Молекулярная диагностика полиморфизма генов ESR и PRLR, влияющих на репродуктивные качества свиней
Автор: Гиниятуллин И.И., Рахматов Л.А., Ахметов Т.М., Муллахметов Р.Р., Тюлькин С.В.
Рубрика: Зоотехния
Статья в выпуске: 1 т.225, 2016 года.
Бесплатный доступ
В данной работе изучен полиморфизм генов эстрогенового рецептора ( ESR ) и пролактинового рецептора ( PRLR ) у йоркшир × ландраских свиноматок в условиях Республики Татарстан. Исследования показали, что у гибридных свиноматок преобладал аллель W (0,83) и генотип WW (68,7%) гена ESR, аллель A (0,70) и генотип АА (0,53) гена PRLR.
Полиморфизм, ген, свинья, пцр, днк
Короткий адрес: https://sciup.org/14288745
IDR: 14288745
Текст научной статьи Молекулярная диагностика полиморфизма генов ESR и PRLR, влияющих на репродуктивные качества свиней
По обобщённым данным ставропольских учёных необходимо углублённо изучать генетические факторы, влияющих на многоплодие животных, обусловлена тем, что этот показатель в значительной степени определяет продуктивность животных. Многоплодие, как и другие признаки воспроизводительной способности, имеет низкий коэффициент наследуемости, в этой связи поиск и использование генетически предрасположенных животных к многоплодию имеет большое практическое значение в селекции [7].
Внедрение результатов фундаментальных исследований молекулярной генетики и ДНК-технологии в свиноводство позволяет изучать и анализировать животных на молекулярном уровне, тем самым определять аллельный полиморфизм генов, контролирующие продуктивные качества, в том числе и воспроизводительные.
Из множества генов, ассоциирующихся у свиней с репродуктивными качествами ( ESR , PRLR , FSHB , NCOA1 , FSHR и другие), представленных в большинстве научных изданий, наиболее выделяются два гена – ESR и PRLR .
Так, по мнению учёных Московской области многие научные исследования сфокусированы на изучении генов эстрогенового ( ESR ) и пролактинового ( PRLR ) рецепторов признанные генами-кандидатами, влияющими на размер гнезда. Размер гнезда является одним из важнейших показателей в свиноводстве. Увеличение количества поросят, получаемых от свиноматки, повышает эффективность данной отрасли [2]
Целью настоящих исследований являлось определение у свиней мясных пород аллельного полиморфизма, значимых для свиноводства генов ESR и PRLR посредством использования молекулярногенетических методов, в частности метода ПЦР-ПДРФ.
Материал и методика исследований. Для проведения ДНК-анализа у 115 помесных (йоркшир × ландрас) свиноматок в КФХ «Пашков С.И.» Верхнеуслонского района Республики Татарстан из яремной вены взята кровь, которую отбирали в пробирки с 100 мМ ЭДТА, так чтобы конечная концентрация достигла 10 мМ.
Пробы ДНК из крови экстрагировали комбинированным щелочным способом [1].
Определение аллельного полиморфизма и генотипов по генам ESR и PRLR свиней проводили методом ПЦР-ПДРФ с использованием двух пар праймеров: ESR-F: 5/-
CCCTCTATGACCTGCTGCTG-3/ и ESR-R: 5/-TCAGATTGTGGTGGGGAAGTTC-3/ [8], PRLR1: 5/-СGGCCGCAGAATCC
TGCTTGC-3/ и PRLR2: 5/-
ACCCCACCTTGTAACCCATCATCC-3/ [9]
по оптимизированной нами технике [5].
Частоту встречаемости генотипов определяли по общепринятым формулам:
-
1. р = n / N ,
-
2. Р А = (2nAA+nAB) : 2N,
-
3. q B = (2nBB+nAB) : 2N ,
где р – частота определения генотипа, n – количество особей, имеющих определенный генотип, N – число особей.
где P А – частота аллеля А, q B – частота аллеля В, N – общее число аллелей.
По закону Харди-Вайнберга определяли ожидаемые результаты частот генотипов [6].
Результаты собственных исследований. Исследования выборки из 115 йоркшир × ландраских свиноматок показали, что распределение по встречаемости генотипов и аллелей генов ESR и PRLR было следующим: ESR WW -генотипа – 79 (68,7%), ESR WM -генотипа – 32 (27,8%), ESR MM -генотипа – 4 (3,5%), ESR W -аллеля – 0,83, ESR M -аллеля – 0,17 и PRLR AA -генотипа – 61 (53,0%), PRLR AB -генотипа – 39 (33,9%), PRLR BB -генотипа – 15 (13,1%), PRLR A -аллеля – 0,70, PRLR B -аллеля – 0,30 соответственно (таблица 1).
Исследования, проведённые в различных породах и популяциях чистопородных и помесных свиней, разводимых (белорусская крупная белая, белорусская, мясная, ландрас, йоркшир, белорусская чёрно-пёстрая, дюрок, белорусская мясная × ландрас) в хозяйствах Республики Беларусь по гену ESR показали, что встречаемость ESR A-аллеля и ESR B-аллеля было 0,46-1 и 0-0,54 соответственно [3]. Полученные нами результаты исследований укладываются в пределы показателей частоты встречаемости аллелей гена ESR, приведенных другими исследователями и соответственно находятся на верхней границе по ESR A-аллелю (другое название ESR W-аллель) и на нижней границе по ESR B-аллелю (ESR M-аллель).
Аналогичные исследования, проведённые в различных породах и популяциях свиней, разводимых (ландрас, йоркшир, белорусская крупная белая, белорусская чёрно-пёстрая, белорусский заводской тип породы йоркшир) в хозяйствах Республики Беларусь по гену PRLR показали, что встречаемость PRLR A -аллеля и PRLR B -аллеля было 0,447-0,654 и 0,346-0,553 соответственно [4].
Таблица 1 - Частота встречаемости аллелей и генотипов по генам ESR и PRLR у свиней
Показатели |
n |
Частота встречаемости |
|||||||
генотипов |
аллелей |
||||||||
по гену ESR |
115 |
WW |
WM |
MM |
W |
M |
|||
n |
% |
n |
% |
n |
% |
||||
Н |
79 |
68,7 |
32 |
27,8 |
4 |
3,5 |
0,83 |
0,17 |
|
О |
79 |
68,7 |
33 |
28,7 |
3 |
2,6 |
|||
по гену PRLR |
115 |
АА |
АВ |
ВВ |
A |
B |
|||
n |
% |
n |
% |
n |
% |
||||
Н |
61 |
53,0 |
39 |
33,9 |
15 |
13,1 |
0,70 |
0,30 |
|
О |
56 |
48,7 |
48 |
41,7 |
11 |
9,6 |
Н – наблюдаемая частота генотипов, О – ожидаемая частота генотипов.
Полученные нами результаты исследований незначительно выходят за пределы показателей частоты встречаемости аллелей гена PRLR , приведенных другими исследователями и соответственно находятся выше границы по PRLR A -аллелю и ниже границы по PRLR B -аллелю.
Заключение. Проведённые исследования показали, что среди йоркшир × ландраских свиноматок в КФХ «Пашков С.И.» Верхнеуслонского района Республики Татарстан преобладал генотип WW и аллель W гена ESR, а также генотип АА и аллель А гена PRLR. Полученные данные по аллельному полиморфизму генов ESR и PRLR приближены по значениям, представленных другими исследователя.
Резюме
В данной работе изучен полиморфизм генов эстрогенового рецептора ( ESR ) и пролактинового рецептора ( PRLR ) у йоркшир × ландраских свиноматок в условиях Республики Татарстан. Исследования показали, что у гибридных свиноматок преобладал аллель W (0,83) и генотип WW (68,7%) гена ESR , аллель A (0,70) и генотип АА (0,53) гена PRLR .
Список литературы Молекулярная диагностика полиморфизма генов ESR и PRLR, влияющих на репродуктивные качества свиней
- Ахметов, Т.М. Оптимизация техники выделения ДНК из крови и спермы/Т.М. Ахметов, С.В. Тюлькин, Ф.М. Нургалиев//Учёные записки КГАВМ. -Том. 205. -Казань, 2011.-С. 18-23.
- Калашникова, Л.А. Полиморфизм по генам эстрагенового и пролактинового рецепторов/Л.А. Калашникова, Е.В. Лаломова//Зоотехния. -2010. -№ 12. -С. 5.
- Ковальчук, М.А. Изучение генетической структуры различных пород и популяций свиней по гену эстрогеннового рецептора (ESR)/М.А. Ковальчук, А.И. Ганджа, Н.В. Журина, О.П. Курак, В.П. Симоненко, Л.Л. Леткевич, И.В. Кириллова//Вестник Брянской государственной сельскохозяйственной академии. -2015. -№ 3-1. -С. 56-59.
- Михайлова, М.Е. Выявление полиморфизма гена пролактинового рецептора (PRLR-AluI), маркера плодовитости свиней с использованием HRM-анализа/М.Е. Михайлова, Е.Л. Романишко//Науковий вicник НУБiП Украiни. -2014. -№ 202. -С. 50-55.
- Нургалиев, Ф.М. Оптимизация техники ПЦР-ПДРФ для генотипирования свиней по генам PRLR, ESR, H-FABP, MC4R/Ф.М. Нургалиев, Т.М. Ахметов, И.И. Гиниятуллин, С.В. Тюлькин, Р.Р. Вафин//Фундаментальные исследования. -Пенза, 2013. -№ 6 (4). -С. 918-921.
- Петухов, В.Л. Ветеринарная генетика с основами вариационной статистики/В.Л. Петухов, А.И. Жигачев, Г.А. Назарова. -М.: Агропромиздат, 1985. -368 с.
- Семенов, В.В. Взаимосвязь гена ESR с воспроизводительными качествами свиней/В.В. Семенов, Л.В. Кононова, В.И. Лозовой. -сб. науч. тр. ВНИИ овцеводства и козоводства. -2014. -Т. 3. -№ 7. -С. 342-347.
- Kamiñski, S. Simultaneous identification of ryanodine receptor 1 (RYR1) and estrogene receptor (ESR) genotypes with the multiplex PCR-RFLP method in Polish Large White and Polish Landrace pigs // S. Kamiñski, A. Rusc, K. Wojtasik // J. Appl. Genet. - 2002. - V. 43 (3). - P. 331-335.
- Linville, R.C. Candidate gene analysis for loci affecting litter size and ovulation rate in swine/R.C. Linville, D. Pomp, R.K. Johnson, M.F. Rothschild//J. Anim. Sci. -2001. -V. 79. -P. 60-67.