Таксономический состав микробного сообщества горячего источника Алла (Байкальская рифтовая зона)
Автор: В. Г. Будагаева, А. А. Раднагуруева, А. В. Малыгин, Д. Д. Бархутова
Журнал: Вестник Бурятского государственного университета. Биология, география @vestnik-bsu-biology-geography
Рубрика: Биология. Микробиология, ботаника, зоология
Статья в выпуске: 1, 2021 года.
Бесплатный доступ
Методом секвенирования гена 16S рРНК изучено разнообразие микробного сообщества в различных биотопах горячего источника Алла. В сообществах воды, микробных матов и осадка выявлены филотипы, принадлежащие к 17 филумам домена Bacteria и 1 — домена Archaea. Видовое богатство и разнообразие микробного сообщества было выше в микробных матах и донных осадках, чем в воде. Особенностью таксономического состава донных осадков является присутствие архей типа Crenarchaeota. Показано влияние температуры на таксономический состав микробного сообщества. При температуре 58–64 ºС преобладали филогенетически разнообразные группы Atribacteria, Nitrospirae, Chloroflexi. При понижении температуры в микробном сообществе доминировали Proteobacteria. При температуре 34 ºС термофильные бактерии филумов Atribacteria, Nitrospirae, Deinococcus-Thermus в микробном мате не выявлены.
Таксономическое разнообразие, нуклеотидные последовательности, микробные маты, горячий источник, Байкальская рифтовая зона
Короткий адрес: https://sciup.org/148317166
IDR: 148317166 | DOI: 10.18101/2587-7148-2021-1-3-11
Список литературы Таксономический состав микробного сообщества горячего источника Алла (Байкальская рифтовая зона)
- Badhai J., Ghosh T. S., Das K. S. Taxonomic and functional characteristics of microbial communities and their correlation with physicochemical properties of four geothermal springs in Odisha, India // Frontiers in Microbiology. 2015. V. 6. № 1166.
- Differences in temperature and water chemistry shape distinct diversity patterns in thermo- philic microbial communities / C. M. Chiriac [et al.] // Appl Environ Microbiol. 2017. V.83 (21). https://doi.org/10.1128/AEM.01363–17.
- Filamentous anoxygenic phototrophic bacteria from cyanobacterial mats of Alla hot springs (Barguzin Valley, Russia) / V.A. Gaisin [et al.] // Extremophiles. 2015. V.19. P. 1067–1076. DOI 10.1007/s00792–015–0777–7
- Genomic and metagenomic insights into the microbial community of a thermal spring / R. Pedron [et al.] // Microbiome. 2019. p. 7:8. https://doi.org/10.1186/s40168–019–0625–6
- Comparative Analysis of Microbial Diversity Across Temperature Gradients in Hot Springs From Yellowstone and Iceland / P. T. Podar [et al.] // Front. Microbiol., 2020. 14 July. https://doi. org/10.3389/fmicb.2020.01625
- Ward D. M. Microbial diversity in natural environments: focusing on fundamental ques- tions// Antonie van Leeuwenhoek. 2006. V. 90. P. 309–324. DOI 10.1007/s10482–006–9090-x
- Wilson K. Preparation of Geomic DNA from Bacteria // Current Protocols in Molecular Biology. 2001. Chapter 2: Unit 2.4. DOI: 10.1002/0471142727.mb0204s56.
- Distribution of Acetothermia-dominated microbial communities in alkaline hot springs of Baikal Rift Zone / S. V. Zaitseva [et al.] // PeerJ Preprints. 2017. https://doi.org/10.7287/peerj. preprints.3492v1 | CC BY4.0 Open Access | rec: 27 Dec 2017, publ: 28
