Обзор методов филогенетической реконструкции языков

Автор: Русаков Сергей Владимирович, Нурбакова Дина Магдановна

Журнал: Вестник Пермского университета. Серия: Математика. Механика. Информатика @vestnik-psu-mmi

Рубрика: Механика. Математическое моделирование

Статья в выпуске: 1 (9), 2012 года.

Бесплатный доступ

Для построения модели филогении языков могут быть использованы различные методы фи- логенетической реконструкции. В данной статье представлен обзор основных методов ре- конструкции языковой филогении

Эволюция языков, филогенетика, моделирование эволюции, типология, многомерный статистический анализ

Короткий адрес: https://sciup.org/14729774

IDR: 14729774

Список литературы Обзор методов филогенетической реконструкции языков

  • Bryant D., Huson D., Kloepper T., Nieselt-Struwe K. Distance corrections on recombinant sequences//Benson G. and R. Page. 2003. WABI 2003: Algorithms in Bioinformatics, Third International Workshop, Proceedings. Lecture Notes in Computer Science 2812. P. 271-286.
  • Legendre P., Makarenkov V. Reconstruction of biogeographical and evolutionary networks using reticulograms//Systematic Biology. 2002. Vol. 51. P. 199-216.
  • Sokal R., Michener C. A statistical method for evaluating systematic relationships//University of Kansas Science Bulletin. 1958. Vol. 38. P. 1409-1438.
  • Nei M., Saitou N. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees//Molecular Biology and Evolution. Vol. 4 (4). P. 406-425.
  • Barbançon F., Warnow T., Evans S., Ringe D., Nakhleh L. An experimental study compa-ring linguistic phylogenetic reconstruction methods//Languages and Genes. UC Santa Barbara: Cambridge University Press, 2007.
  • Nakhleh L., Warnow T., Ringe D., Evans S.N. A Comparison of Phylogenetic Reconstruction Methods on an IE Dataset//The Transactions of the Philological Society. 2005. Vol. 3(2). P. 171-192.
  • Moulton V., Bryant D. NeighbourNet: An Agglomerative Method for the Reconstruction of Phylogenetic Network//Molecular Biology and Evolution. Feb 2004. Vol. 2 (21). P. 255-6.
  • Pagel M, Meade A. Bayesian estimation of correlated evolution across cultures: A case study of marriage systems and wealth transfer at marriage//Holden C.J., Shennan S., Mace R. The Evolution of Cultural Diversity: a phylogenetic approach. 2005. P.235-256.
  • Darlu P., Tassy P. La Reconstruction Phylogénétique. Concepts et Méthodes. 2004. P. 31-145, 195-225.
  • Nakhleh L., Jin G., Zhao F. Mellor-Crummey Reconstruction Phylogenetic Networks Using Maximum Parsimony//Proceedings of 2005 IEEE Computational Systems Bioinformatics Conference. 2005. P. 93-102.
  • Meade A., Pagel M. Comparison of maximum parsimony and Bayesian Bantu language trees//Holden C.J., Shennan S., Mace R. The Evolution of Cultural Diversity: a phylogenetic approach. 2005. P. 53-65.
  • Sober E. Parsimony in Systematics: Philosophical Issues//Annual Review of Ecology and Systematics. 1983. Vol. 14. P. 335-357.
  • Warnow T., Evans S.N., Ringe D., Nakhleh L. A Stochastic Model Of Language Evolution That Incorporates Homoplasy And Borrowing//Phylogenetic Methods and the Prehistory of Languages. July 2004. P.1-25.
  • Chib S., Greemberg E. Understanding the Metropolis-Hastings Algorithm//The American Statistician. November 1995. Vol. 4 (49). P.327-335.
  • Erdem E., Lifschitz V., Nakhleh L., Ringe D. Reconstructing the Evolutionary History of Indo-European Languages using Answer Set Programming//Proceedings of the Fifth International Symposium on Practical Aspects of Declarative Languages. 2003.
  • Posada D., and K. Crandall. Intraspecific gene genealogies: trees grafting into networks//Trends in Ecology & Evolution. 2001. Vol.16. P. 37-45.
Еще
Статья научная