Определение степени смешивания микроорганизмов с различным временем пребывания в поточных биореакторах

Автор: Пищиков Геннадий Борисович, Шихалев Сергей Валерьевич, Лазарев Владимир Александрович

Журнал: Вестник Южно-Уральского государственного университета. Серия: Пищевые и биотехнологии @vestnik-susu-food

Рубрика: Прикладная биохимия и биотехнологии

Статья в выпуске: 4 т.5, 2017 года.

Бесплатный доступ

Рассмотрена возможность оценки характера гидродинамики двухфазного потока в биореакторах непрерывного действия с точки зрения наличия микротурбулентностей или конвективного ламинарного перемешивания, приводящих к нарушению последовательного продвижения микроорганизмов в системе (аппарате, установке). Предложено осуществлять указанную оценку путём расчёта долей микроорганизмов, отличающихся между собой по времени пребывания в любом заданном объёме аппарата. Известно, что при сосуществовании в единичном объёме производственного субстрата микроорганизмов со значительной разницей в возрасте, коррелирующей с временем пребывания их в реакторе, биохимический процесс направленного массообмена идёт неэффективно. В связи с тем, что метаболические процессы у микроорганизмов протекают с большой скоростью, изменение их возрастных функциональных признаков можно соотносить с временем пребывания клеток в системе. Для принятия принципиальных решений при конструировании новых аппаратов или модернизации имеющихся, с задачей реализации моделей потока, приближающегося к поршневому, необходимо иметь метод расчета доли сосуществующих микроорганизмов с различным временем пребывания в интересующем объёме потока биореагентов. Получаемые расчетные данные важны для функционально-структурного моделирования двухфазного потока реагентов, определяющими из которых в биотехнологических процессах являются живые клетки микроорганизмов. Однако искомого решения для оценки состояния системы до настоящего времени не имеется. В данной работе предложен теоретико-вероятностный подход к построению математической модели, позволяющей рассчитать долю сосуществующих микроорганизмов с различным временем пребывания в произвольно заданном объёме аппарата путём принятия начальных и граничных условий. Методика базируется на определении плотности функции распределения по времени пребывания клеток микроорганизмов в аппаратах. Таким образом, полученные результаты позволяют оценить состояние гидродинамики потока системы «производственный субстрат - микроорганизмы» и на этом основании прогнозировать эффективность биохимических процессов, реализуемых в поточных аппаратах.

Еще

Биохимический процесс, микроорганизмы, аппараты, гидродинамика потока, время пребывания, возраст, функциональная зависимость, эффективность

Короткий адрес: https://sciup.org/147160862

IDR: 147160862   |   DOI: 10.14529/food170404

Текст научной статьи Определение степени смешивания микроорганизмов с различным временем пребывания в поточных биореакторах

В решении задач интенсификации биофизикохимических процессов в аппаратах непрерывного действия важное место занимает рациональная организация потока суспензии субстрат – микроорганизмы (МКО) с упорядоченным последовательным перемещением клеток МКО, близким к соблюдению возрастных градаций [1–3]. С точки зрения теории процессов и аппаратов – это модель потока полного вытеснения. Данное требование связано с функциональной особенностью микроорганизмов физиологически изменяющихся в зависимости от своего возраста в процессе перемещения по аппарату [4–6].

В ряде биотехнологических производств процесс получения целевого продукта основывается на взаимодействии изменяющихся во времени по функциональным возможностям и физическим свойствам МКО с изменяющимся по составу производственным субстратом, причём эти изменения взаимозависимы [4, 5]. При этом чем больше доля сосуществующих в данном объёме МКО, значительно отличающихся между собой по возрасту, тем менее эффективно протекает биохимический процесс, так как часть клеток, в силу своего физиологического состояния, не может выполнять функцию, заданную технологией на данной стадии. По этой причине не только уменьшается суммарная скорость биохимических реакций, но и снижается качество целевого продукта [5].

Для различных конкретных биохимических производств возрастная граница сосуществующих МКО устанавливается в результате специальных микробиологических исследований по соотношению возраст – функциональное состояние клеток [6]. Эти данные включаются в качестве начальных условий в расчетные уравнения. Так, например, при производстве высококачественных игристых вин резервуарным методом в непрерывном потоке необходимо максимально возможно соблюдать допустимую границу функционально – возрастной совместимости дрожжевых клеток т д = т2 - тъ где ту и т2 - минимальный и максимальный возраст клеток в рассматриваемом объеме аппарата, т д - допустимая разница в возрасте клеток [5, 7]. Связано это с тем, что на начальной стадии рассматриваемого биохимического процесса, соответственно во входной и центральной зоне аппарата, должно осуществляться брожение, которое могут проводить лишь молодые активные клетки. Одновременно в хвостовой части аппарата (установки) угнетенные возрастные МКО должны через автолиз обогащать субстрат биологически активными веществами, формируя при этом заданные качественные и типичные свойства продукта. В случае же попадания угнетённых клеток в нижние зоны, при движении потока снизу-вверх, последние останутся балластом, так как они уже не обладают бродильной активностью, а процесс автолиза заблокирован консервирующим воздействием сахарозы. Молодые же клетки не могут совершать положительной работы в выходной части аппарата ввиду отсутствия сахарозы в субстрате, они в данном случае будут использовать резервные питательные вещества, обедняя целевой продукт [5, 8].

В связи с тем, что жизненные процессы у микроорганизмов, в частности у дрожжей, особенно в их активной фазе, протекают исключительно быстро (часы) [2, 5, 6], то связь возраста и функционального состояния клеток вполне коррелируют со временем пребывания в аппарате (установке) и могут оцениваться этим параметром. Знание количественного соотношения микроорганизмов различного возраста в данном единичном объеме потока важно для корректировки технологических режимов и решения целевых задач по созданию и оптимизации современной аппаратуры для биотехнологических процессов [7–10].

Несмотря на практическую важность вышеупомянутой задачи [2, 11], в решении которой заинтересованы инженеры, биохимики, биофизики, микробиологи и другие специалисты, она до сих пор не решена [12, 13]. Это объясняется тем, что биохимические процессы, реализуемые в аппаратах с моделью потока диффузионного типа, как правило, описываются нелинейными уравнениями в частных производных, регулярный метод аналитического решения которых отсутствует.

В связи с отсутствием искомого решения в инженерной практике вынужденно пользуются идеализированными моделями, такими, как «идеальное смешение», «идеальное вытеснение». Ниже будет показано, как использовать предлагаемый метод для решения некоторых практически важных нелинейных задач математической физики, встречающихся в биотехнологии.

Исследование

Для решения поставленной задачи будем исходить из уравнения Фоккера–Планка– Колмогорова для функции E ( x , t ) . Согласно [13–17] оно представимо в следующем виде:

—E ( x , t ) + < у— E ( x , t ) = -y E ( x , t )■ D , (1) д t             д x           д x 2

где t – время изучаемого процесса; х – декартова координата, направленная вдоль оси аппарата; D – эффективный коэффициент диффузии (коэффициент продольного перемешивания микроорганизмов в аппарате); ω – средняя по сечению аппарата продольная скорость движения микроорганизмов;

E (x, t)=—q (x, t); q (x, t) - вероятность вы-д t хода микроорганизма из объема аппарата, равного S ■ x, за время t > 0; S - площадь поперечного сечения        аппарата;

1 - q ( x , t ) = p ( x , t ) - вероятность невыхода микроорганизма из указанного объема.

Следовательно, E ( x , t ) - плотность функции распределения микроорганизмов по временам пребывания в объеме S x . По оп-

W ределению т(x) = j tE(x, t) dt - среднее время 0

пребывания микроорганизмов в объеме аппарата, равном S x .

Уравнение (1) представляет собой линейное дифференциальное уравнение в частных производных, которое имеет бесчисленное множество решений. Для выделения единственного решения необходимо к уравнению присоединить начальные и граничные условия. В частности, для полуограниченного канала начальные и граничные условия первого и третьего рода [13], гарантирующие однозначное решение уравнения (1), соответственно, имеют вид:

  • 1.    E ( x ,0 ) = 0, x 0; E ( 0, t ) = J ( t ) ,   (2)

  • 2.    E ( x ,0 ) = 0, x >  0 ;

Поэтому, при < 7 01 0,2, с погрешностью

менее одного процента правую часть выражения (5) можно упростить до вида

E 2 ( x , t ) =

to x

^nDt x + to t

exp

( x — to t )

4 Dt

. (6)

E ( x , t ) - —E ( x , t ) to о x

x = 0

где 3 ( t ) - дельта-функция Дирака [18, 19].

На основании вышеизложенного извест-

ными математическими методами можно получить явные выражения для E ( x , t ) -функций, ( г = 1,2):

E 1 ( x , t ) = 2 n t x CXP

( x — to t )

2 Dt

если функция E ( x , t ) удовлетворяет началь-

ным и граничным условиям (2), и

E 2 ( x , t ) =

to exp

'JnDt

( x — to t )

4 Dt

to2

2 D

1 ф

x + tot

2 Dt

to x

D

Прежде чем переходить к определению степени смешения микроорганизмов PS в том или ином объеме рассматриваемого аппарата, предварительно – для наглядности, выберем три «точки наблюдения»: x = x 1 , x = x 2 и x = x 3, где x 1 x 2 x 3 L , L - рабочая длина (высота) аппарата. Соответствующие им Е -функции изображены на рисунке, где, например, t = tP - точка пересечения кривых E ( x 1 , t ) и E ( x 2, t ) , определяемая из решения уравнения

E ( x 1 , t ) = E ( x 2 , t ) .               (7)

Аналогичным образом, из решения уравнения E (x2, t) — E (x3, t) = 0 определяется значение величины t2,3 . Очевидно, что площади заштрихованных участков на рисунке численно равны PS , т. е. долям сосуществующих микроорганизмов, поступившим в аппарат с потоком жидкости за время т1, т2 и т2, т3 соответственно, где Ti = xi/to, i = 1,2,3. Поэтому tp                м

P S = J E ( x 2, t ) dt + J E ( x 1 , t ) dt = 0                   tP

если функция E ( x , t ) удовлетворяет началь-

= 1 + q ( x 2 , t p ) q ( x 1 , t p )            , (8)

ным и граничным условиям (3).

Здесь ф ( Z ) = ,— V 2 п

Z

г x

J exp —у

dx

инте-

грал вероятности. В формуле (5) последний член неудобен для инженерных расчетов при

малых значениях величины    <7 01, где

2  2D с01 =---, так как в этом случае аргумент у tox1

интеграла вероятности становится слишком большим. Но при больших значениях Z

exp

Г 1 1

V Z Z 3 +

где было учтено, что q ( x , ~ ) = 1, q ( x ,0 ) = 0.

Итак, для определения степени смешения микроорганизмов, при заданных x 1 и x 2 , необходимо знать явное выражение для функции q ( x , t ) и значение величины tP .

По определению t q (x, t ) = J E (x, t) dt.

Следовательно, q 1 ( x , t ) =

1 J 2

V 2 Dt )

1 ф -j=

V 4i—t

xto exp — "9

exp

q 2 ( x , t ) =

Определение степени смешивания микроорганизмов: 1, 2, 3 – графики Е (x, t)-функции в точках наблюдения х = х 1, х = х 2 , х = х 3 , соответственно

mt

JDDt

4 Dt

.    ( x + m t

1 - ф\ -==

I V2 Dt

, ( x + m t

1 - ф\ -^= ( JlDt

-

mx expD. (10)

Значения величин tP 1 и tP 2 при x 2 x 1 найдем из решения нижеследующих уравнений: E i ( x 2 , t ) - E i ( x 1 , t ) = 0, i = 1,2.

x + x2 , 2 x 1 x?

t p 1 = \ 2 1 + ^ 01 ---—ln—    , (11)

2 m L       x 2 - x 1    x 1 _

t p 2 =

x 1 + x 2

2m

x 1

ln

- x 1

2 3 x 2 + x 1

4 3 x 1 + x 2

x 2 x 1

где индексы «один» и «два» соответствуют начальным и граничным условиям первого и третьего рода.

Выражения (11) и (12), при <7 01 0,2, с погрешностью менее двух процентов упрощаются до вида:

_ x 1 + x 2

При D = 0 смешение микроорганизмов, поступивших в аппарат в различное время, отсутствует.

Покажем, что и к этому частному случаю формула (8) применима. Действительно, так как при D = 0

E (x, t ) = m3 (x - mt), x -mt где 6(Z) - ступенчатая функция, равная единице при Z > 0 и равная нулю при Z < 0, то согласно формуле (8)

x , + x 2 где x i <  x 2, tP —          .

12 P 2 m

Вывод

Таким образом, полученные результаты позволяют рассчитать количество сосуществующих микроорганизмов с различным временем пребывания в любом заданном объёме рассматриваемого аппарата и на основании этого достоверно оценивать гидродинамический характер потока реагентов в биореакторах непрерывного действия. По режиму потока осуществляется прогноз эффективности биохимических процессов, реализуемых в данном реакторе.

Список литературы Определение степени смешивания микроорганизмов с различным временем пребывания в поточных биореакторах

  • Carrascosa, A.V. Molecular Wine Microbiology/A.V. Carrascosa, R. Munoz, R. Gonzalez. -Academic Press, 2012. -360 p.
  • Варфоломеев, С.Д. Физическая химия биопроцессов/С.Д. Варфоломеев, А.В. Луковенков, Н.А. Семенова. -М.: КРАСАНД; 2014. -800 с.
  • Kelly, W.J. Using computational fluid dynamics to characterize and improve bioreactor performance/W.J. Kelly//Biotechnol. Appl. Biochem. -2008. -V. 49. -P. 225-238.
  • Singh, H. Bioreactor studies and computational fluid dynamics/H. Singh, D.W. Hutmacher//Adv. Biochem. Eng. Biotechnol. -2009. -V. 112. -P. 231-249.
  • Саришвили, Н.Г. Микробиологические основы технологии шампанизации вина/Н.Г. Саришвили, Б.Б. Рейтблат. -М.: Пищепромиздат, 2000. -364 с.
  • Алмагамбетов, К.Х. Биотехнология микроорганизмов/К.Х. Алмагамбетов. -Астана, 2008. -244 с.
  • Пищиков, Г.Б. Интенсификация шампанизации вина с помощью бифункциональных развитых поверхностей в бродильно-биогенерационных аппаратах/Г.Б. Пищиков//Виноград и вино России. -2009. -№ 5. -C. 14-15.
  • Vogel H.C., Todaro C.M. (eds.) Fermentation and Biochemical Engineering Handbook. 3rd Edition. -Elsevier, 2014. -455 p.
  • Sharma, C. Review of Computational Fluid Dynamics Applications in Biotechnology Processes/C. Sharma, D. Malhotra, A.S. Rathore//Biotechnol. Prog. -2011. -V. 27, № 6. -P. 1497-1510.
  • Hutmacher, D.W. Computational fluid dynamics for improved bioreactor design and 3D culture/D.W. Hutmacher, H. Singh//Trends in Biotechn. -2008. -V. 26, № 4. -P. 166-172.
  • Kaiser, S.C. CFD for Characterizing Standard and Single-use Stirred Cell Culture Bioreactors/S.C. Kaiser, C. Loffelholz, S. Werner, D. Eibl. -Intech, 2011. -P. 97-122.
  • Johnson, С. Verification of energy dissipation rate scalability in pilot and production scale bioreactors using computational fluid dynamics/C. Johnson, M. Natarajan, C. Antoniou//Biotechnol. Progr. -2014. -V. 30, № 6. -P. 760-764.
  • Тихонов, В.И. Марковские процессы/В.И. Тихонов, М.А. Миронов. -М.: Советское радио, 1977. -485 с.
  • Свешников, А.А. Прикладные методы теории случайных функций: учебное пособие/А.А. Свешников. -3-е изд. стер. -М.: Лань, 2011. -464 с.
  • Пугачев, В.С. Теория случайных функций/В.С. Пугачев. -М.: Физматгиз, 1960. -С. 79-83.
  • Феллер, В. Введение в теорию вероятностей и её приложения/В. Феллер. -М.: Мир, 1984. -Т. I. -528 с.
  • Феллер, В. Введение в теорию вероятностей и её приложения/В. Феллер. -М.: Мир, 1984. -Т. II. -752 с.
  • Маделунг, Э. Математический аппарат физики: справочное руководство/Э. Маделунг. -М.: Книга по Требованию, 2012. -618 с.
  • Беккенбах, Э.Ф. Современная математика для инженеров/Э.Ф. Беккенбах, И.Н. Векуа. -М.: ИЛ, 1958. -618 с.
Еще
Статья научная