Секвенирование нового поколения в клинической практике: молекулярные дефекты у пациентов с различным течением миелоидных новообразований
Журнал: Вестник гематологии @bulletin-of-hematology
Статья в выпуске: 2 т.15, 2019 года.
Бесплатный доступ
Короткий адрес: https://sciup.org/170171676
IDS: 170171676
Текст статьи Секвенирование нового поколения в клинической практике: молекулярные дефекты у пациентов с различным течением миелоидных новообразований
на у 3 пациентов, CALR — у 3, не обнаружено ДМ — у 1. У 4 больных выявлены аберрации гена ASXL1 , в одном случае в сочетании с EZH2 . Все выявленные мутации были подтверждены результатами NGS.
У пациента № 1 с предварительным диагнозом ЭТ на первом этапе молекулярно-генетического исследования маркеры клональности не выявлены. По результатам NGS обнаружены мутации в гене IDH1 (Tyr183Cys, COSM6494783) и KIT (Ile924Thr, rs1000138811), что позволило подтвердить клональную природу заболевания. Благоприятное течение ПМФ с префи-бротической стадией отмечено у пациента № 2 с мутацией в гене JAK2 и единственной дополнительной аберрацией, выявленной NGS, в гене TET2 (Gly355Asp, COSM6494926). Трансформация ПМФ в хронический миеломо-ноцитарный лейкоз (ХММЛ) констатирована у пациента № 3 с мутацией 1 типа в гене CALR . Методом NGS обнаружена мутация в гене KRAS (Gly12Ala, COSM522), встречающаяся у пациентов с ХММЛ. У остальных 4 пациентов при проведении первичной молекулярно-генетической диагностики выявлено сочетание драйверной мутации с прогностически неблагоприятными аберрациями в генах ASXL1 и EZH2 . Прогрессия заболевания отмечена у всех больных даже на фоне проведения таргетной терапии руксолитинибом, 2 пациента ( № 5 и № 7 ) умерли. По результатам NGS в образце ДНК пациента № 4 с нарастанием лейкоцитоза
и спленомегалии, быстрым усилением фиброза костного мозга до остеосклероза выявлены мутации в генах CBL (Glu366Lys, COSM6840675 и Arg246Ter, COSM4387952) и TET2 (Pro29Arg COSM5020249) в дополнение к обнаруженным ранее JAK2 и ASXL1 (Tyr591Ter, COSM1681609). Прогрессия ПМФ с развитием нейтропении IV степени, тромбоцитопении тяжелой степени отмечена у пациента № 5 с мутациями JAK2 и ASXL1 (Arg1068Ter, COSM41715) и аберрацией неясного значения Pro278Leu в гене GNAS. Постепенное нарастание бластемии в периферической крови,остеосклероз костного мозга наблюдаются у пациента № 6с мутацией 2 типа в гене CALR, а также дополнительными дефектами в генах ASXL1 (Gly646fsTer12 COSM914346), GNAS (Arg844His, COSM94388) PDGFRA (Ile989Val, rs145019788). Трансфор- мация ПМФ в ОМЛ констатирована у пациента № 7 с мутацией типа 1 в гене CALR и мутацией ASXL1 (Leu691fsTer25) и выявленными при помощи NGS неблагоприятными аномалиями генов IDH1 (Arg132Ser, COSM28748) и DNMT3A (Phe734Leu, COSM1169640).
Выводы. Таким образом, результаты, полученные с помощью NGS, позволяют расширить представления об особенностях молекулярно-генетического профиля новообразования у конкретного пациента. Сопоставление перечня обнаруженных мутаций с различным характером течения МПН говорит о важной прогностической роли дополнительных генетических аберраций. Целесообразным видится внедрение расширенных миелоидных панелей NGS уже на этапе первичной диагностики МПН.