Выделение и характеристика бактериальных эндофитов тополя
Автор: Тюкавина О.Н., Одинцова А.В., Аксенов А.С., Емельянова М.В.
Журнал: Вестник Красноярского государственного аграрного университета @vestnik-kgau
Рубрика: Биологические науки
Статья в выпуске: 5, 2018 года.
Бесплатный доступ
Цель исследования - выделение эндофитных бактерий из древесины тополя лавролистного (Populus laurifolia Ldb.) и тополя душистого (Popu-lus suaveolens Fisch.). Задачи исследования: выде-лить эндофитные бактерии из древесины тополя лавролистного; выделить эндофитные бактерии из древесины тополя душистого; провести иден-тификацию микроорганизмов. Отбор образцов древесины проводили в начале октября стериль-ным возрастным буравом. Опилки древесины из центральной части ствола исследовали методом обрастания. В качестве питательной среды ис-пользовали мясо-пептонный агар. Опилки тополя лавролистного обрастали более интенсивно по сравнению с тополем душистым. Для определения ферментативной (биохимической) активности изучаемых бактерий использовали дифференци-ально-диагностические среды Гисса. Для изолятов бактерий была проведена идентификация путем секвенирования фрагментов гена 16S рРНК. Из чистых культур исследуемых штаммов бактерий выделяли бактериальную ДНК. Фрагмент гена 16S рРНК амплифицировали с использованием прайме-ров F27/1492R...
Бактериальные эндофиты, тополь лавролистный, тополь душистый, древесина
Короткий адрес: https://sciup.org/140238108
IDR: 140238108
Текст научной статьи Выделение и характеристика бактериальных эндофитов тополя
Введение. Тополь – самая высокопродуктивная порода. Насаждения тополя накапливает в 2–3 раза больше запас древесины за более короткий срок (в 2–3 раза), чем насаждения других древесных пород [1]. Интенсивность жизнедеятельности тополей выше, чем у других древесных пород [2]. Выявление факторов, обуславливающих высокую резистентность, регенеративную способность и жизненность тополей, позволило бы рационально использовать древесные ресурсы и повысить продуктивность северных фитоценозов.
Высокие жизненные характеристики растений могут быть обусловлены ассоциативными отношениями с эндофитными микроорганизмами [3]. Свойства микроорганизмов, заселяющих ткани различных растений, могут сильно отличаться [4]. Ряд ученых выделяли эндофитные бактерии из тополей [5, 6]. Но даже условия выращивания их влияют на состав эндофитного сообщества [6]. Поэтому большой интерес представляет изучение эндофитов, присутствующих в растениях, с целью их возможного последующего использования в целях повышения продуктивности растений и защиты их от патогенов.
Цель исследования : выделение эндофитных бактерий из древесины тополя лавролистного и тополя душистого.
Задачи исследования: выделить эндофитные бактерии из древесины тополя лавролистного; вы- делить эндофитные бактерии из древесины тополя душистого; провести идентификацию микроорганизмов.
Методика исследования . Исследование проводили в г. Архангельске. Для отбора образцов древесины с целью выделения эндофитных микроорганизмов выбирали противоположные по регенеративным способностям древесные виды: тополь лав-ролистный ( Populus laurifolia Ldb.) и тополь душистый ( Populus suaveolens Fisch.) . Отбор образцов проводили в начале октября у кронированных без внешних признаков патологий и отсутствием стволовой гнили деревьев тополя лавролистного и тополя душистого в рядовых посадках вдоль Ленинградского проспекта в двукратной повторности. Небольшой участок ствола дерева зачищали от коры, обрабатывали спиртом. Высверленные стерильным возрастным буром из ствола дерева керны в буре помещали в стерильный пакет и доставляли в лабораторию. Кусочки древесины из центральной части ствола полоскали сначала в спирте, а затем дважды в дистиллированной воде. Вода после второго полоскания проверялась на наличие бактерий. Опилки получали из центральной части кусочков керна. Опилки исследовали методом обрастания. В качестве питательной среды использовали мясопептонный агар. Посевы выдерживали в термостате в течение 3-10 суток при температуре 26–28 °С.
Для определения ферментативной (биохимической) активности изучаемых бактерий использовали дифференциально-диагностические среды Гисса. В качестве таких сред выбрали полужидкие среды Гисса, основу которых составляют мясо-пептонный бульон (МПБ) и мясо-пептонный агар (МПА), а также в состав входят углевод и индикатор. Исходная установка рН среды – слабощелочная (7,2–7,4). Чистую культуру исследуемых микроорганизмов засевали петлей в среды малого ряда сред Гисса, который включает мальтозу, глюкозу, сахарозу, сорбит, маннит и лактозу. Посевы инкубировали при 27 °С в течение 48 ч.
Для изолятов бактерий была проведена идентификация путем секвенирования фрагментов гена 16S рРНК и сравнения полученных последовательностей нуклеотидов с гомологичными из базы данных NCBI с использованием программ BLAST.
Результаты исследования . Во всех случаях при высеве опилок на питательную среду отмечалось обрастание их бактериальной массой. Опилки тополя лавролистного обрастают более интенсивно по сравнению с тополем душистым (рис.).

Рис. 1. Выделение бактерий поверхностным методом культивирования: А – древесина тополя лавролистного; Б – древесина тополя душистого
Из древесины тополя лавролистного выделено 4 штамма бактерий, тополя душистого – 2 штамма бактерий. Из них идентифицированы изоляты, относящиеся к семействам Bacillaceae, Staphylococca-ceae и Enterobacteriaceae, в первом случае – к ро- дам Bacillus и Lysinibacillus, во втором – Staphylococcus, в третьем – Brenneria. Характеристика биохимической активности отдельных штаммов представлена в таблице.
Биохимическая активность бактерий-ассоциантов древесины стволов тополей
Микроорганизм |
Глюкоза |
Лактоза |
Сахароза |
Сорбит |
Мальтоза |
Маннит |
Тополь лавролистный |
||||||
Bacillus pumilus |
+ |
– |
– |
– |
++ |
– |
Brenneria salicis |
± |
± |
± |
– |
+ |
± |
Lysinibacillus fusiformis |
+ |
– |
– |
– |
– |
– |
Staphylococcus pasteuri |
± |
– |
– |
– |
+ |
– |
Тополь душистый |
||||||
Bacillus safensis |
± |
– |
± |
– |
– |
– |
Brenneria populi |
++ |
+ |
++ |
– |
++ |
+ |
Примечание : «+» – присутствует; «–» – отсутствует; «±» – переменная активность.
Одним из наиболее привлекательных объектов для промышленного производства препаратов, активно используемых в сельскохозяйственной практике, являются штаммы бактерий рода Bacillus [7]. Данная группа бактерий представляет интерес для создания препаратов для очистки стоков и почв [8, 9].
Вторичные метаболиты штамма Bacillus pumilus эффективно подавляют рост патогенов, вызывающих рак тополя, а также способствуют стимулированию роста и активности фотосинтеза [10]. Штаммы вида Bacillus pumilus синтезируют антибиотик [11], проявляют антагонистическую активность в отношении фитопатогенных бактерий [12]. Штаммы вида Bacillus pumilus характеризуются противогрибковой активностью [13], что позволяет использовать их для создания противогрибковых средств [4, 13], например, в биопрепаратах: YieldShield – против почвен- ных грибных патогенов [4]; Ballad – для борьбы с корневой гнилью, ржавчиной, пятнистостью и плесенью [11]. Bacillus safensis влияет на рост растений в связи с синтезом растительных гормонов [14], обладает антимикробной активностью [15]. Staphylococcus – эндофитные бактерии тополя [16], стимулирующие рост растений [17]. Штаммы вида Lysinibacillus fusiformis проявляют антибактериальную активность [12] и потенциально могут использоваться в биоре-мидиации [18]. Штаммы видов Brenneria populi и Brenneria salicis являются патогенами для древесных растений [19]. Однако Brenneria salicis встречается как эндофит и под влиянием внешних факторов переходит от эндофитного к патогенному образу жизни [20].
Выводы. Из древесины тополя лавролистного выделено 4 штамма бактерий видов: Bacillus pumilus, Lysinibacillus fusiformis, Staphylococcus pas-teuri, Brenneria salicis. Из древесины тополя душистого выделено 2 штамма бактерий видов: Bacillus safensis, Brenneria populi. Штаммы видов Bacillus pumilus, Bacillus safensis, Lysinibacillus fusiformis, Staphylococcus pasteuri являются потенциально хозяйственно полезными, так как способны синтезировать растительные гормоны и применяться в биопрепаратах для защиты растений.
Список литературы Выделение и характеристика бактериальных эндофитов тополя
- Бакулин В.Т. Особенности анатомического строения древесины тополя белого, произрастающего в Западной Сибири//Научные ведомости. Сер. «Естественные науки». -2012. -Т. 18, № 3 (122). -С. 5-14.
- Иванников С.П. Тополь. -М.: Лесн. пром-сть, 1980. -82 с.
- Цавкелова Е.А., Чердынцева Т.А., Нетрусов А.И. Образование ауксинов бактериями, ассоциированными с корнями орхидей//Микробиология. -2005. -Т. 74, № 1. -С. 55-62.
- Максимов И.В., Абизгильдина Р.Р., Пусенкова Л.И. Стимулирующие рост растений микроорганизмы как альтернатива химическим средствам защиты от патогенов (обзор)//Прикладная биохимия и микробиология. -2011. -Т. 47, № 4. -С. 373-385.
- Taghavi S., Barac T., Greenberg B., Borremans B., Vangronsveld J., van der Lelie D. Horizontal gene transfer to endogenous endophytic bacteria from poplar improves phytoremediation of toluene//Appl. Environ. Microbiol. -2005. -№ 71. -Р. 8500-8505.
- Lelie D. van der, Taghavi S., Monchy S., Schwender J., Miller L., Ferrieri R., Rogers A., Wu X., Zhu W., Weyens N., Vangronsveld J., Newman L. Poplar and its Bacterial Endophytes: Coexist-ence and Harmony//Plant Science. -2009. -№ 28. -Р. 346-358.
- Мелентьев А.И. Аэробные спорообразующие бактерии Bacillus Cohn. в агроэкосистемах. -М.: Наука, 2007. -147 с.
- Margesin R., Schinner F. Potential of halotolerant and halophilic microorganisms for biotechnology//Extremophiles. -2001. -Vol. 5. -P. 73-83.
- Zhuang W.Q., Tay J.-H., Maszenan A.M., Tay S.T.L. Bacillus naphthalinovorans sp. nov.from oil-contaminated tropical marine sediments and its role in napththalene biodegradation//Appl. Micro-biol. Biotechnol. -2002. -Vol. 58. -P. 547-553.
- Ren J.-H., Li H., Wang Y.-F., Wu X.-Q. Biocontrol potential of an endophytic Bacillus pumilus JK-SX001 against poplar canker//Biological Control -2013. -№ 67 (3). -P. 421-430.
- Cawoy H., Bettiol W., Fickers P., Ongena M. Bacil-lus -Based Biological Control of Plant Diseases//Pesticides in the Modern World -Pesticides Use and Management. -Rijeka: INTECH, 2011. -P. 273-302.
- Марданова А.М., Лутфуллин М.Т., Шалавина М.А. и др. Поиск и выделение новых штаммов бактерий-антагонистов фитопатогенных микромицетов рода Fusarium//Биоразнообразие и экология грибов и грибоподобных организмов северной Евразии: мат-лы всерос. конф. с междунар. участием. -Екатеринбург: Изд-во Урал. гос. ун-та, 2015. -С. 149-150.
- Mayer F., Kronstad J.W. Breaking the bad: Bacillus blocks fungal virulence factors//Microbial Cell. -2017. -№ 4 (11). -P. 384-386.
- Kothari V.V., Kothari R.K., Kothari C.R., Bhatt V.D.,Nathani N.M., Koringa P.G., Joshi C.G., Vyas B.R.M. Genome sequence of salt-tolerant bacillus safensis strain vk, isolated from saline desert area of Gujarat, India//Genome Announcements. -2013. -№ 1 (5). -P.e00671-e00683.
- Kakade P.D., Chaphalkar S.R. Isolation and purifi-cation of antibacterial peptide from Bacillus safen-sis endophytica bacteria from Anthocephalus ka-damba//International Journal of Current Microbi-ology and Applied Sciences. -2017. -Vol. 6, № 1. -P. 504-511.
- Moore F.P., Barac T., Borremans B., Oeyen L., Vangronsveld J., van der Lelie D., Campbell C.D., Moore E.R.B. Endophytic bacterial diversity in pop-lar trees growing on a BTEX-contaminated site: the characterization of isolates with potential to en-hance phytoremediation//Syst Appl Microbiol. -2012. -№ 29. -P. 539-594.
- Suhandono S., Kusumawardhani M.K., Aditiawati P. Isolation and molecular identification of endophytic bacteria from rambutan fruits (Nephelium lappaceum L.) cultivar binjai//HAYATI Journal of Biosciences. -2016. -№ 23. -P. 39-44.
- Mehta J., Dilbaghi N., Dudeja S.S., Yadav A., Sharma P. Decolourization of simulated dye in aqueous medium using bacterial strains//Europe-an Journal of Advances in Engineering and Tech-nology. -2015. -№ 2 (3). -P. 9-18.
- Черпаков В.В. Болезнь водяных знаков («Wa-termark») на ивах (Salixspp.) в России//Актуальные проблемы лесного комплекса. -2015. -№ 43. -С. 111-118.
- Stefansson J. Screening for the occurrence of Brenneriasalicis in willows in Skåne, Sweden. -Alnarp: Swedish University or Agricultural Scienc-es, 2013. -14 p.