Разнообразие бактерий, выделенных из района разработок месторождения калийных солей Верхнекамья
Автор: Ястребова О.В., Ананьина Л.Н., Пастухова Е.С., Плотникова Е.Г.
Журнал: Вестник Пермского университета. Серия: Биология @vestnik-psu-bio
Рубрика: Микробиология
Статья в выпуске: 10, 2009 года.
Бесплатный доступ
Из почвы, воды и галитовых отходов района солеразработок (г. Соликамск, Пермский край) методом накопительных культур выделено 12 различных по грампринадлежности штаммов бактерий. По результатам генотипирования методами REP-ПЦР и ARDRA выделенные штаммы были объединены в пять различных геномогрупп. У представителей геномогрупп определены нуклеотидные последовательности гена 16S рРНК, сравнительный анализ которых показал принадлежность штаммов к родам Bacillus, Virgibacillus, Pseudomonas, Chromohalobacter и Idiomarina. Из образца породы калийно-магниевых солей выделены два штамма, идентифицированные как представители родов Bacillus и Streptomyces. В накопительной культуре из данного образца на полноценной среде c 20% NaCl обнаружены бактерии, близкородственные бактериям родов Ralstonia и Stenotrophomonas (сходство 98%). Большинство выделенных штаммов растет при 15-20% NaCl в среде культивирования, штаммы С2 и К52 способны к росту в щелочных условиях (pH 9.0). Штамм Pseudomonas sp. К513 использует в качестве субстрата бензойную кислоту в высокой концентрации (5 г/л) при содержании в среде культивирования 3% хлорида натрия.
Короткий адрес: https://sciup.org/147204449
IDR: 147204449
Список литературы Разнообразие бактерий, выделенных из района разработок месторождения калийных солей Верхнекамья
- Гавриш, Е.Ю. Три новых вида бревибактерий -Brevibacterium antiguum sp. nov., Brevibacterium aurantiacum sp. nov. и Brevibacterium permense sp. nov./Е.Ю. Гавриш, В.И. Краузова, Н.В. Потехина и др.//Микробиология. 2004. Т. 73., №2. С. 218-225.
- Кашнер Д. Жизнь микробов в экстремальных условиях. М.: Мир, 1981. 365 с.
- Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Методы генетической инженерии//Молекулярное клонирование. М.: Мир, 1984. 390 с.
- Методы общей бактериологии//пер. с англ.; под ред. Ф. Герхардт и др. М.: Мир, 1983. Т. 1, 2, 3.
- Определитель бактерий Берджи/пер. с англ.; под ред. Дж. Хоулта и др. М.: Мир, 1997. Т. 1, 2.
- Розанова Е.П. Углеводородокисляющие бактерии и их активность в нефтяных пластах/Е.П. Розанова, Т.Н. Назина//Микробиология. 1982. Т. 51. С. 324-348.
- Jukes T.H.//Mamallian protein metabolism/T.H. Jukes, C.R. Cantor. New York: Acad. Press. 1969. P. 21-132.
- Kim D. Molecular cloning and functional characterization of the genes encoding benzoate andp -hydroxybenzoate degradation by the halophilic Chromohalobacter sp. strain HS-2/D. Kim, S.W. Kim, K.Y. Choi//FEMS Microbiol. Lett. 2008. Vol. 280. P. 235-241.
- Margesin R. Potential of halotolerant and halophilic microorganisms for biotecnilogy/R. Margesin, Schinner F.//Extremophiles. 2001. Vol. 5. P. 73-83.
- Muyzer G. Profiling of complex microbial populations by denaturing gradient gel electrophoresis analysis of polymerase chain reaction-amplified genes coding for 16S rRNA/G. Muyzer, E.C. de Waal, A.G. Uitterlinden//Appl. Environ. Microbiol. 1993. Vol. 59. P. 695-700.
- Oie C.S.I. Benzoate and salicylate degradation by Halomonas campisalis, an alkaliphilic and moderately halophilic microorganism/C.S.I. Oie, C.E. Albaugh, B.M. Peyton//Water research. 2007. Vol. 41. № 6. P. 1235-1242.
- Scortichini М. Bacteria associated with hazelnut (Corylus avellana L.) decline are of two groups: Pseudomonas avellanae and strains resembling P. syringae pv. syringae/М. Scortichini, U. Marchesi, M.-P. Rossi//Appl. Environ. Microbiol. 2002. Vol. 68. P. 476-484.
- Sorokin I.D., Haloalkaliphilic diazotrophs in soda solonchak soils/I.D. Sorokin, I.K. Kravchenko, E.V. Doroshenko//FEMS Microbiol Ecol. 2008. V. 65. P. 425-433.
- Thompson J.D. CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position specific gap penalties and weight matrix choice/J.D. Thompson, D.G. Higgins, T.J. Gibson//Nucleic. Acids. Res. 1994. Vol. 22. P. 4673-4680.
- Van de Peer Y. TREECON for Windows a software package for the construction and drawing of evolutionary trees for the Microsoft Windows environment/Y. Van de Peer, R. DeWachter//Comput. Appl. Biosci. 1994. Vol. 10. P. 569-570.
- Vargas A.V. Bacillus bogoriensis sp. nov., a novel alkalophilic, halotolerant bacterium isolated from Kenyan soda lake/A.V. Vargas, O.D. Delgado, R. Hatti-Kaul, B. Mattiasson//International Journal of Systematic and Evolutionar Microbiology. 2005. Vol. 55. P. 899-902.
- Ventosa A. Biology of halophilic aerobic bacteria/A. Ventosa, J.N. Joaquhn, A. Oren//Microbiol. and Molec.Biol. Rev. 1998. Vol.2. P. 504-544.
- Versalovic J. Genomic fingerprinting of bacteria using repetitive sequence-based polymerase chain reaction/J. Versalovic, M. Schneider, F.J. de Bruijn//Meth. Cell. Mol. Biol. 1994. Vol. 5. P. 25-40.
