Использование в практической селекции картофеля результатов ДНК-маркирования исходных родительских форм и межсортовых гибридов

Автор: Гаджиев Н.М., Лебедева В.А., Рыбаков Д.А., Иванов А.В., Желтова В.В., Фомина Н.А., Антонова О.Ю., Гавриленко Т.А.

Журнал: Сельскохозяйственная биология @agrobiology

Рубрика: Физиология, биохимия

Статья в выпуске: 5 т.55, 2020 года.

Бесплатный доступ

Успех селекционных исследований во многом определяется удачным подбором родительских форм для гибридизации. В последние годы при подборе пар в комбинациях скрещиваний наряду с традиционными подходами активно используются результаты маркер-опосредованного отбора (marker assisted selection, MAS) для комбинирования ценных аллелей родительских генотипов. Такой методический прием широко распространен в селекционных программах для различных сельскохозяйственных растений во многих странах, в том числе в России. Применение MAS перспективно как на начальном этапе при подборе родительских сортов для скрещиваний, так и при оценке расщепляющихся гибридных популяций. В представленной работе пары для межсортовых скрещиваний подбирали таким образом, чтобы они дополняли друг друга, объединяя у гибридов доминантные аллели разных R -генов устойчивости к различным болезням и вредителям и хозяйственно ценные признаки родительских сортов. Для повышения результативности отбора перспективных гибридных генотипов использовали комплексный подход, сочетающий MAS c маркерами R -генов устойчивости к разным болезням и вредителям с традиционными методами оценки хозяйственно ценных признаков гибридных популяций. Полученные межсортовые гибриды трех комбинаций (Гусар × Чароит), (Гусар × Алый парус), (Гусар × Сиреневый туман) также участвовали в MAS с 8 маркерами шести R -генов: устойчивости к Y-вирусу картофеля PVY ( Rysto) и X-вирусу картофеля PVX (Rx1), к золотистой Globodera rostochiensis (Wollenweber) Behrens (H1) и бледной G. pallida (Stone) Behrens (Gpa2) картофельным нематодам, расоспецифической устойчивости к фитофторозу (R1, R3а) (возбудитель Phytophthora infestans Mont. de Bary). Фактически все полученные гибриды обладали различными комбинациями ДНК маркеров R -генов. Для выявления аллельного состава R -генов у родительских форм был изучен характер наследования ДНК маркеров в каждой комбинации, что позволило определить уровень гетерозиготности маркированных локусов родительских сортов. По результатам оценки 144 гибридов в полевых и лабораторных условиях выделили 31 генотип с теми или иными хозяйственно ценными признаками (продуктивность, товарность, выравненность гнезд и клубней в гнезде, крахмалистость, полевая устойчивость к фитофторозу), 113 гибридов были забракованы. В отобранной группе, включающей 31 генотип, 23 гибридных генотипа имели относительно высокую продуктивность, которая варьировала от 600 до 1525 г/растение, и 12 из них характеризовались комплексом хозяйственно ценных признаков (высокие показатели продуктивности и товарности клубней, выравненность гнезд и клубней в гнезде), а также обладали различными комбинациями маркеров генов Rysto , Rx1 , H1 , Gpa2 , R1 и R3а . Таким образом, использование комплексного подхода, сочетающего традиционные методы селекции и MAS, повышает результативность отбора перспективных межсортовых гибридов с заданным набором признаков. Отобранные гибридные генотипы представляют интерес для создания конкурентоспособных по продуктивности и качеству сортов с комплексной устойчивостью к различным возбудителям заболеваний и вредителям (в том числе с групповой устойчивостью к вирусам PVY и PVX, с групповой устойчивостью к разным видам нематод), что позволит сократить число химических обработок для защиты урожая.

Еще

Картофель, сорта, гибриды, хозяйственно ценные признаки, устойчивость, r-гены, днк маркеры, mas, pvy, pvx, вирусы картофеля, globodera rostochiensis, золотистая картофельная нематода, globodera pallida, бледная картофельная нематода, фитофтороз, phytophthora infestans

Еще

Короткий адрес: https://sciup.org/142229440

IDR: 142229440   |   DOI: 10.15389/agrobiology.2020.5.981rus

Список литературы Использование в практической селекции картофеля результатов ДНК-маркирования исходных родительских форм и межсортовых гибридов

  • Зыкин В.А. Системный анализ проблемы подбора пар для гибридизации. В сб.: Селекция и семеноводство сельскохозяйственных культур в Западной Сибири. Новосибирск, 1984: 3-12.
  • Сюков В.В. Методы подбора родительских пар для гибридизации у самоопыляющихся растений. Самара, 2014.
  • Лепехов С.Б. Методы подбора пар для скрещивания в селекции на урожайность у самоопыляющихся культур. Труды по прикладной ботанике, генетике и селекции, 2017, 178(4): 76-89 (doi: 10.30901/2227-8834-2017-4-76-89).
  • Simko I., Jansky S., Stephenson S., Spooner D. Genetics of resistance to pests and disease. In: Potato biology and biotechnology: advances and perspectives /D. Vreugdenhil, J. Bradshaw, C. Gebhardt, F. Govers, M. Taylor, D. MacKerron, H. Ross (eds.). Elsevier, St. Louis, MO, 2007: 117-155.
  • Gebhardt C. Bridging the gap between genome analysis and precision breeding in potato. Trends Genet., 2013, 29(4): 248-256 (doi: 10.1016/j.tig.2012.11.006).
  • Milczarek D., Przetakiewicz A., Kaminski P., Flis B. Early selection of potato clones with the H1 resistance gene — the relation of nematode resistance to quality characteristics. Czech J. Genet. Plant Breed., 2014, 50(4): 278-284 (doi: 10.17221/114/2014-CJGPB).
  • Ottoman R.J., Hane D.C., Brown C.R., Yilma S., James S.R., Mosley A.R., James M.C., Vales M.I. Validation and implementation of marker-assisted selection (MAS) for PVY resistance (Ryadg gene) in a tetraploid potato breeding program. American Journal of Potato Research, 2009, 86: 304-314 (doi: 10.1007/s12230-009-9084-0).
  • Nie X., Chen H., Zhang J., Zhang Y., Yang J., Pan H., Song W.X., Murad F., He Y.Q. Bian K. Rutaecarpine ameliorates hyperlipidemia and hyperglycemia in fat-fed, streptozotocin-treated rats via regulating the IRS-1/PI3K/Akt and AMPK/ACC2 signaling pathways. Acta Pharmacologica Sinica, 2016, 37(4): 483-496 (doi: 10.1038/aps.2015.167).
  • Gebhardt C., Bellin D., Henselewski H., Lehmann W., Schwarzfischer J., Valkonen J.P.T. Marker-assisted combination of major genes for pathogen resistance in potato. Theoretical and Applied Genetics, 2006, 112: 1458-1464 (doi: 10.1007/s00122-006-0248-8).
  • Mori K., Sakamoto Y., Mukojima N., Tamiya S., Nakao T., Ishii T., Hosaka K. Development of a multiplex PCR method for simultaneous detection of diagnostic DNA markers of five disease and pest resistance genes in potato. Euphytica, 2011, 180: 347-355 (doi: 10.1007/s10681-011-0381-6).
  • Mori K., Asano K., Tamiya S., Nakao T., Mori M. Challenges of breeding potato cultivars to grow in various environments and to meet different demands. Breeding Science, 2015, 65: 3-16 (doi: 10.1270/jsbbs.65.3).
  • Asano K., Tamiya S. Breeding of pest and disease resistant potato cultivars in Japan by using classical and molecular approaches. The Japan Agricultural Research Quarterly, 2016, 50(1): 1-6 (doi: 10.6090/jarq.50.1).
  • Milczarek D., Plich J., Tatarowska B., Flis B. Early selection of potato clones with resistance genes: the relationship between combined resistance and agronomical characteristics. Breeding Science, 2017, 67: 416-420 (doi: 10.1270/jsbbs.17035).
  • Зотеева Н.М., Антонова О.Ю., Клименко Н.С., Апаликова О.В., Carlson-Nilsson U., Кара-бицина Ю.И., Ухатова Ю.В., Гавриленко Т.А. Использование молекулярных маркеров R генов и типов цитоплазмы при интрогрессивной гибридизации диких полиплоидных мексиканских видов картофеля. Сельскохозяйственная биология, 2017, 52(5): 964-975 (doi: 10.15389/agrobiology.2017.5.964rus).
  • Сайнакова А.Б., Романова М.С., Красников С.Н., Литвинчук О.В., Алексеев Я.И., Никулин А.В., Терентьева Е.В. Исследование коллекционных образцов картофеля на наличие генетических маркеров устойчивости к фитопатогенам. Вавиловский журнал генетики и селекции, 2018, 22(1): 18-24 (doi: 10.18699/VJ18.326).
  • Рогозина Е.В., Терентьева Е.В., Потокина Е.К., Юркина Е.Н., Никулин А.В., Алексеев Я.И. Идентификация родительских форм для селекции картофеля, устойчивого к болезням и вредителям, методом мультиплексного ПЦР-анализа. Сельскохозяйственная биология, 2019, 54(1): 19-30 (doi: 10.15389/agrobiology.2019.1.19rus).
  • Bradshaw J.E., Mackay G.R. Breeding strategies for clonally propagated potatoes. In: Potato genetics /J.E. Bradshaw, G.R. Mackay (eds.). CABI, Wallingford (UK), 1994: 467-497.
  • Wu R., Gallo-Meagher M., Littell R.C., Zeng Z.-B. A general polyploid model for analyzing gene segregation in outcrossing tetraploid species. Genetics, 2001, 159(2): 869-882.
  • Skupinova S., Vejl P., Sedlak P., Domkarova J. Segregation of DNA markers of potato (Solanum tuberosum ssp. tuberosum L.) resistance against Ro1 pathotype Globodera rostochiensis in selected F1 progeny. Rostlinna vyroba, 2002, 48(11): 480-485.
  • Ермишин А.П., Свиточ О.В., Воронкова Е.В., Гукасян О.Н., Лукша В.И. Определение состава и аллельного состояния генов устойчивости к болезням и вредителям у родительских линий картофеля с помощью ДНК маркеров. Генетика, 2016, 52(5): 569-578 (doi: 10.7868/S0016675816050052).
  • Kneib R., Kneib R., da Silva Pereira A., Castro C.M. Allele dosage of PVY resistance genes in potato clones using molecular markers. Crop Breeding and Applied Biotechnology, 2017, 17: 306312 (doi: 10.1590/1984-70332017v17n4a47).
  • Лебедева Н.А. Полиплоидия некоторых видов картофеля. Труды МОИП, отд. биол., 1962, 5: 215-221.
  • Лебедева Н.А. Получение и использование полиплоидов в селекции картофеля. Тезисы докл. 2-го совещания по полиплоидии. Л., 1963: 28-29.
  • Лебедева Н.А. Экспериментальная полиплоидия в селекции. Картофель и овощи, 1965, 4: 20-24.
  • Антонова О.Ю., Швачко Н.А., Новикова Л.Ю., Шувалов О.Ю., Костина Л.И., Клименко Н.С., Шувалова А.Р., Гавриленко Т.А. Генетическое разнообразие сортов картофеля российской селекции и стран ближнего зарубежья по данным полиморфизма SSR-локусов и маркеров R-генов устойчивости. Вавиловский журнал генетики и селекции, 2016, 20(5): 596-606 (doi: 10.18699/VJ16.181).
  • Гавриленко Т.А., Клименко Н.С., Антонова О.Ю., Лебедева В.А., Евдокимова З.З., Га-джиев Н.М., Апаликова О.В., Алпатьева Н.В., Костина Л.И., Зотеева Н.М., Мамадбоки-рова Ф.Т., Егорова К.В. Молекулярный скрининг сортов и гибридов картофеля северозападной зоны Российской Федерации. Вавиловский журнал генетики и селекции, 2018, 22(1): 35-45 (doi: 10.18699/VJ18.329).
  • Хютти А.В., Антонова О.Ю., Мироненко Н.В., Гавриленко Т.А., Афанасенко О.С. Устойчивость картофеля к карантинным болезням. Вавиловский журнал генетики и селекции, 2017, 21(1): 51-61 (doi: 10.18699/VJ17.223).
  • Гавриленко Т.А., Клименко Н.С., Алпатьева Н.В., Костина Л.И., Лебедева В.А., Евдокимова З.З., Апаликова О.В., Новикова Л.Ю., Антонова О.Ю. Генетическое разнообразие сортов картофеля российской селекции и стран ближнего зарубежья по типам цитоплазм. Вавиловский журнал генетики и селекции, 2019, 23(6): 753-764 (doi: 10.18699/VJ19.534).
  • Лебедева В.А. Селекция картофеля на основе межвидовой гибридизации. СПб, 2010.
  • Лебедева В.А., Гаджиев Н.М. Два урожая сорта картофеля Чароит за один сезон. Мат. Международного конгресса «Агрорус». СПб, 2014: 19-20.
  • Гаджиев Н.М., Лебедева В.А. Новый сорт картофеля Гусар. Защита картофеля, 2015, 2: 16.
  • Gavrilenko T., Antonova O., Shuvalova A., Krylova E., Alpatyeva N., Spooner D.M., Novikova L. Genetic diversity and origin of cultivated potatoes based on plastid microsatellite polymorphism. Genetic Resources and Crop Evolution, 2013, 60(7): 1997-2015 (doi: 10.1007/s10722-013-9968-1).
  • Ahmadvand R., Wolf I., Goq'i A.M., Polgar Z., Taller J. Development of molecular tools for distinguishing between the highly similar Rx1 and Rx2 PVX extreme resistance genes in tetraploid potato. Potato Research, 2013, 56(4): 277-291 (doi: 10.1007/s11540-013-9244-y).
  • Song Y.-S., Schwarzfischer A. Development of STS markers for selection of extreme resistance (Rysto) to PVY and maternal pedigree analysis of extremely resistant cultivars. American Journal of Potato Research, 2008, 85(2): 159-170 (doi: 10.1007/s12230-008-9012-8).
  • Schultz L., Cogan N.O.I., Mclean K., Dale M.F.B., Bryan G.J., Forster J.N.W., Slater A.T. Evaluation and implementation of a potential diagnostic molecular marker for Hl-conferred potato cyst nematode resistance in potato. Plant Breeding, 2012, 131: 315-321 (doi: 10.1111/j.1439-0523.2012.01949.x).
  • Asano K., Kobayashi A., Tsuda S., Nishinaka M., Tamiya S. DNA marker-assisted evaluation of potato genotypes for potential resistance to potato cyst nematode pathotypes not yet invading into Japan. Breeding Science, 2012, 62(2): 142-150 (doi: 10.1270/jsbbs.62.142).
  • Ballvora A., Ercolano M.R., Weiss J., Meksem K., Bormann C.A., Oberhagemann P., Sala-mini F., Gebhardt C. The R1 gene for potato resistance to late blight (Phytophthora infestans)
  • belongs to the leucine zipper/NBS/LRR class of plant resistance genes. The Plant Journal, 2002, 30(3): 361-371 (doi: 10.1046/j.1365-313X.2001.01292.x).
  • Huang S., van der Vossen E.A.G., Kuang H., Vleeshouwers V.G., Zhang N., Borm T.J.A., van Eck H.J., Baker B., Jacobsen E., Visser R.G.F. Comparative genomics enabled the isolation of the R3a late blight resistance gene in potato. The Plant Journal, 2005, 42(2): 251-261 (doi: 10.1111/j.1365-313X.2005.02365.x).
  • Банадысев С.А., Старовойтов А.М., Колядко И.И., Маханько В.Л., Фандо В.В., Козлова Л.И., Колядко О.М., Незаконова Л.В., Гончарова Н.Н., Вологдина Л.Н., Стадни-ков И.А., Грибко А.П. Методические рекомендации по специализированной оценке сортов картофеля. Минск, 2003.
  • Симаков Е.А., Склярова Н.П., Яшина И.М. Методические указания по технологии селекционного процесса картофеля. М., 2006.
  • Симаков Е.А. Анисимов Б.В., Шабанов А.Э., Зебрин С.Н., Юрлова С.М., Овэс Е.В., Зей-рук В.Н., Усков А.И., Федотова Л.С., Филиппова Г.И. Методические положения по проведению оценки сортов картофеля на испытательных (тестовых) участках. М., 2013.
  • Рокицкий П.Ф. Биологическая статистика. М., 1973.
  • Dalamu V.B., Umamaheshwari R., Sharma R., Kaushik S., Joseph T., Singh B., Gebhardt C. Potato cyst nematode (PCN) resistance: genes, genotypes and markers. SABRAO Journal of Breeding and Genetics, 2012, 44(2): 202-228.
  • Van der Vossen E.A.G., van der Voort J.R., Kanyuka K., Bendahmane A., Sandbrink H., Baul-combe D.C., Bakker J., Stiekema W.J., Klein-Lankhorst R.M. Homologues of a single resistancegene cluster in potato confer resistance to distinct pathogens: a virus and a nematode. The Plant Juornal, 2000, 23(5): 567-576 (doi: 10.1046/j.1365-313x.2000.00814.x).
Еще
Статья научная