Молекулярные и прогностические особенности глиобластом с отсутствием мутаций генов IDH/BRAF/H3F3A у молодых пациентов
Автор: Рыжова М.В., Абсалямова О.В., Голанов А.В., Пицхелаури Д.И., Снигирева Г.П., Воронина Е.И., Шишкина Л.В., Панина Т.Н., Шибаева И.В., Шугай С.В., Старовойтов Д.В., Баринов А.А., Сычева Р.В., Зубова И.В.
Журнал: Вестник Российского научного центра рентгенорадиологии Минздрава России @vestnik-rncrr
Рубрика: Молекулярная медицина
Статья в выпуске: 4 т.18, 2018 года.
Бесплатный доступ
Резюме Исследование посвящено изучению глиобластом у лиц молодого возраста в возрасте от 19 до 44лет. Цель исследования. Стратификация глиобластом у лиц молодого возраста с отсутствием мутаций (диким типом) генов IDH/BRAF/H3F3A. Материалы и методы. Исследование проведено с помощью изучения структуры метилирования ДНК на уровне генома и иерархического кластерирования на серии из 91 опухоли, в геноме которых отсутствуют мутации генов IDH/BRAF/H3F3A. Результаты. Выявлено два молекулярных кластера, что будет иметь важное значение для дальнейшей стратификации пациентов в последующих клинических испытаниях и для изучения оптимальных альтернативных терапевтических режимов. Заключение. Благодаря использованию сложных молекулярных методов и математического анализа, в работе показана гетерогенность глиобластом с отсутствием мутаций генов IDH/BRAF/H3F3A у молодых пациентов. Выявленные два молекулярных подтипа опухоли показали четкую взаимосвязь с биологическими параметрами и клиническим исходом и могут послужить предиктивным фактором ответа на стандартные протоколы лечения и возможной таргетной терапии. Однако, на сегодняшний день в условиях рутинной диагностики глиобластом по-прежнему целесообразным представляется исследование мутационного статуса генов IDH1/2, BRAF, H3F3A, TERT, TP53, ATRX и статуса метилирования гена MGMT.
Глиобластома, мутации генов, метилирование генов, иерархическое кластерирование
Короткий адрес: https://sciup.org/149132084
IDR: 149132084
Список литературы Молекулярные и прогностические особенности глиобластом с отсутствием мутаций генов IDH/BRAF/H3F3A у молодых пациентов
- Абсалямова О.В., Кобяков Г.Л., Рыжова М.В. и др. Результаты применения современных режимов химиотерапии первой линии в комплексном лечении пациентов с глиобластомой. Вопросы нейрохирургии имени Н.Н. Бурденко. 2016. Т. 80. № 6. С. 5- 14.
- Рыжова М.В., Шишкина Л.В., Желудкова О.Г. и др. Сравнительная характеристика генетических аберраций в глиобластомах у детей и взрослых. Вопросы нейрохирургии имени Н.Н. Бурденко. 2014. Т. 78. № 2. P. 3-11.
- Abounader R. Interactions between PTEN and receptor tyrosine kinase pathways and their implications for glioma therapy. Expert Rev Anticancer Ther. 2009. V. 9. No. 2. P. 235-245.
- Brennan C.W., Verhaak R.G., McKenna A., et al. The somatic genomic landscape of glioblastoma. Cell. 2013. V. 155. No. 2. P. 462-477.
- Cantero D., Rodríguez de Lope Á., Moreno de la Presa R., et al. Molecular Study of Long- Term Survivors of Glioblastoma by Gene-Targeted Next-Generation Sequencing. J Neuropathol Exp Neurol. 2018. V. 77. No. 8. P. 710-716.
- Fan Q.W., Weiss W.A. Targeting the RTK-PI3K-mTOR axis in malignant glioma: overcoming resistance. Curr Top Microbiol Immunol. 2010. V. 347. P. 279-296.
- Hong E.K., Choi S.H., Shin D.J., et al. Radiogenomics correlation between MR imaging features and major genetic profiles in glioblastoma. Eur Radiol. 2018. V. 28. No. 10. P. 4350- 4361.
- Korshunov A., Ryzhova M., Hovestadt V., et al. Integrated analysis of pediatric glioblastoma reveals a subset of biologically favorable tumors with associated molecular prognostic markers. Acta Neuropathol. 2015. V. 129. No. 5. P. 669-678.
- Korshunov A., Capper D., Reuss D., et al. Histologically distinct neuroepithelial tumors with histone 3 G34 mutation are molecularly similar and comprise a single nosologic entity. Acta Neuropathol. 2016. V. 131. No. 1. P. 137-146.
- Korshunov A., Chavez L., Sharma T., et al. Epithelioid glioblastomas stratify into established diagnostic subsets upon integrated molecular analysis. Brain Pathol. 2018. V. 28. No. 5. P. 656-662.
- Korshunov A., Schrimpf D., Ryzhova M., et al. H3-/IDH-wild type pediatric glioblastoma is comprised of molecularly and prognostically distinct subtypes with associated oncogenic drivers. Acta Neuropathol. 2017. V. 134. No. 3. P. 507-516.
- Louis D.N., Ohgaki H., Wiestler O.D., Cavenee W.K. WHO Classification of Tumours of the Central Nervous System. Revised 4th edition. IARC: Lyon. 2016.
- Mathew L.K., Skuli N., Mucaj V., et al. miR-218 opposes a critical RTK-HIF pathway in mesenchymal glioblastoma. Proc Natl Acad Sci U S A. 2014. V. 111. No. 1. P. 291-296.
- McKay M.M., Morrison D.K. Integrating signals from RTKs to ERK/MAPK. Oncogene. 2007. V. 26. No. 22. P. 3113-3121.
- Mellinghoff I.K., Schultz N., Mischel P.S., Cloughesy T.F. Will kinase inhibitors make it as glioblastoma drugs? Curr Top Microbiol Immunol. 2012. V. 355. P. 135-169.
- Phillips H.S., Kharbanda S., Chen R., et al. Molecular subclasses of high-grade glioma predict prognosis, delineate a pattern of disease progression, and resemble stages in neurogenesis. Cancer Cell. 2006. V. 9. No. 3. P. 157-173.
- Qazi M.A., Vora P., Venugopal C., et al. Co-targeting ephrin receptor tyrosine kinases A2 and A3 in cancer stem cells reduces growth of recurrent glioblastoma. Cancer Res. 2018. V. 78. No. 17. P. 5023-5037.
- Sturm D., Witt H., Hovestadt V., et al. Hotspot mutations in H3F3A and IDH1 define distinct epigenetic and biological subgroups of glioblastoma. Cancer Cell. 2012. V. 22. No. 4. P. 425-
- Schwartzentruber J., Korshunov A., Liu X.Y., et al. Driver mutations in histone H3.3 and chromatin remodelling genes in paediatric glioblastoma. Nature. 2012. V. 482. No. 7384. P. 226-231.
- Shu C., Wang Q., Yan X., Wang J. The TERT promoter mutation status and MGMT promoter methylation status, combined with dichotomized MRI-derived and clinical features, predict adult primary glioblastoma survival. Cancer Med. 2018. V. 7. No. 8. P. 3704-3712.
- Shen.R., Mo Q., Schultz N., et al. Integrative subtype discovery in glioblastoma using iCluster. PLoS One. 2012. V. 7. No. 4. e35236.
- Verhaak R.G., Hoadley K.A., Purdom E., et al. Integrated genomic analysis identifies clinically relevant subtypes of glioblastoma characterized by abnormalities in PDGFRA, IDH1, EGFR, and NF1. Cancer Cell. 2010. V. 17. No. 1. P. 98-110.
- Wang Z., Sun Y. Targeting p53 for Novel Anticancer Therapy. Transl Oncol. 2010.V. 3. No.1.P. 1-12.
- Xu X., Bao Z., Liu Y., et al. PBX3/MEK/ERK1/2/LIN28/let-7b positive feedback loop enhances mesenchymal phenotype to promote glioblastoma migration and invasion. J Exp Clin Cancer Res. 2018. V. 37. No. 1. P. 158.
- Zhao Y.H., Wang Z.F., Cao C.J., et al. The Clinical Significance of O6-Methylguanine-DNA Methyltransferase Promoter Methylation Status in Adult Patients With Glioblastoma: A Meta- analysis. Front Neurol. 2018. V. 9. P. 127.
