Quorum Sensing и нодуляционная конкурентоспособность ризобий при инфицировании бобовых растений
Автор: Воробьев Н.И., Проворов Н.А.
Журнал: Сельскохозяйственная биология @agrobiology
Рубрика: Молекулярные и клеточные механизмы симбиоза
Статья в выпуске: 3 т.50, 2015 года.
Бесплатный доступ
Один из основных симбиотических признаков ризобий - способность конкурировать за образование клубеньков у бобовых растений, проявляемая при совместной инокуляции хозяев несколькими штаммами (нодуляционная конкурентоспособность - НКС). Закономерности регуляции НКС остаются малоизученными, что затрудняет использование полученных данных в биотехнологических исследованиях, направленных на повышение эффективности биопрепаратов ризобий. Нами создана математическая модель нодуляционной конкурентоспособности ризобий (НКС) для описания мультиштаммовой инокуляции бобовых растений (НКС-модель). В НКС-модели мы учли, что в соответствии с положением о Quorum Sensing регулировании (QS-регулировании) в почвенных нишах ограничивается не только число бактерий в нише, но и миграция клеток в соседние ниши. НКС-модель представляет собой нелинейную степенную зависимость миграции клеток из ниши от пространственной плотности клеток в нише (величина степени меньше, чем 1). Согласно формуле НКС-модели, относительная доля мигрирующих клеток из ниши обитания уменьшается с ростом плотности клеток в нише. Мы предполагаем, что после мультиштаммовой инокуляции в ризосфере растений в большем количестве (с большей НКС) будет представлен тот бактериальный штамм, который формирует больший миграционный поток клеток из ниши обитания. Верификация и параметрическая идентификация (миграционная активность штаммов, индекс частотно-зависимого отбора) НКС-модели проводились с использованием опубликованных ранее экспериментальных данных. Анализ вычисленных по этим данным параметров НКС-модели показал, что штаммы ризобий с большей миграционной активностью и малым индексом частотно-зависимого отбора образуют больший миграционный поток клеток из ниш обитания и демонстрируют большую НКС. Генетическая модификация ризобий с целью повышения НКС может вызвать интенсификацию миграционных потоков клеток штамма из ниши обитания и к ускоренному расходованию ресурсов ниши. Интенсивная миграция клеток из почвенной ниши может привести к преждевременному расходованию ресурса ниши и вызвать гибель клеток ризобий раньше, чем они образуют симбиоз с бобовыми растениями. Рассмотренные особенности выживания и миграции ризобий в естественных почвенных условиях необходимо учитывать, особенно, при разработке микробных препаратов длительного действия.
Математическое моделирование, клубеньковые бактерии, нодуляционная конкурентоспособность, регуляция quorum sensing, миграция, частотно-за-висимый отбор
Короткий адрес: https://sciup.org/142133590
IDR: 142133590 | DOI: 10.15389/agrobiology.2015.3.298rus
Список литературы Quorum Sensing и нодуляционная конкурентоспособность ризобий при инфицировании бобовых растений
- Курчак О.Н., Проворов Н.А., Симаров Б.В. Плазмида pSym1-32 Rhizobium leguminosarum bv.viceae, контролирующая азотфиксирующую активность, эффективность симбиоза, конкурентоспособность и кислотоустойчивость. Генетика, 2001, 37(9): 1225-1232.
- Онищук О.П., Курчак О.Н., Шарыпова Л.A., Проворов Н.А., Симаров Б.В. Анализ различных типов конкурентоспособности у Тп5-мутантов клубеньковых бактерий люцерны (Sinorhizobium meliloti). Генетика, 2001, 37(11): 1507-1512.
- Онищук О.П., Симаров Б.В. Гены, контролирующие нодуляционную конкурентоспособность клубеньковых бактерий. Генетика 1996, 32: 1157-1166.
- Онищук О.П., Симаров Б.В. Генетическая изменчивость нодуляционной конкурентоспособности у клубеньковых бактерий и ее использование в селекции. Генетика, 1995, 31(3): 293-303.
- Sessitsch A., Jjemba P.K., Hardarson G., Akkermans A.D.L., Wilson K.J. Measurement of the competitiveness index of Rhisobium tropici strain CIAT899 derivatives marked with the gusA gene. Soil Biol. Biochem., 1997, 29: 1099-1110.
- Pérez-Montaño F., Jiménez-Guerrero I., Del Cerro P., Baena-Ropero I., López-Baena F.J., Ollero F.J., Bellogín R., Lloret J., Espuny R. The symbiotic biofilm of Sinorhizobium fredii SMH12, necessary for successful colonization and symbiosis of Glycine max cv. Osumi, is regulated by Quorum Sensing systems and inducing flavonoids via NodD1. PLoS ONE, 2014, 9(8): e105901 ( ) DOI: 10.1371/journal.pone.0105901
- Jitacksorn S., Sadowsky M.J. Nodulation gene regulation and Quorum Sensing control density-dependent suppression and restriction of nodulation in the Bradyrhizobium japonicum-soybean symbiosis. Appl. Environ. Microbiol., 2008, 74: 3749-3756 ( ) DOI: 10.1128/AEM.02939-07
- Zheng H., Zhong Z., Lai X., Chen W.X., Li S., Zhu J. LuxR/LuxI-type Quorum-Sensing system in plant bacterium Mesorhizobium tianshanense controls symbiotic nodulation. J. Bacteriol., 2006, 188: 1943-1949 ( ) DOI: 10.1128/JB.188.5.1943-1949.2006
- Amarger N., Lobreau J.P. Quantitative study of nodulation competitiveness in Rhizobium strains. Appl. Environ. Microbiol., 1982, 44(3): 583-588.
- Beattie G.A., Clayton M.C., Handelsman J. Quantitative Comparison of the laboratory and field competitiveness of Rhizobium leguminosarum biovar phaseoli. Appl. Environ. Microbiol., 1989, 55(11): 2755-2761.
- Проворов Н.А., Воробьев Н.И. Генетические основы эволюции растительно-микробного симбиоза. СПб, 2012.
- Хмель И.А. Quorum-Sensing регуляция экспрессии генов: фундаментальные и прикладные аспекты, роль в коммуникации бактерий. Микробиология, 2006, 75(4): 457-464.
- Шпаков А.О. Сигнальные молекулы бактерий непептидной природы QS-типа. Микробиология, 2009, 78(2): 163-175.
- Conway B., Greenberg E. Quorum-Sensing signals and Quorum-Sensing genes in Burkholderia vietnamiensis. J. Bacteriol., 2002, 184: 1187-1191 ( ) DOI: 10.1128/jb.184.4.1187-1191.2002
- Daniels R., De Vos D.E., Desair J., Raedschelders G., Luyten E., Rosemeyer V., Verreth C., Schoeters E., Vanderleyden J., Michiels J. The cin Quorum-Sensing locus of Rhizobium etli CNPAF 512 affects growth and symbiotic nitrogen fixation. J. Biol. Chem., 2002, 277: 462-468 ( ) DOI: 10.1074/jbc.M106655200
- Koutsoudis M.D., Tsaltas D., Minogue T.D., Von Bodman S.B. Quorum-Sensing regulation governs bacterial adhesion, biofilm development, and host colonization in Pantoea stewartii subspecies stewartii. PNAS, 2006, 103: 5983-5988 ( ) DOI: 10.1073/pnas.0509860103
- Воробьев Н.И., Семенов A.M., Шаталов А.А., Ван Бругген A.Х.К., Свиридова О.В. Нелинейное моделирование автоколебаний численности Pseudomonas fluorescens в субстрат-бактериальной системе. Изв. Самарского НЦ РАН, 2009, 11(7): 1620-1624.
- Schluter J.P., Czuppon P., Schauer O., Pfaffelhuber P., McIntosh M., Becker A. Classification of phenotypic subpopulations in isogenic bacterial cultures by triple promoter probing at single cell level. J. Biotechnol., 2015, 198: 3-14 ( ) DOI: 10.1016/j.jbiotec.2015.01.021
- Проворов Н.А., Онищук О.П., Юргель С.Н., Курчак О.Н., Чижевская Е.П., Воробьев Н.И., Затовская Т.В., Симаров Б.В. Конструирование высокоэффективных симбиотических штаммов бактерий: эволюционные модели и генетические подходы. Генетика, 2014, 50(11): 1273-1285.
- Braeken K., Daniels R., Ndayizeye M., Vanderleyden J., Michiels J. Quorum Sensing in bacteria-plant interactions. In: Molecular mechanisms of plant and microbe coexistence. Berlin, Heidelberg, Springer-Verlag, 2008: 265-289 (ISBN 978-3-540-75574-6) ( ) DOI: 10.1007/978-3-540-75575-3