Синтез производных N-(5-(метилсульфанил)- 4H-1,2,4-триазол-3-ил)пиридин-2-амина и их 1,2,4-триазиновых предшественников
Журнал: Вестник Южно-Уральского государственного университета. Серия: Химия @vestnik-susu-chemistry
Рубрика: Органическая химия
Статья в выпуске: 2 т.15, 2023 года.
Бесплатный доступ
Зучено взаимодействие 5-циано-1,2,4-триазинов с 5-метилсульфанил-4 Н -1,2,4-триазол-3-амином в условиях отсутствия растворителя. В результате был получен продукт нуклеофильного ипсо -замещения цианогруппы в составе триазина на остаток соответствующего гетероциклического амина. Строение продукта было установлено на основе данных спектров ЯМР 1Н и масс-спектрометрии (электроспрей). В спектре ЯМР 1Н следует отметить наличие характеристичного трехпротонного синглета в области 2,61 м. д., который может быть отнесён к сигналу протонов метилсульфанильной группы. Последующее взаимодействие полученного продукта с 2,5-норборнадиеном в условиях автоклава позволило превратить 1,2,4-триазиновый цикл в пиридиновый. Было установлено, что метилсульфанильная группа не претерпевает каких-либо трансформаций в ходе реализации обеих стадий синтеза, что было подтверждено в том числе данными РСА полученного функционализированного пиридина. По данным РСА соединение 4 кристаллизуется в виде двух кристаллографически независимых молекул в нецентросимметричной пространственной группе Р -1 триклинной сингонии. Кристаллическая структура формируется за счёт образования множественных межмолекулярных контактов N∙∙∙H типа между двумя кристаллографически независимыми молекулами триазолилпиридин-2-амина. В спектре ЯМР 1Н последнего наблюдаются два дублета протонов нового пиридинового кольца в области 7,37 и 7,61 м. д. Таким образом, поведение 5-метилсульфанил-4 H -1,2,4-триазол-3-амина отличается от свойств его аналога, содержащего в положении С5 меркаптогруппу. А именно, нашей научной группой ранее было установлено, что в этом случае в ходе реализации ипсо -замещения цианогруппы триазина на фрагмент последнего амина происходила параллельная реакция десульфирования.
Короткий адрес: https://sciup.org/147240932
IDS: 147240932 | УДК: 546.27+546.22+548.1+542.913 | DOI: 10.14529/chem230207
Synthesis of derivatives of N-(5-(methylsulfanyl)-4H-1,2,4-triazol-3-yl)pyridine-2-amines and their 1,2,4-triazine precursors
A solvent-free interaction between 5-cyano-1.2.4-triazines and 5-methylsulfanyl-4 H -1,2,4-triazol-3-amines has been studied. The structure of the product of ipso -substitution of cyano-group with the corresponding heterocyclic amine residue has been proven by 1Н NMR and ESI-MS data. Thus, in the 1Н NMR spectra a three-proton singlet at 2.61 ppm is present, which can be interpreted as the signal of the methylsulfanyl group protons. Subsequent transformation of 1,2,4-triazine scaffold of the resulting product into a pyridine one has been successfully performed under autoclave conditions. It has been found that methylsulfanyl group undergoes no transformations in both stages of synthesis. This fact is also proven by X-Ray crystallography data of the obtained functionalised bypyridines. According to the X-Ray crystallography data, compound 4 crystallizes as two crystallographically independent molecules in non-centrosymmetric space group P-1 with triclinic system. The crystal structure is formed by numerous intermolecular N∙∙∙H contacts between two crystallographically independent molecules of triazolylpyridine-2-amine. The 1Н NMR spectra of compound 4 contain two doublets of the new pyridine cycle at 7.37 and 7.61 ppm. Thus, properties of 5-methysulfanyl-4 H -1,2,4-triazol-3-amine are different from these of its analogue with mercaptogroup at C5 position. Namely, in accordance to our previous results ipso -substitution of C5-cyanogroup of 1,2,4-triazine with moiety of the latter amine is accompanied by desulfurization reaction.
Текст научной статьи Синтез производных N-(5-(метилсульфанил)- 4H-1,2,4-триазол-3-ил)пиридин-2-амина и их 1,2,4-триазиновых предшественников
Производные 1,2,4-триазолов представляют интерес в области сельского хозяйства [1], в качестве ингибиторов коррозии [2], а также биологически активных соединений [3–5]. В частности, данный гетероцикл входит в состав противовирусных препаратов Риамиловир [6] и Триазид [7]. 1,2,4-Триазиновое ядро также представляет интерес с точки зрения фармакофорных свойств [810]. Ранее [11] нами была показана возможность введения остатков 4 H -1,2,4-триазол-3-аминов в состав 1,2,4-триазинового ядра в результате нуклеофильного ипсо -замещения цианогруппы в положении С5, при этом в случае наличия меркаптогруппы в положении С5 триазола параллельно реализовывалась реакция десульфирования, что было подтверждено в том числе встречным синтезом с участием 5-незамещенного 4 H -1,2,4-триазол-3-амина:
Solvent-free
R1 = SH, H
В данной работе нами продолжено изучение возможностей функционализации триазинового цикла фрагментами 4 H -1,2,4-триазол-3-аминов. А именно, было опробовано использование в аналогичном превращении 4 H -1,2,4-триазол-3-амина, имеющего в положении С5 метилсульфанильную группу.
Экспериментальная часть
Исходный 5-цианотриазин ( 1 ) был получен по ранее предложенной методике [11, 12] для аналогичных соединений. Все остальные реагенты коммерчески доступны.
Синтез 6-(4-бромфенил)-3-(4-хлорфенил)-N-(5-(метилсульфанил)-4H-1,2,4-триазол-3- ил)-1,2,4-триазин-5-амина (3)
Смесь 5-цианотриазина 1 (120 мг, 0,32 ммоль) и метилсульфанил-триазола 2 (47 мг,
0,36 ммоль) перемешивают на магнитной мешалке при 155 ºС в атмосфере аргона в отсутствии растворителя в течение 8 ч. Продукт выделяют колоночной хроматографией (хлороформ-этилацетат 9:1, R f 0,3) Получают 100 мг (65 %). Спектр ЯМР 1H (400 МГц, CDCl 3 , м. д., J /Гц): 8,35–8,32 (м, 2Н, С 6 H 4 Cl); 7,73–7,68 (м, 2Н, С 6 H 4 Br); 7,63–7,60 (м, 2Н, С 6 H 4 Br); 7,58–7,54 (м, 2Н, С 6 H 4 Cl); 2,61 (с, 3Н, CH 3 ). MS EI: m/z ( I , %): 474 (100), 475 (19,5) [M]+, 476 (97,2), 477 (18,9) [M+1]+, 478 (31,1), 479 (6,1), 480 (1,4) [M+2]+.
Синтез 3-(4-бромфенил)-6-(4-хлорфенил)-N-(5-(метилсульфанил)-4H-1,2,4-триазол-3- ил)пиридин-2-амина (4)
Реакция проводится в колбе-автоклаве в атмосфере аргона. Исходный 5-аминотриазин (100 мг, 0,21 ммоль) растворяют в 15 мл 1,2-дихлорбензола, после чего к нему добавляют 0,1 мл 2,5-норборнадиена (1,05 ммоль). Полученную смесь перемешивают в течение 24 ч при 215 ºС. Затем растворитель отгоняют при пониженном давлении, продукт выделяют колоночной хроматографией (хлороформ-этилацетат 9:1, R f 0,7). Получают 53 мг (53 %). Аналитический образец получен перекристаллизацией из этанола. Спектр ЯМР 1H (400 МГц, CDCl 3 , м. д., J /Гц): 12,37 (уш. с, 1Н, NH триазол); 7,83–7,80 (м, 2Н, С 6 H 4 Cl); 7,70–7,66 (м, 2Н, С 6 H 4 Br); 7,65–7,63 (уш. с, 1Н, NH); 7,61 (д, 1H, 3J = 7,6 Гц, H-3); 7,52–7,49 (м, 2Н, С 6 H 4 Br); 7,37 (д, 1H, 3J = 7,6 Гц, H-4); 7,33–7,30 (м, 2Н, С 6 H 4 Cl); 2,57 (с, 3Н, CH 3 ). Спектр ЯМР 13С (100 МГц, CDCl 3 , м. д.): 159,37; 154,59; 151,89; 149,31; 139,59; 137,23; 135,72; 134,11; 133,08; 130,55; 129,46; 128,10; 123,50; 121,98; 114,52; 14,12. MS EI: m/z ( I , %): 472 (100), 473 (21,6) [M]+, 474 (97,3), 475 (21) [M+1]+, 476 (31,1), 477 (6,7), 478 (1.4) [M+2]+. Найдено, % : C 50,82; H 3,18; N 14,80. Вычислено, %: C 50,81; H 3,20; N 14,81.
Масс-спектры (тип ионизации - электронный удар) записаны на приборе Shimadzu GCMS-QP2010 Ultra.
Спектры ЯМР 1H и 13С записаны на спектрометре Bruker Avance-400 (400 МГц, внутренний стандарт – SiMe 4 ).
Элементный анализ выполнен на CHN анализаторе РЕ 2400 II фирмы Perkin Elmer.
Рентгеноструктурный анализ (РСА) кристалла 4 проведен на автоматическом четырехкружном дифрактометре D8 QUEST фирмы Bruker (Mo Kα-излучение, λ = 0,71073 Å, графитовый монохроматор). Все расчеты по определению и уточнению структур выполнены с помощью программ Olex2 [13], ShelXS-1997 [14] и ShelXL [15]. Структуры определены прямым методом и уточнены методом наименьших квадратов в анизотропном приближении для неводородных атомов. Положение атомов водорода уточняли по модели наездника (Uизо(H) = 1,2Uэкв(C)). Кристаллографические данные и результаты уточнения структур приведены в таблице. Полные таблицы координат атомов, длин связей и валентных углов депонированы в Кембриджском банке структурных данных (№ 2150484; ; .
Кристаллографические данные, параметры эксперимента и уточнение структуры 4
|
Параметр |
4 |
|
Формула |
C 40 H 30 N 10 S 2 Cl 2 Br 2 |
|
М |
945,58 |
|
Сингония |
Триклинная |
|
Пр. группа |
Р– 1 |
|
a , Å |
11,82(4) |
|
b, Å |
13,82(5) |
|
c, Å |
15,68(6) |
|
α ,º |
112,1(2) |
|
β,º |
108,61(12) |
|
γ ,º |
93,97(13) |
|
V , Å3 |
2196(14) |
|
Z |
2 |
|
ρ (выч.), г/см3 |
1,430 |
|
µ , мм–1 |
2,103 |
|
F (000) |
952,0 |
|
Размер кристалла, мм |
0,5 × 0,39 × 0,3 |
|
Область сбора данных по 2 θ , град. |
5,46–58,68 |
|
Интервалы индексов отражений |
–15 ≤ h ≤ 15, –18 ≤ k ≤ 18, –20 ≤ l ≤ 20 |
|
Измерено отражений |
52968 |
|
Независимых отражений |
10206 |
|
R int |
0,1437 |
|
Переменных уточнения |
507 |
|
GOOF |
1,355 |
|
R -факторы по F 2 > 2 σ ( F 2) |
R 1 = 0,1239, wR 2 = 0,3833 |
|
R-факторы по всем oтражениям |
R 1 = 0,2097, wR 2 = 0,4239 |
|
Остаточная электронная плотность (max/min), e/A3 |
1,77/–0,80 |
Обсуждение результатов
В качестве исходного соединения в данной работе был использован 5-цианотриазин ( 1 ). Его взаимодействие с 5-метилсульфанилтриазол-3-амином ( 2 ) в условиях, использованных нами ранее для введения фрагментов других (гетеро)циклических аминов в состав триазинового ядра [16, 17], привело к получению 6-(4-бромфенил)-3-(4-хлорфенил)- N -[5-(метилсульфанил)-4 H -1,2,4-триазол-3-ил]-1,2,4-триазин-5-амина ( 3 ):
N
MeS H
N
Solvent-free
NH2
SMe
В отличие от ранее [11] описанного нами случая метилирование атома серы в составе триазола привело к изменению характера взаимодействия. А именно, метилсульфанильная группа не претерпела каких-либо изменений в ходе реализации этой стадии. Структура продукта 3 была подтверждена данными спектров ЯМР 1 Н и масс-спектрометрии (электроспрей). Так, в спектре ЯМР 1 Н может быть отмечено наличие характеристичного трехпротонного синглета в области 2,61 м. д., соответствующего метилсульфанильной группе.
Известно, что 1,2,4-триазины являются синтетическими предшественниками соответствующих пиридинов [18, 19]. Причем такой подход зачастую обеспечивает получение соединений, крайне труднодоступных с применением других методов. В соответствие с этим, мы провели взаимодействие триазина 3 с 2,5-норборнадиеном в условиях, которые были ранее использованы нами для получения пиридинов, имеющих в альфа-положении остатки другого гетероциклического амина, в частности, пиразол-4-амина [20], т. е. в автоклаве в среде 1,2-дихлорбензола при 215 ºС. Применение данных условий обусловлено тем фактом, что в традиционных условиях (кипячение в высококипящих органических растворителя, таких как о -ксилол или 1,2-дихлорбензол) подобное превращение не реализуется. В результате этого целевой 3-(4-бромфенил)-6-(4-хлорфенил)- N -(5-(метилсульфанил)-4 H -1,2,4-триазол-3-ил)пиридин-2-амин ( 4 ) был успешно получен с выходом 53 %. В ходе этой стадии также не наблюдалось каких-либо трансформаций метилсульфанильной группы. Структура продукта 4 была подтверждена данными спектров ЯМР 1 Н, 13С, масс-спектрометрии и элементного анализа. В частности, в спектре ЯМР 1 Н могут быть отмечены два дублета протонов нового пиридинового кольца в области 7,37 и 7,61 м. д. Кроме этого, нам удалось получить кристаллы соединения 4 , пригодные для РСА, и изучить его строение этим методом. Структура представлена на рис. 1.
Рис. 1. Строение соединения 4 в представлении атомов эллипсоидами тепловых колебаний с 50%-ной вероятностью (показана одна из двух кристаллографически независимых молекул)
По данным РСА две кристаллографически независимые молекулы соединения 4 кристаллизуются в нецентросимметричной пространственной группе Р -1 триклинной сингонии. Формирование кристаллической структуры характеризуется множественными межмолекулярными контактами N—H типа между двумя кристаллографически независимыми молекулами триазолилпи-ридин-2-амина 4 . При этом расстояния между атомами азота и водорода меньше, чем сумма ван-дер-ваальсовых радиусов соответствующих атомов (2,65 А [21] (рис. 2).
Упаковка молекул соединения 4 характеризуется образованием длинных цепей за счёт межмолекулярных коротких контактов типа N—Br с расстоянием между указанными атомами для разных кристаллографически независимыми молекул 3,163 А и 3,088 А (рис. 3), тогда как сумма ван-дер-ваальсовых радиусов атомов составляет 3,38 А. Ранее в литературе уже была проанализирована природа межмолекулярных взаимодействий между связанными с углеродом галогенами (C-X, где X = F, Cl, Br или I) и электроотрицательными атомами (N, O и S). Поиск в Кембриджской структурной базе данных показал, что электроотрицательные атомы в различных состояниях гибридизации явно предпочитают образовывать контакты с Cl, Br и I (но не F) в направлении расширенной оси связи C-X на межатомных расстояниях, меньших суммы ван-дер-ваальсовых
Рис. 2. Межмолекулярные контакты N∙∙∙H типа между двумя кристаллографически независимыми молекулами соединения 4
радиусов [22]. Недавно на основании данных квантово-химических расчетов, в частности, на основании топологического анализа распределения электронной плотности, были подтверждены выявленные по данным РСА контакты I—N на примере солей (Ph2I)2[M(CN)4] (где M = Ni, Pd), а также сделано отнесение их к галогенным связям. При этом атом галогена является электрофильным центром, атом азота - нуклеофильным. Установлено, что образование подобной галогенной связи происходит с участием неподелённой пары атома азота [23].
Рис. 3. Межмолекулярные контакты N—Br типа в кристалле соединения 4
Необходимо отметить, что пиридины, имеющие в альфа-положении остаток 4 H -1,2,4-триазол-3-амина, представляют непосредственный практический интерес, в частности, с точки зрения биологической активности. Так, среди этих соединений имеются ингибиторы ферментов [24, 25].
Выводы
Таким образом, нами показана возможность функционализации 1,2,4-триазинов фрагментом 5-метилсульфанил-4 H -1,2,4-триазол-3-амина в результате нуклеофильного ипсо -замещения цианогруппы в положении С5 триазина, а также последующего превращения триазинового цикла в пиридиновый в результате реакции с 2,5-норборнадиеном. При этом ранее нашей научной группой было установлено, что при наличии меркаптогруппы в положении С5 триазола имеет место десульфирование в ходе ипсо -замещения цианогруппы триазина. Однако, её замена на метилсульфанильную группу меняет характер взаимодействия, и в ходе реализации обеих стадий синтеза отсутствуют какие-либо её трансформации, что подтверждено в том числе данными РСА полученного замещенного пиридина.
Финансирование
Работа выполнена при поддержке Министерства науки и высшего образования Российской Федерации (грант № 075-15-2022-1118 от 29 июня 2022 г.).
Список литературы Синтез производных N-(5-(метилсульфанил)- 4H-1,2,4-триазол-3-ил)пиридин-2-амина и их 1,2,4-триазиновых предшественников
- The Significance of 1,2,4-Triazoles in Agriculture Science: A Review / S. Sahoo, K.N. Sindhu, K. Sreeveena // Research J. Pharm. and Tech. 2019; No. 12. P. 5091-5097. DOI: 10.5958/0974-360X.2019.00882.5.
- Ингибитор коррозии меди и медьсодержащих сплавов в нейтральных растворах хлоридов (варианты): патент РФ № 2679022 C2, 05.02.2019.
- 1,2,4-Triazoles: A Review of Synthetic Approaches and the Biological Activity / S. Maddila, R. Pagadala, SB. Jonnalagadda // Lett. Org. Chem. 2013. No. 10. P. 693-714. DOI: 10.2174/157017861010131126115448.
- Synthesis and biological evaluation of heterocyclic 1,2,4-triazole scaffolds as promising pharmacological agents / M. Kumari, S. Tahlan, B. Narasimhan et al. // BMC Chemistry 2021. No. 15. P. 5. DOI: 10.1186/s13065-020-00717-y.
- 1,2,4-Triazoles as Important Antibacterial Agents / M. Strzelecka, P. Swiatek // Pharmaceuticals 2021. No. 14. P. 224. DOI: 10.3390/ph14030224.
- Натриевая соль 2-метилтио-6-нитро-7-оксо-[5,1-c]-1,2,4-триазин-7-(4Н)-она, дигидрат, обладающая противовирусной активностью: патент РФ № 2294936, 10.03.2007 г.
- 5-Метил-6-нитро-7-оксо-1,2,4-триазоло[1,5-а]пиримидинид l-аргининия моногидрат: патент РФ № 2529487, 27.09.2014.
- 1,2,4-triazine derivatives: Synthesis and biological applications / M. Arshad, T.A. Khan, M.A. Khan // Int. J. Pharm. Sci. 2014. No. 5. P. 149-162. DOI: 10.1002/chin.201504278.
- An extensive review on 1,2,3 and 1,2,4-triazines scaffold-valuable lead molecules with potent and diverse pharmacological activities / D.S. Rao, G.V.P. Kumar1, B. Pooja et al. // Der Chemica Sinica 2016. No. 7. P. 101-130.
- Synthesis and Tuberculostatic Activity of Some 1,2,4-Triazines / E.V. Shchegol'kov, O.G. Khudina, A.E. Ivanova et al. // Pharm. Chem. J. 2014. No. 48. P. 383-386. DOI: 10.1007/s11094-014-1115-6.
- Reaction of 3-Amino-5#- and 3-Amino-5-sulfanyl-1,2,4-triazoles with 1,2,4-Triazine-5-carbonitriles / A.P. Krinochkin, M R. Guda, D.S. Kopchuk et al. // Russ. J. Org. Chem. 2022. No. 58. P. 188-191. DOI: 10.1134/S1070428022020051.
- Transformations of 1,2,4-Triazines in Reactions with Nucleophiles: V. SNH and ipso-Substitution in the Synthesis and Transformations of 5-Cyano-1,2,4-triazines / D.N. Kozhevnikov, V.N. Kozhevnikov, I S. Kovalev et al. // Russ. J. Org. Chem. 2002. No. 38. P. 744-750. DOI: 10.1023/A:1019631610505.
- OLEX2: a complete structure solution, refinement and analysis program / O.V. Dolomanov, L.J. Bourhis, R.J. Gilde et al. // J. Appl. Cryst. 2009. No. 42. P. 339-341. DOI: 10.1107/S0021889808042726.
- A short history of SHELX / G.M. Sheldrick // Acta Cryst. 2008. No. A64. P. 112-122. DOI: 10.1107/S0108767307043930.
- Crystal structure refinement with SHELXL / G.M. Sheldrick // Acta Cryst. 2015. No. C71. P. 3-8. DOI: 10.1107/S2053229614024218.
- Solvent-free synthesis of 5-(aryl/alkyl)amino-1,2,4-triazines and a-arylamino-2,2'-bipyridines with greener prospects / D.S. Kopchuk, N.V. Chepchugo, I.S. Kovalev et al. // RSC Adv. 2017. No. 7. P. 9610-9619. DOI: 10.1039/c6ra26305d.
- Synthesis of 5-[(Thiophen-3-yl)amino]-1,2,4-triazines / A.P. Krinochkin, M.R. Guda, D.S. Kopchuk et al. // Russ. J. Org. Chem. 2021. No. 57. P. 675-677. DOI: 10.1134/S1070428021040278.
- Reactions of triazines and tetrazines with dienophiles (Review) / A.M. Prokhorov, D.N. Kozhevnikov // Chem. Heterocycl. Compd. 2012. No. 48. P. 1153-1176. DOI: 10.1007/s10593-012-1117-9.
- Tandem inverse-electron-demand hetero-/retro-Diels-Alder reactions for aromatic nitrogen he-terocycle synthesis / A AR. Foster, M.C. Willis // Chem. Soc. Rev. 2013. No. 42. P. 63. DOI: 10.1039/C2CS35316D.
- 1#-Pyrazole-Appended Pyridines and Their 1,2,4-Triazine Precursors: A Rational Synthesis and in silico and in vitro Evaluation of Anti-Cancer Activity / A.P. Krinochkin, Y.K. Shtaitz, A. Ram-mohan et al. // Eur. J. Org. Chem. 2022. No. 22. P. e202200227. DOI: 10.1002/ejoc.202200227.
- Consistent van der Waals Radii for the Whole Main Group / M. Mantina, A.C. Chamberlin, R. Valero et al. // J. Phys. Chem. A. 2009. No. 113. P. 5806-5812. DOI: 10.1021/jp8111556.
- The Nature and Geometry of Intermolecular Interactions between Halogens and Oxygen or Nitrogen / J.P.M. Lommerse, A.J. Stone, R. Taylor et al. // J. Am. Chem. Soc. 1996. No. 118. P. 31083116. DOI: 10.1021/ja953281x.
- Суслонов В.В. Межмолекулярные взаимодействия с участием анионных комплексов пла-тины(11): дис. ... канд. хим. наук. СПб., 2022. 197 с.
- DNA-PK inhibitors: patent EP № 2841428 A1, 04.03.2015.
- Aminotriazole compounds useful as inhibitors of protein kinases: patent US №261268 A1, 24.11.2005.