Разработка способа индикации и идентификации Vibrio parahaemolyticus с помощью real-time ПЦР
Автор: Полеева Марина Владимировна, Чемисова Ольга Сергеевна, Трухачев Алексей Леонидович
Журнал: Вестник Пермского университета. Серия: Биология @vestnik-psu-bio
Рубрика: Микробиология
Статья в выпуске: 2, 2019 года.
Бесплатный доступ
Бактерии Vibrio parahaemolyticus могут быть причиной возникновения острого кишечного заболевания у людей, протекающего по типу пищевой токсикоинфекции. Успех лечебно-профилактических и санитарно-противоэпидемических мероприятий, направленных на предотвращение распространения «галофилезов», во многом зависит от своевременной точной идентификации штаммов вибрионов, выделяемых от больных, из морепродуктов и при мониторинге объектов окружающей среды. Представлена разработка способа идентификации штаммов вида V. parahaemolyticus методом ПЦР в режиме «реального времени» (Real-Time PCR), который включает выделение хромосомной ДНК из исследуемого материала, постановку ПЦР со сконструированными нами праймерами, специфичными к участку гена коллагеназы vppC, и зондом, позволяющим детектировать амплифицированный фрагмент и проводить учет полученных результатов в режиме реального времени. Показана возможность индикации и идентификации микроорганизмов вида V. parahaemolyticus при исследовании проб биологического материала (рыба, морепродукты) на основе метода Real-Time PCR.
Праймеры, металлопротеаза (коллагеназа)
Короткий адрес: https://sciup.org/147227079
IDR: 147227079 | DOI: 10.17072/1994-9952-2019-2-175-181
Список литературы Разработка способа индикации и идентификации Vibrio parahaemolyticus с помощью real-time ПЦР
- Белькова Н.Л., Дзюба Е.В., Суханова Е.В. Молекулярно-генетическая идентификация кишечной микрофлоры и протистов байкальских рыб // Аннотированный список фауны оз. Байкал и его водосборного бассейна. Новосибирск: Наука, 2009. С. 957-980.
- Белькова Н.Л. и др. Молекулярно-генетический мониторинг ассоциированной микрофлоры лососевидных рыб: разнообразие и физиологический статус // Известия Самарского научного центра РАН. 2010. Т. 12, № 1(4). С. 1108-1114.
- Домницкий И.Ю. Ихтиопатология: краткий курс лекций. Саратов, 2016. 120 с.
- Лабораторная диагностика заболеваний, вызываемых парагемолитическими и другими патогенными для человека вибрионами: МУК 4.2.1793-03. М.: Федеральный центр госсанэпиднадзора Минздрава России, 2004. 26 с.
- Организация работы лабораторий, использующих методы амплификации нуклеиновых кислот при работе с материалом, содержащим микроорганизмы I-IV групп патогенности: МУ 1.3.2569-09. М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2010. 51 c.
- Полеева М.В., Чемисова О.С. Использование масс-спектрометрического анализа для детекции бактериальных токсинов // ЖМЭИ. 2018. № 1. С. 93-101.
- Ребриков Д.В. и др. ПЦР в реальном времени. М: Бином. Лаборатория знаний, 2019. 223 с.
- Способ идентификации штаммов вида Vibrio paraharmolyticus методом ПЦР в режиме реального времени: пат. № 2016146441 Рос. Федерации, 2016. № 2644232; заявл. 08.02.2018. Бюл. № 4 / Чемисова О.С., Трухачев А.Л., Рыковская О.А., Полеева М.В.
- Чемисова О.С. и др. Масс-спектрометрический анализ как метод идентификации и внутривидовой дифференциации Vibrio parahaemolyticus // Холера и патогенные для человека вибрионы: материалы проблемной комиссии. Ростов-н/Д, 2013. Вып. 26. С. 153-157.
- Buller N.B. Bacteria from fish and other aquatic animals: a practical identification manual. Oxfordshire: CABI publishing, 2004. 361 p.
- Chakraborty S., Nair G.B., Shinoda S. Pathogenic vibrios in the natural aquatic environment // Rev. Environ. Health. 1997. Vol. 12 (2). P. 63-80.
- Daniels N.A.et al. Emergence of a new Vibrio parahaemolyticus serotype in raw oysters: A prevention quandary // J. Am. Med. Assoc. 2000. Vol. 284 (12). P. 1541-1545.
- Deepanjali A. et al. Seasonal variation in abundance of total and pathogenic Vibrio parahaemolyticus bacteria in oysteralong the southwest coast of India // Appl. Environ. Microbiol. 2005. Vol. 71 (7). P. 3575-3580.
- Di Pinto A., Ciccarese G., Tantillo G. A collagenase-targeted multiplex PCR assay for identification of Vibrio alginolyticus, Vibrio cholerae, and Vibrio parahaemolyticus // J. of Food Protection. 2005. Vol. 68, № 1. P. 150-153.
- Hara-Kudo Y. et al. Improved method for detection of Vibrio parahaemolyticus in seafood // Appl. Environ Microbiol. 2001. Vol. 67 (12). P. 5819-5823.
- Li R. et al. A Novel PCR-Based Approach for Accurate Identification of Vibrio parahaemolyticus // Front Microbiol. 2016. Vol. 7. P. 44.
- Luan X.-Y. et al. Comparison of different primers for rapid detection of Vibrio parahaemolyticus using the polymerase chain reaction // Lett. Appl. Microbiol. 2007. Vol. 44 (3). P. 242-247.
- Reham A.A., Amani M.S. Specific Detection of Pathogenic Vibrio species in shellfish by using multiplex polymerase chain reaction // J. Global Veterinaria. 2012. Vol. 8, № 5. P. 525-531.
- Spanggaard B. et al. The microflora of rainbow trout intestine: a comparison of traditional and molecular identification // Aquaculture. 2000. Vol. 182. P. 1-15.
