Адаптация Pseudomonas helmanticensis к додецилсульфату натрия в присутствии глицерина
Автор: Зубков Илья Николаевич, Кондратьев Вадим Дмитриевич, Шишлянников Сергей Михайлович
Рубрика: Биохимический и пищевой инжиниринг
Статья в выпуске: 2 т.10, 2022 года.
Бесплатный доступ
Культура Pseudomonas helmanticensis, устойчивая к действию додецилсульфата натрия (SDS), способна продуцировать полигидроксиалканоаты (ПГА) - биогенные полиэфиры, применяемые при производстве упаковочных материалов. Устойчивость к алкилсульфатам открывает возможность использования P. helmanticensis для разработки неаксеничных (т. е. не предполагающих предварительной стерилизации сред) процессов получения ПГА. Добавление SDS в среды для культивирования подавляет рост посторонних микроорганизмов, что позволяет избежать паровой стерилизации и снизить стоимость готового полимера. Одним из наиболее перспективных субстратов для получения ПГА является глицерин. Следовательно, целесообразно изучить адаптацию P. helmanticensis к SDS в средах, содержащих глицерин в качестве основного субстрата. Известно, что бактерии Pseudomonas обладают несколькими механизмами, обеспечивающими устойчивость к SDS: образование агрегатов, окруженных защитным матриксом, модификация мембран и синтез расщепляющих алкилсульфаты ферментов. Наличие агрегатов в культурах P. helmanticensis изучалось с помощью эпифлуоресцентной микроскопии с предварительным окрашиванием клеток Акридиновым оранжевым. Модификация клеточных мембран исследовалась путем анализа жирнокислотного состава биомассы методом газовой хроматографии - масс-спектрометрии. Наличие внутриклеточных сульфатаз оценивалось по изменению концентрации SDS в ходе культивирования. Показано, что P. helmanticensis адаптируется к присутствию SDS в средах, содержащих глицерин, путем активации всех трех указанных механизмов. Максимальная концентрация SDS, при которой P. helmanticensis демонстрирует значительный рост биомассы, составляет 0,5 г/л. Такая концентрация ингибирует рост многих других микроорганизмов, благодаря чему P. helmanticensis является перспективным продуцентом для получения ПГА в нестерильных средах, содержащих глицерин и SDS.
Pseudomonas helmanticensis, додецилсульфат натрия, агрегаты, мембранные липиды, жирнокислотный состав, полигидроксиалканоаты, глицерин, эпифлуоресцентная микроскопия, газовая хроматография - масс-спектрометрия, устойчивость к детергентам
Короткий адрес: https://sciup.org/147237387
IDR: 147237387
Список литературы Адаптация Pseudomonas helmanticensis к додецилсульфату натрия в присутствии глицерина
- Volova T.G., Boyandin A.N., Prudnikova S.V. Biodegradation of polyhydroxyalkanoates in natural soils. J. Sib. Fed. Univ. Biol, 2015, vol. 8, no. 2, pp. 152-167. DOI: 10.17516/1997-13892015-8-2-152-167
- Nepomnyashchiy A.P., Shishlyannikov S.M., Shpironok O.G., Alekseeva A.A., Zubkov I.N., Sitnov V.Yu. Soil SDS-degrading bacterium Pseudomonas helmanticensis as a potential producer of polyhydroxyalkanoates. Proc. 19th Int. Sci. Prac. Conf. "Current trends of agricultural industry in global economy ". Kemerovo, 2021, pp. 182-189. DOI: 10.32743/agri.gl.econ.2020.182-189
- Zubkov I.N., Nepomnyshchiy A.P., Kondratyev V.D., Sorokoumov P.N., Sivak K.V., Ramsay E.S., Shishlyannikov S.M. Adaptation of Pseudomonas helmanticensis to fat hydrolysates and SDS: fatty acid response and aggregate formation. J. Microbiol., 2021, vol. 59, no 11, pp. 1104-1111. DOI: 10.1007/s12275-021-1214-5
- Klebensberger J., Rui O., Fritz E., Schink B., Philipp B. Cell aggregation of Pseudomonas aeruginosa strain PAO1 as an energy-dependent stress response during growth with sodium dodecyl sulfate. Arch. Microbiol., 2006, vol. 185, no. 6, pp. 417-427. DOI: 10.1007/s00203-006-0111-y
- Klebensberger J., Birkenmaier A., Geffers R., Kjelleberg S., Philipp B. SiaA and SiaD are essential for inducing autoaggregation as a specific response to detergent stress in Pseudomonas aeruginosa. Environ. Microbiol., 2009, vol. 11, no. 12, pp. 3073-3086. DOI: 10.1111/j.1462-2920.2009.02012.x
- Flemming H.-C., Wingender J. The biofilm matrix. Nat. Rev. Microbiol., 2010, vol. 8, pp.623-633.
- Nyberg H. The influence of ionic detergents on the phospholipid fatty acid compositions of Porphyridium purpureum. Phytochemistry, 1985, vol. 24, no. 3, pp. 435-440. DOI: 10.1016/S0031-9422(00)80742-6
- Зубков И.Н., Шишлянников С.М. Толерантность бактерий Pseudomonas к додецилсуль-фату натрия // Вестник ЮУрГУ. Серия «Пищевые и биотехнологии». 2022. Т. 10, № 1. С. 5-14. [Zubkov I.N., Shishlyannikov S.M. Tolerance of Pseudomonas bacteria to sodium dodecyl sulfate. Bulletin of the South Ural State University. Ser. Food and Biotechnology, 2022, vol. 10, no. 1, pp. 514. (In Russ.)] DOI: 10.14529/food220101
- Boltes I., Czapinska H., Kahnert A., von Bulow R., Dierks T., Schmidt B., von Figura K., Kertesz M.A., Uson I. 1.3 A structure of arylsulfatase from Pseudomonas aeruginosa establishes the catalytic mechanism of sulfate ester cleavage in the sulfatase family. Structure, 2001, vol. 9, no. 6, pp. 483-491. DOI: 10.1016/s0969-2126(01)00609-8
- Muller I., Kahnert A., Pape T., Sheldrick G.M., Meyer-Klaucke W., Dierks T., Kertesz M., Uson I. Crystal structure of the alkylsulfatase AtsK: Insights into the catalytic mechanism of the Fe(II) a-ketoglutarate-dependent dioxygenase superfamily. Biochemistry, 2004, vol. 43, no. 11, pp. 3075-3088. DOI: 10.1021/bi035752v
- Guerin-Mechin L., Dubois-Brissonnet F., Heyd B., Leveau J.Y. Quaternary ammonium compound stresses induce specific variations in fatty acid composition of Pseudomonas aeruginosa. Int. J. Food Microbiol., 2000, vol. 55, no. 1-3, pp. 157-159. DOI: 10.1016/S0168-1605(00)00189-6
- Fitzgerald J.W., Kight L.C. Physiological control of alkylsulfatase synthesis in Pseudomonas aeruginosa: effects of glucose, glucose analogs, and sulfur. Can. J. Microbiol., 1977, vol. 23, pp. 1456-1464. DOI: 10.1139/m77-214
- Collier D.N., Hager P.W., Phibbs Jr. P.V. Catabolite repression control in the Pseudomonads. Res. Microbiol., 1996, vol. 147, no. 6-7, pp. 551-561. DOI: 10.1016/0923-2508(96)84011-3
- Poblete-Castro I., Wittmann C., Nikel P.I. Biochemistry, genetics and biotechnology of glycerol utilization in Pseudomonas species. Microb. Biotechnol., 2019, vol. 13, no. 1, pp. 32-53. DOI: 10.1111/1751-7915.13400
- Hayashi, K. A rapid determination of sodium dodecyl sulfate with methylene blue. Anal. Bio-chem., 1975, vol. 67, pp. 503-506. DOI: 10.1016/0003-2697(75)90324-3
- Shanklin J., Whittle E. Evidence linking the Pseudomonas oleovorans alkane ©-hydroxylase, an integral membrane diiron enzyme, and the fatty acid desaturase family. FEBSLett., 2003, vol. 545, no. 2-3, pp. 188-192. DOI: 10.1016/s0014-5793(03)00529-5