Особенности консервации актинобактерий рода Rhodococcus

Автор: Каменских Т.Н., Куюкина М.С., Ившина И.Б.

Журнал: Вестник Пермского университета. Серия: Биология @vestnik-psu-bio

Рубрика: Микробиология

Статья в выпуске: 2, 2004 года.

Бесплатный доступ

Определен показатель жизнеспособности лиофилизированных культур Rhodococcus ssp. после длительного хранения, достаточный для восстановления клеточной популяции. Консервацию алканотрофных родококков рекомендовано производить в условиях предварительного их культивирования на питательных углеводородсодержащих средах. Экспериментально обосновано, что эффективными лиопротекторами являются сахарозо-желатиновый агар и желатиновый агар с добавлением Rhodococcus-биосурфактанта.

Короткий адрес: https://sciup.org/147204313

IDR: 147204313

Текст научной статьи Особенности консервации актинобактерий рода Rhodococcus

Объектом исследования служили 53 штамма актинобактерий из Региональной профилированной коллекции алканотрофных микроорганизмов ИЭГМ УрО РАН (Каталог штаммов..., 1994; , принадлежащих к шести видам

Rhodococcus (R erythropolis, R. fascians, R. "longus ", R. opacus, R. rhodochrous, R ruber).

Культуры выращивали на мясопептонном агаре (МПА) и в жидкой минеральной среде с пропаном в качестве единственного источника углерода в газовоздушной атмосфере (1:5) (Ившина и др., 1987). Консервацию культур осуществляли методом лиофилизации - высушивания клеток в вакууме из замороженного состояния с помощью лабораторного лиофилизатора типа ОЕ-960 (Венгрия). В качестве лиопротекторов использовали сахарозо-желатиновый агар (СЖА) Файбича (10% сахарозы, 1,5% желатина, 0,1% агара “Difco”), трегалозо-желатиновый агар (ТЖА: 10% трегалозы, 1,5% желатина, 0,1% агара “Difco") и желатиновый агар с добавлением биосурфактанта (БС+ЖА), полученного из штамма Rhodococcus ruber ИЭГМ 235 (Kuyukina et al., 2001). Количество жизнеспособных клеток определяли методом точечных высевов по числу колониеобразующих единиц (Веслополова, 1'995). Эффективность метода хранения оценивали по показателям выживаемости и биологической . активности поддерживаемых культур. Константы скорости отмирания лиофильно высушенных штаммов родококков и рациональную длительность хранения их в лиофилизированном состоянии рассчитывали по известным формулам (Нестеров и др., 1986; Mikata, Banno, 1989). Проверку сохранения исходных свойств культур осуществляли путем контрольного опреде ления ключевых признаков (Методы общей бактериологии, 1983; Ившина и др., 1995). Все эксперименты проводили в 3-кратной повторности.

Статистическую обработку полученных результатов проводили с использованием пакета компьютерных программ Microsoft Excel.

-                                 ПО

Результаты и обсуждение

Известно, что успешность лиофилизации и эффективность последующего хранения родококков существенно зависят рт условий предварительного культивирования и наличия протекторного соединения при консервации клеток (Ившина, Каменских и др., 1995; Каменских, Ившина, 2000). Так, изучение жизнеспособности культур, поддерживаемых в течение 2-12 лет в лиофильно высушенном состоянии, показало, что применение сахарозо-желатинового агара (СЖА) в качестве протектора способствует сохранению большого числа жизнеспособных клеток родококков, предварительно выращенных на МПА (табл. 1). При этом необходимо отметить, что наиболее высокая (107-108 клеток/мл) выживаемость бактериальных клеток отмечается у пигментированных культур - представителей видов R. fascians, R. rhodochrous и R. ruber.

Таблица 1 Жизнеспособность родококков после длительного сохранения их в лиофилизированном состоянии

Длительность

Число жизнеспособ-

хранения, годы

ных клеток/мл

Rhodococcus

erythropolis

ИЭГМ 12

11,5

(35,1 +0,94) х 106

ИЭГМ 16

11,5

(14,7 ± 0,61) х 10s

ИЭГМ 17

11,5

(21,7 + 0,74) х 106

ИЭГМ 19

11,5

(70,7 ± 1,33) х 106

ИЭГМ 21

11,5

(98,6 ± 1,57) х 103

ИЭГМ 190

10,0

(15,3 ± 0,62) х 106

ИЭГМ 193

10,0

(30,9 +0,88) х 104

ИЭГМ 201

10,0

(36,0 ± 0,95) х 106

ИЭГМ 202

10,0

(12,4 ± 1,76) х 104

R. fascians

ИЭГМ 35

11,5

(49,5 + 1,11) хЮ6

ИЭГМ 38

11,5

(81,6 + 1,43) хЮ6

ИЭГМ 42

11,5

(21,3 + 0,73) х! О6

ИЭГМ 174

10,0

(47,3 + 1,09) х106

ИЭГМ 178

10,0

(18,1 ± 0,67) хЮ6

ИЭГМ 288

10,0

(54,8 ± 1.17) хЮ6

R. «longus»

ИЭГМ 27

2,0

(3,66 +0,95) х 106

ИЭГМ 69

2,0

(19,1 ± 2,18) хЮ7

R. opacus

ИЭГМ 56

2,5

(14,2 + 0,60) х 106

ИЭГМ 58

2,5

(31,0 ± 0,28) х 10*

ИЭГМ 263

11

(12,2 + 0,55) х 105

R rhodochrous

ИЭГМ 63

10,5

(32,4 ± 0,9) хЮ6

ИЭГМ 653

4,0

(11,4± 1,69) хЮ7

ИЭГМ 655

4,0

(13,0 +0,57) хЮ4

R. ruber

ИЭГМ 77

12

(20,9 + 2,29) х107

ИЭГМ 81

10,5

(11,3 +1,68) хЮ7

ИЭГМ 91.

8

(31,0 + 6,40) х 107

ИЭГМ 93

9

(64,0 +5,10) х 106

ИЭГМ 321

10,5

! (59,7 ± 1,22) х106

Примечание. Приведены средние данные определения численности (клеток/мл) и 95%-ный доверительный интервал.

Однако выборочная проверка углеводородокис-ляющей способности отдельных штаммов показала выраженное снижение исследуемой активности некоторых культур родококков. В то же время метод лиофилизации бактериальных клеток, предварительно выращенных на пропане, с применением классического протектора (СЖА) приводит к существенному снижению срока гарантированного хранения газоокисляющих родококков (табл. 2). По нашим данным, средний срок рациональной длительности хранения пропанокисляющих штаммов составляет 7,6 лет.

Ранее нами (Каменских, 1998; Каменских, Ившина, 2000) было показано, что повышение степени устойчивости газоокисляющих родококков к длительному хранению в лиофилизированном состоянии может быть достигнуто путем изменения состава защитной среды. В частности, добавление 1 мМ ацетата-а-токоферола в качестве антиоксиданта в состав защитной среды способствует увеличению числа жизнеспособных клеток, осуществляющих окисление пропана. С целью поиска новых эффективных условий консервации алкано-трофных родококков нами было осуществлено предварительное культивирование клеток на среде с пропаном, при этом использовались новые криопротекторы - трегалозо-желатиновый агар и желатиновый агар с добавлением Rhodococcus-бт- сурфактанта - гликолипида трегалозы. В состав , этих соединений входит низкомолекулярный диса-харидный компонент - трегалоза, обладающая эффективным защитным действием (Волков и др., 1992; Israeli et al., 1993; Ivshina et al, 1998; Arguelles, 2000; Kuyukina et al., 2001).

По нашим данным, высокая выживаемость исследуемых культур в процессе лиофилизации достигается при использовании в качестве протектора сахарозо-желатинового или трегалозо-желатинового агара. Как видно из табл. 3, показатель выживаемости родококков R. ruber ИЭГМ 333, предварительно выращенных в присутствии пропана, в этих условиях опыта составляет 37-40%. С целью прогнозирования эффективности данного способа лиофилизации для длительной консервации был использован тест на ускоренное хранение. Для этого при помощи графиков Аррениуса, построенных по экспериментальным данным, определяли величины констант скорости отмирания клеток при температуре +4°С, обычно используемой для хранения лиофилизированных препаратов, а также рассчитывали рекомендуемую продолжительность хранения исследуемых культур в лиофилизированном состоянии (табл. 4). Произведенные расчеты показывают, что рациональная длительность хранения родококков при условии предварительного выращивания их в присутствии пропана и использования в качестве протектора сахарозо-желатинового агара составляет более 5 лет, тогда как применение желатинового агара с добавлением /?/гос/ососсп$-биосурфактанта способствует значительному увеличению прогнозируемого срока хранения - до 18 лет. Учитывая стабилизирующую роль трегалозы при продолжительном хранении бактериальных препаратов в лиофилизированном состоянии, следует отметить, что определяющим ствия с клеточными биополимерами, в частности аспектом, по-видимому, является состояние трега- липидными компонентами (Волков и др., 1992). лозы, которое существенно зависит от взаимодей-

Таблица2

Влияние среды предварительного культивирования на жизнеспособность лиофилизированных культур R. ruber при хранении в течение 1-9 лет

Выживаемость газоокисляющих родококков R. ruber ИЭГМ 333 в зависимости от условий лиофилизации

Крио-протектор

Число жизнеспособных клеток/мл

Выживаемость, %

до лиофилизации

сразу после лиофилизации

СЖА

3,4 х 105 (34,4±2,62)х104

1,4 х 105 (13,8+1,66)х104

40,1

ТЖА

3,4 х 10s (34,4+2,62)х104

1,3 х 105 (13,0±1,61)х104

37,8

БС+ЖА

3,4 х 105 (34,4±2,62)х104

3,0 х 104 (ЗО,1±2,45)х1О3

8,8

Примечание. Здесь и в табл. 4 СЖА - сахарозожелатиновый агар; ТЖА - трегалозо-желатиновый агар; БС+ЖА - желатиновый агар с добавлением ЯЛое/ососсмя-биосурфактанта.

Таблица 4

Прогноз выживаемости R. ruber ИЭГМ 333 в зависимости от криопротектора и среды предварительного культивирования родококков

Среда культивирования / криопротектор

С3/СЖА

К, год"1

-2,9

РДХ, го ды 5,1

С3 /ТЖА

-3,1

7,8

С3 / БС+ЖА

-3,6

17,9

Список литературы Особенности консервации актинобактерий рода Rhodococcus

  • Веслополова Е.Ф. Микрометод определения численности колониеобразующих микроорганизмов//Микробиология. 1995. Т. 64, № 2. С. 279-284.
  • Волков В.Я., Сахаров Б.В., Щепкин В.Д., Федюкина Г.Н., Кашуба А.А. О природе устойчивости клеток дрожжей к высушиванию//Микробиология. 1992. Т. 61, вып. 2. С. 214-222.
  • Ившина И.Б., Бердичевская М.В. Зверева Л.В., Рыбалка Л.В., Еловикова Е.А. Фенотипическая характеристика алканотрофных родококков из различных экосистем//Микробиология. 1995. Т. 64, №4. С. 507-513.
  • Ившина И.Б., Каменских Т.Н., Козырева Г.И. Антибиотикочувствительность родококков, культивируемых на разных средах//Факторы и механизмы регуляции развития бактериальных популяций. Свердловск, 1990. С. 92-98.
  • Ившина И.Б., Каменских Т.Н., Куюкина М.С., Рычкова М.И., Шадрин О.А., Чумаков ОБ. Методы консервации культур Rhodococcus spp. и их применение в практике поддержания специализированного фонда алканотрофных родококков//Микробиология. 1995. Т. 64, вып. 1. С. 118-128.
  • Ившина И.Б., Пшеничное Р.А., Оборин А.А. Про-панокисляющие родококки. Свердловск, 1987.
  • Каменских Т.Н. Консервация и гарантированное сохранение родококков ех situ: Дис... канд. биол. наук. Пермь, 1998.
  • Каменских Т.Н., Ившина КБ. Консервация и гарантированное сохранение бактерий рода Rhodococcus II Вестник Перм. унта. 2000. Вып. 2. Биология. С. 122-130.
  • Каталог штаммов региональной профилированной коллекции алканотрофных микроорганизмов/Под ред. И.Б. Ившиной. М.: Наука, 1994.
  • Короиелли Т.В., Комарова Т.И., Юферева С.Г., Ильинский В.В., Чивкунова О.Б., Розынов Б.В. Полярные липиды углеводородокисляющих бактерий среды//Микробиология. 1993. Т. 62, вып. 2. С. 231-237.
  • Коронепли Т.Е., Дермичева С.Г., Ильинский В.В., Комарова Т.П., Поршнева О.В. Видовая структура углеводородокисляющих бактериоценозов водных экосистем разных климатических зон//Микробиология. 1994. Т. 63, вып. 5. С. 917-922.
  • Методы общей бактериологии/Под ред. Ф. Герхардта и др. М.: Мир, 1983. Т. 1,2.
  • Милько Е.С., Егоров Н.С. Гетерогенность популяции бактерий и процесс диссоциации. М.: Издво МГУ, 1991.
  • Нестеров А.И., Кошелев А.В., Гальченко В.Ф., Иванов М.В. Выживаемость облигатных метанотрофных бактерий при лиофилизации и последующем хранении//Микробиология. 1986. Т. 55, вып. 2. С. 271-277.
  • Ротмистров М.Н., Ставская С.С., Татанова Л.А., Григорьева Т.Ю., Тренина Г.А., Ключева М.В., Емцева ТВ. Хранение псевдомонад, разлагающих поверхностноактивные вещества//Микробиология. 1990. Т. 59, вып. I.С 156-161.
  • Arguelles J. С. Physiological roles of trehalose in bacteria and yeasts: a comparative analysis II Arch. Microbiol. 2000. Vol. 174. P. 217-224.
  • Israeli E., Shajfer B.T., Ligthart B. Protection of freezedried Escherichia coli by trehalose upon exposure to environmental conditions II Cryobiology. 1993. Vol. 30. P. 519-523.
  • Ivshina 1.В., Kuyukina M.S., Philp J.C., Christofl N. Oil desoiption from mineral and organic materials using biosurfactant complexes produced by Rhodococcus species II World J. Microbiol. Biotechnol. 1998. Vol. 14. P. 711-717.
  • Mikata K, Banno I. Preservation of yeast cultures by Ldiying viability after 5 years of storage at 5 C IIIFO Research Communications. 1989. № 14. P. 80-103.
  • Kuyukina M.S., Ivshina IB., Philp J.C., Christofi N., Dunbar S.A., Ritchkova M.L Recovery of Rhodococcus biosurfactants using methyl tertiarybutyl ether extraction II J. Microbiol. Methods. 2001. Vol. 46, № 2. P. 149-156.
Еще
Статья научная