Тест-системы ПЦР для выявления генома каприпоксвирусов и вируса заразного узелкового дерматита

Тест-системы ПЦР для выявления генома каприпоксвирусов и вируса заразного узелкового дерматита

Автор: Спрыгин А.В., Пестова Я.Е., Кострова Е.С., Кононова С.В., Бьядовская О.П., Жбанова Т.В., Кононов А.В.

Журнал: Сельскохозяйственная биология @agrobiology

Рубрика: Диагностика инфекций

Статья в выпуске: 2 т.54, 2019 года.

Бесплатный доступ

Интенсификация животноводства неизбежно повышает риски заноса и распространения инфекционных заболеваний, из которых наиболее опасны трансграничные. Инфекции крупного рогатого скота, вызываемые каприпоксвирусами, в частности вирусом заразного узелкового дерматита (ЗУД, Lumpy skin disease, LSD), поражают крупный и мелкий рогатый скоту, нанося существенный экономический ущерб. До 2015 года территория Российской Федерации была благополучна по ЗУД, однако из-за локальных конфликтов на Ближнем Востоке и изменений климата заболевание распространяется в северном направлении (масштабные вспышки LSD в Турции, странах Балканского полуострова, ЕС и в России). Широкое использование живых гомологичных вакцин против LSD в соседних странах также актуализирует разработку методов диагностики этого возбудителя, позволяющих выявлять геномы полевых изолятов и дифференцировать вакцинный вирус ЗУД КРС. Нами впервые в России разработан и валидирован комплекс методов ПЦР в режиме реального времени для однорежимного тестирования проб на наличие генома каприпоксвирусов, полевых изолятов вируса заразного узелкового дерматита и вакцинного вируса ЗУД КРС типа Neethling...

Еще

Заразный узелковый дерматит, нодулярный дерматит, вакцинный штамм, каприпоксвирус, пцр

Короткий адрес: https://sciup.org/142220110

IDR: 142220110   |   DOI: 10.15389/agrobiology.2019.2.347rus

Список литературы Тест-системы ПЦР для выявления генома каприпоксвирусов и вируса заразного узелкового дерматита

  • Coetzer J.A.W. Lumpy skin disease. In: Infectious diseases of livestock/J.A.W. Coetzer, R.C. Tustin (eds.). Oxford University Press, Cape Town, 2004.
  • Hunter P., Wallace D. Lumpy skin disease in southern Africa: a review of the disease and aspects of control. Journal of the South African Veterinary Association, 2001, 72: 68-71 ( ) DOI: 10.4102/jsava.v72i2.619
  • Woods J.A. Lumpy skin disease: a review. Tropical Animal Health and Production, 1988, 20(1): 11-17.
  • Sameea Yousefi P., Mardani K., Dalir-Naghadeh B., Jalilzadeh-Amin G. Epidemiological study of lumpy skin disease outbreaks in North-western Iran. Transboundary and Emerging Diseases, 2016, 64(6): 1782-1789 ( ) DOI: 10.1111/tbed.12565
  • Buller R.M., Arif B.M., Black D.N., Dumbell K.R., Esposito J.J., Lefkowitz E.J., McFad-den G., Moss B., Mercer A.A., Moyer R.W., Skinner M.A., Tripathy D.N. Family Poxviridae. In: Virus taxonomy: classification and nomenclature of viruses. Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses/C.M. Fauquet, M.A. Mayo, J. Maniloff, U. Desselberger, L.A. Ball (eds.). Elsevier Academic Press, San Diego, 2005.
  • Tulman E.R., Afonso C.L., Lu Z., Zsak L., Kutish G.F., Rock D.L. Genome of lumpy skin disease virus. Journal of Virology, 2001, 75(15): 7122-7130 ( )
  • DOI: 10.1128/JVI.75.15.7122-7130.2001
  • Elhaig M.M., Selim A., Mahmoud M. Lumpy skin disease in cattle: frequency of occurrence in a dairy farm and a preliminary assessment of its possible impact on Egyptian buffaloes. Onderstepoort Journal of Veterinary Research, 2017, 84(1): e1-e6 ( )
  • DOI: 10.4102/ojvr.v84i1.1393
  • Gomo C., Kanonhuwa K., Godobo F., Tada O., Makuza S.M. Temporal and spatial distribution of lumpy skin disease (LSD) outbreaks in Mashonaland West Province of Zimbabwe from 2000 to 2013. Tropical Animal Health and Production, 2017, 49(3): 509-514 ( )
  • DOI: 10.1007/s11250-017-1222-y
  • Swiswa S., Masocha M., Pfukenyi D.M., Dhliwayo S., Chikerema S.M. Long-term changes in the spatial distribution of lumpy skin disease hotspots in Zimbabwe. Tropical Animal Health and Production, 2017, 49(1): 195-199 ( )
  • DOI: 10.1007/s11250-016-1180-9
  • Zeynalova S., Asadov K., Guliyev F., Vatani M., Aliyev V. Epizootology and molecular diagnosis of lumpy skin disease among livestock in Azerbaijan. Frontiers in Microbiology, 2016, 7: 1022 ( )
  • DOI: 10.3389/fmicb.2016.01022
  • Carn V.M., Kitching R.P. An investigation of possible routes of transmission of lumpy skin disease virus (Neethling). Epidemiology & Infection, 1995, 114: 219-226 ( )
  • DOI: 10.1017/S0950268800052067
  • Chihota C.M., Rennie L.F., Kitching R.P., Mellor P.S. Mechanical transmission of lumpy skin disease virus by Aedes aegypti (Diptera: Culicidae). Epidemiology & Infection, 2001, 126: 317-321 ( )
  • DOI: 10.1017/S0950268801005179
  • Lubinga J.C., Tuppurainen E.S., Coetzer J.A., Stoltsz W.H., Venter E.H. Transovarial passage and transmission of LSDV by Amblyomma hebraeum, Rhipicephalus appendiculatus and Rhipicephalus decoloratus ticks. Experimental and Applied Acarology, 2014, 62(1): 67-75 ( )
  • DOI: 10.1007/s10493-013-9722-6
  • Tuppurainen E.S., Venter E.H., Coetzer J.A., Bell-Sakyi L. Lumpy skin disease: attempted propagation in tick cell lines and presence of viral DNA in field ticks collected from naturally-infected cattle. Ticks and Tick-borne Diseases, 2015, 6(2): 134-140 ( )
  • DOI: 10.1016/j.ttbdis.2014.11.002
  • Tasioudi K.E., Antoniou S.E., Iliadou P., Sachpatzidis A., Plevraki E., Agianniotaki E.I., Fouki C., Mangana-Vougiouka O., Chondrokouki E., Dile C. Emergence of lumpy skin disease in Greece, 2015. Transboundary and Emerging Diseases, 2016, 63(3): 260-265 ( )
  • DOI: 10.1111/tbed.12497
  • Carn V.M., Kitching R.P. An investigation of possible routes of transmission of lumpy skin disease virus (Neethling). Epidemiology and Infection, 1995, 114(1): 219-226.
  • Alkhamis M.A., Vander Waal K. Spatial and temporal epidemiology of lumpy skin disease in the Middle East, 2012-2015. Frontiers in Veterinary Science, 2016, 3: 19 ( )
  • DOI: 10.3389/fvets.2016.00019
  • Mercier A., Arsevska E., Bournez L., Bronner A., Calavas D., Cauchard J., Falala S., Cau-four P., Tisseuil C., Lefrançois T., Lancelot R. Spread rate of lumpy skin disease in the Balkans, 2015-2016. Transboundary and Emerging Diseases, 2017, 65: 240-243 ( )
  • DOI: 10.1111/tbed.12624
  • Abutarbush S.M., Ababneh M.M., Al Zoubi I.G., Al Sheyab O.M., Al Zoubi M.G., Alekish M.O., Al Gharabat R.J. Lumpy skin disease in Jordan: disease emergence, clinical signs, complications and preliminary-associated economic losses. Transboundary and Emerging Diseases, 2015, 62(5): 549-554 ( )
  • DOI: 10.1111/tbed.12177
  • Бирюченкова М.В., Тимина А.М, Зиняков Н.Г., Щербаков А.В. Результаты генодиагностики нодулярного дерматита в Дагестане и Чеченской Республике -первое официальное подтверждение болезни на территории Российской Федерации. Ветеринария сегодня, 2015, 4(15): 43-45.
  • Sprygin A., Artyuchova E., Babin Y., Prutnikov P., Kostrova E., Byadovskaya O., Kononov A. Epidemiological characterization of lumpy skin disease outbreaks in Russia in 2016. Transboundary and Emerging Diseases, 2018, 65(6): 1514-1521 ( )
  • DOI: 10.1111/tbed.12889
  • OIE. Follow-up report No. 20. Report Date: 28/12/2018. Режим доступа: http://www.oie.int/wa-his_2/temp/reports/en_fup_0000029055_20181228_142744.pdf. Без даты.
  • Bedeković T., Šimić I., Krešić N., Lojkić I. Detection of lumpy skin disease virus in skin lesions, blood, nasal swabs and milk following preventive vaccination. Transboundary and Emerging Diseases, 2018, 65(2): 491-496 ( )
  • DOI: 10.1111/tbed.12730
  • Kononov A., Prutnikov P., Shumilova I., Kononova S., Nesterov A., Byadovskaya O., Pestova Y., Diev V., Sprygin A1. Determination of lumpy skin disease virus in bovine meat and offal products following experimental infection. Transboundary and Emerging Diseases, 2019, 00: 1-9 ( )
  • DOI: 10.1111/tbed.13158
  • Tuppurainen E.S., Venter E.H., Shisler J.L., Gari G., Mekonnen G.A., Juleff N., Lyons N.A., De Clercq K., Upton C., Bowden T.R., Babiuk S., Babiuk L.A. Capripoxvirus diseases: current status and opportunities for control. Transboundary and Emerging Diseases, 2017, 64(3): 729-745 ( )
  • DOI: 10.1111/tbed.12444
  • Bedeković T., Šimić I., Krešić N., Lojkić I. Detection of lumpy skin disease virus in skin lesions, blood, nasal swabs and milk following preventive vaccination. Transboundary and Emerging Diseases, 2018, 65(2): 491-496 ( )
  • DOI: 10.1111/tbed.12730
  • Пестова Я.Е, Артюхова Е.Е., Кострова Е.Е, Шумилова И.Н., Кононов А.В., Спрыгин А.В. Разработка ПЦР в режиме реального времени для выявления возбудителя заразного узелкового дерматита в пробах от крупного рогатого скота. Сельскохозяйственная биология, 2018, 53(2): 422-429 ( )
  • DOI: 10.15389/agrobiology.2018.2.422rus
  • Lin L.I. A concordance correlation coefficient to evaluate reproducibility. Biometrics, 1989, 45(1): 255-268 ( )
  • DOI: 10.2307/2532051
  • Ireland D.C., Binepal Y.S. Improved detection of capripoxvirus in biopsy samples by PCR. Journal of Virological Methods, 1998, 74(1): 1-7 ( )
  • DOI: 10.1016/S0166-0934(98)00035-4
  • Stubbs S., Oura C.A., Henstock M., Bowden T.R., King D.P., Tuppurainen E.S. Validation of a high-throughput real-time polymerase chain reaction assay for the detection of capripoxviral DNA. Journal of Virological Methods, 2012, 179(2): 419-422 ( )
  • DOI: 10.1016/j.jviromet.2011.11.015
  • Vidanovic D., Sekler M., Petrovic T., Debekjak Z., Vaskovic N., Matovic K., Hoffmann B. Real-time PCR assays for the species detection of field Balkan strains of lumpy skin disease virus. Acta Veterinaria Belgrade, 2016, 66(4): 444-454 ( )
  • DOI: 10.1515/acve-2016-0038
  • Agianniotaki E.I., Chaintoutis S.C., Haegeman A., Tasioudi K.E., De Leeuw I., Katsoulos P.D., Sachpatzidis A., De Clercq K., Alexandropoulos T., Polizopoulou Z.S., Chondrokouki E.D., Dovas C.I. Development and validation of a TaqMan probe-based real-time PCR method for the differentiation of wild type lumpy skin disease virus from vaccine virus strains. Journal of Virological Methods, 2017, 249: 48-57 ( )
  • DOI: 10.1016/j.jviromet.2017.08.011
  • Babiuk S., Bowden T.R., Parkyn G., Dalman B., Manning L., Neufeld J., Embury-Hyatt C., Copps J., Boyle D.B. Quantification of lumpy skin disease virus following experimental infection in cattle. Transboundary and Emerging Diseases, 2008, 55(7): 299-307 ( )
  • DOI: 10.1111/j.1865-1682.2008.01024.x
  • Sprygin A., Pestova Y., Prutnikov P., Kononov A. Detection of vaccine-like lumpy skin disease virus in cattle and Musca domestica L. flies in an outbreak of lumpy skin disease in Russia in 2017. Transboundary and Emerging Diseases, 2018, 65(5): 1137-1144 ( )
  • DOI: 10.1111/tbed.12897
  • Спрыгин А.В, Кононов А.В., Бьядовская О.П. и др. Олигонуклеотидные праймеры и флуоресцентно-меченый зонд, способ и тест-система ПЦР в режиме реального времени для выявления генома каприпоксвирусов. Пат. 2658493, ФГБУ «Федеральный центр охраны здоровья животных» (ФГБУ «ВНИИЗЖ»). № 2017130118. Заявл. 24.08.2017. Опубл. 21.06.2018. Бюл. № 18.
  • Спрыгин А.В, Кононов А.В., Бьядовская О.П. и др. Олигонуклеотидные праймеры и флуоресцентно-меченый зонд, способ и тест-система для выявления генома полевых изолятов вируса заразного узелкового дерматита (нодулярного дерматита) КРС в реакции полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. Пат. 2668398, ФГБУ «Федеральный центр охраны здоровья животных» (ФГБУ «ВНИИЗЖ»). № 2017124318. Заявл. 07.07.2017. Опубл. 28.09.2018. Бюл. № 28.
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp