Отбор полиморфных локусов генома для идентификации популяций Pinus sylvestris L. на Восточно-Европейской равнине
Автор: Пришнивская Яна Викторовна, Нассонова Елена Сергеевна, Васильева Юлия Сергеевна, Боронникова Светлана Витальевна
Журнал: Бюллетень науки и практики @bulletennauki
Рубрика: Биологические науки
Статья в выпуске: 5 т.5, 2019 года.
Бесплатный доступ
У 8 смежных популяций Pinus sylvestris L., расположенных на Восточно-Европейской равнине, были протестированы десять пар праймеров к 10 генам, а также четырех пары праймеров к 4 локусам не кодирующих регионов хпДНК. Из протестированных 14 пар праймеров к исследуемым локусам были отобраны два локуса не кодирующих регионов хпДНК ( psbA-trnH, trnL-trnF ), которые наиболее полиморфны, имеют гомологичные последовательности в базах данных и поэтому они рекомендованы для молекулярно-генетической идентификации смежных популяций P. sylvestris на Восточно-Европейской равнине.
Генетическое разнообразие, полиморфные локусы, молекулярные маркеры, идентификация, популяция, восточно-европейская равнина
Короткий адрес: https://sciup.org/14115434
IDR: 14115434 | DOI: 10.33619/2414-2948/42/03
Список литературы Отбор полиморфных локусов генома для идентификации популяций Pinus sylvestris L. на Восточно-Европейской равнине
- Алтухов Ю. П. Динамика генофондов при антропогенных воздействиях // Вестник ВОГиС. 2004. T. 8. №2. C. 40-59.
- Макеева В. М., Смуров А. В., Политов Д. В. и др. Оценка состояния генофонда и жизнеспособности лесопосадок ели европейской (Picea abies (L.) Karst.) из парков города Москвы и Подмосковья // Леса России: политика, промышленность, наука, образование: Материалы третьей международной научно-технической конференции. 2018. С. 187-190.
- Видякин А. И. Популяционная структура сосны обыкновенной на востоке европейской части России: автореф. дисс.. д-ра биол. наук. Екатеринбург, 2004. 48 с.
- Ветчинникова Л. В., Титов А. Ф., Кузнецова Т. Ю. Карельская береза: биологические особенности, динамика ресурсов и воспроизводство. Петрозаводск: Карельский научный центр РАН. 2013. 312 с.
- Rogers S. O., Bendich A. J. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummified plant tissues // Plant Molecular Biology. 1985. V. l. №19. P. 69-76.
- Бельтюкова Н. Н., Нечаева Ю. С., Пришнивская Я. В., Тайман К. Е. Оптимизация методики выделения ДНК некоторых хвойных видов растений Пермского края // Синтез знаний в естественных науках. Рудник будущего: проекты, технологии, оборудование: материалы международной конференции. Пермь, 2011. С. 278-282.
- Wachowiak W., Balk P. A., Savolainen O. Search for nucleotide diversity patterns of local adaptation in dehydrins and other cold-related candidate genes in Scots pine (Pinus sylvestris L.) // Tree Genetics & Genomes. 2009. №5. P. 117-132.
- Ersoz E. S., Wright M. H., Gonzalez-Martinez S. C. et al. Evolution of disease response genes in loblolly pine: insights from candidate genes // PLoS ONE. 2010. V. 5. №12. P. 1-12.
- Wang X.-R., Tsumura Y., Yoshimaru H. et al. Phylogenetic relationships of Eurasian pines (Pinus, Pinaceae) based on chloroplast rbcl, matk, rpl20-rps18 spacer, and trnv intron sequences // American Journal of Botany. 1999. V. 86. №12. P. 1742-1753.
- Ferri G., Alù M., Corradini B. et al. Forensic botany: species identification of botanical trace evidence using a multigene barcoding approach // Int J Legal Med. 2009. V. 23. P. 395-401.
