Сравнительный анализ бактериального сообщества рубца у молодых и взрослых особей Rangifer tarandus из арктических регионов России в летне-осенний период

Сравнительный анализ бактериального сообщества рубца у молодых и взрослых особей Rangifer tarandus из арктических регионов России в летне-осенний период

Автор: Ильина Л.А., Лайшев К.А., Йылдырым Е.А., Филиппова В.А., Дуняшев Т.П., Дубровин А.В., Никонов И.Н., Новикова Н.И., Лаптев Г.Ю., Южаков А.А., Романенко Т.М., Вылко Ю.П.

Журнал: Сельскохозяйственная биология @agrobiology

Рубрика: Северное оленеводство

Статья в выпуске: 2 т.53, 2018 года.

Бесплатный доступ

Оленеводство - стратегически значимая отрасль животноводства в арктических регионах Российской Федерации. На сегодняшний день микробиоценоз рубца у северного оленя (в сравнении с другими жвачными) наименее изучен, хотя его анализ представляет значительный интерес в связи с оценкой адаптационно-физиологических и анатомических приспособлений организма, позволяющих использовать скудные питательные ресурсы тундры и лесотундры. В настоящей работе впервые выполнены молекулярно-генетические исследования микробиома рубца северных оленей ненецкой породы, обитающих на территории двух регионов Арктической зоны России. Цель работы заключалась в сравнительной оценке таксономического состава бактериального сообщества рубца молодых и взрослых особей Rangifer tarandus из разных мест обитания. Образцы содержимого рубца отбирали в летне-осенний период в 2017 году от трех молодых (возраст 1-2 года) и трех взрослых особей (3-6 лет) из каждой возрастной группы в Ямало-Ненецком автономном округе (АО) и Мурманской области. Состав бактериального сообщества рубца анализировали методам Т-RFLP (terminal restriction fragment length polymorphism). У северных оленей из Ямало-Ненецкого АО разнообразие микроорганизов в рубце было достоверно более высоким (Р

Еще

Микроорганизмы рубца, северный олень, молекулярно-генетические методы, арктика

Короткий адрес: https://sciup.org/142214135

IDR: 142214135   |   DOI: 10.15389/agrobiology.2018.2.355eng

Список литературы Сравнительный анализ бактериального сообщества рубца у молодых и взрослых особей Rangifer tarandus из арктических регионов России в летне-осенний период

  • Orpin C.G., Mathiesen S.D., Greenwood Y., Blix A.S. Seasonal changes in the ruminal microflora of the high-arctic Svalbard reindeer (Rangifer tarandus platyrhynchus). Appl. Environ. Microb., 1985, 50(1): 144-151.
  • Sundset M.A., Edwards J.E., Cheng Y.F., Senosiain R.S., Fraile M.N., Northwood K.S., Præsteng K.E., Glad T., Mathiesen S.D., Wright A.D.G. Molecular diversity of the rumen microbiome of Norwegian reindeer on natural summer pasture. Microb. Ecol., 2009, 57: 335-348 ( ) DOI: 10.1007/s00248-008-9414-7
  • Mathiesen S.D., Mackie R.I., Aschfalk A., Ringø E., Sundset M.A. Microbial ecology of the gastrointestinal tract in reindeer -changes through season. In: Microbial ecology of the growing animal; Biology of the growing animals. V. 3/W. Holzapfel, P. Naughton (eds.). Elsevier Press, Oxford: 73-100.
  • Sundset M.A., Edwards J.E., Cheng Y.F., Senosiain R.S., Fraile M.N., Northwood K.S., Praesteng K.E., Glad T., Mathiesen S.D., Wright A.D. Rumen microbial diversity in Svalbard reindeer, with particular emphasis on methanogenic archaea. FEMS Microbiol. Ecol., 2009, 70(3): 553-562 ( ) DOI: 10.1111/j.1574-6941.2009.00750.x
  • Sundset M.A., Præsteng K.E., Cann I.K.O., Mathiesen S.D., Mackie R.I. Novel rumen bacterial diversity in two geographically separated sub-species of reindeer. Microb. Ecol., 2007, 54: 424-438 ( ) DOI: 10.1007/s00248-007-9254-x
  • Orpin C.G., Joblin K.N. The rumen anaerobic fungi. In: The rumen microbial ecosystem/P.N. Hobsen, C.S. Stewart (eds.). Blackie Academic & Professional, London, 1997: 140-195.
  • Тараканов Б.В. Методы исследования микрофлоры пищеварительного тракта сельскохозяйственных животных и птицы. М., 2006.
  • Church D.C. Ruminant animal: Digestive physiology and nutrition. Prentice Hall, New Jersey, 1993.
  • Hungate R.E. The rumen and its microbes. Academic Press, NY, 1966.
  • Jami E., Mizrahi I. Composition and similarity of bovine rumen microbiota across individual animals. PLoS ONE, 2012, 7(3): e33306 ( ) DOI: 10.1371/journal.pone.0033306
  • Veneman J.B., Muetzel S., Hart K.J., Faulkner C.L., Moorby J.M., Perdok H.B. Does dietary mitigation of enteric methane production affect rumen function and animal productivity in dairy cows? PLoS ONE, 2015, 10(10): e0140282 ( ) DOI: 10.1371/journal.pone.0140282
  • Snelling T.J., Genç B., McKain N., Watson M., Waters S.M., Creevey C.J., Wallace R.J. Diversity and community composition of methanogenic archaea in the rumen of Scottish upland sheep assessed by different methods. PLoS ONE, 2014, 9(9): e106491 ( ) DOI: 10.1371/journal.pone.0106491
  • de la Fuente G., Belanche A., Girwood S.E., Pinloche E., Wilkinson T., Newbold C.J. Pros and cons of Ion-Torrent next generation sequencing versus Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism T-RFLP for studying the rumen bacterial community. PLoS ONE, 2014, 9(7): e101435 ( ) DOI: 10.1371/journal.pone.0101435
  • Salgado-Flores A., Hagen L.H., Ishaq S.L., Zamanzadeh M., Wright A.-D.G., Pope P.B. Rumen and cecum microbiomes in reindeer (Rangifer tarandus tarandus) are changed in response to a lichen diet and may affect enteric methane emissions. PLoS ONE, 2016, 11(5): e0155213. ( ) DOI: 10.1371/journal.pone.0155213
  • Han X., Yang Y., Yan H., Wang X., Qu L., Chen Y. Rumen bacterial diversity of 80 to 110-day-old goats using 16S rRNA sequencing. PLoS ONE, 2015, 10(2): e0117811 ( ) DOI: 10.1371/journal.pone.0117811
  • Wang L., Xu Q., Kong F., Yang Y., Wu D., Mishra S., Li Y. Exploring the goat rumen microbiome from seven days to two years. PLoS ONE, 2016, 11(5): e0154354 ( ) DOI: 10.1371/journal.pone.0154354
  • Zielińska S., Kidawa D., Stempniewicz L., Łoś M., Łoś J.M. New insights into the microbiota of the Svalbard Reindeer Rangifer tarandus platyrhynchus. Front. Microbiol., 2016, 7: 170 ( ) DOI: 10.3389/fmicb.2016.00170
  • Gruninger R.J., Sensen C.W., McAllister T.A., Forster R.J. Diversity of rumen bacteria in Canadian cervids. PLoS ONE, 2014, 9(2): e89682 ( ) DOI: 10.1371/journal.pone.0089682
  • Zhi-Peng L., Na J., Han-Lu L., Xue-Zhe C., Yi J., Fu-He Y., Guang-Yu L. Analysis of bacterial diversity in rumen of sika deer (Cervus nippon) fed different forages using DGGE and T-RFLP. China Agriculture Science, 2014, 47(4): 759-768 ( ) DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2014.04.016
  • Лаптев Г.Ю., Новикова Н.И., Ильина Л.А., Йылдырым Е.А., Нагорнова К.В., Думова В.А., Солдатова В.В., Большаков В.Н., Горфункель Е.П., Дубровина Е.Г., Соколова О.Н., Никонов И.Н., Лебедев А.А. Нормы содержания микрофлоры в рубце крупного рогатого скота. СПб, 2016.
  • Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Молекулярное клонирование. М., 1984.
  • Самандас А.М., Лайшев К.А., Самойлов С.Г. Современная эпизоотическая ситуация по некробактериозу северных оленей на Таймыре. Сибирский вестник сельскохозяйственной науки, 2011, 5-6: 92-96.
  • Лайшев К.А., Самандас А.М., Митюков А.С., Прокудин А.В., Силкина Е.В. Эпизоотологический мониторинг основных болезней животных на крайнем севере. Известия Санкт-Петербургского государственного аграрного университета, 2011, 24: 118-121.
  • Nelson K.E., Zinder S.H., Hance I., Burr P., Odongo D., Wasawo D., Odenyo A., Bishop R. Phylogenetic analysis of the microbial populations in the wild herbivore gastrointestinal tract: insights into an unexplored niche. Environ. Microbiol., 2003, 5: 1212-1220 ( ) DOI: 10.1046/j.1462-2920.2003.00526.x
  • Roach J.A.G., Musser S.M., Morehouse K., Woo J.Y.J. Determination of usnic acid in lichen toxic to elk by liquid chromatography with ultraviolet and tandem mass spectrometry determination. J. Agr. Food Chem., 2006, 54: 2484-2490 ( ) DOI: 10.1021/jf052767m
  • Лузина О.А., Салахутдинов Н.Ф. Биологическая активность усниновой кислоты и ее производных. Ч. 2. Действие усниновой кислоты и ее производных на высшие организмы, молекулярные и физико-химические аспекты биологической активности (обзорная статья). Биоорганическая химия, 2016, 3(42), 2016: 276 ( ) DOI: 10.7868/S0132342316030106
  • Sundset M.A., Kohn A., Mathiesen S.D., Præsteng K.E. Eubacterium rangiferina, a novel usnic acid-resistant bacterium from the reindeer rumen. 2008. Naturwissenschaften, 95: 741-749 ( ) DOI: 10.1007/s00114-008-0381-0
  • Панкратов Т.А., Качалкин А.В., Корчиков Е.С., Добровольская Т.Г. Микробные сообщества лишайников. Микробиология, 2017, 3(86): 265-283 ( ) DOI: 10.7868/S0026365617030156
  • Nocek J.E. Bovine acidosis: implications on laminitis. J. Dairy Sci., 1997, 80: 1005-1028 ( ) DOI: 10.3168/jds.S0022-0302(97)76026-0
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp