Полиморфизм гена IL-6 у больных COVID-19 русских Челябинской области

Автор: Беляева Светлана Валерьевна, Сташкевич Дарья Сергеевна, Баландина Светлана Эдуардовна, Мякотина Дарья Эдуардовна

Журнал: Вестник Челябинского государственного университета. Образование и здравоохранение @vestnik-csu-obrazovaniye-i-zdravookhraneniye

Рубрика: Экспериментальные материалы

Статья в выпуске: 4 (20), 2022 года.

Бесплатный доступ

Пандемия, связанная с коронавирусом тяжелого острого респираторного синдрома - 2 (SARSCoV-2), вызвавшим вспышку коронавирусной болезни 2019 года (COVID-19), стала серьезной проблемой общественного здравоохранения во всем мире. Известно, что генетические факторы хозяина ассоциированы с тяжестью течения COVID-19. Обнаружение различий между бессимптомными и тяжелобольными пациентами с COVID-19 способствует более широкому пониманию этого заболевания и может помочь в разработке новых методов лечения. Интерлейкин-6 (IL-6) представляет собой многофункциональный цитокин, секретируемый многими типами клеток, включая моноциты/макрофаги, дендритные клетки, фибробласты, эндотелиальные клетки, Ви Т-клетки, в ответ на воспалительные стимулы и вирусные инфекции. IL-6 играет ключевую роль в обострении воспалительной реакции при инфекции SARS-CoV-2. Повышенные концентрации IL-6 и других цитокинов в сыворотке крови являются признаками тяжелого течения COVID-19. Различные эффекты IL-6 связаны с концентрацией цитокина, определяемой полиморфизмами гена. В данном исследовании мы провели сравнение распределения аллелей и генотипов гена IL-6 у больных с разными формами тяжести течения туберкулеза COVID-19. Были использованы следующие методы: выделение образцов ДНК из цельной крови, проведение генотипирования исследуемых полиморфизмов генов с помощью полимеразно-цепной реакции и электрофорез в агарозном геле. Мы установили, что у больных с легкой формой понижена частота генотипа G/G, отвечающего за высокий уровень продукции цитокина, в сравнении с больными с более тяжелым течением. С группой больных с тяжелой формой различия находятся на уровне тенденции.

Еще

Интерлейкин-6 (il-6), полиморфизмы гена, биомаркеры covid-19

Короткий адрес: https://sciup.org/170197188

IDR: 170197188   |   DOI: 10.24411/2409-4102-2022-10401

Текст научной статьи Полиморфизм гена IL-6 у больных COVID-19 русских Челябинской области

Коронавирусная болезнь 2019 года (COVID-19) представляет собой инфекционное респираторное заболевание, вызванное коронавирусом тяжелого острого респираторного синдрома — 2 (SARS-CoV-2), быстро распространяющимся РНК-вирусом [1]. По данным ВOЗ вирус привел к более 400 млн подтвержденных случаев заражения и более 6 млн смертельных случаев [2]. В настоящее время ведется поиск потенциальных биомаркеров заболевания, которые повысят эффективность ранней диагностики, а также позволят разрабатывать методики лечения и предупреждения распространения COVID-19.

Патофизиологический процесс, лежащий в основе COVID-19, характеризуется усиленным иммунным ответом хозяина и повышенным уровнем циркулирующих провоспалительных цитокинов, включая IL-6 [3]. IL-6 представляет собой цитокин с плейотропными функциями, варьирующими от гемопоэза и регуляции метаболизма до воспаления, аутоиммунитета и реакций острой фазы [4]. IL-6 в значительной степени способствует нарушению регуляции иммунного ответа при COVID-19, в основном действуя в двух направлениях: с одной стороны, он может снижать цитолиз, нарушая выработку IFNγ, тем самым ослабляя противовирусную защиту; с другой сторо- ны, он может ингибировать дифференцировку регуляторных Т-клеток, вызывать стимулирование ответа Th2, а также вызывать Th17-подобную поляризацию CD4+ Т-клеток, что приводит к неконтролируемому гипервоспалению [5]. IL-6 играет решающую роль в иммунопатогенезе COVID-19, что подтверждается данными многочисленных исследований, сообщающих о повышении концентрации этого цитокина в сыворотке, прежде всего, в тяжелых случаях [5].

Различные эффекты IL-6 связаны с концентрацией цитокина, определяемой полиморфизмами гена. Ген, кодирующий IL-6, расположен на хромосоме 7p21. В настоящее время широко исследуется полиморфизм в промоторной области гена IL-6 (–174)*C/G, который приводит к замене гуанина (G) на цитозин (С) в позиции –174. Согласно литературным данным, аллель G отвечает за более высокую продукцию IL-6, в то время как гомозиготность по аллелю С (генотип С/С) — за низкую [6]. Полиморфизмы гена IL-6, связанные с уровнями IL-6 в сыворотке, ассоциированы с неблагоприятными клиническими последствиями COVID-19, включая госпитализацию в отделение интенсивной терапии (ОИТ), острый респираторный дистресс-синдром (ОРДС) и смерть [7]. Таким образом, изучение полиморфизмов гена IL-6 может дать представление о межиндивидуальных вариациях риска заболевания и лежащего в его основе патогенеза.

Цель работы

Оценить особенности частоты встречаемости полиморфизма гена IL-6 у больных COVID-19 русских Челябинской области.

Материалы и методы

Исследуемую группу составили 124 больных COVID-19 русской национальности — пациенты противоковидных больниц города Челябинска. В контрольной выборке — 218 потенциально здоровых донора ГБУЗ «Челябинская областная станция переливания крови» русской популяции. Популяционная принадлежность определялась по данным генеалогического анамнеза до третьего поколения (согласно рекомендациям 8-го Международного симпозиума в 1980 г., Лос-Анджелес, США). Для сравнительного анализа между больными с разными формами COVID-19 мы разделили больных на 3 группы по тяжести течения заболевания. Больные в группах со средней и высокой степенью тяжести имели двустороннюю пневмонию (по данным компьютерной томографии подтверждена 1-2-я степень поражения легких). Больные с легкой формой имели антитела (без вакцинации), но не имели выраженных клинических признаков заболевания.

В качестве биологического материала для исследования использовалась венозная кровь, взятая в пробирки с 0,5 %-м раствором калиевой соли этилендиаминтетрауксусной кислоты (ЭДТА). Выделение ДНК проводили с использованием реагентов PROTRANS DNA Box 500 согласно инструкции производителя (Protrans, Germany).

Для выявления SNP IL-6 (–174)*C/G выполняли аллель-специфическую полимеразную цепную реакцию (ПЦР) с реактивами ООО НПФ «Литех» (г. Москва). Для амплификации использовали прибор «Терцик» НПФ «ДНК-Технология». Интерпретацию результатов проводили с помощью электрофоретической детекции в 3 %-м агарозном геле.

Статистическая обработка

Для расчета достоверности различий по частоте встречаемости аллельных вариантов, генотипов между группами русских здоровых и больных COVID-19 использовали программу PAST (v. 3.16; Hammer et al., 2001), в которой проводилась оценка критерия Пирсона χ 2 с помощью анализа четырехпольной таблицы. Вероятность возникновения признака в исследуемой группе в зависимости от носительства определенного аллельного варианта, генотипа оценивали критерием отношения шансов (OR) с расчетом 95 %-го доверительного интервала (ДИ). Оценка достоверности различий в распределении частот аллелей и генотипов и соответствие закону Харди-Вайнберга проводились с использованием онлайн-приложения SNPStats.

Во всех случаях различия считали статистически значимыми при р ≤ 0,05, незначимыми при р > 0,10, для промежуточных значений р (0,05 < р ≤ 0,10) обсуждали тенденцию к различиям.

Результаты

На первом этапе нами был проведен анализ частоты встречаемости полиморфизма гена IL-6 (–174)*G/C в группе больных COVID-19 и здоровых русских Челябинской области (табл. 1). Достоверных различий между группами больных и контрольной не было обнаружено.

Таблица 1

IL-6 (–174)*G/C

Больные COVID-19 N = 124

Контрольная группа N = 218

χ²

p-Value

OR

CI

N

%

N

%

Аллели

G

133

53,6

216

49,5

1,057

0,304

1,177

0,862

1,610

C

115

46,4

220

50,5

1,057

0,304

0,849

0,621

1,160

Генотипы

G/G

38

30,6

54

24,7

1,387

0,239

1,342

0,822

2,191

G/C

57

45,9

108

49,5

0,404

0,525

0,866

0,557

1,348

C/C

29

23,3

56

25,6

0,224

0,636

0,883

0,527

1,478

Анализ распределения частот аллелей и генотипов гена IL-6 (–174)*G/C в группах больных COVID-19 и здоровых русских Челябинской области

На следующем этапе мы провели сравнительный анализ частоты встречаемости полиморфизма гена IL-6 (–174)*G/C среди больных COVID-19 и контрольной группы с учетом половой принадлежности.

При проведении сравнительного анализа распределения аллелей и генотипов гена IL-6 (–174)*G/C у женщин достоверные различия между группами больных и контрольной не были обнаружены. Результаты представлены в таблице 2.

Таблица 2

Анализ распределения частот аллелей и генотипов гена IL-6 (–174)*G/C в группах больных COVID-19 и здоровых русских Челябинской области с учетом принадлежности к женскому полу

IL-6 (–174)*G/C

Больные COVID-19 N = 60

Контрольная группа N = 89

χ²

p-Value

OR

CI

N

%

N

%

Аллели

G

64

53,3

87

48,8

0,570

0,451

1,195

0,752

1,901

C

56

46,6

91

51,1

0,570

0,451

0,836

0,526

1,330

Генотипы

G/G

18

30

21

23,5

0,761

0,384

1,388

0,664

2,902

G/C

28

46,6

45

50,5

0,218

0,641

0,856

0,444

1,648

C/C

14

23,4

23

25,8

0,121

0,729

0,873

0,407

1,874

При проведении сравнительного анализа распределения аллелей и генотипов гена IL-6 (–174)*G/C у мужчин достоверные различия между группами больных и контрольной не были обнаружены. Результаты представлены в таблице 3.

На третьем этапе мы провели сравнение частоты встречаемости аллелей и генотипов IL-6 (–174)*G/C в трех группах больных с разными формами COVID-19: больных с тяжелой, средней и легкой клиническими формами заболевания (данные представлены в таблице 4).

Таблица 3

Анализ распределения частот аллелей и генотипов гена IL-6 (–174)*G/C в группах больных COVID-19 и здоровых русских Челябинской области с учетом принадлежности к мужскому полу

IL-6 (–174)*G/C

Больные COVID-19 N = 64

Контрольная группа N = 129

χ²

p-Value

OR

CI

N

%

N

%

Аллели

G

69

53,9

129

50

0,522

0,469

1,169

0,764

1,788

С

59

46,1

129

50

0,522

0,469

0,855

0,559

1,307

Генотипы

G/G

20

31,2

33

25,5

0,690

0,407

1,322

0,683

2,559

G/С

29

45,3

63

48,8

0,213

0,645

0,868

0,476

1,584

С/С

15

23,4

33

25,5

0,105

0,746

0,891

0,442

1,795

У больных с тяжелой и средней формами преобладает аллель IL-6 (–174)*G (56 % и 55 %), а у больных с легкой, наоборот, аллель IL-6 (–174)*C (54 %), который снижает продукцию IL-6. Анализ распределения частот аллелей IL-6 (–174)*G/C у больных с различными формами COVID-19 до- стоверных различий не выявил. У больных с легкой формой понижена частота генотипа G/G в сравнении с больными с более тяжелым течением. С группой больных с тяжелой формой различия находятся на уровне тенденции (χ2 = 2,902; P= 0,0517, OR = 0,350, 95 % CI 0,101–1,206).

Таблица 4

Распределение аллелей и генотипов полиморфизма гена IL-6 (–174)*G/C в группах больных COVID-19 с различными клиническими формами заболевания

IL-6 (–174)*G/C

Тяжелая N = 44

Средняя N = 56

Легкая N = 24

N

%

N

%

N

%

Аллели

G

49

55,6

62

55,4

22

45,8

С

39

44,4

50

44,6

26

54,2

Генотипы

G/G

16

36,4

18

32,2

4

16,6

G/С

17

38,6

26

46,4

14

58,4

С/С

11

25

12

21,4

6

25

Обсуждение результатов

Имеющиеся данные свидетельствуют о том, что дисбаланс в продукции IL-6 может повлиять на три основных аспекта вирусной инфекции: во-первых, на элиминацию вируса, во-вторых, на устойчивость и распространение вируса и, наконец, на хроническую вирусную инфекцию [5]. Известно, что уровень продукции зависит в том числе от полиморфизмов гена IL-6.

На первом этапе нашего исследования был проведен анализ частоты встречаемости полиморфизма гена IL-6 (–174)*G/C в группе больных COVID-19 и здоровых русских Челябинской области. Оценив частоту встречаемости аллеля IL-6 (–174)*G, который ассоциирован с повышенной продукцией, в контрольной группе русских Челябинской области (49,5 %), мы установили, что она соответствует среднеевропейской [4]. Известно, что самая низкая частота встречаемости аллеля IL-6 (–174)*G — в финской популяции (19 %), а самая высокая — в японской и корейской популяциях (около 100 %) [4].

По данным литературы для женщин характерны более легкое течение и низкая смертность от заболевания COVID-19 по сравнению с мужчинами, что обусловлено генетическими, а также эндокринными факторами, влияющими на иммунный ответ. Поэтому мы провели сравнительный анализ частоты встречаемости полиморфизма гена IL-6 (–174)*G/C среди больных COVID-19 и контрольной группы с учетом половой принадлежности. При проведении сравнительного анализа распределения аллелей и генотипов гена IL-6 (–174)*G/C у женщин и мужчин достоверные различия между группами больных и контрольной не были обнаружены.

Исследования показывают, что во время вирусной инфекции IL-6 сверхэкспрессируется, и это может оказывать потенциально неблагоприятное воздействие на иммунный ответ против SARS-CoV-2. У пациентов с COVID-19 повышенные концентрации IL-6 в сыворотке коррелируют со степенью тяжести по данным КТ [5]. Основываясь на этих исследованиях, мы провели сравнение частоты встречаемости аллелей и генотипов IL-6 (–174)*G/C в трех группах больных с разными формами COVID-19: тяжелой, средней и легкой клиническими формами заболевания. У больных с тяжелой и средней формами преобладает аллель IL-6 (–174)*G и генотип G/G, которые отвечают за повышенную продукцию цитокина, а у больных с легкой, наоборот, аллель IL-6 (–174)*C, который снижает продукцию IL-6. У больных с легкой формой понижена частота генотипа G/G в сравнении с больными с более тяжелым течением, с группой больных с тяжелой формой различия находятся на уровне тенденции. Известно, что генотип IL-6 (–174)*G/G обуславливает повышенный уровень экспрессии IL-6, что наблюдается, прежде всего, у пациентов с тяжелыми случаями, и связано с прогрессированием ОРДС и риском смерти [7].

Заключение

В данной работе представлены результаты по ассоциации генетического полиморфизма гена IL-6 (–174)*G/C с COVID-19 у русских Челябинской области. Поиск информативных биомаркеров COVID-19 в направлении полиморфизмов, которые отличаются по этнической и расовой принадлежности, перспективно со стороны создания вакцин, лекарств, предупреждающих развитие инфекции и полностью исключающих ее распространение. Необходимо продолжить исследование генных полиморфизмов цитокинов, продукты которых участвуют в иммунном ответе на COVID-19, а также рассмотреть комбинации и межгенные взаимодействия, поскольку их совместное действие может иметь различные эф- фекты, что будет способствовать развитию новых взглядов на профилактические и терапевтические подходы к данному заболеванию.

Список литературы Полиморфизм гена IL-6 у больных COVID-19 русских Челябинской области

  • Muralidar S., Ambi S. V., Sekaran S., Krishnan U. M. The emergence of COVID-19 as a global pandemic: Understanding the epidemiology, immune response and potential therapeutic targets of SARS-CoV-2 // Biochimie. 2020. Vol. 179. P. 85-100.
  • Gusev E., Sarapultsev A., Solomatina L. [et al]. SARS-CoV-2-Speci c Immune Response and the Pathogenesis of COVID-19 // International journal of molecular sciences. 2022. Vol. 23. No. 3.
  • Paces J., Strizova Z., Smrz D., Cerny J. COVID-19 and the Immune System // Physiological Research. 2020. Vol. 69. No. 3. P. 379-388.
  • Hirano T. IL-6 in in ammation, autoimmunity and cancer // International Immunology. 2021. Vol. 33. No. 3. P. 127-148.
  • Gubernatorova E. O., Gorshkova E. A., Polinova A. I. [et al]. IL-6: Relevance for immunopathology of SARS-CoV-2 // Cytokine & growth factor reviews. 2020. Vol. 53. P. 13-24.
  • Kerget F., Kerget B. Frequency of Interleukin-6 rs1800795 (-174G/C) and rs1800797 (-597G/A) Polymorphisms in COVID-19 Patients in Turkey Who Develop Macrophage Activation Syndrome // Japanese Journal of Infectious Diseases. 2021. Vol. 74. No. 6. P. 543-548.
  • Smieszek S. P., Przychodzen B. P., Polymeropoulos V. M. [et al]. Assessing the potential correlation of polymorphisms in the IL-6R with relative IL-6 elevation in severely ill COVID-19 patients // Cytokine. 2021. Vol. 148.
Еще
Статья научная