In silico и in vivo изучение противовоспалительной активности азометиновых производных 2-амино-4,5,6,7-тетрагидро-1-бензотиофен-3-карбоксамида и 2-замещённых 5,6,7,8-тетрагидробензо[4,5]тиено[2,3-d]пиримидин-4(3h)-она
Автор: Чиряпкин А.С., Кодониди И.П., Абисалова И.Л., Дьякова И.Н.
Журнал: Juvenis scientia @jscientia
Рубрика: Оригинальные исследования
Статья в выпуске: 1 т.11, 2025 года.
Бесплатный доступ
Введение. Поиск эффективных и малотоксичных веществ с противовоспалительным действием является актуальной задачей фармации, так как патологический процесс воспаления развивается при различных заболеваниях. Целью исследования являлся поиск новых соединений с выраженным противовоспалительным действием среди азометиновых и пиримидиновых производных. Объектами исследования являются азометиновые производные 2-амино-4,5,6,7-тетрагидро-1-бензотиофен-3-карбоксамида (3a-3s) и соответствующие им 2-замещённые 5,6,7,8-тетрагидробензо[4,5]тиено[2,3-d]пиримидин-4(3H)-она (4a-4s).
Прогноз, молекулярный докинг, противовоспалительная активность, цог-2, азометины, тетрагидротиенопиримидины
Короткий адрес: https://sciup.org/14133129
IDR: 14133129 | DOI: 10.32415/jscientia_2025_11_1_16-24
Текст научной статьи In silico и in vivo изучение противовоспалительной активности азометиновых производных 2-амино-4,5,6,7-тетрагидро-1-бензотиофен-3-карбоксамида и 2-замещённых 5,6,7,8-тетрагидробензо[4,5]тиено[2,3-d]пиримидин-4(3h)-она
Основания Шиффа (азометины) представляют собой обширный класс органических соединений, которые проявляют различные виды биологической активности. Например, у них выявлены противогрибковые, антибактериальные, противомалярийные, антипролиферативные, противовоспалительные, противовирусные и жаропонижающие свойства [1]. В частности, имеются источники литературы, указывающие на наличие противовоспалительных свойств у данного класса веществ. Например, осуществлялось изучение противовоспалительной активности новых оснований Шиффа c тиадиазолом на трёх моделях: ингибирование денатурации белка и гемолиза эритроцитов, стабилизация мембраны эритроцитов и анализ ингибирования протеиназ. В результате установлено, что тестируемые соединения могут замедлять процесс денатурации белка. Все вещества эффективно уменьшали гемолиз, вызванный нагреванием, а также оказывали значительную антипротеазную активность, что может свидетельствовать о наличии у них противовоспалительных свойств [2]. Установлено, что основания Шиффа на основе 2-амино-5-хлорбензойной кислоты могут проявлять противовоспалительную активность, сопоставимую с ацеклофенаком [3]. Результаты фармакологических исследований синтезированных оснований Шиффа из 2-[(1,3-бензо-тиазол-2-ил)сульфанил]-N-[4-(гидразинкарбонил) фенил]ацетамида вывялили у них наличие противовоспалительной активности [4]. Для азометинов 7-гидрокси-4-формилкумарина и 7-метокси-4-фор-милкумарина in vitro установлено противовоспалительное действие на модели денатурации белка посредством ингибирования циклооксигеназы-2 (ЦОГ-2) [5]. Также осуществлялась оценка противовоспалительной активности на модели in vivo, основанной на имитации воспалительного отёка путём инъекции свежего альбумина куриного яйца в лапу мыши, оснований Шиффа с фрагментами коричного альдегида и аминокислотами триптофаном или гистидином. Наибольшую противовоспалительную активность, сопоставимую по силе с аспирином, оказала структура, содержащая остаток триптофана [6]. Основания Шиффа на основе хиназолинона показали высокую противовоспалительную активность путём ингибирования фермента — микросомальной простагландин-синтазы (mPGES-1), снижение активности которой приводит к избирательному снижению биосинтеза простагландина Е2 [7]. По результатам молекулярного докинга были выбраны и затем целенаправленно синтезированы наиболее перспективные соединения с ядром 1,3,4-оксадиазола, которые могут оказать противовоспалительную активность. Дальнейшая in vivo оценка противовоспалительной активности полученных соединений показала, что некоторые из них проявляют активность, но уступают в силе фармакологического эффекта препарату сравнения индометацину [8]. Таким образом, рассматриваемый класс органических соединений является перспективным для разработки на его основе новых лекарственных средств с противовоспалительным действием.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
В качестве объектов исследования выступают азометиновые производные 2-амино-4,5,6,7-тетра-гидро-1-бензотиофен-3-карбоксамида (3a-3s) и соответствующие им 2-замещённые 5,6,7,8-тетра-гидробензо[4,5]тиено[2,3-d]пиримидин-4(3H)-она (4a-4s). Азометиновые производные образовывались в ходе взаимодействия 2-амино-4,5,6,7-тетра-гидро-1-бензотиофен-3-карбоксамида ( 1 ) с ароматическими альдегидами ( 2 ) в среде этанола при слабом кипячении исходных соединений [9, 10]. Затем полученный продукт реакции ( 3 ) подвергли гетероциклизации до 2-замещённых 5,6,7,8-тетра-гидробензо[4,5]тиено[2,3-d]пиримидин-4(3H)-она ( 4 ). Реакцию проводили в среде ледяной уксусной кислоты при добавлении каталитических количеств диметилсульфоксида (ДМСО) [11, 12]. Схема синтеза исследуемых соединений представлена на рисунке 1.
Молекулярный докинг проводился в свободно распространяемой программе Autodock 4.0 [13]. Молекулярное моделирование осуществлялось с учётом конформационной подвижности лигандов, торсионные углы которых были установлены и заданы в данной программе. Заряды всех атомов моделируемой системы рассчитаны алгоритмом

Рисунок 1 / Figure 1. Схема синтеза исследуемых соединений. Реагенты и условия: а — этанол, нагревание; b — ледяная уксусная кислота, ДМСО, нагревание / Synthesis scheme of the studied compounds. Reagents and conditions: a — ethanol, heating; b — glacial acetic acid, DMSO, heating.
Гастейгера (Gasteiger algorithm), и у них присутствуют только полярные атомы водорода. В программе был задан поиск 200 энергетически выгодных конформаций образования молекулярного комплекса изучаемых соединений с белковой мишенью с использованием ламарковской скоринговой функции подсчёта энергии взаимодействия (Lamarckian GA 4.2). Расстояние между точками сетки составляло 0,375 Å. Прогноз противовоспалительной активности проводился с использованием человеческой ЦОГ-2 с идентификационным номером 5IKT [14] из базы данных виртуальных структур RCSB Protein Data Bank (. В этом комплексе находится ингибитор данного фермента — толфе-намовая кислота. Областью вычислительного эксперимента является куб, центр которого находится по следующим координатам: x = 165,42, y = 185,74, z = 192,38. Количество точек в измерениях по осям x, y и z равно 46. Среднеквадратическое отклонение между местоположением толфенамовой кислоты в комплексе 5IKT (рентгеноструктурный анализ) и её расположением в лиганд-рецепторном комплексе по данным молекулярной стыковки составляет 0,86 Å (должно быть не выше 3 Å), что позволяет получить низкое различие между истинной и прогнозируемой конформацией моделируемой молекулы в активном сайте ЦОГ-2 согласно применяемому алгоритму молекулярного докинга [15].
Виртуальные структуры моделируемых соединений были построены в программе HyperChem 8.0.4, а затем геометрически оптимизированы методом молекулярной механики с использованием метода MM+, который позволяет получить приближённую равновесную геометрию молекулы без длительных вычислительных расчётов. Окончательная оптимизация геометрии виртуальных структур рассчитывалась в программе ORCA 4.1 с использованием теории функционала плотности (UB3LYP) и базового набора 6–311G** [16].
Изучение противовоспалительной активности синтезированных соединений проводили на модели острого экссудативного воспаления, вызван- ного субплантарным введением 2% раствора формалина в правую переднюю лапку мышей-самцов линии Balb/C весом 32,0–36,0 г (на момент начала эксперимента) в объёме 0,05 мл [17]. Исследуемые вещества вводили в дозе 50 мг/кг однократно перорально в виде водной суспензии за один час до введения формалина и при курсовом введении один раз в течение пяти суток. В качестве референтного средства использовали диклофенак (таблетки 50 мг), который вводили в дозе 50 мг/кг. Животные содержались в стандартных условиях вивария при естественном освещении: температура окружаю- щего воздуха 22 ± 2 °C, относительная влажность 65 ± 5%. Оценку прироста массы правой передней лапки проводили на пике воспаления через 3 часа после введения формалина путём взвешивания ампутированных передних лап мышей. Сравнение массы проводили между интактной (левой передней лапкой) и контрольной (правой передней лапкой).
Полученные результаты обрабатывали методом вариационной статистики и проверяли на нормальность распределения с помощью критерия Колмогорова-Смирнова. Рассчитывали среднее значение (М) и стандартные ошибки среднего (m).
Таблица 1 / Table 1
Значения минимальной энергии лиганд-ферментного взаимодействия моделируемых соединений с активным сайтом ЦОГ-2 / Values of the minimum energy of ligand-enzyme interaction of the modeled compounds with the active site of COX-2
Соединение / Compound |
Энергия, ккал/моль / Energy, kcal/mol |
Соединение / Compound |
Энергия, ккал/моль / Energy, kcal/mol |
3a |
-8,72 |
4a |
-8,70 |
3b |
-9,36 |
4b |
-9,61 |
3c |
-8,39 |
4c |
-8,07 |
3d |
-8,60 |
4d |
-8,01 |
3e |
-8,70 |
4e |
-7,94 |
3f |
-9,27 |
4f |
-9,22 |
3g |
-8,87 |
4g |
-8,36 |
3h |
-8,80 |
4h |
-8,38 |
3i |
-8,43 |
4i |
-8,05 |
3j |
-9,07 |
4j |
-9,01 |
3k |
-4,17 |
4k |
-4,11 |
3l |
-9,12 |
4l |
-9,30 |
3m |
-9,54 |
4m |
-9,79 |
3n |
-9,37 |
4n |
-9,35 |
3o |
-9,46 |
4o |
-9,56 |
3p |
-8,53 |
4p |
-8,03 |
3q |
-8,61 |
4q |
-8,52 |
3r |
-8,36 |
4r |
-8,22 |
3s |
-7,98 |
4s |
-7,96 |
Толфенамовая кислота / Tolfenamic acid |
-8,52 |
Диклофенак / Diclofenac |
-8,21 |
Целекоксиб / Celecoxib |
-8,35 |
Рофекоксиб / Rofecoxib |
-8,30 |
Для нормального распределения в качестве параметрического критерия использовали критерий Стьюдента, а в случаях отличного от нормального распределения в качестве непараметрического критерия — U-критерий Манна — Уитни.
РЕЗУЛЬТАТЫ И ИХ ОБСУЖДЕНИЕ
Согласно данным молекулярного докинга наиболее перспективными соединениями среди азо-метиновых производных 2-амино-4,5,6,7-тетрагид-ро-1-бензотиофен-3-карбоксамида с точки зрения ингибирования ЦОГ-2 могут являться следующие структуры: 3b, 3l, 3m, 3n, 3o и получаемые из них пиримидиновые производные — 4b, 4l, 4m, 4n, 4o, энергия образования молекулярного комплекса которых превосходит виртуальные референты. При этом особый интерес представляют вещества 3m, 3n, 3o, 4m, 4n и 4o, так как в своей структуре содержат атом галогена, который, например, присутствует в структуре таких нестероидных противовоспалительных средств, как диклофенак, индометацин, эторикоксиб и целекоксиб.
Для дальнейшего изучения in vivo противовоспалительной активности было выбрано 10 наиболее перспективных соединений, исходя из данных предшествующего вычислительного эксперимента: 3b, 3l, 3m, 3n, 3o, 4b, 4l, 4m, 4n, 4o (таблица 1).
Исследование проводили на модели острого экссудативного воспаления, вызванного субплан- тарным введением 2% раствора формалина в правую переднюю лапку в объёме 0,05 мл. Первая серия опытов была скрининговой и выполнялась на ограниченном количестве животных (n=3). Результаты представлены в таблице 2.
Таблица 2 / Table 2 Влияние исследуемых соединений в дозе 50 мг/ кг на экссудативную фазу острого воспаления (n=3) / The effect of the studied compounds at a dose of 50 mg/kg on the exudative phase of acute inflammation (n=3)
Соединение / Compound |
Прирост массы лапы в % / Paw weight gain in % |
3b |
35,93 ± 3,05 |
3l |
47,84 ± 3,59 |
3m |
39,87 ± 6,65 |
3n |
33,67 ± 2,63 |
3o |
42,69 ± 2,08 |
4b |
43,52 ± 1,87 |
4l |
49,32 ± 4,58 |
4m |
53,86 ± 5,51 |
4n |
43,60 ± 6,32 |
4o |
58,39 ± 7,01 |
Контроль / Control |
67,06 ± 3,17 |
Таблица 3 / Table 3
Влияние исследуемых соединений и препарата сравнения на экссудативную фазу острого воспаления в дозе 50 мг/кг (n=8) при однократном профилактическом применении / The effect of the studied compounds and the reference drug on the exudative phase of acute inflammation at a dose of 50 mg/kg
(n=8) with a single prophylactic application
Соединение / Compound |
Показатели / Indicators |
Значение Р, отличия от контрольной группы в % / P-value, % of difference with the control group |
|
Прирост массы лапы в % / Paw weight gain in % М ± m |
Прирост массы лапы, г / Paw weight gain, g М ± m |
||
Контроль / Control |
53,84 ± 8,56 |
0,090 ± 0,020 |
– |
Диклофенак / Diclofenac |
32,14 ± 5,47 |
0,054 ± 0,010 |
0,05 (– 40%) |
3b |
37,49 ± 5,42 |
0,062 ± 0,008 |
0,21 (– 31%) |
3n |
32,57 ± 7,46 |
0,055 ± 0,013 |
0,16 (– 39%) |
Таблица 4 / Table 4
Изучение противовоспалительной активности соединений-лидеров при курсовом терапевтическом применении в дозе 50 мг/кг на модели формалинового отёка (n=8) / Study of the anti-inflammatory activity of leading compounds in the course of therapeutic use at a dose of 50 mg/kg on a model of formalin edema (n=8)
Соединение / Compound |
Прирост массы лапы, г / Paw weight gain, g М ± m |
Значение Р, отличия от контрольной группы в % / P-value, % of difference with the control group |
Контроль / Control |
0,090 ± 0,006 |
— |
Диклофенак / Diclofenac |
0,051 ± 0,006* |
0,0005 (- 43%) |
3b |
0,074 ± 0,006 |
0,08 (-18%) |
3n |
0,054 ± 0,008* |
0,003 (-40%) |
*статистически значимые различия по сравнению с контрольной группой / *statistical significance in comparison with the control group
По результатам скрининговых исследований были выбраны соединения 3b и 3n. Для этих соединений проводились исследования на 4 группах животных, состоящих из 8 особей в каждой. В первой серии исследуемые вещества вводили разово за час до инъекции формалина (профилактическое введение). Результаты представлены в таблице 3. Во второй серии исследуемые вещества вводили ежедневно в течение 5 суток (терапевтическое введение). Результаты представлены в таблице 4. В качестве референтного средства использовали диклофенак.
Изучение соединений на модели формалин-индуцированного острого экссудативного воспаления показало, что соединение 3b при профилактическом введении снижает развитие отёка на 31%, а соединение 3n — на 39% по сравнению с контрольной группой. Полученный эффект сопоставим с действием диклофенака, снижающего прирост повреждённой лапки на 40%.
При курсовом применении исследуемых субстанций на пятые сутки эксперимента прирост массы лапки в группе животных, получавших соединение 3b, снизился на 18%, в группе, получавшей
3n, — на 40%, в группе, получавшей диклофенак, — на 43% относительно контроля.
ЗАКЛЮЧЕНИЕ
Соединения под лабораторным шифром 3b и 3n демонстрируют наличие противовоспалительной активности на модели формалинового отёка. Соединение 3n является наиболее перспективным для дальнейшего исследования, так как его действие сопоставимо с препаратом сравнения диклофенаком.
Финансирование: Авторы заявляют об отсутствии финансирования.