Полиморфизм гена IL-6 у больных COVID-19 русских Челябинской области
Автор: Беляева Светлана Валерьевна, Сташкевич Дарья Сергеевна, Баландина Светлана Эдуардовна, Мякотина Дарья Эдуардовна
Рубрика: Экспериментальные материалы
Статья в выпуске: 4 (20), 2022 года.
Бесплатный доступ
Пандемия, связанная с коронавирусом тяжелого острого респираторного синдрома - 2 (SARSCoV-2), вызвавшим вспышку коронавирусной болезни 2019 года (COVID-19), стала серьезной проблемой общественного здравоохранения во всем мире. Известно, что генетические факторы хозяина ассоциированы с тяжестью течения COVID-19. Обнаружение различий между бессимптомными и тяжелобольными пациентами с COVID-19 способствует более широкому пониманию этого заболевания и может помочь в разработке новых методов лечения. Интерлейкин-6 (IL-6) представляет собой многофункциональный цитокин, секретируемый многими типами клеток, включая моноциты/макрофаги, дендритные клетки, фибробласты, эндотелиальные клетки, Ви Т-клетки, в ответ на воспалительные стимулы и вирусные инфекции. IL-6 играет ключевую роль в обострении воспалительной реакции при инфекции SARS-CoV-2. Повышенные концентрации IL-6 и других цитокинов в сыворотке крови являются признаками тяжелого течения COVID-19. Различные эффекты IL-6 связаны с концентрацией цитокина, определяемой полиморфизмами гена. В данном исследовании мы провели сравнение распределения аллелей и генотипов гена IL-6 у больных с разными формами тяжести течения туберкулеза COVID-19. Были использованы следующие методы: выделение образцов ДНК из цельной крови, проведение генотипирования исследуемых полиморфизмов генов с помощью полимеразно-цепной реакции и электрофорез в агарозном геле. Мы установили, что у больных с легкой формой понижена частота генотипа G/G, отвечающего за высокий уровень продукции цитокина, в сравнении с больными с более тяжелым течением. С группой больных с тяжелой формой различия находятся на уровне тенденции.
Интерлейкин-6 (il-6), полиморфизмы гена, биомаркеры covid-19
Короткий адрес: https://sciup.org/170197188
IDR: 170197188 | DOI: 10.24411/2409-4102-2022-10401
Текст научной статьи Полиморфизм гена IL-6 у больных COVID-19 русских Челябинской области
Коронавирусная болезнь 2019 года (COVID-19) представляет собой инфекционное респираторное заболевание, вызванное коронавирусом тяжелого острого респираторного синдрома — 2 (SARS-CoV-2), быстро распространяющимся РНК-вирусом [1]. По данным ВOЗ вирус привел к более 400 млн подтвержденных случаев заражения и более 6 млн смертельных случаев [2]. В настоящее время ведется поиск потенциальных биомаркеров заболевания, которые повысят эффективность ранней диагностики, а также позволят разрабатывать методики лечения и предупреждения распространения COVID-19.
Патофизиологический процесс, лежащий в основе COVID-19, характеризуется усиленным иммунным ответом хозяина и повышенным уровнем циркулирующих провоспалительных цитокинов, включая IL-6 [3]. IL-6 представляет собой цитокин с плейотропными функциями, варьирующими от гемопоэза и регуляции метаболизма до воспаления, аутоиммунитета и реакций острой фазы [4]. IL-6 в значительной степени способствует нарушению регуляции иммунного ответа при COVID-19, в основном действуя в двух направлениях: с одной стороны, он может снижать цитолиз, нарушая выработку IFNγ, тем самым ослабляя противовирусную защиту; с другой сторо- ны, он может ингибировать дифференцировку регуляторных Т-клеток, вызывать стимулирование ответа Th2, а также вызывать Th17-подобную поляризацию CD4+ Т-клеток, что приводит к неконтролируемому гипервоспалению [5]. IL-6 играет решающую роль в иммунопатогенезе COVID-19, что подтверждается данными многочисленных исследований, сообщающих о повышении концентрации этого цитокина в сыворотке, прежде всего, в тяжелых случаях [5].
Различные эффекты IL-6 связаны с концентрацией цитокина, определяемой полиморфизмами гена. Ген, кодирующий IL-6, расположен на хромосоме 7p21. В настоящее время широко исследуется полиморфизм в промоторной области гена IL-6 (–174)*C/G, который приводит к замене гуанина (G) на цитозин (С) в позиции –174. Согласно литературным данным, аллель G отвечает за более высокую продукцию IL-6, в то время как гомозиготность по аллелю С (генотип С/С) — за низкую [6]. Полиморфизмы гена IL-6, связанные с уровнями IL-6 в сыворотке, ассоциированы с неблагоприятными клиническими последствиями COVID-19, включая госпитализацию в отделение интенсивной терапии (ОИТ), острый респираторный дистресс-синдром (ОРДС) и смерть [7]. Таким образом, изучение полиморфизмов гена IL-6 может дать представление о межиндивидуальных вариациях риска заболевания и лежащего в его основе патогенеза.
Цель работы
Оценить особенности частоты встречаемости полиморфизма гена IL-6 у больных COVID-19 русских Челябинской области.
Материалы и методы
Исследуемую группу составили 124 больных COVID-19 русской национальности — пациенты противоковидных больниц города Челябинска. В контрольной выборке — 218 потенциально здоровых донора ГБУЗ «Челябинская областная станция переливания крови» русской популяции. Популяционная принадлежность определялась по данным генеалогического анамнеза до третьего поколения (согласно рекомендациям 8-го Международного симпозиума в 1980 г., Лос-Анджелес, США). Для сравнительного анализа между больными с разными формами COVID-19 мы разделили больных на 3 группы по тяжести течения заболевания. Больные в группах со средней и высокой степенью тяжести имели двустороннюю пневмонию (по данным компьютерной томографии подтверждена 1-2-я степень поражения легких). Больные с легкой формой имели антитела (без вакцинации), но не имели выраженных клинических признаков заболевания.
В качестве биологического материала для исследования использовалась венозная кровь, взятая в пробирки с 0,5 %-м раствором калиевой соли этилендиаминтетрауксусной кислоты (ЭДТА). Выделение ДНК проводили с использованием реагентов PROTRANS DNA Box 500 согласно инструкции производителя (Protrans, Germany).
Для выявления SNP IL-6 (–174)*C/G выполняли аллель-специфическую полимеразную цепную реакцию (ПЦР) с реактивами ООО НПФ «Литех» (г. Москва). Для амплификации использовали прибор «Терцик» НПФ «ДНК-Технология». Интерпретацию результатов проводили с помощью электрофоретической детекции в 3 %-м агарозном геле.
Статистическая обработка
Для расчета достоверности различий по частоте встречаемости аллельных вариантов, генотипов между группами русских здоровых и больных COVID-19 использовали программу PAST (v. 3.16; Hammer et al., 2001), в которой проводилась оценка критерия Пирсона χ 2 с помощью анализа четырехпольной таблицы. Вероятность возникновения признака в исследуемой группе в зависимости от носительства определенного аллельного варианта, генотипа оценивали критерием отношения шансов (OR) с расчетом 95 %-го доверительного интервала (ДИ). Оценка достоверности различий в распределении частот аллелей и генотипов и соответствие закону Харди-Вайнберга проводились с использованием онлайн-приложения SNPStats.
Во всех случаях различия считали статистически значимыми при р ≤ 0,05, незначимыми при р > 0,10, для промежуточных значений р (0,05 < р ≤ 0,10) обсуждали тенденцию к различиям.
Результаты
На первом этапе нами был проведен анализ частоты встречаемости полиморфизма гена IL-6 (–174)*G/C в группе больных COVID-19 и здоровых русских Челябинской области (табл. 1). Достоверных различий между группами больных и контрольной не было обнаружено.
Таблица 1
IL-6 (–174)*G/C |
Больные COVID-19 N = 124 |
Контрольная группа N = 218 |
χ² |
p-Value |
OR |
CI |
|||
N |
% |
N |
% |
||||||
Аллели |
|||||||||
G |
133 |
53,6 |
216 |
49,5 |
1,057 |
0,304 |
1,177 |
0,862 |
1,610 |
C |
115 |
46,4 |
220 |
50,5 |
1,057 |
0,304 |
0,849 |
0,621 |
1,160 |
Генотипы |
|||||||||
G/G |
38 |
30,6 |
54 |
24,7 |
1,387 |
0,239 |
1,342 |
0,822 |
2,191 |
G/C |
57 |
45,9 |
108 |
49,5 |
0,404 |
0,525 |
0,866 |
0,557 |
1,348 |
C/C |
29 |
23,3 |
56 |
25,6 |
0,224 |
0,636 |
0,883 |
0,527 |
1,478 |
Анализ распределения частот аллелей и генотипов гена IL-6 (–174)*G/C в группах больных COVID-19 и здоровых русских Челябинской области
На следующем этапе мы провели сравнительный анализ частоты встречаемости полиморфизма гена IL-6 (–174)*G/C среди больных COVID-19 и контрольной группы с учетом половой принадлежности.
При проведении сравнительного анализа распределения аллелей и генотипов гена IL-6 (–174)*G/C у женщин достоверные различия между группами больных и контрольной не были обнаружены. Результаты представлены в таблице 2.
Таблица 2
Анализ распределения частот аллелей и генотипов гена IL-6 (–174)*G/C в группах больных COVID-19 и здоровых русских Челябинской области с учетом принадлежности к женскому полу
IL-6 (–174)*G/C |
Больные COVID-19 N = 60 |
Контрольная группа N = 89 |
χ² |
p-Value |
OR |
CI |
|||
N |
% |
N |
% |
||||||
Аллели |
|||||||||
G |
64 |
53,3 |
87 |
48,8 |
0,570 |
0,451 |
1,195 |
0,752 |
1,901 |
C |
56 |
46,6 |
91 |
51,1 |
0,570 |
0,451 |
0,836 |
0,526 |
1,330 |
Генотипы |
|||||||||
G/G |
18 |
30 |
21 |
23,5 |
0,761 |
0,384 |
1,388 |
0,664 |
2,902 |
G/C |
28 |
46,6 |
45 |
50,5 |
0,218 |
0,641 |
0,856 |
0,444 |
1,648 |
C/C |
14 |
23,4 |
23 |
25,8 |
0,121 |
0,729 |
0,873 |
0,407 |
1,874 |
При проведении сравнительного анализа распределения аллелей и генотипов гена IL-6 (–174)*G/C у мужчин достоверные различия между группами больных и контрольной не были обнаружены. Результаты представлены в таблице 3.
На третьем этапе мы провели сравнение частоты встречаемости аллелей и генотипов IL-6 (–174)*G/C в трех группах больных с разными формами COVID-19: больных с тяжелой, средней и легкой клиническими формами заболевания (данные представлены в таблице 4).
Таблица 3
Анализ распределения частот аллелей и генотипов гена IL-6 (–174)*G/C в группах больных COVID-19 и здоровых русских Челябинской области с учетом принадлежности к мужскому полу
IL-6 (–174)*G/C |
Больные COVID-19 N = 64 |
Контрольная группа N = 129 |
χ² |
p-Value |
OR |
CI |
|||
N |
% |
N |
% |
||||||
Аллели |
|||||||||
G |
69 |
53,9 |
129 |
50 |
0,522 |
0,469 |
1,169 |
0,764 |
1,788 |
С |
59 |
46,1 |
129 |
50 |
0,522 |
0,469 |
0,855 |
0,559 |
1,307 |
Генотипы |
|||||||||
G/G |
20 |
31,2 |
33 |
25,5 |
0,690 |
0,407 |
1,322 |
0,683 |
2,559 |
G/С |
29 |
45,3 |
63 |
48,8 |
0,213 |
0,645 |
0,868 |
0,476 |
1,584 |
С/С |
15 |
23,4 |
33 |
25,5 |
0,105 |
0,746 |
0,891 |
0,442 |
1,795 |
У больных с тяжелой и средней формами преобладает аллель IL-6 (–174)*G (56 % и 55 %), а у больных с легкой, наоборот, аллель IL-6 (–174)*C (54 %), который снижает продукцию IL-6. Анализ распределения частот аллелей IL-6 (–174)*G/C у больных с различными формами COVID-19 до- стоверных различий не выявил. У больных с легкой формой понижена частота генотипа G/G в сравнении с больными с более тяжелым течением. С группой больных с тяжелой формой различия находятся на уровне тенденции (χ2 = 2,902; P= 0,0517, OR = 0,350, 95 % CI 0,101–1,206).
Таблица 4
Распределение аллелей и генотипов полиморфизма гена IL-6 (–174)*G/C в группах больных COVID-19 с различными клиническими формами заболевания
IL-6 (–174)*G/C |
Тяжелая N = 44 |
Средняя N = 56 |
Легкая N = 24 |
|||
N |
% |
N |
% |
N |
% |
|
Аллели |
||||||
G |
49 |
55,6 |
62 |
55,4 |
22 |
45,8 |
С |
39 |
44,4 |
50 |
44,6 |
26 |
54,2 |
Генотипы |
||||||
G/G |
16 |
36,4 |
18 |
32,2 |
4 |
16,6 |
G/С |
17 |
38,6 |
26 |
46,4 |
14 |
58,4 |
С/С |
11 |
25 |
12 |
21,4 |
6 |
25 |
Обсуждение результатов
Имеющиеся данные свидетельствуют о том, что дисбаланс в продукции IL-6 может повлиять на три основных аспекта вирусной инфекции: во-первых, на элиминацию вируса, во-вторых, на устойчивость и распространение вируса и, наконец, на хроническую вирусную инфекцию [5]. Известно, что уровень продукции зависит в том числе от полиморфизмов гена IL-6.
На первом этапе нашего исследования был проведен анализ частоты встречаемости полиморфизма гена IL-6 (–174)*G/C в группе больных COVID-19 и здоровых русских Челябинской области. Оценив частоту встречаемости аллеля IL-6 (–174)*G, который ассоциирован с повышенной продукцией, в контрольной группе русских Челябинской области (49,5 %), мы установили, что она соответствует среднеевропейской [4]. Известно, что самая низкая частота встречаемости аллеля IL-6 (–174)*G — в финской популяции (19 %), а самая высокая — в японской и корейской популяциях (около 100 %) [4].
По данным литературы для женщин характерны более легкое течение и низкая смертность от заболевания COVID-19 по сравнению с мужчинами, что обусловлено генетическими, а также эндокринными факторами, влияющими на иммунный ответ. Поэтому мы провели сравнительный анализ частоты встречаемости полиморфизма гена IL-6 (–174)*G/C среди больных COVID-19 и контрольной группы с учетом половой принадлежности. При проведении сравнительного анализа распределения аллелей и генотипов гена IL-6 (–174)*G/C у женщин и мужчин достоверные различия между группами больных и контрольной не были обнаружены.
Исследования показывают, что во время вирусной инфекции IL-6 сверхэкспрессируется, и это может оказывать потенциально неблагоприятное воздействие на иммунный ответ против SARS-CoV-2. У пациентов с COVID-19 повышенные концентрации IL-6 в сыворотке коррелируют со степенью тяжести по данным КТ [5]. Основываясь на этих исследованиях, мы провели сравнение частоты встречаемости аллелей и генотипов IL-6 (–174)*G/C в трех группах больных с разными формами COVID-19: тяжелой, средней и легкой клиническими формами заболевания. У больных с тяжелой и средней формами преобладает аллель IL-6 (–174)*G и генотип G/G, которые отвечают за повышенную продукцию цитокина, а у больных с легкой, наоборот, аллель IL-6 (–174)*C, который снижает продукцию IL-6. У больных с легкой формой понижена частота генотипа G/G в сравнении с больными с более тяжелым течением, с группой больных с тяжелой формой различия находятся на уровне тенденции. Известно, что генотип IL-6 (–174)*G/G обуславливает повышенный уровень экспрессии IL-6, что наблюдается, прежде всего, у пациентов с тяжелыми случаями, и связано с прогрессированием ОРДС и риском смерти [7].
Заключение
В данной работе представлены результаты по ассоциации генетического полиморфизма гена IL-6 (–174)*G/C с COVID-19 у русских Челябинской области. Поиск информативных биомаркеров COVID-19 в направлении полиморфизмов, которые отличаются по этнической и расовой принадлежности, перспективно со стороны создания вакцин, лекарств, предупреждающих развитие инфекции и полностью исключающих ее распространение. Необходимо продолжить исследование генных полиморфизмов цитокинов, продукты которых участвуют в иммунном ответе на COVID-19, а также рассмотреть комбинации и межгенные взаимодействия, поскольку их совместное действие может иметь различные эф- фекты, что будет способствовать развитию новых взглядов на профилактические и терапевтические подходы к данному заболеванию.
Список литературы Полиморфизм гена IL-6 у больных COVID-19 русских Челябинской области
- Muralidar S., Ambi S. V., Sekaran S., Krishnan U. M. The emergence of COVID-19 as a global pandemic: Understanding the epidemiology, immune response and potential therapeutic targets of SARS-CoV-2 // Biochimie. 2020. Vol. 179. P. 85-100.
- Gusev E., Sarapultsev A., Solomatina L. [et al]. SARS-CoV-2-Speci c Immune Response and the Pathogenesis of COVID-19 // International journal of molecular sciences. 2022. Vol. 23. No. 3.
- Paces J., Strizova Z., Smrz D., Cerny J. COVID-19 and the Immune System // Physiological Research. 2020. Vol. 69. No. 3. P. 379-388.
- Hirano T. IL-6 in in ammation, autoimmunity and cancer // International Immunology. 2021. Vol. 33. No. 3. P. 127-148.
- Gubernatorova E. O., Gorshkova E. A., Polinova A. I. [et al]. IL-6: Relevance for immunopathology of SARS-CoV-2 // Cytokine & growth factor reviews. 2020. Vol. 53. P. 13-24.
- Kerget F., Kerget B. Frequency of Interleukin-6 rs1800795 (-174G/C) and rs1800797 (-597G/A) Polymorphisms in COVID-19 Patients in Turkey Who Develop Macrophage Activation Syndrome // Japanese Journal of Infectious Diseases. 2021. Vol. 74. No. 6. P. 543-548.
- Smieszek S. P., Przychodzen B. P., Polymeropoulos V. M. [et al]. Assessing the potential correlation of polymorphisms in the IL-6R with relative IL-6 elevation in severely ill COVID-19 patients // Cytokine. 2021. Vol. 148.