Частоты аллельных групп и гаплотипов HLA в популяции осетин Владикавказа

Автор: Конева Елена Петровна, Хамаганова Екатерина Георгиевна, Абдрахимова Алена Руслановна

Журнал: Вестник гематологии @bulletin-of-hematology

Рубрика: В помощь практическому врачу

Статья в выпуске: 2 т.14, 2018 года.

Бесплатный доступ

Короткий адрес: https://sciup.org/170150021

IDR: 170150021

Текст статьи Частоты аллельных групп и гаплотипов HLA в популяции осетин Владикавказа

Введение. Регистр потенциальных доноров костного мозга ФГБУ «НМИЦ гематологии» г. Москва в своем большинстве представлен донорами,проживающими в Москве и Московской области и самоопределившимися, как русские. Однако в состав регистра входят также представители других этнических групп и регионов проживания,в частности осетины Владикавказа. Осетины являются носителями осетинского языка, который принадлежит к иранской группе индоевропейских языков, и предположительно являются потомками Алан — племени скифосарматского происхождения. Генетические исследования осетин (митохондриальной ДНК и Y-гаплогрупп) выявили большее их сходство с русскими, чем с соседями — другими популяциями Кавказа. Исходя из всего вышесказанного, оценка иммуногенетического профиля осетин по генам HLA представляется особенно интересной.

Целью данной работы было оценить частоты встречаемости аллельных групп и гаплотипов HLA у осетин Владикавказа.

Материалы и методы . Исследуемая выборка представлена 127 здоровыми донорами, которые проживают в г. Владикавказ Северной Осетии и являются осетинами в третьем поколении. Материал для исследования — венозная кровь. Выделение ДНК — Blood DNA Extraction Kit на приборе NorDiag Arrow (NorDiag, Норвегия). Типирование по 6 локусам генов HLA проводили методом PCR-SSO на платформе Luminex с использованием наборов Lifecodes SSO Typing Kit (Immucor, США), для уточнения неоднозначностей пользовались наборами Olerup (Швеция). 127 доноров типированы по локусам HLA-A, —

ВСЕРОССИЙСКАЯ НАУЧНО-ПРАКТИЧЕСКАЯ

КОНФЕРЕНЦИЯ С МЕЖДУНАРОДНЫМ УЧАСТИЕМ

«АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ ИММУНОГЕНЕТИКИ И ТКАНЕВОГО ТИПИРОВАНИЯ»

Санкт-Петербург 30–31 мая 2018 г.

B, — C, — DRB1, — DQB1, из них 119 доноров дополнительно типированы по локусу -DQA1. Статистическую обработку данных и соответствие наблюдаемого распределения аллельных групп равновесию Харди-Вайнберга проводили с использованием программы Arlequin 3.5.

Результаты. Согласно закону Харди-Вайнберга исследуемая выборка находится в состоянии равновесия по всем локусам. В результате типирования осетин по генам HLA I класса было выявлено 14 аллельных групп в локусе А, 20 аллельных групп в локусе B и 13 аллельных групп в локусе C. Наиболее распространенными вариантами в локусе HLA-A оказались A*02 (24. %), A*30 (13.4 %) и A*03 (12.6 %). В локусе HLA-B — B*49 (15.7 %), B*51 (12.6 %), B*07 (11 %). Среди аллельных групп локуса HLA-C высокие частоты наблюдались для C*07 (41.3 %), C*06 (15.3 %), C*04 ( .3 %) и C*12 ( .3 %).

При типировании осетинской популяции по генам HLA II класса было выявлено 12 аллельных групп в локусе HLA-DRB1, 6 аллельных групп в локусе HLA-DQA1 и 5 аллельных групп в локусе HLA-DQB1. Самыми высокочастотными в локусе HLA-DRB1 аллельными группами оказались DRB1*13 (21.7 %), DRB1*11 (17.3 %), DRB1*15 (13 %).

В локусах HLA-DQA1 и HLA-DQB1 наиболее частотными были DQA1*01 (47 %), DQA1*05 (31 %), DQA1*02 (11 %), DQB1*06 (34.2 %), DQB1*03 (30.2 %), DQB1*02 (23.6 %).

При оценке шестилокусных гаплотипов в популяции осетин (2n=23 ) наиболее частым оказался гаплотип A*30-B*49-C*07-DRB1*13-DQA1*01-DQB1*06 (9 %). Данный гаплотип с подобной частотой не встречается ни в одной доступной для сравнения попу- ляции,однако с меньшей частотой есть у турок (0.02 %), итальянцев (0.13 %) и жителей Никарагуа (0.22 %). Следующие гаплотипы, выявленные в популяции осетин: A*03-B*07-C*07-DRB1*15-DQA1*01-DQB1*06 (встретился с частотой 4.6 %) и A*32-B*0 -C*07-DRB1*03-DQA1*05-DQB1*02(счастотой 2.5 %) довольно распространены в европейских популяциях и среди русских доноров регистра ФГБУ «НМИЦ гематологии»; и гаплотип A*02-B*51-C*16-DRB1*11-DQA1*05-DQB1*03 с частотой 3.7 % — характерен прежде всего для представителей азиатских популяций. Гаплотип, который преобладает в большинстве европейских популяций и у русских доноров регистра ФГБУ «НМИЦ гематологии» — A*01-B*0 -C*07-DRB1*03-DQA1*05-DQB1*02, у осетин занимает пятое по частоте место и встречается в 1.7 % случаев.

Выводы. Таким образом, осетины Владикавказа представляют собой популяцию, уникальность которой заключается в одновременном присутствии у них с высокой частотой таких аллельных групп, как HLA-A*02 и A*30, HLA-B*51 и B*07, а также гаплотипов A*03-B*07-C*07-DRB1*15-DQA1*01-DQB1*06 и A*02-B*51-C*16-DRB1*11-DQA1*05-DQB1*03, характерных для европейцев и для азиатов. Кроме того, отличительной чертой осетин,выделяющей их среди мировых и ос-новныхроссийскихпопуляций,можносчитать высокие частоты аллельных групп HLA-B*49, HLA-C*07, HLA-DRB1*13 и гаплотипа A*30-B*49-C*07-DRB1*13-DQA1*01-DQB1*06. Типи-рование и включение в регистр доноров с подобными генотипами повысит вероятность нахождения совместимых неродственных доноров для пациентов из того же региона и пациентов с редкими генотипами HLA.

Статья