Оптимизация определения параметров генетической чистоты линий подсолнечника на основе микросателлитных локусов ДНК
Автор: Гучетль С.З., Фролов С.С., Кузнецова Е.С.
Рубрика: Селекция и семеноводство сельскохозяйственных растений
Статья в выпуске: 3 (175), 2018 года.
Бесплатный доступ
Широкое внедрение гибридов в производство в основном сдерживается из-за сложного семеноводства, предусматривающего поддержание родительских линий на высоком уровне генетический чистоты. Поэтому целью работы была оптимизация определения параметров генетической чистоты линий подсолнечника на основе микросателлитных локусов ДНК. Материалом для исследования служили 12 линий коллекции подсолнечника Армавирской опытной станции ВНИИМК. Геномную ДНК выделяли из 100 отдельных 5- 7-дневных этиолированных проростков подсолнечника каждого образца с использованием СТАВ-буфера. Показано, что 11 пар праймеров для ПЦР выявляют стабильный, воспроизводящийся полиморфизм фракций амплифицированной ДНК. В результате проведенных исследований для определения параметров генетической чистоты линий подсолнечника с помощью микросателлитных локусов ДНК с использованием критериев уровня полиморфизма были отобраны семь пар праймеров. Для оптимизации метода две пары праймеров (ORS 5 и Har 432) были объединены в мультиплексный набор. Остальные пять локусов (ORS 559, Har 432, ORS 5, ORS 815, ORS 1144) амплифицировались отдельно. Сократить количество анализов также позволяет создание смесей, состоящих из объединенных аликвот ДНК отдельных проростков в одной пробирке. В случае если после ПЦР на фореграмме обнаруживаются дорожки с несколькими фракциями, образцы ДНК, из которых собрана эта нетипичная смесь, амплифицируются отдельно, чтобы выяснить количество нетипичных семян.
Подсолнечник, линии, генетическая чистота, днк, микросателлитные локусы
Короткий адрес: https://sciup.org/142216735
IDR: 142216735 | DOI: 10.25230/2412-608X-2018-3-175-34-39
Список литературы Оптимизация определения параметров генетической чистоты линий подсолнечника на основе микросателлитных локусов ДНК
- Зайцев Н.И., Деревенец В.Н., Фролов С.С. Эффективные приемы гибридного семеноводства подсолнечникa//Земледелие. -2009. -№ 8. -С. 9-10.
- Гучетль С.З., Челюстникова Т.А., Антонова Т.С. Некоторые особенности определения генетической чистоты линий и гибридов подсолнечника методом изоферментного анализа//Масличные культуры. Науч.-тех. бюл. ВНИИМК. -2015. -№ 4 (164). -С. 14-19.
- Zhuang S. Application of esterase isozyme for identifying the purity of hybrid rice cultivars//Fujian Journal of Agricultural Sciences. -2004. -Vol. 1. -Is. 4. -Р. 247-249.
- Nikolic Z., Vujakovic M., Jevtic A. Genetic purity of sunflower hybrids determined on the basis of isozymes and seed storage proteins//Helia. -2008. -Vol. 31. -No 2 (48). -P. 47-54.
- Сахарова А.Н., Андреева Г.Н., Фесенко И.А., Хрусталева Л.И., Карлов Г.И. Применение SSR-маркеров для оценки уровня гибридности семян F1 огурца//Известия ТСХА. -2011. -Вып. 6. -С. 150-155.
- Дубина Е.В., Королёва С.В., Гаркуша С.В., Юрченко С.А, Есаулова Л.В. Разработка методической схемы оценки гибридности семян F1 Brassica oleracea L., основанной на полиморфизме микросателитных ДНК-маркеров//Достижения науки и техники АПК. -2016. -Т. 30. -№ 8. -С. 49-51.
- Акинина Г.Е., Тереняк Ю.Н., Шарыпина Я.Ю., Попов В.Н. Генетическая чистота семян -актуальный вопрос современной генетики и селекции растений//Фактори експериментальної еволюцiї органiзмiв. -2016. -Т. 18. -С. 56-60.
- Способ оценки типичности инбредных линий и уровня гибридности семян F1 подсолнечника: патент № 2294965 РФ/Антонова Т.С., Челюстникова Т.А., Гучетль С.З., Рамазанова С.А.; заявл. 04.07. 05, опубл. 10.03.07. -Бюл. № 17. -С.1-7.
- Molecular biomarker analysis -SSR analysis of sunflower. ISO/TR 17622:2015. International standard. -2015. -11 p.
- Zhang L.-S., Becquet V., Shao-Hua L., Zhang D. Optimization of multiplex PCR and multiplex gel electrophoresis in sunflower SSR analysis using infrared fluorescence and tailed primers//Acta Botanica Sinica. -2003. -Vol. 45. -Is. 11. -P. 1312-1318.
- Супрун И.И., Токмаков С.В., Степанов И.В., Иванова А.М. Разработка мультиплексного набора для маркерной селекции яблони на устойчивость к парше//Научные труды Государственного научного учреждения Северо-Кавказского зонального научно-исследовательского института садоводства и виноградарства Российской академии сельскохозяйственных наук. -2017. -Т. 12. -С. 26-30.
- Токмаков С.В., Супрун И.И., Насонов А.И. Разработка мультиплексной SSR-маркерной системы для идентификации штаммов парши яблони//Микология и фитопатология. -2017. -Т. 51. -№ 6. -С. 394-403.
- Saghai-Maroof M.A., Soliman K.M., Jorgensen R.A., Allard R.W. Ribosomal DNA spacer-length polymorphisms in barley: Mendelian inheritance, chromosomal location, and population dynamics//PNAS USA. -1984. -Vol. 81. -P. 8014-8018.
- Гучетль С.З., Фролов С.С., Зайцев Р.Н., Кузнецова Е.С. Паспортизация линий и гиб-ридов подсолнечника селекции Армавирской опытной станции ВНИИМК: подбор оптимальных ДНК локусов и условий ПЦР//Масличные культуры. Науч.-тех. бюл. ВНИИМК. -2017. -№ 3 (171). -С. 23-28.
- Использование ПЦР-анализа в генетико-селекционных исследованиях: Научно-методическое руководство/Под ред. Сиволапа Ю.М. -Киев: Аграрна наука, 1998. -156 с.
- Айала Ф., Кайгер Д. Современная генетика. -М.: МИР, 1988. -Т. 3. -332 с.
