Полиморфизмы гена HSTN и показатели молочной продуктивности у коров голштинской породы

Автор: Макаров Д.О., Сенина Р.Ю., Калашникова Л.А.

Журнал: Биология в сельском хозяйстве @biology-in-agriculture

Рубрика: Актуальные вопросы зоотехнии и ветеринарии

Статья в выпуске: 2 (51), 2026 года.

Бесплатный доступ

Проведен анализ ассоциации однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) гена гистатерина (HSTN) с признаками молочной продуктивности у коров голштинской породы (n=37). Цель работы заключалась в оценке связи трех локусов HSTN344, HSTN517 и HSTN545 с удоем за 305 дней лактации, массовыми долями жира и белка в молоке, а также индексом соматических клеток (SCS), характеризующим состояние вымени. Дополнительно были определены частоты генотипов и аллелей по изученным полиморфизмам. При анализе отдельных SNP статистически значимое различие выявлено только по содержанию белка для локуса HSTN545, где у животных с генотипом AA показатель был выше, чем у носителей генотипа TA. Для локусов HSTN344 и HSTN517 устойчивых однолокусных ассоциаций с изученными признаками не установлено, хотя для HSTN517 в парном сравнении отмечено различие между генотипами TC и TT по SCS. Анализ сочетаний локусов показал, что оценка полиморфизмов HSTN более информативна на уровне комплексных генотипов. Для двулокусных комбинаций HSTN344TT/ HSTN545AA, HSTN545AA/HSTN517TC и HSTN545AA/ HSTN517TT отмечены более высокие значения белка, тогда как сочетание HSTN545TA/HSTN517TC характеризовалось более высоким удоем по сравнению с HSTN545AA/HSTN517TT. При трёхлокусном анализе наиболее высокие значения белка выявлены для комбинаций HSTN344TT/HSTN545AA/HSTN517TT и HSTN344TT/HSTN545AA/HSTN517TC. Вместе с тем интерпретация части различий ограничена малочисленностью отдельных генотипических классов. Таким образом, полученные данные свидетельствуют о том, что полиморфизмы гена HSTN у голштинского скота не проявляют устойчивого самостоятельного влияния на весь комплекс исследованных признаков, однако могут рассматриваться как дополнительные молекулярные маркеры, представляющие интерес для дальнейшей проверки на расширенных выборках.

Голштинская порода, hstn, snp, молочная продуктивность, содержание жира, содержание белка, индекс соматических клеток, ассоциативный анализ

Короткий адрес: https://sciup.org/147254642

IDR: 147254642   |   УДК: 636.2.034:636.2.082.2

HSTN gene polymorphisms and milk production traits in Holstein cows

An association analysis was performed to investigate the relationship between single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the histatherin gene (HSTN) and milk production traits in Holstein cows (n = 37). The aim of the study was to assess the association of three loci, HSTN344, HSTN517, and HSTN545, with 305-day milk yield, milk fat percentage, milk protein percentage, and somatic cell score (SCS) as an indicator of udder health. In addition, genotype and allele frequencies were determined for the polymorphisms under study. In the single-locus analysis, a statistically significant difference was detected only for milk protein percentage at the HSTN545 locus, where animals with the AA genotype showed higher values than carriers of the TA genotype. No stable single-locus associations with the studied traits were identified for HSTN344 or HSTN517, although a pairwise comparison for HSTN517 revealed a difference in SCS between the TC and TT genotypes. Analysis of locus combinations showed that the evaluation of HSTN polymorphisms was more informative at the level of complex genotypes. Among two-locus combinations, HSTN344TT/HSTN545AA, HSTN545AA/HSTN517TC, and HSTN545AA/HSTN517TT were associated with higher milk protein values, whereas the HSTN545TA/HSTN517TC combination was characterized by higher milk yield compared with HSTN545AA/HSTN517TT. In the three-locus analysis, the highest protein values were observed for the HSTN344TT/HSTN545AA/HSTN517TT and HSTN344TT/ HSTN545AA/HSTN517TC combinations. At the same time, the interpretation of some differences was limited by the small size of several genotype classes. Overall, the data indicate that HSTN polymorphisms in Holstein cattle do not exert a stable independent effect on the full set of traits examined, although they may be considered additional molecular markers requiring further validation in larger populations.

Текст научной статьи Полиморфизмы гена HSTN и показатели молочной продуктивности у коров голштинской породы

факторов, связанных с формированием хозяйственно ценных признаков у голштинского скота, представляет значительный интерес как для теоретических исследований, так и для практики племенной работы. Современные подходы к совершенствованию молоч- ного скота в возрастающей степени опираются на молекулярно-генетические методы, включая генотипирование и геномную оценку, что позволяет уточнять селекционную ценность животных уже на ранних этапах отбора [3-5].

Показатели молочной продуктивности относятся к сложным количественным признакам и формируются под влиянием совокупности наследственных и средовых факторов [6, 7]. В этой связи особое значение приобретают исследования генов-кандидатов, связанных с синтезом и составом молока, а также поиск геномных регионов, ассоциированных с технологическими и продуктивными признаками [8, 9]. Для разных популяций крупного рогатого скота показана информативность полиморфизмов генов молочных белков и других кандидатных локусов при оценке признаков молочной продуктивности, что подтверждает целесообразность дальнейшего изучения новых маркеров в конкретных породах и выборках [8-10].

Одним из генов, представляющих интерес в этом направлении, является ген HSTN, кодирующий гиста-терин, для которого описаны антимикробные свойства [10, 11]. По данным современных исследований, HSTN рассматривается как ген, потенциально связанный как с продуктивными характеристиками молока, так и с состоянием молочной железы [10-12]. Это делает обоснованным анализ полиморфизмов HSTN в связи с показателями удоя, содержанием основных компонентов молока и соматическими клетками у коров молочного направления продуктивности [1012].

При оценке молочной продуктивности важно учитывать, что удой, массовые доли жира и белка, а также показатели, характеризующие соматические клетки в молоке, отражают различные стороны биологии лактации и качества молочного сырья [6, 7, 13]. Показатели, основанные на содержании соматических клеток, широко используются при оценке состояния вымени и риска воспалительных процессов, в том числе субклинического мастита [13, 14]. На этом фоне исследование SNP гена HSTN у коров голштинской породы представляется актуальным и позволяет уточнить возможную связь данного гена с изменчивостью основных показателей молочной продуктивности. Целью настоящей работы явилась оценка ассоциаций полиморфизмов гена HSTN с продуктивными показателями у коров голштинской породы.

Материалы и методы исследвоаний. В исследование включили 37 коров голштинской породы одной популяции. Для каждой коровы имелись зоотехнические данные: удой за 305 дней U305, массовые доли жира GIR% и белка BELOK%, а также показатель соматических клеток, преобразованный в индекс SCS по формуле SCS = log2(SCC/100000) + 3. Вариабельность признаков описывали как среднее значение ± стандартная ошибка среднего M±SE.

Генотипирование проводили по трём SNP гена HSTN Histatherin: HSTN545 g.-866T>A rs109955918, HSTN344 g.11124T>G rs109805873, HSTN517 g.107T>C rs110175257. Амплификацию выполняли ПЦР со специфичными праймерами, далее проводили рестрикционный анализ ПДРФ с использованием эн- донуклеаз MfeI, TaqI и EcoRI с последующей электрофоретической верификацией наборов фрагментов. По характерным профилям фрагментов устанавливали генотипы животных.

Связь генотипов с фенотипическими признаками оценивали однофакторным дисперсионным анализом ANOVA по фактору «генотип» внутри породы. При неодинаковых дисперсиях и неравных численностях групп применяли вариант критерия Вэлча Welch ANOVA. Пост-хок сравнения выполняли тестом Games-Howell. Порог статистической значимости устанавливали на уровне p<0,05, значения p в диапазоне 0,05-0,10 интерпретировали как тенденции. Статистическую обработку проводили в R версии 4.5.0 с использованием пакетов rstatix, ggpubr, dplyr и car.

Для сопоставления с выборкой холмогорской породы n=89 использовали ту же панель SNP, идентичные процедуры генотипирования и один и тот же статистический протокол, что обеспечивает корректность межпородного сравнения в части используемых методов.

Результаты и обсуждения. Таблица 1 суммирует однолокусные сравнения по трём SNP HSTN у голштинов с учётом неравных численностей групп, где для HSTN344 представлены GG (n=6), TG (n=16) и TT (n=15), для HSTN545 - AA (n=17), TA (n=17) и TT (n=3), а для HSTN517 - CC (n=8), TC n=(14) и TT n=(15), и общие p-value по большинству признаков остаются выше 0,05, что указывает на отсутствие устойчивых однослокусных эффектов на показатели молочной продуктивности в HSTN344 и в HSTN517, тогда как по белку в HSTN545 фиксируется значимость уровня p=0,04. На этом фоне виден единственный подтверждённый контраст в HSTN545 по белку, где AA (3,36±0,06%) выше TA (3,24±0,09%), что отмечено звёздочками у строк 4 и 5, тогда как TT (3,21±0,21%) при n=3 даёт широкий доверительный интервал и не влияет на общий рисунок. В HSTN517 общий ANOVA по SCS равен 0,10, однако отмечено парное различие между TC (3,58±0,06) и TT (3,67±0,07), причём у строк 8 и 9 стоят взаимные пометки значимости, что указывает на локальный сдвиг при отсутствии общего эффекта фактора «генотип» в рамках этого локуса.

Взаимосвязи признаков внутри таблицы выглядят согласованно с популяционной логикой, поскольку при близких средних по удою в пределах локуса проценты жира и белка сохраняются в узком диапазоне, а обнаруженное повышение белка в HSTN545AA не сопровождается системным ростом жира или SCS, что укладывается в представление о разводняющем эффекте высоких удоев на проценты компонентов и о независимых от состава молока колебаниях SCS, связанных прежде всего со статусом вымени и менеджментом, при этом SCS остаётся валидным индикатором здоровья вымени и риска мастита.

Таблица 1 - Показатели молочной продуктивности по генотипам каждого локуса HSTN

п/п

Локус

Генотип

n

Удой (M±SE)

p-value

Жир% (M±SE)

p-value

Белок% (M±SE)

p-value

SCS (M±SE)

p-value

1

344

GG

6

10786±2336

0.78

4,15±0,32

0.96

3,32±0,13

0.22

3,53±0,14

0.11

2

TG

16

10428±897

4,10±0,24

3,24±0,08

3,64±0,06

3

TT

15

10040±1435

4,13±0,23

3,33±0,08

3,64±0,06

4

545

AA

17

9764±1048

0.34

4,11±0,22

0.96

3,36±0,06*5

0.04*

3,61±0,06

0.48

5

TA

17

10797±1157

4,14±0,21

3,24±0,09*4

3,64±0,06

6

TT

3

10873±4452

4,10±1,00

3,21±0,21

3,55±0,36

7

517

CC

8

10373±2310

0.58

4,21±0,37

0.81

3,25±0,16

0.74

3,60±0,10

0.10

8

TC

14

10749±1115

4,10±0,24

3,30±0,08

3,58±0,06*9

9

TT

15

9912±1116

4,10±0,22

3,30±0,08

3,67±0,07*8

Примечание: * -p<0,05; ** -p<0,01; ***- p<0,001.

Таблица 2 суммирует девять комбинаций HSTN344/HSTN545 у голштинов с неравными численностями групп, где наиболее представлены TG/TA (n=9), TT/AA (n=8), TG/AA (n=6) и TT/TA (n=6), тогда как для GG/TT, TG/TT и TT/TT по одному наблюдению, что ограничивает интерпретацию крайних средних. По удою статистически значимых парных контрастов в таблице не отмечено и разброс средних лежит от 9363 кг у HSTN344TG/HSTN545TT (9363 кг, n=1) и HSTN344GG/HSTN545TT (12853 кг, n=1) при близких значениях у крупных групп, по жиру значимых различий также нет при максимуме 4,27% у HSTN344TT/HSTN545TA и локально высоком значении 4,52% у HSTN344TG/HSTN545TT при n=1. По белку выявлен единственный устойчивый кластер различий, где HSTN344TT/HSTN545AA (3,43±0,02%, n=8) достоверно выше HSTN344TG/HSTN545AA (3,25±0,04%, n=6), HSTN344TG/HSTN545TA (3,22±0,07%, n=9) и HSTN344TT/HSTN545TA (3,23±0,06%, n=6), что отражено звёздочками в соответствующих строках, при этом SCS варьирует узко от 3,50 до 3,71 без подтверждённых сдвигов между крупными группами.

Внутренние соотношения признаков выглядят биологически согласованными, поскольку более высокие значения белка у HSTN344TT/HSTN545AA сопровождаются умеренным удоем относительно HSTN344TG/HSTN545TA и HSTN344TT/HSTN545TA, а большинство комбинаций при сопоставимых удоях удерживают жир и белок в узких интервалах, что соответствует эффекту «разбавления» процентов компонентов при росте выхода молока. SCS в основных группах остаётся на сходном уровне без подтверждённых контрастов и отражает прежде всего состояние вымени и управленческие факторы, тогда как сильная отрицательная связь SCS с удоем чаще проявляется в более крупных выборках или при выраженном воспалении вымени. Эти наблюдения согласуются с обзорными и экспериментальными данными по фенотипическим связям «удой - состав» и по роли SCC/SCS в оценке качества молока и риска мастита.

Табли ца 2 - Показатели молочной продуктивности для комбинаций HSTN344/HST N545

п/п

Генотип

n

Удой, кг

Жир, %

Белок, %

SCS

1

GG/AA

3

10107±1784

4,21±0,24

3,37±0,08

3,54±0,11

2

GG/TA

2

10772±86

4,13±0,21

3,33±0,06

3,50±0,06

3

GG/TT

1

12853

4,06

3,17

3,54

4

TG/AA

6

9876±425

4,10±0,22

3,25±0,04**7

3,62±0,05

5

TG/TA

9

10914±667

4,06±0,13

3,22±0,07*7

3,64±0,03

6

TG/TT

1

9363

4,52

3,31

3,71

7

TT/AA

8

9551±858

4,08±0,14

3,43±0,02**4

3,63±0,04

8

TT/TA

6

10630±1273

4,27±0,18

3,23±0,06*7

3,69±0,04

9

TT/TT

1

10403

3,72

3,15

3,42

Примечание: * -p<0,05; ** -p<0,01; ***-p<0,001.

Таблица 3 охватывает девять комбинаций HSTN344/HSTN517 у голштинов при неравных n, где наиболее представлены TT/TT (n=7), TG/TC (n=6) и TG/TT (n=6), тогда как для GG/CC (n=1), GG/TT (n=2) и TT/CC (n=3) объёмы минимальны, что требует осторожной интерпретации крайних средних. По удою отмечен единственный подтверждённый парный контраст внутри фонового генотипа HSTN344TG, где HSTN344TG/HSTN517TC (11326±543 кг) выше HSTN344TG/HSTN517TT (9600±362 кг), по жиру выделяются группы с высокими процентами у HSTN344TT/HSTN517CC (4,62±0,13%) и HSTN344TT/HSTN517CC (4,45±0,00%), причём обе от- личаются от нескольких сочетаний с более низким жиром, по белку значимых парных различий не зафиксировано при локально высоких значениях у HSTN344GG/HSTN517TT (3,44±0,07%) и HSTN344TT/ HSTN517CC (3,41±0,07%) на фоне малых n, по SCS зафиксировано снижение у HSTN344GG/ HSTN517TC (3,52±0,03%) относительно HSTN344TG/HSTN517TT (3,68±0,05%) и HSTN344TT/HSTN517TT (3,67±0,05%) при отсутствии других устойчивых контрастов внутри крупных групп.

Фенотипические соотношения выглядят согласованными с популяционной логикой, поскольку сочетания с более высоким жиром вроде HSTN344TT/

HSTN517CC и HSTN344GG/HSTN517TT одновременно демонстрируют невысокий удой относительно HSTN344TG/HSTN517TC и HSTN344GG/HSTN517TC, что укладывается в известный «разбавляющий» эффект более высокого выхода молока на проценты жира и белка, тогда как пара HSTN344GG/HSTN517TC против HSTN344TG/HSTN517TT иллюстрирует ожида- емое сочетание более высокого удоя с несколько меньшим SCS, согласующееся с отрицательной связью SCC/SCS с продуктивностью и его ролью маркёра риска мастита. Эти мотивы неоднократно показаны в обзорах по компонентам молока и в исследованиях, связывающих повышение SCC с потерями удоя и ухудшением здоровья вымени.

Таблица 3 - Показатели молочной продуктивности для комбинаций HSTN344/HSTN517

п/п

Генотип

n

Удой, кг

Жир, %

Белок, %

SCS

1

GG/CC

1

12075

3,72

3,23

3,38

2

GG/TC

3

11465±696

4,10±0,13*7

3,27±0,06

3,52±0,03*9*6

3

GG/TT

2

9123±2578

4,45±0,00*8*9

3,44±0,07

3,62±0,13

4

TG/CC

4

10322±1315

4,02±0,18*7

3,14±0,09

3,65±0,04

5

TG/TC

6

11326±543*6

4,20±0,24

3,29±0,07

3,58±0,03

6

TG/TT

6

9600±362*5

4,06±0,16*7

3,25±0,04

3,68±0,05*2

7

TT/CC

3

9875±2200

4,62±0,13*8*9*6*4*2

3,41±0,07

3,62±0,03

8

TT/TC

5

9627±1160

3,97±0,13*7*3

3,33±0,05

3,61±0,06

9

TT/TT

7

10405±928

4,04±0,16*7*3

3,29±0,07

3,67±0,05*2

Примечание: * -p<0,05; ** -p<0,01; ***- p<0,001.

Таблица 4 суммирует восемь комбинаций HSTN545/HSTN517 у голштинов при неравных численностях, где наиболее представлены AA/TT (n=10), TA/TC (n=7), TA/CC (n=6) и AA/TC (n=5), тогда как AA/CC и TT/TC имеют по n=2, а TT/TT всего n=1, что ограничивает интерпретацию крайних средних. По удою отмечен подтверждённый контраст HSTN545TA/HSTN517TC (11028±541 кг, n=7) выше HSTN545AA/HSTN517TT (9331±577 кг, n=10), что симметрично помечено звёздочками в строках 5 и 3, тогда как высокое среднее у HSTN545TT/HSTN517TC (11628±1225 кг, n=2) и у HSTN545TA/HSTN517TT (11502±1046 кг, n=4) следует трактовать осторожно из-за малых объёмов. По жиру значимых различий не выявлено, хотя наблюдаются крайние значения у HSTN545TT/HSTN517TT (4,52%, n=1) и у HSTN545TT/HSTN517TC (3,89%, n=2), по белку фиксируется чёткий кластер: HSTN545AA/HSTN517TC (3,39±0,03%, n=5) и HSTN545AA/HSTN517TT (3,34±0,04%, n=10) достоверно выше HSTN545TT/ HSTN517TC (3,16±0,01%, n=2), что отмечено *** и ** у соответствующих строк, при этом HSTN545TA/HSTN517TT (3,18±0,07%, n=4) остаётся среди низких по уровню без подтверждённых парных пометок. По SCS статистически значимых контрастов нет, диапазон значений узок от 3,48±0,06% у HSTN545TT/ HSTN517TC до 3,73±0,07% у HSTN545TA/ HSTN517TT что указывает на отсутствие выраженного эффекта пары локусов на этот признак при текущих n. Фенотипические соотношения выглядят биологически согласованными, поскольку более высокий белок у HSTN545AA/HSTN517TC и HSTN545AA/HSTN517TT сочетается с умеренным или пониженным удоем, а низкий белок у HSTN545TT/HSTN517TC сопровождается высоким удоем при малом n, что соответствует широко описанному «разбавляющему» эффекту роста выхода молока на проценты компонентов. Одновременно SCS остаётся стабильным между крупными группами и выступает индикатором состояния вымени и риска мастита, при увеличении которого на больших массивах часто фиксируют снижение удоя, поэтому отсутствие выраженных сдвигов SCS здесь скорее отражает ограниченную мощность и небольшие различия по воспалительному статусу. Эти интерпретации согласуются с обзорными и экспериментальными данными по отрицательной связи SCC/SCS с продуктивностью и по снижению концентраций жира и белка на фоне повышенной молочности.

Таблица 4 - Показатели молочной продуктивности для комбинаций HSTN545/HSTN517

п/п

Генотип

n

Удой, кг

Жир, %

Белок, %

SCS

1

AA/CC

2

11322±754

4,23±0,51

3,35±0,12

3,48±0,10

2

AA/TC

5

10006±1191

4,16±0,24

3,39±0,03***7

3,61±0,04

3

AA/TT

10

9331±577*5

4,06±0,12

3,34±0,04**7

3,64±0,04

4

TA/CC

6

10057±1290

4,20±0,17

3,22±0,08

3,65±0,03

5

TA/TC

7

11028±541*3

4,11±0,16

3,28±0,06

3,59±0,04

6

TA/TT

4

11502±1046

4,11±0,24

3,18±0,07

3,73±0,07

7

TT/TC

2

11628±1225

3,89±0,17

3,16±0,01***2**3

3,48±0,06

8

TT/TT

1

9363

4,52

3,31

3,71

9

AA/CC

2

11322±754

4,23±0,51

3,35±0,12

3,48±0,10

Примечание: * -p<0,05; ** -p<0,01; ***-p<0,001.

Таблица 5 суммирует 17 тройных комбинаций HSTN344/HSTN545/HSTN517 у голштинов при вы- раженно неравных n, где наиболее информативны группы с n=3-4, а часть ячеек представлена единич- ными наблюдениями, что требует осторожной интерпретации крайних средних. По удою отмечена тенденция внутри фонового генотипа HSTN344TG/ HSTN545TA, где HSTN344TG/HSTN545AA/ HSTN517TT (9410±478 кг, n=4) уступает HSTN344TG/ HSTN545TA/HSTN517TC (11585±815 кг, n=4) со значением p=0,061, при этом высокие средние у HSTN344TT/HSTN545TA/HSTN517TT (11803±1417 кг, n=3) и HSTN344TG/HSTN545TA/HSTN517TC (11585±815 кг, n=4) подтверждают «интенсивный» профиль продуктивности на фоне малых n. По жиру выделяются контрасты с участием высокожирных комбинаций HSTN344GG/ HSTN545AA/HSTN517TT (4,45±0,00%, n=2) и HSTN344TT/ HSTN545TA/ HSTN517СС (4,55±0,20%, n=2), причём HSTN344GG/ HSTN545AA/HSTN517TT (4,45±0,00%, n=2) выше HSTN344TT/HSTN545AA/HSTN517TC (3,90±0,06%, n=3) и выше HSTN344TG/ HSTN545AA/ HSTN517TT (3,87±0,15%, n=4) при p<0,05-0,10, а HSTN344TT/ HSTN545TA/HSTN517CC (4,55±0,20%, n=2) выше HSTN344TG/ HSTN545AA/ HSTN517TT (3,87±0,15%, n=4) при p=0,058, что согласуется со звёздочными пометками в строках 1, 11 и 5. По белку формируется компактный кластер повышенных значений у HSTN344TT/HSTN545AA/HSTN517TT (3,43±0,02%, n=4), HSTN344TT/ HSTN545AA/ HSTN517TC (3,41±0,04%, n=3) и HSTN344TG/ HSTN545AA/ HSTN517TC (3,35±0,02%, n=2) относительно низких у HSTN344TT/ HSTN545TA/ HSTN517TT (3,11±0,03%, n=3) и HSTN344TG/ HSTN545AA/ HSTN517TT (3,21±0,05%, n=4), где подтверждены множественные контрасты уровня p<0,05 и p<0,01, в том числе HSTN344TT/ HSTN545AA/ HSTN517TT (3,43±0,02%, n=4) выше HSTN344TT/ HSTN545TA/ HSTN517TT (3,11±0,03%, n=3) p=0,0002, HSTN344TT/ HSTN545AA/ HSTN517TC (3,41±0,04%, n=3) выше HSTN344TT/ HSTN545TA/HSTN517TT (3,11±0,03%, n=3) p=0,0022 и HSTN344TG/HSTN545AA/HSTN517TT (3,21±0,05%, n=4) ниже HSTN344TT/ HSTN545AA/ HSTN517TT (3,43±0,02%, n=4) p=0,0043, а также отмечены тенденции p<0,1 для нескольких пар с участием HSTN344GG/HSTN545AA/HSTN517TT и HSTN344TT/ HSTN545TA/HSTN517TC . При этом по SCS значимых пар и тенденций уровня p<0,1 не выявлено, а диапазон средних остаётся узким от 3,50 до 3,84.

По взаимосвязям фенотипов картина согласуется с популяционной логикой, поскольку более высокие значения белка у сочетаний в HSTN517AA и умеренными удоями сосуществуют с низким белком у «интенсивной» HSTN344TT/HSTN545TA/HSTN517TT , что укладывается в известный эффект разбавления процентов компонентов на фоне возрастания выхода молока, тогда как SCS между основными группами остаётся стабильным и не демонстрирует сопряжённого снижения удоя при текущих объёмах, что ожидаемо для когорт без выраженного воспаления вымени и подтверждается ролью SCS как маркёра мастита и качества молока. Эти соотношения согласуются с обзорными данными о снижении процентов жира и белка при повышенной молочности и с работами, показывающими связь SCC/SCS с потерями удоя и качеством молока.

Таблица 5 - Показатели молочной продуктивности для для комбинаций HSTN344/HSTN545/HSTN517

п/п

Генотип

n

Удой, кг

Жир, %

Белок, %

SCS

1

GG/AA/TT

2

9123±2578

4,45±0,00*11*5

3,44±0,07

3,62±0,13

2

GG/TA/TC

2

10772±86

4,13±0,21

3,33±0,06

3,50±0,06

3

GG/TT/TC

1

12853

4,06

3,17

3,54

4

TG/AA/TC

2

10809±171

4,56±0,53

3,35±0,02**15*5

3,59±0,10

5

TG/AA/TT

4

9410±478

3,87±0,15*1

3,21±0,05**12*11*4

3,63±0,06

6

TG/TA/CC

4

10322±1315

4,02±0,18

3,14±0,09*12

3,65±0,04

7

TG/TA/TC

4

11585±815

4,02±0,25

3,26±0,11

3,58±0,02

8

TG/TA/TT

1

10600

4,38

3,39

3,84

9

TG/TT/TT

1

9363

4,52

3,31

3,71

10

TT/AA/CC

1

10568

4,75

3,47

3,58

11

TT/AA/TC

3

9471±2088

3,90±0,06*1

3,41±0,04**15*5

3,62±0,05

12

TT/AA/TT

4

9357±1074

4,05±0,21

3,43±0,02***15**5*6

3,66±0,06

13

TT/TA/CC

2

9528±3763

4,55±0,20

3,38±0,10

3,63±0,04

14

TT/TA/TC

1

9317

4,44

3,28

3,78

15

TT/TA/TT

3

11803±1417

4,03±0,31

3,11±0,03***12**11**4

3,69±0,08

16

TT/TT/TC

1

10403

3,72

3,15

3,42

17

GG/AA/CC

1

12075

3,72

3,23

3,38

Примечание: * -p<0,05; ** -p<0,01; ***- p<0,001.

Сопоставление с холмогорской породой подчёркивает породоспецифичность реализации HSTN при схожем дизайне и разном объёме выборок n=37 у голштинов против n=89 у холмогоров, что напрямую влияет на мощность тестов. У голштинов единственный устойчивый сигнал на уровне pTAпри p=0,04 при отсутствии значимых эффектов в HSTN344 и локальном, а не общем, сдвиге по SCS в HSTN517TCTC по белку при отсутствии устойчивых ассоциаций для HSTN344 и HSTN545. На уровне комбинаций у голштинов картина по белку формируется за счёт кластера повышенных значений у триад HSTN344TT/HSTN545AA/HSTN517TT , HSTN344TT/ HSTN545AA/ HSTN517TC и HSTN344TG/ HSTN545AA/ HSTN517TC при узком диапазоне SCS без подтвер- ждённых сдвигов, тогда как у холмогоров выделены комбинации, связанные с повышенным удоем HSTN344GG/HSTN517CC и HSTN344TT/HSTN517TC/ HSTN545TA, с лучшим белком для HSTN344GA/ HSTN545TA и с минимальными уровнями SCS у HSTN545AA/HSTN517CC и у полного комплекса HSTN344TT/HSTN545TT/HSTN517TT. Совокупно это указывает, что в голштинской популяции HSTN545 проявляется как модификатор белка при нейтральности HSTN344 и локальных сдвигах по SCS в HSTN517, тогда как в холмогорской выборке ведущую роль по белку играет HSTN517 при нейтральности HSTN344 и HSTN545 и выраженных комплексных эффектах на удой и SCS. Такие различия согласуются с породными различиями фоновой генетической архитектуры, с возможными отличиями LD вокруг HSTN и с управленческими факторами, поэтому практическая рекомендация едина для обеих пород.

Заключение. В проведённом исследовании на ограниченной, но репрезентативной для хозяйственной практики выборке голштинов не выявлено устойчивых однослокусных эффектов HSTN по всем четырём признакам одновременно, однако несколько контрастов на уровне отдельных локусов и пар генотипов согласуются с биологической логикой взаимосвязей „удой - состав молока - SCS“, при этом единственный стабильный сигнал у голштинов пришёлся на различие по белку между генотипами в локусе HSTN545 при сопоставимых уровнях жира и SCS, что подтвер- ждает скорее модифицирующую, чем ведущую роль данного локуса в формировании компонентного состава. С практической точки зрения использование маркеров HSTN в одиночку едва ли даст заметное преимущество в отборе, тогда как их включение в многофакторные панели совместно с проверенными кандидатными генами и геномными оценками представляется более обоснованным [3-5, 8-10]. Эти выводы согласуются с современными представлениями о генетике молочной продуктивности и указывают на необходимость валидации ассоциаций на материале конкретных популяций в рамках действующих программ геномной селекции [3-5, 9, 10].

Сопоставление с холмогорской выборкой подчёркивает породоспецифичность реализации HSTN. Для холмогорской породы ключевым оказался локус HSTN517 по белку генотип TT выше TC при отсутствии устойчивых эффектов в HSTN344 и HSTN545, а на уровне комплексных профилей отмечались сочетания, связанные с более высоким удоем и меньшим SCS. В сумме это подтверждает модифицирующую, а не ведущую роль HSTN и необходимость учитывать различия фоновой генетической архитектуры и менеджмента. Оптимальная практическая стратегия одинакова для обеих пород - использовать HSTN как часть многомаркерных панелей и гаплотипных профилей с последующей валидацией эффектов на расширенных многостадных когортах.