Выявление BCRABL1 подобного ОЛЛ у детей

Материалы и методы. На основании ранее опубликованных данных нами была отрабо- тана система анализа экспрессии 5 генов методом ПЦР в режиме реального времени (IGJ, SPATS2L, MUC4, CRLF2, CA6) для верификации группы BCR-ABL1-подобного ОЛЛ. Экспрессию генов оценивали методом deltaCt по отношению к экспрессии контрольного гена ABL1, после чего формировали единый интегральный показатель. В том случае, если он был близок к результату, полученному у пациентов с BCR-ABL1-позитивным ОЛЛ, то пациентов относили в группу BCR-ABL1-подобного ОЛЛ. В исследуемую группу было включено 147 детей с ОЛЛ из B-линейных предшественников в возрасте от 1,2 до 17 лет (медиана 4,0 лет). Из этого числа было 10 пациентов с Ph-позитивным ОЛЛ,59 пациентов с известными структурными и количественными цитогенетическими аберрациями включая транслокации t(9;22)(q34; q11), t(12;21) (p13; q22), t(1;19)(q23; p13), перестройки 11q23/ MLL, высокую гипердиплодию (n=51–65), гипо-диплоидию (n<45), а 78 пациентов сформировали группу без повторяющихся генетических перестроек («другие B-ОЛЛ»). Перестройки генов ABL1, ABL2, CRLF2, IgH, JAK2, PDGFRb/CSFR1 оценивали методом FISH. Делеции в гене IKZF1 выявляли методом MLPA. Наличие химерного гена CRLF2-P2RY8 проводили методами ПЦР в геномной ДНК, MLPA и FISH. Химерный ген CRLF2-IgH выявляли методом FISH. Результаты терапии оценивали по кривым бессобытийной выживаемости (БСВ) и кумулятивной частоте развития рецидива (КЧР)

Результаты. Иерархический кластерный анализ и анализ главных компонент показали что 16пациентов с ОЛЛ кластеризовались совместно с 9из 10 случаев Ph-позитивного ОЛЛ. Из 16 человек с BCR-ABL1-подобным профилем экспрессии было 3 пациента с ОЛЛ и синдромом Дауна, 1 пациент с внутрихромосомной амплификацией 21, 1 пациент с транслокацией t(12;21)/ETV6-RUNX1, а также 11 пациентов без повторяющихся перестроек («другие B-ОЛЛ»). Пациент с наличием транслокации t(12;21) был исключен из дальнейшего анализа. У пациентов с BCR-ABL1-подобным ОЛЛ достоверно чаще выявлялись делеции в гене IKZF1 и высокая экспрессия CRLF2 по сравнению с пациентами без BCR-ABL1-подобного профиля (67 % и 11 % 40 % и 6 %, соответственно; p<0,001 в обоих случаях). У 9 пациентов, у которых определяли наличие химерных генов с участием тиро-зинкиназ, перестройки гена JAK2 выявлены в двух случаях, CRLF2 — в четырех (по 2 случая CRLF2-IgH и CRLF2-P2RY8), еще в двух случаях перестройки ни одного из исследованных генов выявлено не было. Среди пациентов с BCR-ABL1-подобным ОЛЛ превалировали девочки (80 % против 57 % в оставшейся группе, p=0,011), у них чаще выявлялся инициальный лейкоцитоз более 30х109/л (67 % и 18 %, соответственно, p=0,001) и М3 статус костного мозга на 15-й день индукции ремиссии (27 % и 4 %, соответственно p=0,010). Пациенты с BCR-ABL1-подобным ОЛЛ чаще стратифицировались в группу высокого риска (40 % и 9 %, соответственно, p=0,001). БСВ пациентов с BCR-ABL1-подобным ОЛЛ, лечившихся по протоколу ALL–MB2008 (n=10) была достоверно ниже по сравнению с группой «другие B-линейные ОЛЛ» пациентами без BCR-ABL1-подобного профиля экспрессии (n=57) (0,28±0,17 и 0,93±0,04, соответственно, p<0,001) а КВР — статистически значимо выше (0,57±0,19 и 0,02±0,02, соответственно, p<0,001). Диагностическая эффективность BCR-ABL1-подобного профиля экспрессии генов для предсказания рецидива составляет 0,939 (95 % ДИ 0,881–0,997).

Выводы. Таким образом, нами показана технология быстрой идентификации пациентов с BCR-ABL1 -подобным ОЛЛ методом ПЦР в режиме реального времени. В данной группе пациентов часто выявляются случаи с делециями IKZF1 , а также перестройки с участием киназ. Прогноз для пациентов с BCR-ABL1 -подобным ОЛЛ при лечении по протоколу ALL–MB2008 — неблагоприятный.