РАЗРАБОТКА УСТРОЙСТВА ДЛЯ НАСТРОЙКИ И ПРОВЕРКИ ОПТИЧЕСКОЙ СИСТЕМЫ ГЕНЕТИЧЕСКОГО АНАЛИЗАТОРА ДЛЯ МАССОВОГО ПАРАЛЛЕЛЬНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ
Автор: Е. К. Васильева, И. В. Чубинский-Надеждин, В. Е. Курочкин, Я. И. Алексеев, Ю. В. Куликов
Журнал: Научное приборостроение @nauchnoe-priborostroenie
Рубрика: Научные статьи, посвященные памяти Л.Н. Галль
Статья в выпуске: 4, 2024 года.
Бесплатный доступ
Описана разработка устройства для настройки и тестирования оптической системы секвенатора ДНК для массового параллельного секвенирования. Устройство содержит микрофлюидную ячейку с флуоресцентными микросферами, иммобилизованными на плоской поверхности канала ячейки. Микросферы диаметром 1 мкм служат моделью флуоресцентных колоний фрагментов ДНК, образующихся в ходе амплификации и последующего секвенирования. Рассмотрен метод иммобилизации стабильного монослоя микросфер на поверхности канала ячейки.
Секвенатор ДНК, колонии ДНК, флуоресцентные микросферы, микрофлюидная ячейка, оптическая система, цифровые изображения
Короткий адрес: https://sciup.org/142242732
IDR: 142242732
Список литературы РАЗРАБОТКА УСТРОЙСТВА ДЛЯ НАСТРОЙКИ И ПРОВЕРКИ ОПТИЧЕСКОЙ СИСТЕМЫ ГЕНЕТИЧЕСКОГО АНАЛИЗАТОРА ДЛЯ МАССОВОГО ПАРАЛЛЕЛЬНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ
- 1. Bentley R.D., Balasubramanian S., Swerdlow H.P. et al. Accurate whole human genome sequencing using reversible terminator chemistry // Nature. 2008. Vol. 456, no. 6. P. 53–59. DOI: 10.1038/nature07517
- 2. Sequencing platforms. URL: https://www.illumina.com/systems/sequencingplatforms.html
- 3. Shendure J., Balasubramanian S., Church G.M., Gilbert W et al. DNA sequencing at 40: past, present and future // Nature. 2017. Vol. 550. P. 345–353. DOI: 10.1038/nature24286.
- 4. Ansorge W.J. Next-generation DNA sequencing techniques // New Biotechnology. 2009. Vol. 25, no. 4. P. 195–203. DOI: 10.1016/j.nbt.2008.12.009
- 5. Бородинов А.Г., Манойлов В.В., Заруцкий И.В., Петров А.И., Курочкин В.Е. Поколения методов секвенирования ДНК // Научное приборостроение. 2020. Т. 30. № 4. С. 3–20. URL: http://iairas.ru/mag/2020/abst4.php#abst1
- 6. Sammak P., Rosania G., Zana L., et al. Microbead-based test plates and test methods for fluorescence imaging systems. Патент США US20020098588A1.
- 7. Эрни Д.Г., Пинто Д.Ф., Боуэн М.Ш. и др. Testing device and method of its use. Патент РФ № RU2701875C1. URL: https://patents.google.com/patent/RU2701875C1/en
- 8. Thermo Fisher Scientific (дата обращения 12.09.2021). URL: https://www.thermofisher.com/
- 9. Курочкин В.Е., Чубинский-Надеждин И.В. и др. Выявление основных популяций лимфоцитов с помощью цитометрии по изображениям // Медицинская техника. 2019. Т. 53, № 3 (315). С. 5–8. URL: https://www.elibrary.ru/item.asp?id=38215577
- 10. Институт аналитического приборостроения. Каталог приборов. URL: http://iairas.ru/catalog.php
