Мультиплексная мультилокусная ПЦР в реальном времени для анализа и контроля вируса лейкоза птиц подгрупп A, B, J и K в России

Мультиплексная мультилокусная ПЦР в реальном времени для анализа и контроля вируса лейкоза птиц подгрупп A, B, J и K в России

Автор: Бородин А.М., Алексеев Я.И., Коновалова Н.В., Терентьева Е.В., Серова Н.Ю., Ефимов Д.Н., Емануйлова Ж.В., Смолов С.В., Огнева О.А., Фисинин В.И.

Журнал: Сельскохозяйственная биология @agrobiology

Рубрика: Диагностика инфекций

Статья в выпуске: 2 т.54, 2019 года.

Бесплатный доступ

Вирус лейкоза птиц (ВЛП) относится к роду Alpharetrovirus семейства Retroviridae и имеет диплоидный геном, состоящий из одноцепочечной РНК. Для кур специфичны вирусы подгрупп A, B, C, D, E, J и K. Классификация вируса основана на различиях в структуре белка оболочки - GP85. Инфекция ВЛП, и в особенности инфекция ВЛП подгруппы J, наносит огромный ущерб промышленному птицеводству. Золотым стандартом для выявления ВЛП считается выделение вируса в культурах клеток CEFs или DF-1. Недостаток этого метода - длительность процедуры до получения результата (7-9 сут). Наиболее широкое распространение для выявления ВЛП получил иммуноферментный анализ. В его основе лежит выявление группоспецифического антигена ВЛП р27. Однако у этого метода также есть недостатки, главные из которых - получение ложноположительных результатов из-за экспрессии р27 эндогенными вирусами и недостаточная чувствительность. При проведении настоящего исследования нами разработана тест-система для выявления наиболее распространенных в мире подгрупп ВЛП (A, B, J и K) и осуществления контроля за распространением ВЛП...

Еще

Вирус лейкоза птиц, влп подгрупп a, b, j, к, полимеразная цепная реакция в реальном времени, выявление влп

Короткий адрес: https://sciup.org/142220112

IDR: 142220112   |   DOI: 10.15389/agrobiology.2019.2.369rus

Список литературы Мультиплексная мультилокусная ПЦР в реальном времени для анализа и контроля вируса лейкоза птиц подгрупп A, B, J и K в России

  • Payne L.N. Retrovirus-induced disease in poultry. Poultry Sci., 1998, 77(8): 1204-1212 ( ) DOI: 10.1093/ps/77.8.1204
  • Payne L.N., Brown S.R., Bumstead N., Howes K., Frazier J.A., Thouless M.E. A novel subgroup of exogenous avian leukosis virus in chickens. Journal of General Virology, 1991, 72: 801-807 ( ) DOI: 10.1099/0022-1317-72-4-801
  • Li X., Lin W., Chang S., Zhao P., Zhang X., Liu Y., Chen W., Li B., Shu D., Zhang H., Chen F., Xie Q. Isolation, identification and evolution analysis of a novel subgroup of avian leukosis virus isolated from a local Chinese yellow broiler in South China. Archives of Virology, 2016, 161(10): 2717-2725 ( ) DOI: 10.1007/s00705-016-2965-x
  • Gao L., Qin L.T., Pan W., Wang Y.Q., Lee Qi X., Gao H.L., Wang X.M. Avian leukosis virus subgroup J in layer chickens, China. Emerg. Infect. Dis., 2010, 16(10): 1637-1638 ( ) DOI: 10.3201/eid1610.100780
  • Плотников В.А., Гребенникова Т.В. Дудникова Е.К., Шульпин М.И., Лазарева С.П., Никонова З.Б., Меньщикова А.Э., Норкина С.Н., Алипер Т.И. О распространении вируса лейкоза птиц в птицеводческих хозяйствах на территории России. Сельскохозяйственная биология, 2013, 6: 36-42 ( ) DOI: 10.15389/agrobiology.2013.6.36rus
  • Peng H., Qin L., Bi Y., Wang P., Zou G., Li J., Yang Y., Zhong X., Wei P. Rapid detection of the common avian leukosis virus subgroups by real-time loop-mediated isothermal amplification. Virology Journal, 2015, 12: 195 ( )
  • DOI: 10.1186/s12985-015-0430-1
  • Spencer J.L. Progress towards eradication of lymphoid leukosis viruses -а review. Avian Pathology, 1984, 13(4): 599-619 ( )
  • DOI: 10.1080/03079458408418560
  • Qin L., Gao Y., Ni W., Sun M., Wang Y., Yin C., Qi X., Gao H. Wang X. Development and application of real-time pcr for detection of subgroup J avian leukosis virus. Journal of Clinical Microbiology, 2013, 51(1): 149-154 ( )
  • DOI: 10.1128/JCM.02030-12
  • Kim Y., Gharaibeh S.M., Stedman N.L., Brown T.P. Comparison and verification of quantitative competitive reverse transcription polymerase chain reaction (QC-RT-PCR) and real time RT-PCR for avian leucosis virus subgroup J. Journal of Virological Methods, 2002, 102(1-2): 1-8 ( )
  • DOI: 10.1016/S0166-0934(01)00372-X
  • Smith L.M., Brown S.R., Howes K., McLeod S., Arshad S.S., Barron G.S., Venugopal K., McKay J.C., Payne L.N. Development and application of polymerase chain reaction (PCR) tests for the detection of subgroup J avian leukosis virus. Virus Res., 1998, 54(1): 87-98 ( )
  • DOI: 10.1016/S0168-1702(98)00022-7
  • Yang S., Lin S., Kelen G.D., Quinn T.C., Dick J.D., Gaydos C.A., Rothman R.E. Quantitative multiprobe PCR assay for simultaneous detection and identification to species level of bacterial pathogens. Journal of Clinical Microbiology, 2002, 40(9): 3449-3454 ( )
  • DOI: 10.1128/JCM.40.9.3449-3454.2002
  • Lamien C.E., Lelenta M., Goger W., Silber R., Tuppurainen E., Matijevic M., Luckins A.G., Diallo A. Real time PCR method for simultaneous detection, quantitation and differentiation of capripoxviruses. Journal of Virological Methods, 2011, 171(1): 134-140 ( )
  • DOI: 10.1016/j.jviromet.2010.10.014
  • Nakamura S., Ochiai K., Hatai H., Ochi A., Sunden U., Umemura T. Pathogenicity of avian leukosis viruses related to fowl glioma-inducing virus. Avian Pathology, 2011, 40(5): 499-505 ( )
  • DOI: 10.1080/03079457.2011.605783
  • Cui N., Su S., Chen Z., Zhao X., Cui Z. Genomic sequence analysis and biological characteristics of a rescued clone of avian leukosis virus strain JS11C1, isolated from indigenous chickens. J. Gen. Virol., 2014, 95(Pt 11): 2512-2522 ( )
  • DOI: 10.1099/vir.0.067264-0
  • Shao H., Wang L., Sang J., Li T., Liu Y., Wan Z., Qian K., Qin A., Ye A. Novel avian leukosis viruses from domestic chicken breeds in mainland China. Archives of Virology, 2017, 162(7): 2073-2076 ( )
  • DOI: 10.1007/s00705-017-3344-y
  • Chang S.W., Hsu M.F., Wang C.H. Gene detection, virus isolation, and sequence analysis of avian leukosis viruses in Taiwan country chickens. Avian Diseases, 2013, 57(2): 172-177 ( )
  • DOI: 10.1637/10387-092612-Reg.1
  • Bacon L.D., Fulton J.E., Kulkarni G.B. Methods for evaluating and developing commercial chicken strains free of endogenous subgroup E avian leukosis virus. Avian Pathology, 2004, 33(2): 233-243 ( )
  • DOI: 10.1080/0307943042000195731
  • Kansaku N., Guemene D., Nakamura A., Uchida M. sequence characterization of K-gene linked region in various chicken breeds. The Journal of Poultry Science, 2011, 48(3): 181-186 ( )
  • DOI: 10.2141/jpsa.010072
  • Meng F., Li X., Fang J., Gao Y., Zhu L., Xing G., Tian F., Gao Y., Dong X., Chang S., Zhao P., Cui Z., Liu Z. Genomic diversity of the Avian leukosis virus subgroup J gp85 gene in different organs of an infected chicken. J. Vet. Sci., 2016, 17(4): 497-503 ( )
  • DOI: 10.4142/jvs.2016.17.4.497
  • Wang P., Lin L., Li H., Yang Y., Huang T., Wei P. Diversity and evolution analysis of glycoprotein GP85 from avian leukosis virus subgroup J isolates from chickens of different genetic backgrounds during 1989-2016: coexistence of five extremely different clusters. Archives of Virology, 2017, 163(2): 377-389 ( )
  • DOI: 10.1007/s00705-017-3601-0
  • Sung H.W., Reddy S.M., Fadly A.M. High virus titer in feather pulp of chickens infected with subgroup J avian leukosis virus. Avian Diseases, 2002, 46(2): 281-286 ( 10.1637/0005-2086(2002)0462.0.CO;2)
  • DOI: :10.1637/0005-2086
  • Zavala G., Jackwood M.W., Hilt D.A. Polymerase chain reaction for detection of avian leukosis virus subgroup J in feather pulp. Avian Diseases, 2002, 46(4): 971-978 ( 10.1637/0005-2086(2002)0462.0.CO;2)
  • DOI: :10.1637/0005-2086
  • Davidson I., Borenshtain R. The feather tips of commercial chickens are a favorable source of DNA for the amplification of Marek's disease virus and avian leukosis virus, subgroup J. Avian Pathology, 2002, 31(3): 237-240 ( )
  • DOI: 10.1080/03079450220136549
  • Whitcomb J.M., Hughes S.H. Retroviral reverse transcription and integration: progress and problems. Annu. Rev. Cell Biol., 1992, 8: 275-306 ( )
  • DOI: 10.1146/annurev.cb.08.110192.001423
  • Bar-Magen T., Sloan R.D., Donahue D.A., Kuhl B.D., Zabeida A., Xu H., Oliveira M., Hazuda D.J., Wainberg M.A. Identification of novel mutations responsible for resistance to MK-2048, a second-generation HIV-1 integrase inhibitor. Journal of Virological Methods, 2010, 84(18): 9210-9216 ( )
  • DOI: 10.1128/JVI.01164-10
  • Pandiri A.R., Gimeno I.M., Mays J.K., Reed W.M., Fadly A.M. Reversion to subgroup J avian leukosis virus viremia in seroconverted adult meat-type chickens exposed to chronic stress by adrenocorticotrophin treatment. Avian Diseases, 2012, 56(3): 578-582 ( )
  • DOI: 10.1637/9949-092611-ResNote.1
Еще
Статья научная
QR-код для установки приложения SciUp Наведите камеру и скачайте бесплатное приложение SciUp