Подбор информативных праймеров и оптимальных условий ПЦР для проведения ssr-анализа геномной ДНК сои селекции АОС ВНИИМК
Автор: Гучетль С.З., Фролов С.С., Кузнецова Е.С.
Рубрика: Селекция и семеноводство сельскохозяйственных растений
Статья в выпуске: 3 (175), 2018 года.
Бесплатный доступ
Одной из возможностей развития соевой отрасли в России является внедрение в селекционные программы современных биотехнологических подходов, основанных на использовании молекулярных маркеров. Так, для изучения генетического разнообразия информативным, воспроизводимым и сравнительно недорогим классом ДНК-маркеров являются микросателлитные (SSR) маркеры. Сорта сои АОС ВНИИМК не были исследованы по ДНК локусам. Необходимо было провести поиск SSR-праймеров, выявляющих полиморфизм фракций ДНК и оптимизацию температурных режимов амплификации ДНК для создания системы молекулярных маркеров для идентификации и паспортизации сортов, линий и гибридов сои селекции АОС ВНИИМК. Материалом для исследования служили пять сортов сои коллекции АОС ВНИИМК и один сорт коллекции ВНИИМК. Геномную ДНК выделяли из семядольных листьев этиолированных проростков сои с использованием СТАВ буфера. Для 16 пар SSR-праймеров подобраны оптимальные температуры отжига. Они варьировали от 48 до 60 оС...
Соя, сорта, днк, микросателлитные локусы
Короткий адрес: https://sciup.org/142216733
IDR: 142216733 | DOI: 10.25230/2412-608X-2018-3-175-28-33
Список литературы Подбор информативных праймеров и оптимальных условий ПЦР для проведения ssr-анализа геномной ДНК сои селекции АОС ВНИИМК
- Кривошлыков К.М., Рощина Е.Ю. Современные тенденции рынка сои в мире и России//Масличные культуры. Науч.-тех. бюл. ВНИИМК. -2016. -Вып. 2 (166). -С. 68-72.
- Зайцев Н.И., Бочкарёв Н.И., Зеленцов С.В. Перспективы и направления селекции сои в России в условиях реализации национальной стратегии импортозамещения//Масличные культуры. Науч.-тех. бюл. ВНИИМК. -2016. -№ 2. -С. 3-11.
- Брик А.Ф., Сиволап Ю.М. Молекулярно-генетический полиморфизм сои, детектированный ПП-ПЦР, SSRP и ISSR//Цитология и генетика. -2001. -№ 5. -С. 3-9.
- Рамазанова С.А., Гучетль С.З., Челюстникова Т.А., Антонова Т.С. Идентификация сортов сои российской селекции на основе анализа микросателлитных (SSR) локусов ДНК//Масличные культуры. Науч.-тех. бюл. ВНИИМК. -2008. -№ 2 (139). -С. 56-58.
- Абугалиева С.И., Волкова Л.А., Нурланова А.А., Жанпеисова А.С., Туруспеков Е.К. ДНК-фин-герпринтинг сортов сои Казахстана с использованием микросателлитных маркеров//Биотехнология. Теория и практика. -2013. -№ 3. -С. 23-35.
- Bisen A., Khare D., Nair P.,Tripath N. SSR analysis of 38 genotypes of soybean (Glycine max (L.) Merr.) genetic diversity in India//Physiol. Mol. Biol. Plants. -2015. -V. 21 (1). -P. 109-115 DOI: 10.1007/s12298-014-0269-8
- Tantasawat P., Trongchuen J., Prajongjai T., Jenweerawat S. and Chaowiset W. SSR analysis of soybean (Glycine max (L.) Merr.) genetic relationship and variety identification in Thailand//Australian Journal of Crop Science. -2011.-V. 5 (3) -P. 283-290.
- Рамазанова С.А., Антонова Т.С. Использование микросателлитных локусов (SSR) ДНК для идентификации гибридов F1 сои//Труды Кубанского государственного аграрного университета. -2017. -№ 66. -С. 219-223.
- Рамазанова С.А., Гучетль С.З., Челюстникова Т.А., Антонова Т.С., Мошненко Е.В. Внутрисортовой полиморфизм сортов сои селекции ВНИИМК//Масличные культуры. Науч.-тех. бюл. ВНИИМК. -2009. -№ 2 (141). -С. 96-98.
- Леонова И.Н. Молекулярные маркеры: использование в селекции зерновых культур для идентификации, интрогрессии и пирамидирования генов//Вавиловский журнал генетики и селекции. -2013. -Т. 17. -№ 2. -С. 314-325.
- Гучетль С.З., Фролов С.С., Зайцев Р.Н., Кузнецова Е.С. Паспортизация линий и гибридов подсолнечника селекции Армавирской опытной станции ВНИИМК: подбор оптимальных ДНК локусов и условий ПЦР//Масличные культуры. Науч.-тех. бюл. ВНИИМК. -2017. -№ 3 (171). -С. 23-28.
- Гучетль С.З., Челюстникова Т.А., Антонова Т.С., Бочковой А.Д. ДНК-генотипирование на основе RAPD-и SSR-маркеров: апробирование и подбор оптимальных условий для Helianthus annuus L.//Наука Кубани. -2007. -№ 2. -С. 44-46.
- Saghai-Maroof M.A., Soliman K.M., Jorgensen R A., Allard R.W. Ribosomal DNA spacer-length polymorphisms in barley: Mendelian inheritance, chromosomal location, and population dynamics//PNAS USA. -1984. -V. 81. -P. 8014-8018.
- Cregan P.B., Jarvik T., Bush A.L., Shoemaker R.C., Lark K.G., Kahler A.L., Van Toai T.T., Lohnes D.G., Chung J., Specht J.E. An integrated genetic linkage map of soybean//Crop Science. -1999. -Vol. 39. -P. 1464-1490.
- Использование ПЦР-анализа в генетико-селекционных исследованиях: Научно-методи-ческое руководство/Под ред. Сиволапа Ю.М. -Киев: Аграрна наука, 1998. -156 с.
- Айала Ф., Дж. Кайгер. Современная генетика. -М.: Мир, 1988. -Т. 3. -332 с.
- Рамазанова С.А. Идентификация сортов сои (Glycine max L.) с использованием микросателлитных локусов ДНК//Масличные культуры. Науч.-тех. бюл. ВНИИМК. -2016. -Вып. 2 (166). -С. 63-67.
