Характеристика RF-линий подсолнечника коллекции ВНИИМК с помощью микросателлитных маркеров ДНК
Автор: Гучетль С.З., Логинова Е.Д., Рябовол И.В., Головатская А.В., Савиченко Д.Л., Волошко А.А., Борисенко О.М., Савченко В.Д., Фролов С.С., Горбаченко О.Ф., Пихтярева А.А.
Рубрика: Селекция, семеноводство и биотехнология сельскохозяйственных растений
Статья в выпуске: 1 (197), 2024 года.
Бесплатный доступ
Подсолнечник - одна из наиболее рентабельных масличных культур. Задача селекции подсолнечника - создание новых высокоурожайных гибридов. Для ее решения важное значение имеет генетическое разнообразие исходного селекционного материала. Оценить это разнообразие можно с использованием молекулярно-генетических маркеров, в частности микросателлитов. Цель данной работы заключалась в генотипировании коллекции Rf-линий, анализе ее генетического разнообразия с помощью микросателлитных маркеров. Анализ для 54 Rf-линий коллекции ФГБНУ ФНЦ ВНИИМК выполнен с помощью 12 SSR-маркеров. По этим маркерам были составлены генетические паспорта для всех изучаемых линий и определены основные показатели информативности SSR-локусов. Коллекция характеризовалась большим генетическим разнообразием, в сумме были получены (Nа) 55 аллелей, в среднем 4,58 аллеля на локус. Эффективное число аллелей (Ne) в среднем 2,48. Индекс полиморфного информационного содержания (PIC) составил 0,51. Уровень гетерогенности линий был достаточно низким (5,5 %), что говорит об их хорошей генетической выровненности. По результатам анализа коллекция была разделена на два кластера на уровне объединения 15,8. Минимальная генетическая дистанция между линиями составила 0. Первый кластер cформировали 11 линий. Большая часть линий (43 шт.) образовали второй кластер. Уникальность коллекции составила 91 %.
Генетическое разнообразие, генотипирование, подсолнечник, helianthus annuus, маркер, ssr, линии-восстановители фертильности
Короткий адрес: https://sciup.org/142241296
IDR: 142241296 | DOI: 10.25230/2412-608X-2024-1-197-17-23
Список литературы Характеристика RF-линий подсолнечника коллекции ВНИИМК с помощью микросателлитных маркеров ДНК
- Filippi C.V., Merino G.A., Montecchia J.F., Aguirre N.C., Rivarola M., Naamati G., Fass M.I., Álvarez D., Di Rienzo J., Heinz R.A., Contreras Moreira B., Lia V.V., Paniego N.B. Genetic diversity, population structure and linkage disequilibrium assessment among international sunflower breeding collections // Genes. - 2020. - 11 (3). - 283. DOI: 10.3390/genes11030283 EDN: FUBKHR
- Goryunova S.V., Goryunov D.V., Chernova A.I., Martynova E.U., Boldyrev S.V., Ayupova A.F., Mazin P.V., Gurchenko E.A., Pavlova A.S., Petrova D.A., Dmitriev A.E., Chebanova Y.V., Gorlova L.A., Demurin Y.N., Garkusha S.V., Mukhina Z.M., Savenko E.G. Genetic and phenotypic diversity of the sunflower collection of the Pustovoit All-Russia Research Institute of Oil Crops (VNIIMK) // Helia. - 2019. - 42 (70). - Р. 45-60. DOI: 10.1515/helia-2018-0021 EDN: IVIRDU
- Velimirović A., Jovović Z., Perović D., Lehnert H., Mikić S., Mandić D., Pržulj N., Mangini G., Finetti-Sialer M.M. SNP diversity and genetic structure of "Rogosija", an old Western Balkan durum wheat collection // Plants. - 2023. - 12 (5). - 1157. DOI: 10.3390/plants12051157 EDN: XSKEQT
- Duca M., Port A., Cucereavî A., Șestacova T. SSR markers assessment in estimation of genetic polymorphism in sunflower // International Journal of Advanced Research in Biological Sciences. - 2015. - 2 (1). - Р. 70-77.
- Zhang L.S., Clerc V. Le, Li S., Zhang D. Establishment of an effective set of simple sequence repeat markers for sunflower variety identification and diversity assessment // Canadian Journal of Botany. - 2005. - V. 83. - P. 66-72. DOI: 10.1139/B04-155
