HLA-генетические дистанции между донорами регистра "НМИЦ гематологии", российскими и некоторыми зарубежными популяциями

Материалы и методы. В исследование вошли 2230 потенциальных доноров костного мозга (КМ)регистра «НМИЦ гематологии», которые самоопределились как этнически русские. ДНК выделяли из периферической крови, взятой с антикоагулянтом ЭДТА, при помощи станции для выделения ДНК NorDiag Arrow (Norway). HLA-типирование проводили методом гибридизации с олигонуклетид-ными зондами (SSO) — Immucor Transplant Diagnostic, Inc. (USA) на платформе анализатора Luminex 200 по пяти генам HLA – A*, — B*, — C*, — DRB1*, — DQB1*. Частоты групп HLA-аллелей и соответствия наблюдаемого распределения равновесию Харди – Вайнберга определяли с помощью компьютерной программы Arlequin 3.5 методом максимального правдоподобия при помощи алгоритма максимизации ожидания. Для анализа g. d. использовались данные российских и некоторых зарубежных популяций, которые представлены в базе данных allelefrequencies. net (AF — и открытой литературе. Всего привлечены данные по 52 популяциям, включая доноров-москвичей регистра «НМИЦ гематологии», которые самоопределились как русские, доноров «НМИЦ гематологии» — осетин из Вла- дикавказа и 10 иных российских популяций, исследованных другими коллективами авторами. Критерий включения популяции в анализ — данные минимально по группам аллелей HLA-A*-B*-DRB1* генов, сумма частот гаплотипов по каждому HLA-гену равная 1. Расчёт генетических расстояний проводили по методу Нея c помощью программы Phylip 3.695, как и построение филогенетических деревьев.

Результаты . Доноры-москвичи, самоопределившиеся как русские, близки по частотам групп аллелей HLA-генов к другим популяциям русских и некоторым славянским популяциям. Наиболее приближены к донорам-русским из Москвы самарцы, новосибирцы, русские из Челябинска, и поляки, g. d. < 0,1. Несколько дальше отстоят русские из Карелии (g. d.=0,131); Кировской области (g. d.=0,136); население Башкортостана — этнически смешанная популяция, состоящая в основном из представителей трёх групп — башкир, русских и татар (g. d.=0,170); население Северо-Западного региона (g. d.=0,19 ); татары Челябинской области (g. d.=0,24) и Татарстана (g. d.=0,33 ). Наиболее удалёнными по HLA-генам от доноров-москвичей из российских популяций были башкиры Челябинской области (g. d.=1,075), осетины (g. d.=1,2 3) и тувинцы (g. d.=1,593). Из включённых в анализ славянских популяций наиболее близки к донорам-москвичам — поляки и словаки (g. d.=0,123), чехи (g. d.=0,143), удалены — хорваты (g. d.=0,230) и сербы (g. d.=0,401). Наиболее удалёнными от москвичей европейскими популяциями являлись баски (g. d.=1,66) и саами (g. d.=3,012). Наибольшая генетическая дивергенция у доноров-москвичей наблюдалась с аборигенами Австралии и индейцами Северной и Южной Америки (g. d. от ,204 до 29,519).

На отсутствие значительной дивергенции между популяциями русских указывает взаимное расположение этих популяций

ВЕСТНИК ГЕМАТОЛОГИИ, том XIV, № 2, 2018

(«листьев») на филогенетическом дереве, а также незначительная длина ветвей, на которых они располагаются. Ветвь, к которой относятся тувинцы, отпочковывается вместе с монгольской ветвью от одного вышележащего узла. Ветвь, на которой располагаются осетины — единственный народ Северного Кавказа, язык которого относится к иранской группе индоевропейской семьи, отпочковывается от одного узла с популяциями Юго-Восточной Европы/Юго-Западной Азии. На своеобразность этой популяции указыва- ет значительная длина ветви, на которой расположен осетинский «лист».

Выводы . Генетическая дивергенция по HLA- генам между различными популяциями русских незначительна. Однако российские популяции разного этнического происхождения отличаются существенным HLA- генетическим разнообразием, поэтому необходимо привлекать в российские регистры доноров из различных регионов России с разными этническими составами.