Классификация отечественных сортов капусты Brassica oleracea L. c использованием SSR маркеров
Автор: Домблидес А.С., Домблидес Е.А., Бондарева Л.Л., Пивоваров В.Ф.
Журнал: Овощи России @vegetables
Рубрика: Селекция и семеноводство сельскохозяйственных растений
Статья в выпуске: 5 (43), 2018 года.
Бесплатный доступ
Для получения новых селекционных форм среди разнообразных представителей вида Brassica oleraceae L. (CC, 2n = 18) необходимо знать генетическую основу используемого селекционного материала. Традиционные сорта и новые сорта, гибриды, появляющиеся в последнее время, составляют основные генетические ресурсы. Классификация коллекций с использованием ДНК маркеров позволяет выделить ценные генотипы и установить родословные селекционного материала, с тем, чтобы в дальнейшем получать новые формы с набором ценных признаков. Использование микросателлитных маркеров (SSR) в виде B. oleraceae L. показали высокую эффективность по выявлению полиморфизма между разновидностями, между сортами и внутри сортов. В данной работе было взято 16 пар праймеров для амплификации микросателлитных локусов геномной ДНК 24 отечественных селекционных образцов капусты. Все оцененные локусы характеризовались высокой информативностью: 14 из 16 имели уровень PIC > 0,5. На основе полученных данных была построенная дендрограмма на основе коэффициента Джаккарта...
Капуста, ssr маркеры, генетические расстояния, микросателлитные локусы, полиморфизм
Короткий адрес: https://sciup.org/140238383
IDR: 140238383 | DOI: 10.18619/2072-9146-2018-5-9-12
Список литературы Классификация отечественных сортов капусты Brassica oleracea L. c использованием SSR маркеров
- Артемьева А.М., Клоке Э., Чесноков Ю.В. Анализ филогенетических связей вида Brassica oleracea L. (Капуста огородная)//Вестник ВОГиС. -2009. -Т. 13. -№ 4. -С. 759-771.
- Шаптуренко М.Н., Печковская Т.В., Вакула С.И., Якимович А.В., Забара Ю.М., Хотылева Л.В. Информативные EST-SSR-маркеры для типирования и внутривидовой дифференциации Brassica oleracea var. capitata L.//Вавиловский журнал генетики и селекции. -2016. -Т. 20. -№ 1. -С. 51-56. 10.18699/VJ16.133.
- Formisano G., Roig C., Esteras C., Ercolano M.R., Nuez F., Monforte A.J., Picof M.B. Genetic diversity of Spanish Cucurbita pepo landraces: an unexploited resource for summer squash breeding//Genet. Resour. Crop Evol. 2012. V. 59, N6. P. 1169-1184.
- Izzah N.K., Lee J., Perumal, S., Park J.Y., Ahn K., Fu D., Kim G-B., Nam Y-W., Yang T-J. Microsatellite-based analysis of genetic diversity in 91 commercial Brassica oleracea L. cultivars belonging to six varietal groups//Genetic Resources and Crop Evolution. 2013. V.60. 10.1007/s10722-013-9966-3.
- Jaccard P. Nouvelle recherches sur la distribution florale//Bull. Soc. Vandoise Sci. Nat. 1908. V.44, P. 223-270.
- Kumar A., Mishra P., Singh S.C., Sundaresan V. Efficiency of ISSR and RAPD markers in genetic divergence analysis and conservation management of Justicia adhatoda L., a medicinal plant//Plant Syst. Evol. -2014. -V. 300: 1409-1420. 10.1007/s00606-013-0970-z.
- Louarn S., Torp A.M., Holme I.B., Andersen S.B., Jensen B.D. Database derived microsatellite markers (SSRs) for cultivar differentiation in Brassica oleracea.//Genet. Resour. Crop. Evol. 2007. V. 54, P. 1717-1725.
- Lowe, A.J., C. Moule, M. Trick, and K.J. Edwards. Efficient large-scale development of microsatellites for marker and mapping applications in Brassica crop species//Theor. Appl. Genet. 2004. V. 108, P. 1103-1112.
- Paterson A.H., Lan T-h, Amasino R., Osborn T.C. Quiros C Brassica genomics: a complement to, and early beneficiary of the Arabidopsis sequence. Genome Biology 2001. V. 2, P. 1011. 1011-1011.1014.
- Powel W., Machray G.C., Povan J. Polymorphism revealed by simple sequence repeats//Trends Plant Sci. 1996. V. 1, P. 215-222.
- Tonguc M., Griffiths P.D. Genetic relationships of Brassica vegetables determined using database derived sequence repeats//Euphytica 2004. V. 137: 193-201.
