Подбор праймеров и зонда для амплификации участка гена В646L вируса АЧС
Автор: Фролов Г.С., Канашкина Е.В., Равилов Р.Х., Галимзянов И.Г., Ефимова М.А., Закиров Т.М., Хамидуллина А.И.
Статья в выпуске: 3 т.255, 2023 года.
Бесплатный доступ
Африканская чума свиней (АЧС) - заразное вирусное заболевание свиней, характеризующееся лихорадкой, гиперемией кожи, множественными кровоизлияниями во внутренние органы, атаксией, тяжелой депрессией и высокой смертностью в острых случаях. Совершенствование методов диагностики вируса АЧС является одним из важнейших этапов в борьбе и профилактике этого заболевания. Наряду с рутинными методами диагностики, такими как выделение, РГАД, РИФ, разработанная в последние годы ПЦР в реальном времени, широко используется для диагностики в лабораториях различного уровня, благодаря ее эффективности, высокой чувствительности и специфичности. В связи с тем, что новые вирусные изоляты демонстрируют новые генетические модели, необходим редизайн праймеров, чтобы иметь возможность обнаруживать распространенные, в настоящее время, генотипы вируса АЧС. Разработаны праймеры и зонд для гена B646L вируса АЧС, кодирующего р72 мажорный белок капсида. Праймеры оптимизированы на основе термодинамических параметров и вторичной структуры для высокой эффективности амплификации. Результаты проверки специфичности разработанных праймеров в базе данных GenBank показали, что сконструированные олигонуклеотиды в подавляющем большинстве случаев были комплементарны гену B646L вируса АЧС.
Вирус африканской чумы свиней, олигонуклеотидные праймеры
Короткий адрес: https://sciup.org/142238551
IDR: 142238551 | DOI: 10.31588/2413_4201_1883_2_255_350
Список литературы Подбор праймеров и зонда для амплификации участка гена В646L вируса АЧС
- Ефимова, М. А. Анализ иммунодоминантных пептидов вируса африканской чумы свиней для конструирования кандидатных вакцин / М. А. Ефимова, А. Г. Галеева, А. И. Хамидуллина, Р. Х. Равилов // Аграрная наука. - 2023. - № 3. - С. 40-45.
- Колбасов, Д. В. Африканская чума свиней: создание вакцины актуально / Д. В. Колбасов // Животноводство России. - 2020. - № 7. - С. 29-33.
- Нефедьева, М. В. Анализ иммуномодулирующих белков вируса африканской чумы свиней / М. В. Нефедьева, И. А. Титов, К. А. Мима, А. С. Малоголовкин // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. -2019. - № 1. - С. 42-48.
- Хисамутдинов, А. Г. Эпизоотическая ситуация по туберкулезу крупного рогатого скота в Республике Татарстан / А. Г. Хисамутдинов, Д. Н. Мингалеев, Р. Х. Равилов [и др.] // Ученые записки Казанской государственной академии ветеринарной медицины им. Н.Э. Баумана. - 2018. - Т. 234. - № 2. - С. 2112 1 7.
- Flannery, J. Identification of novel testing matrices for African swine fever surveillance /j. Flannery, M. Ashby, R. Moore, S. Wells, P. Rajko-Nenow, C. L.Netherton [et al.] //j. Vet. Diagn.Invest. - 2020. - V. 32(6). - P. 961-963.
- Hwang, H. J. Development and validation of a fast quantitative real-time PCR assay for the detection of African swine fever viru s / H. J. Hwang, Y.S. Choi, K. Song, M. Frant, J.H. Kim // Front. Vet. Sci. - 2023. -V. 4. -P. 9:1037728.
- Luo, Y. Development of an updated PCR assay for detection of African swine fever virus / Y. Luo, S. A. Atim, L. Shao, C. Ayebazibwe, Y. Sun, Y. Liu [et al.] // Arch Virol. - 2017. - V. 162(1). - P. 191-199.
- Ravilov, R. K. Viralvectorvac ci n esagainstASF: problemsandprospectives / R. K. Ravilov, A. A. Rizvanov, D. N. Mingaleev, E. Y. Zakirova [et al.] // FrontiersinVeterinaryScience. - 2022. - Т. 9. -P. 830244.
- Yin, D. Development of RealTime PCR Based on A137R Gene for the Detection of African Swine Fever Virus. / D. Yin, R. Geng, H. Lv, C. Bao, H. Shao, J. Ye, K. Qian and A. Qin // Front. Vet. Sci. - 2021. - V. 8. - P. 753-967.
