Первичный скрининг коллекционных грибных штаммов антагонистов к возбудителю фомоза рапса озимого

Бесплатный доступ

В лаборатории биометода агро-технологического отдела ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК с целью разработки микробиологического метода снижения вредоносности наиболее опасной болезни рапса озимого - фомоза (Leptosphaeria maculans (Desm.) Ces. et de Not, анаморфная стадия Phoma lingam (Tode) Desm.), в 2024 г. из рабочей коллекции проводили поиск перспективных штаммов-продуцентов микробиопрепаратов. В результате первичного скрининга выделено 26 перспективных грибных штаммов с разными типами антагонистической активности (конкуренция за площадь питания, гиперпаразитизм и антибиоз) против возбудителя фомоза: шесть штаммов из рода Trichoderma, семь - из рода Penicillium, четыре - из рода Chaetomium, три - из рода Aspergillus, два - из класса Basidiomycota, а также по одному из родов Sordaria, Metarhizium, Trichothecium и Talaromyces.

Еще

Фомоз, рапс озимый, первичный скрининг, грибные штаммы антагонисты, микробиологический метод

Короткий адрес: https://sciup.org/142243372

IDR: 142243372   |   DOI: 10.25230/2412-608X-2024-4-200-107-113

Текст научной статьи Первичный скрининг коллекционных грибных штаммов антагонистов к возбудителю фомоза рапса озимого

Введение. Для снижения вредоносности одной из наиболее распространенных и опасных болезней рапса озимого – фо-моза (возбудитель Leptosphaeria maculans (Desm.) Ces. et de Not, анаморфная стадия Phoma lingam (Tode) Desm.) [1], актуальной задачей является разработка микробиологического метода. В условиях центральной зоны Краснодарского края, а в последние годы и в южных областях Нечерноземья, фомоз является одной из наиболее вредоносных болезней озимых культур семейства капустные, в том числе и рапса озимого, поражение которой может привести к снижению урожая до 40,0 %, а при раннем заражении – и к преждевременной гибели растений [2–5]. В качестве основных мер ее контроля рекомендуются: устойчивые сорта, уборка растительных остатков, соблюдение севооборота (срок возврата рапса на прежнее поле не ранее чем через 3–4 года), оптимальные сроки посева, пространственная изоляция, протравливание семян и применение фунгицидов во время вегетации культуры [6].

Зарегистрированных биопрепаратов от фомоза на рапсе в России нет. В лаборатории биометода агротехнологического отдела ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК, одной из немногих в России, многие годы ведутся исследования по разработке микробиологических средств защиты масличных культур от болезней. В основе разработанной в лаборатории концепции целенаправленного создания микробиопрепаратов для защиты масличных и других сельскохозяйственных культур от болезней лежит поиск штаммов антагонистов, безопасных для человека, нефитотоксичных, проявляющих высокую активность в широко варьируемых погодных условиях против комплекса патогенов, обладающих полифунк-циональным типом действия [7]. Начальным этапом этих исследований является ступенчатый скрининг вновь выделенных или коллекционных штаммов в лабораторных условиях in vitro.

Настоящая работа посвящена первому этапу ступенчатого скрининга – первичному скринингу коллекционных грибных штаммов к агрессивному изоляту возбудителя фомоза рапса озимого Phoma lingam in vitro.

Материалы и методы. Исследования проводили в лаборатории биометода агро-технологического отдела ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК в 2024 г. Объектом исследований служили: конидиальная стадия агрессивного изолята возбудителя фомоза рапса озимого Phoma lingam , выделенного в центральной зоне Краснодарского края; коллекционные штаммы грибных антагонистов возбудителей болезней масличных культур – 26 штаммов, представленных родами Trichoderma , Penicillium , Chaetomium , Sordaria , Metarhizium , Trichothecium, Talaromyces , Aspergillus , а также классом Basidiomycota.

Оценку антагонистической активности штаммов in vitro к агрессивному изоляту возбудителя фомоза рапса озимого проводили методом двойных или встречных культур [8]. Метод позволяет определить антагонистическую активность выделенных или коллекционных штаммов при совместном культивировании с возбудителем болезни (агрессивным изолятом) в одной чашке Петри.

Культуры грибных антагонистов и возбудителя болезни выращивали отдельно в течение пяти–семи суток на агаризирован-ной питательной среде. Стерильным сверлом размером 0,7 см вырезали блоки с мицелием антагониста и патогена и помещали в одну чашку Петри на расстоянии 6,0 см. Контролем служили культуры антагонистов и патогена, посеянные порознь. Антагонистов и патоген выращивали на картофельно-сахарозном агаре (КСА) [9] и на специализированной для грибов среде Рудакова [10]. Учёты взаимодействия патогена с антагонистами проводили на 20 сутки культивирования, отмечали:

  • -    рост патогена и антагониста в % от площади чашки Петри (конкуренция за площадь питания);

  • -    наличие или отсутствие зон задержки роста патогена в результате синтеза антагонистами гидролитических ферментов или веществ антибиотической природы (стерильная зона);

  • -    нарастание антагониста на колонию патогена (гиперпаразитическая зона).

Результаты и обсуждения. Результаты первичной оценки коллекционных грибных штаммов к возбудителю фомоза рапса озимого Phoma lingam методом двойных или встречных культур на питательных средах КСА и Рудакова показали, что все штаммы проявили антагонистическую активность, при этом механизм антагонистического действия грибов представлен тремя типами: конкуренция за площадь питания, гиперпаразитизм и антибиоз.

Из 26 испытанных коллекционных штаммов грибов к возбудителю фомоза на среде КСА пять штаммов из рода Trichoderma (Т-1, Т-2, Т-3, Т-4 и Т-5 Trichoderma sp.) проявили тройной тип механизма антагонистической активности, заняв 100 % поверхности питательной среды, со стерильной зоной 4,5–5,5 мм и с гиперпаразитической зоной 0,5–3,7 см2 (табл. 1, рис. 1).

Таблица 1

Антагонистическая активность грибных штаммов к возбудителю фомоза рапса озимого Phoma lingam при температуре 25 °С на 20-е сутки культивирования на среде КСА

ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК, 2024 г.

Штамм антагонист

Площадь зарастания поверхности питательной среды

Размер стерильной зоны, мм

Размер гиперпаразитической зоны, см2

антагонистом

патогеном

%

см2

%

см2

Phoma lingam

-

-

27,6

17,5 ± 1,3

-

-

конкуренция за площадь питания + антибиоз + гиперпаразитизм

T-1 Trichoderma sp .

100

63,6 ± 0

5,8

3,7 ± 0,1

4,5 ± 0,5

3,7 ± 0,1

T-2 Trichoderma sp .

100

63,6 ± 0

1,3

0,8 ± 0,2

5,0 ± 0

0,8 ± 0,2

T-3 Trichoderma sp .

100

63,6 ± 0

2,1

1,4 ± 0,2

5,5 ± 0,5

1,4 ± 0,2

T-4 Trichoderma sp .

100

63,6 ± 0

0,8

0,5 ± 0,3

5,0 ± 0

0,5 ± 0,3

T-5 Trichoderma sp .

100

63,6 ± 0

1,2

0,8 ± 0

5,5 ± 0,5

0,8 ± 0

конкуренция за площадь питания + антибиоз

Pv-3 Penicillium verrucosum

53,7

34,2 ± 1,8

18,5

11,8 ± 2,0

10,0 ± 0

0

Pk-1 Penicillium vermiculatum

56,1

35,7 ± 5,3

27,2

17,3 ± 2,0

8,0 ± 1,0

0

Pbc-1 Penicillium brevi-compactum

46,7

29,7 ± 0,7

35,2

22,4 ± 0,5

7,5 ± 0,5

0

Pp-1 Penicillium purpurescens

69,5

44,2 ± 3,9

12,4

7,9 ± 1,2

7,5 ± 2,5

0

Av-1 Aspergillus versicolor

64,8

41,3 ± 5,9

15,6

9,9 ± 1,1

7,5 ± 0,5

0

An-1 Aspergillus niger

66,3

41,2 ± 4,9

12,7

8,1 ± 4,0

7,5 ± 0,5

0

Af-1 Aspergillus flavus

53,9

34,3 ± 1,1

17,7

11,2 ± 1,9

6,5 ± 0,5

0

М-1 Metarhizium sp .

53,4

33,9 ± 1,5

15,2

9,7 ± 1,1

6,5 ± 0,5

0

Xk-1 Chaetomium olivaceum

61,6

39,3 ± 0,5

23,7

15,1 ± 1,5

6,0 ± 0

0

Pr-1 Penicillium rugulosum

25,8

16,5 ± 1,8

16,4

10,4 ± 0,6

5,5 ± 0,5

0

Xk-2 Chaetomium globosum

66,1

42,1 ± 3,2

18,7

11,8 ± 1,9

5,5 ± 0,5

0

Tt-1 Talaramyces trachispermus

25,8

16,4 ± 0,2

40,0

25,5 ± 0,3

5,5 ± 2,5

0

Хk-4 Chaetomium sp .

65,8

41,9 ± 1,3

21,3

13,5 ± 2,2

5,0 ± 0

0

Sm-1 Sordaria macrospora

80,3

51,1 ± 6,3

7,0

4,4 ± 2,4

5,0 ± 0

0

Pf-1 Penicillium funiculosum

58,7

37,4 ± 1,5

11,6

7,5 ± 0,2

4,5 ± 0,5

0

Tr-1 Trichothecium roseum

82,7

53,6 ± 0

10,4

6,6 ± 1,7

4,0 ± 1,0

0

A-1 Basidiomycota

86,9

55,3 ± 2,1

11,1

7,1 ± 1,8

3,5 ± 0,5

0

Хk-3 Chaetomium globosum

63,5

44,4 ± 0,2

16,4

10,4 ± 0,2

2,5 ± 0,5

0

M-24 Penicillium vermiculatum

53,7

34,2 ± 0,1

9,9

6,3 ± 4,7

1,5 ± 0,5

0

конкуренция за площадь питания + гиперпаразитизм

Tk-1 Trichoderma koningii

87,4

55,6 ± 0

25,2

16,0 ± 2,0

0

8,1 ± 3,5

И-3 Basidiomycota

53,5

34,0 ± 2,9

31,1

19,8 ± 2,7

0

3,1 ± 1,2

T-1 Trichoderma sp .      T-3 Trichoderma sp .      T-4 Trichoderma sp .

Рисунок 1 – Антагонистическая активность грибов рода Trichoderma к возбудителю фомоза рапса озимого Phoma lingam через 20 суток совместного культивирования на среде КСА при температуре 25 °С (ориг.) (ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК, 2024 г.): а – колония патогена; б – колония антагониста; в – стерильная зона; г – гиперпаразитизм; д – конкуренция за площадь питания

Двойной тип механизма антагонистической активности (конкуренция за площадь питания и антибиоз) проявили семь штаммов из рода Penicillium (Pv-3 Penicillium verrucosum , Pk-1 Penicillium vermiculatum , Pbc-1 Penicillium brevi-compactum , Pp-1 Penicillium purpurescens , Pr-1 Penicillium rugulosum , Pf-1 Penicillium funiculosum и M-24 Penicillium vermiculatum ), четыре из рода Chaetomium (Xk-1 Chaetomium oliva-ceum , Xk-2 и Хk-3 Chaetomium globosum и Хk-4 Chaetomium sp . ), три из рода Aspergillus (Av-1 Aspergillus versicolor , An-1 Aspergillus niger и Af-1 Aspergillus flavus ), а также штаммы М-1 Metarhizium sp . , Tt-1

Talaramyces trachispermus , Sm-1 Sordaria macrospora , Tr-1 Trichothecium roseum и A-1 Basidiomycota . Вышеуказанные штаммы на 20 сутки заняли от 25,8 до 86,9 % площади поверхности питательной среды при таковой у патогена 7,0–40,0 %, а также образовали стерильную зону задержки роста патогена размером от 1,5 до 10,0 мм. Максимальная стерильная зона установлена у штаммов Pv-3 Penicillium verrucosum , Pk-1 Penicillium vermiculatum , Pbc-1 Penicillium brevi-compactum , Pp-1 Penicillium pur-purescens , Av-1 Aspergillus versicolor и An-1 Aspergillus niger – 7,5–10,0 мм (рис. 2).

Pv-3 Penicillium

Pk-1 Penicillium

Pbc-1 Penicillium

verrucosum vermiculatum brevi-compactum

Pp-1 Penicillium           Av-1 Aspergillus             An-1 Aspergillus purpurescens                versicolor                      niger

Рисунок 2 – Антибиотическая активность грибных штаммов к возбудителю фомоза рапса озимого Phoma lingam через 20 суток совместного культивирования на среде КСА при температуре 25 °С (ориг.) (ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК, 2024 г.): а – колония патогена; б – колония антагониста; в – стерильная зона

Штаммы И-3 Basidiomycota и Tk-1 Trichoderma koningii на среде КСА проявили двойной тип механизма антагонистической активности (конкуренция за площадь питания и гиперпаразитизм), заняв 53,5–87,4 % поверхности питательной среды при гиперпаразитической зоне 3,1– 8,1 см2 соответственно.

На специализированной для грибов питательной среде Рудакова у 12 штаммов (Т-1, Т-2, Т-3, Т-4 и Т-5 Trichoderma sp., Xk-1 Chaetomium olivaceum, Xk-2 и Хk-3 Chae-tomium globosum, и Хk-4 Chaetomium sp., И-3 и А-1 Basidiomycota и Tr-1 Trichothe-cium roseum) выявлен двойной тип антагонистической активности к возбудителю фо-моза рапса озимого Phoma lingam – конку- ренция за площадь питания и гиперпаразитизм (табл. 2). При этом максимальную конкуренцию за площадь питания проявили штаммы из рода Trichoderma (Т-1, Т-2, Т-3, Т-4 и Т-5), заняв 100 % поверхности питательной среды, а максимальная гиперпаразитическая зона выявлена у штаммов Xk-2 и Хk-3 Chaetomium glo-bosum, Tr-1 Trichothecium roseum и И-3 Ba-sidiomycota – 8,2–12,1 см2.

Таблица 2

Антагонистическая активность грибных штаммов к возбудителю фомоза рапса озимого Phoma lingam при температуре 25 °С на 20-е сутки культивирования на среде Рудакова

ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК, 2024 г.

Штамм антагонист

Площадь зарастания поверхности питательной среды

Размер стерильной зоны, мм

Размер гиперпаразитической зоны, см2

антагонистом

патогеном

%

см2

%

см2

Phoma lingam

-

-

78,0

49,1 ± 0,6

-

-

конкуренция за площадь питания + гиперпаразитизм

T-1 Trichoderma sp .

100

63,6 ± 0

2,7

1,7 ± 0,2

0

1,7 ± 0,2

T-2 Trichoderma sp .

100

63,6 ± 0

2,0

1,2 ± 0,5

0

1,2 ± 0,5

T-3 Trichoderma sp .

100

63,6 ± 0

4,2

2,6 ± 0,2

0

2,6 ± 0,2

T-4 Trichoderma sp .

100

63,6 ± 0

2,9

1,8 ± 0,1

0

1,8 ± 0,1

T-5 Trichoderma sp .

100

63,6 ± 0

6,0

2,1 ± 1,0

0

2,1 ± 1,0

Tr-1 Trichothecium roseum

100

63,6 ± 0

13,4

8,5 ± 1,7

0

8,5 ± 1,7

A-1 Basidiomycota

90,7

57,7 ± 2,9

14,3

9,1 ± 1,1

0

7,1 ± 0,9

Xk-2 Chaetomium globosum

81,4

51,7 ± 1,5

16,5

10,5 ± 2,1

0

8,2 ± 1,7

Xk-1 Chaetomium olivaceum

77,9

49,6 ± 2,2

17,7

11,3 ± 1,2

0

1,9 ± 0,3

Хk-4 Chaetomium sp .

75,3

47,9 ± 0

13,8

8,7 ± 0

0

6,8 ± 0

Хk-3 Chaetomium globosum

71,8

45,6 ± 1,0

16,8

10,6 ± 0,7

0

8,3 ± 0,5

И-3 Basidiomycota

58,9

37,4 ± 0,8

23,5

15,5 ± 0,5

0

12,1 ± 0,4

конкуренция за площадь питания + антибиоз

Av-1 Aspergillus versicolor

56,1

35,7 ± 0,4

33,1

21,0 ± 5,5

5,0 ± 1,0

0

Pr-1 Penicillium rugulosum

36,3

23,0 ± 1,6

46,6

29,6 ± 2,2

3,5 ± 0,5

0

Tk-1 Trichoderma koningii

100

63,6 ± 0

6,0

2,1 ± 0,7

2,5 ± 0,5

0

Pk-1 Penicillium vermiculatum

59,5

37,8 ± 5,4

33,2

21,1 ± 1,9

2,5 ± 0,5

0

Pbc-1 Penicillium brevi-compactum

54,9

34,9 ± 0,4

37,9

24,1 ± 0,6

2,5 ± 0,5

0

Pp-1 Penicillium purpurescens

52,8

33,5 ± 0,4

29,6

18,8 ± 0,7

2,5 ± 0,5

0

Af-1 Aspergillus flavus

58,3

37,1 ± 1,1

21,8

13,8 ± 0,7

2,5 ± 0,5

0

An-1 Aspergillus niger

87,4

55,5 ± 4,9

10,6

6,7 ± 3,6

2,0 ± 1,0

0

M-24 Penicillium vermiculatum

55,7

35,4 ± 0,1

35,0

22,2 ± 1,4

1,0 ± 0

0

Pv-3 Penicillium verrucosum

58,3

37,2 ± 1,7

39,5

25,1 ± 3,2

1,0 ± 0

0

конкуренция за площадь питания

Sm-1 Sordaria macrospora

97,8

62,2 ± 0,1

2,1

1,3 ± 0,1

0

0

Pf-1 Penicillium funiculosum

51,5

32,8 ± 1,0

47,8

30,4 ± 1,4

0

0

М-1 Metarhizium sp .

42,0

26,7 ± 0,3

43,9

27,9 ± 1,6

0

0

Конкуренцию за площадь питания и антибиоз проявили три штамма из рода Aspergillus (Av-1 Aspergillus versicolor , An-1 Aspergillus niger и Af-1 Aspergillus flavus ), шесть – из рода Penicillium (Pv-3 Penicillium verrucosum , Pk-1 Penicillium vermiculatum , Pbc-1 Penicillium brevi-compactum , Pp-1 Penicillium purpurescens , Pr-1 Penicillium rugulosum и M-24 Penicillium vermicula-tum ), а также штамм Tk-1 Trichoderma kon-ingii . При этом максимальную конкуренцию за площадь питания показал штамм Tk-1 Trichoderma koningii , заняв 100 % площади среды, а максимальный антибиоз – штаммы Pr-1 Penicillium rugulosum и Av-1 Aspergillus versicolor при стерильной зоне 3,5 и 5,0 мм соответственно. Только конкуренция за площадь питания выявлена у штаммов SM-1 Sordaria macrospora , Pf-1 Penicillium funiculosum и М-1 Metarhizium sp . , которые заняли от 42,0 до 97,8 % поверхности питательной среды, когда патоген при этом зарос всего на 2,1–47,8 %.

Таким образом, на двух питательных средах: КСА и Рудакова, выделено 26 перспективных грибных штаммов, проявивших антагонистическую активность к возбудителю фомоза рапса озимого с разными типами действия, для проведения вторичного скрининга на фоне искусственного заражения в лабораторных условиях во влажной камере.

Заключение. В результате первичного скрининга грибных штаммов антагонистов из рабочей коллекции лаборатории биометода агротехнологического отдела ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК в 2024 г. на средах КСА и Рудакова выделены перспективные штаммы грибов с разными типами антагонистической активности к возбудителю фомоза рапса озимого: конкуренция за площадь питания, гиперпаразитизм и антибиоз. При этом пять штаммов из рода Trichoderma (Т-1, Т-2, Т-3, Т-4 и Т-5 Trichoderma sp.) проявили тройной тип механизма антагонистической активности. Максимальный антибиоз установлен у штаммов Pv-3 Penicillium verrucosum, Pk-1 Penicillium vermiculatum, Pbc-1 Penicillium brevi-compactum, Pp-1 Penicillium pur-purescens, Av-1 Aspergillus versicolor, An-1 Aspergillus niger и Pr-1 Penicillium rugu-losum, максимальная гиперпаразитическая зона – у штаммов Xk-2 и Хk-3 Chaetomium globosum, Tr-1 Trichothecium roseum и И-3 Basidiomycota, а максимальная конкуренция за площадь питания – у штамма Tk-1 Trichoderma koningii. Только конкуренция за площадь питания выявлена у штаммов Sm-1 Sordaria macrospora, Pf-1 Penicillium funiculosum и М-1 Metarhizium sp. В дальнейшем выделенные штаммы будут оценены во вторичном скрининге на фоне искусственного заражения возбудителем фо-моза рапса озимого в лабораторных условиях во влажной камере и в грунте.

Список литературы Первичный скрининг коллекционных грибных штаммов антагонистов к возбудителю фомоза рапса озимого

  • Index Fungorum Data Bases: [Электронный ресурс]. - Режим доступа: https://www.indexfungorum.org/names/Names_Record.asp?RecordID=230154 (дата обращения: 29.10.2024).
  • Бочкарев Н.И., Пивень В.Т., Тишков Н.М. [и др.]. Защита рапса // Защита и карантин растений. - 2017. - № S1. - С. 3776. EDN: XQQWJV
  • Сердюк О.А., Трубина В.С., Горлова Л.А. Влияние внутренней инфекции на всхожесть и масличность семян масличных культур семейства капустные // Масличные культуры. - 2019. - Вып. 3 (179). -С.119-123.
  • Gomzhina M.M., Gasich E.L. Plenodomus species infecting oilseed rape in Russia // Plant Protection News. - 2022. -No. 105 (3). - P. 135-147.
  • Костин Н.К., Кузнецова А.А., Дудченко И.П. [и др.]. Видовой состав микромицетов, ассоциированных с растениями рапса озимого некоторых регионов России // Сб. тезисов докладов конф. "Генетические технологии в микробиологии и микробное разнообразие", Пущино, 06-08 декабря 2022 г. - С. 56-59. EDN: HSIUQG
  • Гасич Е.Д. Фомоз рапса (обзор литературы) // Вестник защиты растений. -2004. - № 1. - С. 11-24. EDN: YKUWZV
  • Маслиенко Л.В. Лаборатория биологических средств защиты растений (вчера, сегодня, завтра) // История научных исследований во ВНИИМКе за 90 лет. - Краснодар, 2002. - С. 191-197.
  • Егоров Н.С. Выделение микробов антагонистов и биологические методы учета их антибиотической активности. - М.: Изд-во Моск. ун-та, 1957. - 78 с.
  • Лысак В.В., Желдакова Р.А., Фомина О.В. Микробиология. Практикум: пособие. - Минск: БГУ, 2015. - 115 с.
  • Рудаков О.Л. Микофильные грибы, их биология и практическое значение. -М.: Наука, 1981. - 160 с. EDN: UAJMLR
Еще
Статья научная