Анализ генетического разнообразия естественных популяций и ремонтно-маточных стад стерляди на основании полиморфизма межмикросателлитных маркеров
Автор: Пелеева Альбина Рафиковна, Комарова Лидия Васильевна, Васильева Юлия Сергеевна
Журнал: Бюллетень науки и практики @bulletennauki
Рубрика: Биологические науки
Статья в выпуске: 4 т.4, 2018 года.
Бесплатный доступ
Изучено генетическое разнообразие двух естественных популяций стерляди ( Acipenser ruthenus L., Acipenseridae): из нижнего течения реки Сухона в Вологодской области и из среднего течения реки Кама Пермского края; а также двух ремонтно-маточных стад стерляди из Саратовского отделения ФГБНУ «ГосНИОРХ» и из рыбоводного хозяйства «ООО Тополь» Пермского края. Для определения показателей генетического разнообразия был использован ISSR (Inter Simple Sequence Repeats) - метод анализа полиморфизма ДНК с использованием ПЦР. У изученных выборок A. ruthenus выявлены 89 ISSR-PСR маркеров. В зависимости от праймера число амплифицированных ISSR-PCR маркеров A. ruthenus варьировало от 5 (праймер (CT)8TG) до 15 (праймер (CA)6GT), а их размеры - от 200 (ISSR-9 и X9) до 1500 (X9) пн. На общую выборку A. ruthenus доля полиморфных локусов высока и составила 0,910, ожидаемая гетерозиготность равна 0,296, а число эффективных аллелей - 1,518. Показатели генетического разнообразия выше в популяции из реки Кама (HE=0,224; ne=1,380) и ниже в ремонтно-маточном стаде из рыбоводного хозяйства «ООО Тополь» (HE=0,170; ne=1,290). Наибольшее число редких ISSR-PCR маркеров отмечено в природной популяции из реки Кама (R=3). В ремонтно-маточном стаде из «ООО Тополь» не выявлено ни одного редкого ISSR-PCR маркера. Генетически более гетерогенной является группа естественных популяций по сравнению с группой ремонтно-маточных стад стерляди. Установлена генетическая структура изученных двух естественных популяций (Gst=0,297) и двух ремонтно-маточных стад A. ruthenus (Gst=0,281). Даны рекомендации по использованию данных о генетическом разнообразии изученных популяций и стад стерляди для сохранения генофонда вида A. ruthenus.
Issr-pcr маркеры, полиморфизм днк, природные популяции, ремонтно-маточные стада
Короткий адрес: https://sciup.org/14111941
IDR: 14111941 | DOI: 10.5281/zenodo.1218207
Список литературы Анализ генетического разнообразия естественных популяций и ремонтно-маточных стад стерляди на основании полиморфизма межмикросателлитных маркеров
- Raymakers C. CITES, the Convention on International Trade in Endangered Species of Wild Fauna and Flora: its role in the conservation of Acipenseriformes//Journal of Applied Ichthyology. 2006. V. 22. №S1. P. 53-65.
- Сытова М. В. Разработка научных подходов развития осетрового хозяйства на основе прослеживаемости продукции из осетровых рыб//Труды ВНИРО. 2016. Т. 159. С. 143-150.
- Чебанов М. С., Галич Е. В. Руководство по искусственному воспроизводству осетровых рыб. Технические доклады ФАО по рыбному хозяйству и аквакультуре. №558. Анкара: Изд-во продовольственной и сельскохозяйственной организации ООН, 2013. 325 с.
- Козлова Н. В., Базелюк Н. Н., Файзулина Д. Р., Стоногина Е. В. Применение молекулярно-генетических исследований в аквакультуре осетровых рыб//Вестник Астраханского государственного технического университета. Серия: Рыбное хозяйство. 2013. №3. С. 113-117.
- Рябова Г. Д., Климонов В. О., Шишанова Е. И. Генетическая изменчивость природных популяций и доместицированных стад осетровых России. М.: Россельхозакадемия, 2008. 94 с.
- Кузьмин Е. В., Кузьмина О. Ю. Полиморфизм локуса миогенов у некоторых представителей семейства осетровых (Acipenseridae)//Генетика. 2014. Т. 50. №9. С. 1089-1097.
- Мамонова А. С., Шишанова Е. И. Генетическая изменчивость одомашненных стад русского осетра (Acipenser gueldenstaedtii, Brandt)//Вестник Астраханского государственного технического университета. Серия: Рыбное хозяйство. 2016. №4. С. 83-92.
- Рожкован К. В., Челомина Г. Н., Рачек Е. И. Молекулярная идентификация и особенности генетического разнообразия межвидовых гибридов амурского осетра (Acipenser schrenckii × A. baerii, A. baerii × A. schrenckii, A. schrenckii × A. ruthenus и A. ruthenus × A. schrenckii) по данным изменчивости мультилокусных RAPD-маркеров//Генетика. 2008. Т. 44. №11. С. 1453-1460.
- Барминцева А. Е., Мюге Н. С. Использование микросателлитных локусов для установления видовой принадлежности осетровых и выявления особей гибридного происхождения//Генетика. 2013. Т. 49. №9. С. 1093.
- Слуквин А. М., Конева О. Ю., Лесюк М. И. Генетическая идентификация стерляди (Acipenser ruthenus L.), выращенной в ОАО «Рыбхоз «Полесье» Пинского района Брестской области, по микросателлитным маркерам//Молекулярная и прикладная генетика, 2009. Т. 9. С. 146-152.
- Рожкован К. В., Челомина Г. Н., Иванов С. А. Филогенетические связи амурского осетра Acipenser shrenskii Brandt, 1869 по данным секвенирования 18S рДНК//Цитология, 2009. Т. 51. №3. С. 265.
- Мельникова М. Н., Сенчукова А. Л., Павлов С. Д. Разработка новых популяционно-генетических маркеров для вида Parasalmo (Oncorhynchus) mykiss на основе вариабельности межсателлитной ДНК//Доклады Академии наук. 2010. Т. 435. №1. С. 138-141.
- Rogers S. O., Bendich A. J. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummified plant tissues//Plant Molecular Biology. 1985. V. 5. №2. P. 69-76.
- Zietkiewicz E., Rafalski A., Labuda D. Genome Fingerprinting by Simple Sequence Repeat (SSR)-Anchored Polymerase Chain Reaction Amplification//Genomics. 1994. V. 20. №2. P. 176-183.
- Комарова Л. В., Костицына Н. В., Боронникова С. В. Подбор ISSR-праймеров для молекулярно-генетического анализа стерляди (Acipenser ruthenus Linnaeus)//Тенденции инновационных процессов в науке. Сборник статей Международной научно-практической конференции. 2015. С. 6-9.
- Yeh F. C., Mao J., Young R. C. POPGENE, the Microsoft Windows-based user-friendly software for population genetic analysis of co-dominant and dominant markers and quantitative traits. Alta, Department of Renewable Resources, Univ. of Alberta, Edmonton, 1999. 238 p.
- Светлакова Т. Н., Бобошина И. В., Нечаева Ю. С., Боронникова С. В. Генетическая дифференциация популяции Populus tremula L. в Пермском крае на основании полиморфизма ISSR-маркеров//Аграрный вестник Урала. 2012. №3 (95). С. 11-13.
- Peakall R., Smouse P. E. GenAlE×6: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research//Mol. Ecol. Not. 2006. V. 6. P. 288-295.
- Боронникова С. В. Молекулярно-генетический анализ генофондов редких и исчезающих видов растений Пермского края: автореф. дисс. … д-ра биол. наук. Уфа, 2009. 44 с.
- Урбах В. Ю. Математическая статистика для биологов и медиков. М.: Изд-во академии наук СССР, 1963. 323 с.
- Животовский Л. А. Статистические методы анализа частот генов в природных популяциях//Итоги науки и техники. Общая генетика. М.: ВИНИТИ АН СССР, 1983. Т. 8. С. 76-104.
