa . Выполнен молекулярно-генетический анализ 1271 растения (83 каллусных линии) на наличие аллелей устойчивости/восприимчивости следующих генов устойчивости риса к Pyricularia oryzae Cav. [ Magnaporthe grisea (Hebert Barr.)]: Pi-z , Pi-b , Pi-1 , Pi-2 , Pi-ta . У удвоенных гаплоидов идентифицировали один-четыре гена в зависимости от наличия гетерозигот в исходных гибридах. При определении одного гена у DHs частота появления вариабельных каллусных линий составляет 24,0 %, по двум генам полиморфизм встречается среди 47,7 % каллусов, по трем генам полиморфны 62,5 % каллусных линий. У одной каллусной линии представлено не более четырех комбинации аллелей генов устойчивости к пирикуляриозу риса. Различия по частоте мономорфных каллусных линий, детектированных по одному, двум и трем генам, отсутствуют (χ2 = 0,21-0,95, р = 0,33-0,65). У одной каллусной линии с одинаковой комбинацией аллелей устойчивости двух генов сформировалось до 66 растений, с одинаковой комбинацией аллелей трех генов - до 18 растений. Зависимость полиморфизма от числа удвоенных гаплоидов на каллусной линии отсутствовала: коэффициент корреляции между числом аллелей одного гена и числом DHs - r = -0,14, между числом комбинаций аллелей по двум генам и DHs r = 0,25, между числом комбинаций аллелей по трем генам и DHs r = -0,35 (р function show_abstract() { $('#abstract1').hide(); $('#abstract2').show(); $('#abstract_expand').hide(); }

Еще

Oryza sativa, удвоенные гаплоиды, частота внутрикаллусной генетической изменчивости, гены устойчивости к пирикуляриозу

Короткий адрес: https://sciup.org/142238896

IDR: 142238896   |   DOI: 10.15389/agrobiology.2023.3.554rus

Список литературы Оценка частоты внутрикаллусной изменчивости андрогенных удвоенных гаплоидов риса (Oryza sativa L.) по генам устойчивости к пирикуляриозу

  • Germana M.A. Gametic embryogenesis and haploid technology as valuable support to plant breeding. Plant Cell. Rep., 2011, 30: 839-857 (doi: 10.1007/s00299-011-1061-7).
  • Jauhar P.P., Xu S.S., Baenziger P.S. Haploidy in cultivated wheats: induction and utility in basic and applied research. Crop Sci., 2009, 49: 737-755 (doi: 10.2135/cropsci2008.08.0462).
  • Niazian M., Shariatpanahi M.E. In vitro-based doubled haploid production: recent improve-ments. Euphytica, 2020, 216: 69 (doi: 10.1007/s10681-020-02609-7).
  • Evans D.A., Sharp W.R., Medina-Filho H.P. Somaclonal and gametoclonal variation. Amer. J. Bot., 1984, 71(2): 759-774 (doi: 10.2307/2443467).
  • Gosal S.S., Pathak D., Wani S.H., Vij S., Pathak M. Accelerated Breeding of plants: methods and applications. In: Accelerated plant breeding. Vol. 1 /S.S. Gosal, S.H. Wani (eds.). Springer Nature Swizerland AG, 2020: 1-29 (doi: 10.1007/978-3-030-41866-3_1).
  • D’Amato F. Cytogenetics of plant cell and tissue cultures and their regenerates. Critical Reviews in Plant Sciences, 1985, 3(1): 73-112 (doi: 10.1080/07352688509382204).
  • Segui-Simarro J.M., Nuez F. Pathways to doubled haploidy: chromosome doubling during an-drogenesis. Cytogenet. Genome Res., 2008, 120: 358-369 (doi: 10.1159/000121085).
  • Daghma D.E.S., Hensel G., Rutten T., Melzer M., Kumlehn J. Cellular dynamics during early barley pollen embryogenesis revealed by time-lapse imaging. Frontiers in Plant Science, 2014, 5: 675 (doi: 10.3389/flps.2014.00675).
  • Воронкова Е.В., Ермишин А.П. Гаплоидия в селекции картофеля: генетические основы селекции картофеля. Биотехнология и селекция растений (Минск), 2012, 3: 170-203.
  • Сельдимирова О.А., Круглова Н.Н. Андроклинный эмбриоидогенез in vitro злаков. Успехи современной биологии, 2014, 134(5): 476-487.
  • Zagorska N.A., Shtereva L.A., Kruleva M.M., Sotirova V.G., Baralieva D.L., Dimitrov B.D. Induced androgenesis in tomato (Lycopersicon esculentum Mill.). III. Characterization of the re-generants. Plant Cell Rep., 2004, 22: 449-456 (doi: 10.1007/s00299-003-0720-8).
  • Cistue L., Soriano M., Castillo A.M., Valles M.P., Sanz J.M., Echavarri B. Production of doubled haploids in durum wheat (Triticum turgidum L.) through isolated microspore culture. Plant Cell Rep., 2006, 25: 257-264 (doi: 10.1007/s00299-005-0047-8).
  • Grammatikaki G., Avgelis A., Sonnino A. Behavior of potato gametoclonal plants against the necrotic strain of potato Y potyvirus. Russ. J. Plant Physiol., 2007, 54(4): 507-512 (doi: 10.1134/S1021443707040115).
  • Goncharova J.K. Selective elimination of alleles in rice anther culture. Russ. J. Genet., 2013, 49(2): 170-177 (doi: 10.1134/S102279541210002X).
  • Mishra R., Rao G.J.N., Rao R., N., Kaushal P. Development and characterization of elite dou-bled haploid lines from two indica rice hybrids. Rice Sci., 2015, 22(6): 290-299 (doi: 10.1016/j.rsci.2015.07.002).
  • Windarsih G., Utami D.W., Widyastuti U. Molecular markers application for blast resistance selection on the double haploid rice population. Makara Journal of Science, 2014, 18(2): 31-41 (doi: 10.7454/mss.v18i2.3134).
  • Yi G., Lee H.-S., Kim K.-M. Improved marker-assisted selection efficiency of multi-resistance in doubled haploid rice plants. Euphytica, 2015, 203: 421-428 (doi: 10.1007/s10681-014-1303-1).
  • Tripathy S.K., Swain D., Mohapatra P.M., Prusti A.M., Sahoo B., Panda S., Dash M., Chakma B., Behera S. Exploring factors affecting anther culture in rice (Oryza sativa L.). Journal of Applied Biology and Biotechnology, 2019, 7(02): 87-92 (doi: 10.7324/JABB.2019.70216).
  • Maharani A., Fanata W.I.D., Laeli F.N., Kim K.-M., Handoyo T. Callus induction and regen-eration from anther cultures of indinesian indica black rice cultivar. J. Crop Sci. Biotechol., 2020, 23(1): 21-28 (doi: 10.1007/s12892-019-0322-0).
  • Круглова Н.Н. К проблеме унификации терминологии при разработке инновационной биотехнологии андроклинной гаплоидии. Экобиотех, 2019, 2(2): 100-115 (doi: 10.31163/2618-964Х-2019-2-2-100-115).
  • Yamamoto T., Soeda Y., Nishikawa A., Hirohara H. A study of somaclonal variation for rice improvement induced by three kinds of anther-derived cell culture techniques. Plant Tissue Cul-ture Letters, 1994, 11(2): 116-121.
  • Chen C.C., Chen C.-M. Changes in chromosome number in microspore callus of rice during successive subcultures. Canadian Journal of Genetics and Cytology, 1980, 22(4): 607-614 (doi: 10.1139/g80-066).
  • Yoshida S., Watanabe K., Fujino M. Non-random gametoclonal variation in rice regenerants from callus subcultured for a prolonged period under high osmotic stress. Euphytica, 1998, 104: 87-94 (doi: 10.1023/А:1018699724552).
  • Yamagishi M., Yano M., Fukuda Y., Fukui K., Otani M., Shimada T. Distorted segregation of RFLP markers in regenerated plants derived from anther culture of an F1 hybrid of rice. Genes & Genet. Syst., 1996, 71: 37-41 (doi: 10.1266/ggs.71.37).
  • Castillo A.M., Valles M.P., Cistue L. Comparison of anther and isolated microspore culture in barley. Effects of culture density and regeneration medium. Euphytica, 2000, 113: 1-8 (doi: 10.1023/A:1003937530907).
  • Илюшко М.В. Регенерационный максимум в андрогенных каллусных линиях риса Oryza sativa L. in vitro. Рисоводство, 2019, 2(43): 29-32.
  • Ilyushko M.V., Romashova M.V. Rice tetraploid formation in androgenesis in vitro. Russian Ag-ricultural Sciences, 2020, 4: 14-17 (doi: 10.31857/S2500262720030047).
  • Ilyushko M.V., Romashova M.V. Variability of rice haploids obtained from in vitro anther culture. Russian Agricultural Sciences, 2019, 45(3): 243-246 (doi: 10.3103/S1068367419030108).
  • Ilyushko M.V., Romashova M.V., Zhang J.-M., Deng L.-W., Liu D.-J., Zhang R., Guchenko S.S. Intra-callus variability of rice doubled haploids generated through in vitro andro-genesis. Sel’skokhozyaistvennaya biologiya [Agricultural Biology], 2020, 55(3): 533-543 (doi: 10.15389/agrobiology.2020.3.533eng).
  • Farrell T.C., Fox K.M., Williams R.L., Fukai S. Genotypic variation for cold tolerance during reproductive development in rice: screening with cold air and cold water. Field Crops Research, 2006, 98: 178-194 (doi: 10.1016/j.fcr.2006.01.003).
  • Chu C. The N6 medium and its application to anther culture of cereal crops. Proc. Simposium on Plant Tissue Culture. Peking, 1978: 43-50.
  • Илюшко М.В. Сравнительный анализ питательных сред для регенерации растений риса из каллуса в культуре пыльников in vitro. Известия ТСХА, 2007, 2: 126-133.
  • Гончарова Ю.К. Использование метода культуры пыльников в селекции риса. Краснодар, 2012.
  • Aljanabi S.M., Martinez I. Universal and rapid salt-extraction of high quality genomic DNA for PCR-based techniques. Nucleic Acid Research, 1997, 25(22): 4692-4693 (doi: 10.1093/nar/25.22.4692).
  • Dubina E.V., Kostylev P.I., Garkusha S.V., Ruban M.G. Development of blast-resistant rice varie-ties based on application of DNA technologies. Euphytica, 2020, 216: 162 (doi: 10.1007/s10681-020-02698-4).
  • Wang J.C., Correll J.C., Jia Y. Characterization of rice blast resistance genes in rice germplasm with monogenic lines and pathogenicity assays. Crop Protection, 2015, 72: 132-138 (doi: 10.1016/j.cropro.2015.03.014).
  • Ferrie A.M.R., Caswell K.L. Isolated microspore culture techniques and recent progress for hap-loid and doubled haploid plant production. Plant Cell Tiss. Organ. Cult., 2011, 104: 301-309 (doi: 10.1007/s11240-010-9800-y).
  • Sarao N.K., Gosal S.S. In vitro androgenesis for accelerated breeding in rice. In: Biotechnologies of crop improvement. Vol. 1 /S.S. Gosal, S.H. Wani (eds.). Springer, Cham, 2018: 407-435 (doi: 10.1007/978-3-319-78283-6_12).
  • Win A., Tanaka T.S.T., Matsui T. Panicle inclination influences pollination stability of rice (Oryza sativa L.). Plant production Science, 2020, 23(1): 60-68 ((doi: 10.1080/1343943Х.2019.1698971).
  • Тырнов В.С., Давоян Н.И. Цитогенетика соматических тканей гаплоидов. В кн.: Гаплоидия и селекция. М., 1976: 57-65.
  • Kasha K.J., Hu T.C., Oro R., Simion E., Shim Y.S. Nuclear fusion leads to chromosome doubling during mannitol pretreatment of barley (Hordeum vulgare L.) microspores. Journal of Experimental Botany, 2001, 52(359): 1227-1238 (doi: 10.1093/jxb/52.359.1227).
  • Ilyushko M.V., Skaptsov M.V., Romashova M.V. Nuclear DNA content in rice (Oryza sativa L.) regenerants derived from anther culture in vitro. Sel’skokhozyaistvennaya biologiya [Agricultural Biology], 2018, 53(3): 531-538 (doi: 10.15389/agrobiology.2018.3.531eng).
  • Савенко Е.Г., Власов В.Г. Цитологическое и гистологическое изучение пыльников риса. Рисоводство, 2009, 14: 20-21.
  • Kuznetsova O.I., Ash O.A., Gostimskij S.A. The effect of duration of callus culture on the accumulation of genetic alteration in pea Pisum sativum L. Russ. J. Genet., 2006, 42(5): 555-562 (doi: 10.1134/s1022795406050139).
Еще
Статья научная