Современные достижения компьютерного моделирования вирусных частиц

Современные достижения компьютерного моделирования вирусных частиц

Автор: Чиряпкин Алексей Сергеевич, Глушко Александр Алексеевич, Чиряпкин Виталий Сергеевич, Гендугов Тембот Алимович

Журнал: Бюллетень науки и практики @bulletennauki

Рубрика: Биологические науки

Статья в выпуске: 6 т.5, 2019 года.

Бесплатный доступ

Компьютерное моделирование является бурно развивающимся методом научных исследований. В настоящее время проводятся вычислительные эксперименты в различных областях человеческой деятельности, в том числе в медицинской и фармацевтической. В данной статье рассматриваются современные достижения и научные подходы компьютерного моделирования вирусных частиц. Проводится анализ публикаций, приведены сведения о достижениях в этой области. В заключении авторы делают вывод о перспективах дальнейшего развития исследований и области их применения. Наибольшее значение данные работы в современном мире приобретают в области медицины и фармакологии.

Еще

Компьютерное моделирование, вирус, достижение, применение, фармация, медицина

Короткий адрес: https://sciup.org/14115547

IDR: 14115547   |   DOI: 10.33619/2414-2948/43/07

Список литературы Современные достижения компьютерного моделирования вирусных частиц

  • Шредингер Э. Что такое жизнь? Физический аспект живой клетки. Ижевск: РХД. 2002.
  • Brooks B. R., Bruccoleri R. E., Olafson B. D., States D. J., Swaminathan S., Karplus M. CHARMM: A program for macromolecular energy, minimization, and dynamics calculations // J Comp Chem. 1983. V. 4. №. 2. P. 187-217. DOI: 10.1002/jcc.540040211
  • Foresman J. B., Frish A. Exploring Chemistry with Electronic Structures Methods. Second Edition. 1996. Gaussian Inc., Pittssburg, p. 302.
  • Шилов М. А., Веселов В. В. Компьютерное моделирование молекулярных систем методом молекулярной динамики. Иваново: ИГТА. 2010. 168 с.
  • Schlecht M. F. Molecular Modeling on the PC 1998, 763 pages. New York: Wiley-VCH
  • Чиряпкин А. С., Глушко А. А. Математическое моделирование в области медицины и фармации // Ростовский научный журнал. 2019. № 3. С. 343-351.
  • Букринская А. Г. Вирусология. М.: Медицина, 1986. 336 с.
  • Miller A. D. Human gene therapy comes of age // Nature. 1992. V. 357. P. 455-460.
  • DOI: 10.1038/357455a0
  • Douglas T., Young M. Host-guest encapsulation of materials by assembled virus protein cages // Nature. 1998. V. 393. P. 152-155.
  • DOI: 10.1038/30211
  • Destito G., Yeh R., Rae C.S., Finn M.G., Manchester M. Folic acid-mediated targeting of cowpea mosaic virus particles to tumor cells // Chem. Biol. 2007. V. 14. № 10. P. 1152-1162.
  • DOI: 10.1016/j.chembiol.2007.08.015
  • Gupta S. S., Raja K. S., Kaltgrad E., Strable E., Finn M. G. Virus-glycopolymer conjugates by copper(i) catalysis of atom transfer radical polymerization and azide-alkyne cycloaddition // Chem. Commun. 2005. V. 34. P. 4315-4317.
  • DOI: 10.1039/B502444G
  • Dick G. W., Kitchen S. F., Haddow A. Zika virus. I. Isolations and serological specificity // J. Trans R Soc Trop Med Hyg. 1952. V. 46. P. 509-520.
  • Schuler-Faccini L., Ribeiro E. M., Feitosa I. M., Horovitz D. D., Cavalcanti D. P., Pessoa A., Doriqui M. J., Neri J. I., Neto J. M., Wanderley H. Y., Cernach M., El-Husny A. S., Pone M. V., Serao C. L., Sanseverino M. T. Brazilian Medical Genetics Society-Zika Embryopathy Task Force. Possible association between zika virus infection and microcephaly - Brazil // MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2016. V. 65. P. 59-62.
  • Козлов А. Е., Казанцев А. В., Ляпина Е. П. Лихорадка зика как глобальная угроза общественному миру // Бюллетень медицинских Интернет-конференций. 2016. T. 6. C. 625-626.
  • Sirohi D., Chen Z., Sun L., Klose T., Pierson T. C., Rossmann M. G., Kuhn R. J. The 3.8 angstrom resolution cryo-EM structure of Zika virus // Science. 2016. V. 352. P. 467-470.
  • DOI: 10.1126/science.aaf5316
  • Павлович С. А. Основы вирусологии. Мн.: Выш. шк. 2001. 192 с.
  • Wales D. J. The energy landscape as a unifying theme in molecular science // Philos. Trans. R. Soc. A. 2005. V. 363. P. 357-377.
  • DOI: 10.1098/rsta.2004.1497
  • Johnston I. G, Louis A. A., Doye J. P. K. Modelling the self-assembly of virus capsids // Journal of Physics: Condensed Matter. 2010. V. 22. № 10. P. 104101.
  • DOI: 10.1088/0953-8984/22/10/104101
  • Perilla J. R., Schulten K. Physical properties of the HIV-1 capsid from all-atom molecular dynamics simulations // Nature Communications. 2017. V. 8. № 15959.
  • DOI: 10.1038/ncomms15959
Еще
Статья обзорная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp