Суперкомпьютерный анализ геномных и транскриптомных данных, полученных с помощью технологий высокопроизводительного секвенирования ДНК
Автор: Спицина Анастасия Михайловна, Орлов Юрий Львович, Подколодная Наталья Николаевна, Свичкарев Анатолий Владленович, Дергилев Артур Игоревич, Чен Минг, Кучин Николай Владимирович, Черных Игорь Геннадьевич, Глинский Борис Михайлович
Журнал: Программные системы: теория и приложения @programmnye-sistemy
Рубрика: Программное и аппаратное обеспечение распределенных и суперкомпьютерных систем
Статья в выпуске: 4 (31) т.7, 2016 года.
Бесплатный доступ
Развитие технологий высокопроизводительного секвенирования ДНК привело к появлению нового класса объемных геномных данных и алгоритмов их обработки и анализа. Суперкомпьютерные вычисления являются необходимым инструментом работы с генетическими данными. Представлены задачи геномики и транскриптомики, анализа экспрессии генов в контексте вычислительной сложности. Дан обзор компьютерных подходов и разработанных авторами программ для решения задач, возникающих при аннотации геномных данных и анализе экспрессии генов
ID: 14336096 Короткий адрес: https://sciup.org/14336096
