Ассоциация мочекаменной болезни у пациентов с различными состояниями семейного анамнеза по уролитиазу с полиморфизмами его кандидатных генов в российской популяции

In this study we have evaluated the link between the urolithiasis and burdened familial history and single nucleotide polymorphisms (SNP) of the candidate genes without familial anamnesis. We have investigated 125 adult patients with urolithiasis (main study group) from Central Russia and 188 healthy adults from the same region (control group). Among the patients from the main group 43 had healthy relatives (27 male and 16 female patients) and 82 with familial history of urolithiasis (52 male and 30 female patients). Material for investigations was venous blood. Using real-time polymerase chain reaction with assays from “ Applied Biosystems” three SNPs were evaluated for the following genes: solute carrier family 26 (anion exchanger), member 2 (SLC26A6, rs2310996), tumor necrosis factor (ligand) superfamily, member 11 (TNFSF11, rs9525641), ORAI calcium release-activated calcium modulator 1 (ORAI1, rs7135617). Using angle transformation method of Fisher we have determined the connection between SNPs of ORAI1 and urolithiasis in patients from Russian population both with and without urolithiasis familial history. No such connection was found for SKC26A6 and TNFSF11. The results obtained from the study show that independent of the familial history the presence of the certain SNPs (ORAI1) could influence the morbidity with urolithiasis.

О.И. Аполихин¹, А.В. Сивков¹, О.В. Константинова¹, Т.В. Тупицына², П.А. Сломинский², Д.Н. Калиниченко^{1 1}НИИ урологии Минздрава России, Москва

2Институт молекулярной генетики РАН, Москва

очекаменная болезнь (МКБ) занимает одно из ведущих мест в структуре урологических заболеваний по частоте встречаемости, частоте обращений за скорой медицинской помощью и госпи тализаций [1, 2]. По данным официальной статистики, в 2012 году показатель заболеваемости уролитиазом на 100 тыс. населения по Российской Федерации составил 550,5, а абсолютное число зарегистрированных пациентов – 787 555, при этом прирост количества заболевших по сравнению с 2002 г. составил 25,1% [3]. Рецидивы мочекаменной болезни после различных оперативных вмешательств в течение 5 лет могут иметь место у половины пациентов [4, 5]. Несмотря на то, что известен немалый перечень причин, ведущих к развитию уролитиаза, увеличение его распространенности практически во всех странах мира указывает на необходимость поиска новых факторов риска камнеобразования [6].

Считается, что в основе любого па-тологичекого процесса лежит взаимодействие генов человека и факторов внешней среды [7]. Давно изучено возникновение МКБ при наследственно де-терменированных нарушениях обмена веществ: глицинурии, ксантинурии, первичной оксалурии, цистинурии, однако эти заболевания встречаются редко [8]. В то же время по данным литературы у 40-50% пациентов с МКБ обнаруживают отягощенный семейный анамнез по этому заболеванию [1, 9].

В последнее десятилетие основным направлением изучения генетических факторов риска развития МКБ стало выявление ассоциации полиморфизма того или иного гена с МКБ. Ре- зультатами подобных исследований является установление наличия или отсутствия ассоциации полиморфизма гена с МКБ. Изучение таких ассоциаций имеет большое значение для понимания патогенеза заболевания и выбора тактики ведения больных уролитиазом.

В нашей стране в ФГБУ «НИИ урологии» Минздрава России в течение нескольких лет проводится исследование по поиску полиморфных вариантов кандидатных генов мочекаменной болезни и выявлена связь между полиморфизмом гена VDR и мочекаменной болезнью в российской популяции. Для генов TNFRSF11B, ESR1, KL, CASR такой зависимости обнаружено не было [10].

Monico C. et al. [11] и Soleimani M. [12] исследовали ген SLC26A6 (rs2310996) и роль его полиморфизмов в развитии МКБ. Chou Y. et al. [13] изучали ген ORAI1 (rs7135617) и показали, что полиморфизм гена ORAI1 может являться генетическим фактором риска возникновения и рецидива МКБ. При этом авторы не изучали роль полиморфизмов генов при различных состояниях семейного анамнеза указанного заболевания. Однако среди пациентов с уролитиазом есть больные, имеющие здоровых родственников, и пациенты с отягощенным семейным анамнезом. Изучение связи МКБ с полиморфизмами ее кандидат-ных генов с учетом выше названных анамнестических данных имеет большое значение для выявления групп риска, прогнозирования, профилактики и ме-тафилактики заболевания.

Целью данного исследования явился поиск полиморфных вариантов генов, ассоциированных с мочекаменной болезнью в российской популяции у больных без и с семейной кластеризацией уролитиаза.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

С помощью методов генетического анализа обследовано 125 пациентов с МКБ (основная группа) и 188 соматически здоровых человек из общей российской популяции (контрольная группа). В основной группе выделены 43 пациента со здоровыми родственниками (первая подгруппа) и 82 – с отягощенной наследственностью по МКБ (вторая подгруппа). В первой подгруппе было 27 мужчин (62,8%) и 16 женщин (37,2%), во второй подгруппе - 52 мужчин (63,4%) и 30 женщин (36,6%).

Для проведения анализа полиморфных ДНК-маркеров в кандидатных генах у пациентов с уролитиазом и в контрольной группе были созданы две коллекции ДНК, выделенной из венозной крови обследуемых лиц, посредством стандартного фенолхлороформного метода или с использованием набора AxyPrepBlood Genomic DNA Miniprep Kit («Axygene», США). Осуществлен анализ полиморфных вариантов трех кандидатных генов МКБ: гена мембранного анионного транспортера семейства 26 (SLC26A6, rs2310996), гена фактора некроза опухолей 11 (TNFSF11, rs9525641), гена модулятора активатора высвобождения кальция 1 (ORAI1, rs7135617).

Полиморфные варианты анализируемых генов определяли методом ПЦР в режиме реального времени с использованием тест-систем компании «Ap-plied Biosystems» в контрольной группе и у больных уролитиазом: в подгруппе пациентов со здоровыми родственниками и в подгруппе больных с семейной кластеризацией МКБ. При расчетах объединяли генотипы по аллелю Т. Статистический анализ осуществляли с помощью метода углового преобразования Фишера.

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

Проведенные исследования позволили установить спектр и частоты встречаемости вариантов генотипов и аллелей 3 кандидатных генов мочекаменной болезни в общей российской популяции (контрольной группе) и в двух подгруппах пациентов с уролитиазом: со здоровыми родственниками и с отяго- щенным семейным анамнезом и провести их сравнительный анализ.

В общей российской популяции (контрольная группа) при определении полиморфизма гена SLC26A6 встречаемость генотипов следующая: T/T и T/C – 99,5%, C/C – 0,5%. Встречаемость аллелей: T – 88,6%; C – 11,4%. Для гена TNFSF11 встречаемость генотипов составляет: T/T и С/Т– 74,5%; C/C – 25,5%. Встречаемость аллелей: T – 48,9%; C – 51,1%. Для гена ORAI1 встречаемость генотипов следующая: G/T и T/T – 86,8%; G/G – 13,2%. Встречаемость аллелей: T – 61,4%; G – 38,6% (табл. 1).

У пациентов с МКБ со здоровыми родственниками (первая подгруппа) при определении полиморфизма гена SLC26A6 встречаемость генотипов следующая: T/T и T/C – 100,0%; C/C – 0%. Встречаемость аллелей: Т – 91,9%; С – 8,1%. При статистическом анализе для полиморфизма гена SLC26A6 выявлено, что отличия в частоте генотипов в контрольной выборке и выборке пациентов с МКБ являются недостоверными: p= 0,815, отличия в частоте аллелей недостоверны: p= 0,112. Для гена TNFSF11 встречаемость генотипов составила: T/T и С/Т – 74,4%; C/C – 25,6%. Встречаемость аллелей:

Таблица 1. Спектр и частота встречаемости генотипов и аллелей кандидатных генов уролитиаза в общей российской популяции (контрольной группе) с объединением генотипов по аллелю Т

№	Ген	Варианты генотипов и аллелей	Встречаемость
			Абс. число	Частота, %
1	SLC26A6	T/CT;/TC/C	188 1	99,5 0,5
		T C	335 43	88,6 11,4
2	TNFSF11	С/СT/; СT/T	48 140	25,5 74,5
		C T	192 184	51,1 48,9
3	ORAI1	G/G G/T; T/T	25 164	13,2 86,8
		G T	146 232	38,6 61,4

Таблица 2. Спектр и частоты встречаемости генотипов с объединением генотипов по аллелю Т и аллелей кандидатных генов уролитиаза у пациентов с МКБ без семейной отягощенности анамнеза

№	Ген	Варианты генотипов и аллелей	Встречаемость Абс. число Частота, %		Достоверность различий с контрольной группой (р)
1	SLC26A6	T/CT;/TC/C	43 0	100 0	0,815
		T C	79 7	91,9 8,1	0,112
2	TNFSF11	С/С С/T; T/T	11 32	25,6 74,4	0,153
		C T	45 41	52,3 47,7	0,833
3	ORAI1	G/G G/T; T/T	10 33	23,3 76,7	0,048
		G T	39 47	45,3 54,7	0,250

Т – 47,7%; С – 52,3%. При статистическом анализе для гена TNFSF11 выявлено, что отличия в частоте генотипов в контрольной выборке и выборке пациентов с МКБ безсемейной отягощенно-сти в анамнезе являются недостоверными: p= 0,153, отличия в частоте аллелей недостоверны: p= 0,833. Для полиморфизма гена ORAI1 встречаемость генотипов следующая: G/T и T/T – 76,7%; G/G – 23,3%. Встречаемость аллелей: Т – 54,7%; G – 45,3%. При статистическом анализе для гена ORAI1 выявлено, что отличия в частоте генотипов в контрольной выборке и выборке пациентов с МКБ являются достоверными: p= 0,048, отличия в частоте аллелей недостоверны: p= 0,250 (табл. 2).

У пациентов с отягощенным семейным анамнезом по МКБ (вторая подгруппа) при определении полиморфизма гена SLC26A6 встречаемость генотипов следующая: T/T и T/C – 100,0%; C/C – 0% . Встречаемость аллелей: T – 86,6%; C – 13,4%. При статистическом анализе для гена SLC26A6 выявлено, что отличия в частоте генотипов в контрольной выборке и выборке пациентов с МКБ с семейной кластеризацией являются недостоверными: p=0,697, отличия в частоте аллелей недостоверны: и

Таблица 3. Спектр и частоты встречаемости генотипов с объединением генотипов по аллелю Т и аллелей кандидатных генов уролитиаза у больных МКБ с семейной отягощенностью анамнеза

№	Ген	Варианты генотипов и аллелей	Встречаемость Абс. число Частота, %		Достоверность различий с контрольной группой (р)
1	SLC26A6	T/CT;/TC/C	82 0	100 0	0,697
		T C	142 22	86,6 13,4	0,089
2	TNFSF11	С/С С/T; T/T	17 65	20,7 79,3	0,088
		C T	72 92	43,9 56,1	0,126
3	ORAI1	G/G G/T; T/T	20 62	24,4 75,6	0,012
		G T	77 87	47 53	0,070

p=0,089. Для гена TNFSF11 встречаемость генотипов следующая: T/T и С/Т – 79,3%; C/C – 20,7%. Встречаемость аллелей: T – 56,1%; C – 43,9%. При статистическом анализе для гена TNFSF11 выявлено, что отличия в частоте генотипов в контрольной выборке и выборке пациентов с МКБ с семейной кластеризацией являются недостоверными: p= 0,088, отличия в частоте аллелей недостоверны: p= 0,126. Для гена ORAI1 встречаемость генотипов следующая: G/T и T/T – 75,6%; G/G – 24,4%. Встре- чаемость аллелей: T – 53,0%; G – 47,0%. При статистическом анализе для гена ORAI1 выявлено, что отличия в частоте генотипов в контрольной выборке и выборке пациентов с МКБ с семейной кластеризацией являются достоверными: p=0,012, отличия в частоте аллелей недостоверны p= 0,070 (табл. 3).

Таким образом, отличия в частоте генотипов в контрольной выборке и выборках пациентов с МКБ в российской популяции являются достоверными только в случае полиморфизма в гене

ORAI1. Связь выявлена для групп пациентов без семейной и с семейной кластеризацией уролитиаза.

ВЫВОДЫ

Существует связь между полиморфными вариантами гена модулятора активатора высвобождения кальция 1 (ORAI1, rs7135617) и мочекаменной болезнью у пациентов со здоровыми родственниками и больных с отягощенным семейным анамнезом по уролитиазу в российской популяции. Зависимости между мочекаменной болезнью и полиморфизмами гена мембранного анионного транспортера семейства 26 (SLC26A6, rs2310996) и гена фактора некроза опухолей 11 (TNFSF11, rs9525641) не обнаружено. Полученные результаты свидетельствуют о том, что в развитии уролитиаза в российской популяции независимо от состояния семейного анамнеза заболевания могут играть роль генетические факторы, в частности, полиморфные варианты гена ORAI1. □

Резюме: