Генетическая структура популяций лошадей рысистых пород по аллелям D-системы групп крови
Автор: Князев C.П., Дубровская P.M., Фадеева Н.С., Гуторова Н.В., Данильченко Н.В., Никитин С.В.
Журнал: Сельскохозяйственная биология @agrobiology
Рубрика: Генетико-селекционное улучшение животных
Статья в выпуске: 4 т.38, 2003 года.
Бесплатный доступ
Оценивали генетическую структуру трех популяций лошадей орловской и русской рысистых пород по аллелям системы D групп крови. Для идентификации аллелей и генотипов по фенотипам использовали ограниченные панели антисывороток-реагентов. Рассматриваются различия между породами и географически разобщенными популяциями лошадей, обусловленные векторами естественного и искусственного отбора.
Короткий адрес: https://sciup.org/142132900
IDR: 142132900
Текст научной статьи Генетическая структура популяций лошадей рысистых пород по аллелям D-системы групп крови
Известно, что система D групп крови лошадей контролируется тесно сцепленными генами, так называемыми комплексными аллелями (гаплотипами), каждый из которых детерминирует фиксированный набор антигенов, передающийся потомству как единая феногруппа. Среди млекопитающих, имеющих генетические систе- мы с аналогичной детерминацией, у домашних лошадей система D групп крови явля- ется одной из наиболее сложных. В настоящее время известно 17 антигенов (Da, Db, Dc, Dd, De, Df, Dg, Dh, Di, Dk, Dl, Dm, Dn, Do, Dp, Dq, Dr), образующих феногруппы, генетический контроль которых осуществляется 24 комплексными аллелями (Dadl, adlnr adlr bcmq cefgmq cegimnq cfgkm cfmqr cgm cmgp cgmq cgmqr cgmr deklqr Ddeloq,, Ddelq,, Ddfklr, ,Ddghmp, ,Ddghmq, D,dghmqr, D, dkl, Dd,lnq, Dd,lnqr, Dd,lqr, Dq), (1, 2). ,Поэтом, у при-, менение даже полной панели антисывороток-реагентов ко всем 17 антигенам не позволяет однозначно идентифицировать многие генотипы по фенотипу. Ситуация ос- ложняется еще и тем, что в последнее десятилетие сократилось производство реагентов. В то же время высокий полиморфизм и сложная комплексная детерминация феногрупп D-системы групп крови отражают ее селективную значимость. В связи с этим определение уровня полиморфизма этой системы имеет научно-теоретическое значение при оценке микроэволюционных процессов в ходе отбора. В популяциях лошадей для определения частоты аллелей и генотипов D-системы групп крови используют косвенные методы анализа, в частности соотношение Харди-Вайнберга (3).
В задачу нашей работы входила оценка частоты аллелей системы D групп крови в трех популяциях орловских и русских рысаков, а также различий между этими породами.
Методика. Объектом исследования служили три выборки ( n = 341) лошадей: I ( n = 176) и II ( n = 70) — соответственно русские и орловские рысаки (из Западной Сибири), III ( n = 95) — орловские рысаки (из европейской части России). Образцы крови лошадей сибирских и европейской популяций тестировали соответственно в Новосибирском аграрном университете и Всероссийском НИИ коневодства (ВНИ-ИК) по единой методике при использовании антисывороток-реагентов производства ВНИИК (4-6). При типировании животных применяли семь антисывороток-реагентов, которые позволяли выявить только семь соответствующих антигенов системы D групп крови (Da, Dс, Dd, De, Df, Dh, Dm). В связи с этим 24 аллеля мы распределили по 10 группам, объединив аллели с идентичными фрагментами (молекулярными маркерами гаплотипов), —
1. Группировка аллелей системы D групп крови ло- так называемые условные алле- шадей рысистых пород для анализа генетиче-ской ли, частоту которых и определя- структуры популяций ли в исследуемых выборках жи- |
||
Группа аллелей |
Выявляемый условный аллель |
ч астота условных вотных (табл. 1). аллелей в популя- Статистическую обра- ции ( р ) |
adl adlnr adlr D bcmq , D cgm , D cgmp , D cgmq , D cgmqr , D cgmr D cefgmq D cegimnq D cfgkm , D cfmqr deklqr deloq delq D dfklr , , D dghmp , D dghmq , D dghmqr dkl dlnq dlnqr dlqr Dq , , , |
Dad Dcm D cefm Dcem Dcfm Dde Ddf dhm Dd D– |
ботку данных проводили по Ла- 1 кину (7). Предполагалось, что
фактическое число конкретных фенотипов, P i — частота фено- |
типа в популяции, теоретически ожидаемая по Харди-Вайнбергу (табл. 2). Достоверность соответствия частоты аллелей, рассчитанной по Lh , оценивали на основании совпадения фактического и теоретического числа фенотипов по критерию χ 2 (8). Степень отклонения фактического числа фенотипических классов от ожидаемого оценивали по коэффициенту корреляции ( r ).
-
2. Характеристика выявляемых фенотипов по системе D групп крови лошадей рысистых пород
3. Частота аллелей D-системы групп крови лошадей рысистых пород
Фенотип по наличию антигенов |
Генотипический состав класса |
Ожидаемая частота фенотипа ( P i ) |
||||||
Da |
Dc |
Dd 1 |
De |
Df т |
Dh |
Dm |
||
+ |
– |
+ |
– |
– |
– |
– |
Dad/Dad, Dad/Dd, Dad/D– |
p 12 +2 p 1 ( p 9 + p 10 ) |
– |
+ |
– |
– |
– |
– |
+ |
Dcm/Dcm, Dcm/D– |
p 22 +2 p 2 p 10 |
– |
+ |
– |
+ |
+ |
– |
+ |
cefm cefm cm cefm cefm cem |
p 32 +2 p 3 ( p 2 + p 4 + p 5 + p 10 )+ |
Dcefm/Dcfm,,Dcem/Dcfm,,Dcm/D– , |
+ 2 p 4 p 5 |
|||||||
– |
+ |
– |
+ |
– |
– |
+ |
Dcem/Dcem, Dcm/Dcem, Dcem/D– |
p 42 +2 p 4 ( p 2 + p 10 ) |
– |
+ |
– |
– |
+ |
– |
+ |
Dcfm/Dcfm, Dcm/Dcfm, Dcfm/D– |
p 52 +2 p 5 ( p 2 + p 10 ) |
– |
– |
+ |
+ |
– |
– |
– |
Dde/Dde, Dde/Dd, Dde/D– |
p 62 +2 p 6 ( p 9 + p 10 ) |
– |
– |
+ |
– |
+ |
– |
– |
Ddf/Ddf, Ddf/Dd, Ddf/D– |
p 72 +2 p 7 ( p 9 + p 10 ) |
– |
– |
+ |
– |
– |
+ |
+ |
dhm dhm dhm d dhm – |
p 82 +2 p 8 ( p 9 + p 10 ) |
– |
– |
+ |
– |
– |
– |
– |
Dd/Dd, Dd/ , D– , |
p 92 +2 p 9 p 10 |
– |
– |
– |
– |
– |
– |
– |
D–/D– |
p 102 |
+ |
+ |
+ |
– |
– |
– |
+ |
Dad/Dcm |
2 p 1 p 2 |
+ |
+ |
+ |
+ |
+ |
– |
+ |
D ad /D cefm |
2 p 1 p 3 |
+ |
+ |
+ |
+ |
– |
– |
+ |
Dad/Dcem |
2 p 1 p 4 |
+ |
+ |
+ |
– |
+ |
– |
+ |
Dad/Dcfm |
2 p 1 p 5 |
+ |
– |
+ |
+ |
– |
– |
– |
Dad/Dde |
2 p 1 p 6 |
+ |
– |
+ |
– |
+ |
– |
– |
Dad/Ddf |
2 p 1 p 7 |
+ |
– |
+ |
– |
– |
+ |
+ |
ad dhm |
2 p 1 p 8 |
– |
+ |
+ |
+ |
– |
– |
+ |
Dcm/Dde, Dcem/Dde, Dcem/Dd |
2( p 2 p 6 + p 4 p 6 + p 4 p 9 ) |
– |
+ |
+ |
– |
+ |
– |
+ |
Dcm/Ddf, Dcfm/Ddf, Dcfm/Dd |
2( p 2 p 7 + p 5 p 7 + p 5 p 9 ) |
– |
+ |
+ |
– |
– |
+ |
+ |
cm dhm |
2 p 2 p 8 |
– |
+ |
+ |
– |
– |
– |
+ |
Dcm/Dd |
2 p 2 p 9 |
– |
+ |
+ |
+ |
+ |
– |
+ |
Dcefm/Dde, Dcefm/Ddf, Dcem/Ddf, |
2( p 3 p 6 + p 3 p 7 + p 4 p 7 + |
Dcefm/Dd, Dcfm/Dde |
+ p 3 p 9 + p 5 p 6 ) |
|||||||
– |
+ |
+ |
+ |
+ |
+ |
+ |
cefm dhm |
2 p 3 p 8 |
– |
+ |
+ |
+ |
– |
+ |
+ |
cem dhm |
2 p 4 p 8 |
– |
+ |
+ |
– |
+ |
+ |
+ |
D cfm /D dhm |
2 p 5 p 8 |
– |
– |
+ |
+ |
+ |
– |
– |
Dde/Ddf |
2 p 6 p 7 |
– |
– |
+ |
+ |
– |
+ |
+ |
de dhm |
2 p 6 p 8 |
– |
– |
+ |
+ |
+ |
+ |
+ |
D df /D dhm |
2 p 7 p 8 |
П р и м е ч а н и е: р — частота условных аллелей в популяции.
Результаты. Лошади рысистых пород в разных выборках существенно различались по частоте аллелей системы D групп крови (табл. 3). При этом различия между европейской и сибирской популяциями орловских рысаков были аналогичны таковым между орловскими и русскими рысаками. Частота аллеля Dcm (модальная для всех трех популяций) у ор-
Аллель |
I выборка |
II выборка |
III выборка |
Dad |
0,20 |
0,11 |
0,17 |
Dcm |
0,29 |
0,21 |
0,41 |
D cefm |
0,04 |
0,01 |
0,01 |
Dcem |
0,07 |
0,05 |
0,05 |
Dcfm |
0,03 |
0,01 |
0,01 |
Dde |
0,18 |
0,10 |
0,07 |
Ddf |
0,03 |
0,12 |
0,05 |
dhm |
0,05 |
0,08 |
0,07 |
Dd |
0,10 |
0,18 |
0,15 |
D– |
0,01 |
0,13 |
0,01 |
П р и м е ч а н и е. Описание вариантов см. |
в разделе «Ме- |
||
тодика». |
ловских рысаков из европейской части России была в 1,5-2,0 раза выше, чем в сибирских популяциях.
Следовательно, по этому параметру внутрипородная изменчивость значительно превосходит межпородную. Орловские рысаки из Западной Сибири, характеризовались высокой частотой аллелей Ddf и D– , которые в других популяциях встречались очень редко (0,3-0,5) или даже практически отсутствовали.
Для более полной количественной оценки различий между по- пуляциями мы рассчитывали генетические дистанции по частоте как фенотипов, так и аллелей системы D:
Сравниваемые популяции лошадей |
По частоте фенотипов |
По частоте аллелей |
Русская рысистая (сибирская популяция)— орловская рысистая (европейская популяция) |
0,1429 |
0,0322 |
Орловская рысистая (сибирская популяция)— орловская рысистая (европейская популяция) |
0,2683 |
0,0622 |
Русская рысистая (сибирская популяция)— орловская рысистая (сибирская популяция) |
0,2830 |
0,0843 |
Дистанции, рассчитанные по частоте аллелей, оказались существенно меньше, чем по частоте фенотипов групп крови, однако тенденция была сходной. Так, наименьшая дистанция выявлена между популяциями русского и орловского рысака из европейской части России, а наибольшая — между рысаками русской и орловской пород из Сибири. Внутрипородные географически разобщенные группировки рысаков орловской породы занимали промежуточное положение, располагаясь по этому показателю ближе к популяциям из Западной Сибири.
Поскольку значения частот аллелей рассчитывали по максимальному правдоподобию с предположением о соответствии соотношению по Харди-Вайнбергу, то заранее ожидалось, что расхождение по фактической и теоретической частоте фенотипов будет минимальным. Однако оказалось, что по этому показателю различия в популяции русских рысаков были статистически значимыми, тогда как в двух популяциях орловских рысаков — соответствовали соотношению по Харди-Вайнбергу (табл. 4).
При расчете коэффициентов корреляции между фактическим и теоретически ожидаемым числом фенотипических классов соответствующие комплексные фенотипы были обозначены как феногруппы по принципу присутствия в эритроцитах тех или иных сочетаний антигенов D-системы групп крови. Это соответствие оказалось максимальным в III и минимальным — в I выборке; орловские рысаки II выборки занимали промежуточное положение, приближаясь к показателям лошадей из I выборки. Анализ полиморфизма по аллелям D - системы групп крови показал, что различия между популяциями лошадей одной и той же породы из географически удаленных регионов (II и III выборки) могут быть столь же значительными, как и между породами, несмотря даже на неоднократный завоз производителей из других районов.
Различная степень отклонения изучаемых популяций от состояния равновесия по Харди-Вайнбергу свидетельствует об участии высокополиморфной D - системы групп крови в формировании общей приспособлен-
-
4. Фактическое ( n ф акт . ) и ожидаемое ( n теор.) число фенотипов системы D групп крови в различных популяциях лошадей рысистых пород
Комплексные фенотипы по наличию антигенов
I выборка ( n = 176)
II выборка ( n = 70)
III выборка ( n = 95)
Daи Dcи Ddп Deп
Df1 Dh Dm
n факт . n теор.
n факт . n теор.
n факт . n теор.
+
–
+
–
–
–
–
2
14,78
3
5,62
9
7,91
–
+
–
–
–
–
+
25
15,82
6
6,91
18
16,75
–
+
–
+
+
–
+
1
6,65
0
0,64
0
1,02
–
+
–
+
–
–
+
2
8,25
4
2,56
2
4,23
–
+
–
–
+
–
+
3
3,33
0
0,48
0
0,81
–
–
+
+
–
–
–
11
12,67
5
5,04
3
2,59
–
–
+
–
+
–
–
1
1,32
8
6,22
1
1,76
–
–
+
–
–
+
+
1
2,38
3
3,92
2
2,59
–
–
+
–
–
–
–
2
2,11
8
5,54
0
2,42
–
–
–
–
–
–
–
0
0,02
1
1,18
0
0,01
+
+
+
–
–
–
+
18
20,42
5
3,23
10
13,24
+
+
+
+
+
–
+
9
2,82
2
0,15
0
0,32
+
+
+
+
–
–
+
16
4,93
0
0,77
6
1,62
+
+
+
–
+
–
+
4
2,11
0
0,15
1
0,32
+
–
+
+
–
–
–
8
12,67
0
1,54
2
2,26
+
–
+
–
+
–
–
0
2,11
2
1,85
0
1,62
+
–
+
–
–
+
+
6
3,52
3
1,23
1
2,26
–
+
+
+
–
–
+
27
25,27
6
4,90
6
7,54
–
+
+
–
+
–
+
6
4,44
5
3,95
8
4,28
–
+
+
–
–
+
+
5
5,10
2
2,35
8
5,45
–
+
+
–
–
–
+
16
10,21
3
5,29
16
11,69
–
+
+
+
+
–
+
7
7,00
0
1,54
0
1,12
–
+
+
+
+
+
+
0
0,70
0
0,11
0
0,13
–
+
+
+
–
+
+
1
1,23
0
0,56
0
0,67
–
+
+
–
+
+
+
1
0,53
0
0,11
0
0,13
–
–
+
+
+
–
–
2
1,90
1
1,68
1
0,67
–
–
+
+
–
+
+
2
3,17
3
1,12
1
0,93
–
–
+
+
+
+
+
0
0,53
0
1,34
0
0,67
Достоверность различий (Р)
Коэффициент корреляции ( r )
< 0,001 0,80
Нет 0,85
Нет 0,93
П р и м е ч а н и е. То же, что в табл. 3.
ности особей и их сообществ, а также о различной интенсивности протекающих в этих популяциях селективных процессов. Возможно, это отклонение оказывает влияние и на расхождение векторов отбора, при различных вкладах естественного и искусственного отбора в формирование генофонда популяции.
В европейской популяции орловских рысаков, предковой как по отношению к сибирской популяции, так и к рысакам русской породы влияние отбора было минимальным. Это объясняется тем, что рысаки европейской популяции обитают в «первичном ареале» — «центре происхождения» (по Вавилову) (9). При этом можно предположить, что генофонд орловской рысистой породы наиболее консолидирован, а изменения, при-вносимые искусственным отбором, незначительны и не приводят к существенным отклонениям от ожидаемых по соотношению Харди-Вайнберга.
Четкая дифференциация западно-сибирской группировки орловских рысаков от европейской популяции по частоте аллелей Ddf и D –, скорее всего, обусловлена генетико-автоматическими процессами, «эффектом основателя». В то же время незначительное отклонение от соотношения Харди-Вайнберга может быть обусловлено естественным отбором в пользу наиболее адаптированных к местным условиям особей. Влияние искусственного отбора в этом случае менее вероятно, так как отбор в обеих популяциях орловских рысаков проводят по одному и тому же комплексу признаков, в который не входят группы крови (последние используют лишь для иммуно-генетической экспертизы родословных) и относительно одинаковыми методами.
В отличие от орловских рысаков при разведении русской рысистой породы регулярно использовали прилитие крови лошадей американской селекции (стандар-тбредная «кровь»). Значительное нарушение соотношений Харди-Вайнберга в изучаемой популяции русских рысаков имеет двойственную природу и является результатом суммарного действия естественного и искусственного отбора. Поскольку русские рысаки представляют собой «продукт» относительно недавнего скрещивания двух фенотипически и генетически разнородных пород с продолжающимся прилитием крови лошадей американской селекции, при их разведении в условиях Западной Сибири должно выщепляться значительное число особей, генотипы которых могут оказаться относительно менее адаптивными. В результате избирательной гибели (преимущественно на ранних этапах онтогенеза) или выбраковки таких особей естественным образом соотношение генотипических и фенотипических классов в популяции нарушается.
Необходимо отметить, что селекцию русских рысаков в отличие от орловских проводят в последнее время не по комплексу признаков, а главным образом по признакам резвости, что опять же должно сопровождаться смещением равновесия по частоте генотипических классов.
Таким образом, значительные отклонения по соотношению фенотипов и генотипов генетических систем лошадей рысистых пород обусловлены совместным действием естественного и искусственного отбора. Исключительная полиаллель-ность, высокая полиморфность и возможная ассоциированность D-системы групп крови лошадей с некоторыми морфофизиологическими признаками свидетельствуют о необходимости использования в селекции генетических маркеров (10, 11).
Л И Т Е Р А Т У Р А
-
1. B o w l i n g A. Horse Genetics. Wallingford, 1996.
-
2. С о t h r a n E.G., L o n g Y.G. A new phenogroup in the horse D system of red cell alloantigens found in
the Caspian pony. Animal genetics, 1994, 25: 49-50.
-
3. Л и Ч. Введение в популяционную генетику. M., 1978.
-
4. К н я з е в С.П., Ч е р н о в а Т.Г., К л о п о в а О.В. Иммуногенетический анализ популяций рыси
стых лошадей Западной Сибири. С.-х. биол., 1995, 2: 56-60.
-
5. Д у б р о в с к а я P.M. Полиморфизм эритроцитарных антигенов и белков крови лошадей и перспективы его использования в селекционной работе. Автореф. докт. дис. М., 1988.
-
6. Д у б р о в с к а я P.M., С т а р о д у м о в И.М. Методические рекомендации по использованию полиморфных систем белков и групп крови при контроле достоверности происхождения лошадей. Рязань, 1986.
-
7. Л а к и н Г.Ф. Биометрия. М., 1990.
-
8. Ж и в о т о в с к и й Л.А. Показатель сходства популяций по полиморфным признакам. Журн. общ. биол., 1979, 4: 587-602.
-
9. В а в и л о в Н.И. Избр. тр. Т. 2. Проблемы селекции. M.-Л., 1960.
-
10. К н я з е в С.П., Н и к и т и н С.В. Ассоциации масти и антигенов системы D групп крови лошадей.
-
11. К н я з е в С.П., Н и к и т и н С.В., Г о р е л о в И.Г. и др. Ассоциации генетических маркеров в двух родственных породах свиней. Генетика, 1999, 35, 5: 674-680.
Генетика, 1999, 35, 4: 499-503.
Hoвoсuбирский государственный аграрный Поступила в редакцию 2
университет, 630039, Новосибирск, ул. Добролюбова, 160; апреля 2002 года
Всероссийский НИИ коневодства, Рязанская обл.;
Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск
GENETIC STRUCTURE OF POPULATIONS OF THE HORSE
TROTTER BREED ON ALLELES OF SYSTEM D OF BLOOD GROUPS
S.P. Knyazev, R.M. Dubrovskaya, N.S. Fadeeva, N.V. Gutorova, N.V. Danil’chenko, S.V. Nikitin
S u m m a r y
The authors used the original technique for identification of alleles and genotypes on the phenotypes by means of limited panel of antiserum-reagents and population-genetic analysis for the purpose of estimation of genetic structure of three horse populations of the Orlov and Russian trotter breed on alleles of D system of blood groups. The differences between the breeds and geography disconnected animals populations were revealed, that is due to different vectors of the natural and artificial selection.