Секвенирование нового поколения в клинической практике: молекулярные дефекты у пациентов с различным течением миелоидных новообразований
Автор: Полушкина Л.Б., Шуваев В.А., Фоминых М.С., Ефремова Е.В., Мотыко Е.В., Руженкова Ю.С., Самородова А.П., Павленко Н.Б., Бакай М.П., Мартыненко Л.С., Клеина Е.В., Волошин С.В., Бессмельцев С.С., Чечеткин А.В., Мартынкевич И.С.
Журнал: Вестник гематологии @bulletin-of-hematology
Статья в выпуске: 2 т.15, 2019 года.
Бесплатный доступ
Короткий адрес: https://sciup.org/170171676
IDR: 170171676
Текст статьи Секвенирование нового поколения в клинической практике: молекулярные дефекты у пациентов с различным течением миелоидных новообразований
на у 3 пациентов, CALR — у 3, не обнаружено ДМ — у 1. У 4 больных выявлены аберрации гена ASXL1 , в одном случае в сочетании с EZH2 . Все выявленные мутации были подтверждены результатами NGS.
У пациента № 1 с предварительным диагнозом ЭТ на первом этапе молекулярно-генетического исследования маркеры клональности не выявлены. По результатам NGS обнаружены мутации в гене IDH1 (Tyr183Cys, COSM6494783) и KIT (Ile924Thr, rs1000138811), что позволило подтвердить клональную природу заболевания. Благоприятное течение ПМФ с префи-бротической стадией отмечено у пациента № 2 с мутацией в гене JAK2 и единственной дополнительной аберрацией, выявленной NGS, в гене TET2 (Gly355Asp, COSM6494926). Трансформация ПМФ в хронический миеломо-ноцитарный лейкоз (ХММЛ) констатирована у пациента № 3 с мутацией 1 типа в гене CALR . Методом NGS обнаружена мутация в гене KRAS (Gly12Ala, COSM522), встречающаяся у пациентов с ХММЛ. У остальных 4 пациентов при проведении первичной молекулярно-генетической диагностики выявлено сочетание драйверной мутации с прогностически неблагоприятными аберрациями в генах ASXL1 и EZH2 . Прогрессия заболевания отмечена у всех больных даже на фоне проведения таргетной терапии руксолитинибом, 2 пациента ( № 5 и № 7 ) умерли. По результатам NGS в образце ДНК пациента № 4 с нарастанием лейкоцитоза
и спленомегалии, быстрым усилением фиброза костного мозга до остеосклероза выявлены мутации в генах CBL (Glu366Lys, COSM6840675 и Arg246Ter, COSM4387952) и TET2 (Pro29Arg COSM5020249) в дополнение к обнаруженным ранее JAK2 и ASXL1 (Tyr591Ter, COSM1681609). Прогрессия ПМФ с развитием нейтропении IV степени, тромбоцитопении тяжелой степени отмечена у пациента № 5 с мутациями JAK2 и ASXL1 (Arg1068Ter, COSM41715) и аберрацией неясного значения Pro278Leu в гене GNAS. Постепенное нарастание бластемии в периферической крови,остеосклероз костного мозга наблюдаются у пациента № 6с мутацией 2 типа в гене CALR, а также дополнительными дефектами в генах ASXL1 (Gly646fsTer12 COSM914346), GNAS (Arg844His, COSM94388) PDGFRA (Ile989Val, rs145019788). Трансфор- мация ПМФ в ОМЛ констатирована у пациента № 7 с мутацией типа 1 в гене CALR и мутацией ASXL1 (Leu691fsTer25) и выявленными при помощи NGS неблагоприятными аномалиями генов IDH1 (Arg132Ser, COSM28748) и DNMT3A (Phe734Leu, COSM1169640).
Выводы. Таким образом, результаты, полученные с помощью NGS, позволяют расширить представления об особенностях молекулярно-генетического профиля новообразования у конкретного пациента. Сопоставление перечня обнаруженных мутаций с различным характером течения МПН говорит о важной прогностической роли дополнительных генетических аберраций. Целесообразным видится внедрение расширенных миелоидных панелей NGS уже на этапе первичной диагностики МПН.