Оптимизация технологии генотипирования сои на основе анализа полиморфизма SSR-локусов ДНК
Автор: Рамазанова С.А., Коломыцева А.С.
Рубрика: Селекция и семеноводство сельскохозяйственных растений
Статья в выпуске: 1 (181), 2020 года.
Бесплатный доступ
Соя - основная белково-масличная культура в мире. С каждым годом растет производство соевых бобов. Селекции и семеноводству этой культуры уделяется особое внимание вследствие ее высокого экономического значения. Для характеристики новых сортов, заявленных на выдачу патента, в настоящее время используются морфологические признаки. Современные методы оценки позволяют применять для этих целей уникальные профили ДНК, полученные на основе микросателлитных (SSR) локусов. Целью данной работы было оптимизировать уже существующую технологию идентификации и паспортизации сортов сои. Были выбраны 13 пар SSR-праймеров, локализованных в разных хромосомах сои. Результаты амплификации ДНК 23 сортов сои разных селекцентров показали, что все 13 изученных SSR-локусов полиаллельны. В целом было выявлено 38 аллелей, что в среднем составило 2,9 на локус. Значение индекса информативности маркера (PIC) варьировало от 0,36 до 0,63 и в среднем составило 0,52. Среднее значение эффективного числа аллелей было 2,15...
Соя, микросателлиты, днк, идентификация, паспортизация, генетическое разнообразие
Короткий адрес: https://sciup.org/142223408
IDR: 142223408 | DOI: 10.25230/2412-608X-2020-1-181-42-48
Список литературы Оптимизация технологии генотипирования сои на основе анализа полиморфизма SSR-локусов ДНК
- Петибская В.С., Баранов В.Ф., Кочегура А.В., Зеленцов С.В. Соя: качество, использование, производство. - М.: Аграрная наука, 2001. - 64 с.
- Гражданский кодекс Российской Федерации: Части первая - четвертая: [Принят Гос. Думой 23 апреля 1994 года, с изменениями и дополнениями по состоянию на 10 апреля 2009 г.] // Собрание законодательства РФ. - 1994. - № 22. - Ст. 1438.
- Hamada H., Petrino M.C., Takugana T. A novel repeated element with Z-DNA-forming potential is widely found in evolutionarily diverse eukaryotic genomes // PNAS. - 1982. -Vol. 79. - No 23. - P. 6465-6469. DOI: 10.1073/pnas.79.21.6465
- Использование ПЦР-анализа в генетикоселекционных исследованиях: научно-методическое руководство / Под. ред. Ю.М. Сиволапа. - Киев: Аграрна наука, 1998. - 156 с.
- Varshney R.K., Graner A., Sorrells M.E. Genic microsatellite markers in plants: Features and applications // TRENDS in Biotechnology. -2005. - Vol. 23. - No 1. - P. 48-55.
- Morgante M., Rafalski A., Biddle P., Tingey S., Olivieri A.M. Genetic mapping and variability of seven soybean simple sequence repeat loci // Genome. - 1994. - V. 37. - No 5. -P. 763-769.
- Rongven J., Akkaya M.S., Bhagwat A.A., Lavi U., Cregan P.B. The use of microsatellite DNA markers for soybean genotype identification // Theor. Appl. Genet. - 1995. - V. 90. - P. 43-48.
- Абугалиева C.H., Волкова Л.А., Нурпанова А.А., Жанпеисова А.С., Туруспеков Е.К. ДНК-фингерпринтинг сортов сои Казахстана с использованием SSR-маркеров // Биотехнология. Теория и практика. - 2013. - № 3. -С. 26-34.
- Hudcovicovä M., Kraic J. Utilisation of SSRs for Characterisation of the Soybean (Glycine max (L.) Merr.) Genetic Resources // Czech Journal of Genetics and Plant Breeding. - 2003. -V. 39 (4). - P. 120-126.
- DOI: 10.17221/3729-CJGPB
- Bisen A., Khare D., Nair P., Tripathi N. SSR analysis of 38 genotypes of soybean (Glycine max (L.) Merr.) genetic diversity in India // Physiol. Mol. Biol. Plants. - 2015. - V. 21 (1). -P. 109-115.
- DOI: 10.1007/s12298-014-0269-8
- Kujane K., Sedibe M.M., Mofokeng A. Genetic diversity analysis of soybean (Glycine max (L.) Merr.) genotypes making use of SSR markers // Australian Journal of Crope Science. -2019. - V. 13 (07) - P. 1113-1119.
- DOI: 10.21475/ajcs.19.13.07.p1638
- Рамазанова С.А. Идентификация генотипов сои разного происхождения с использованием полиморфизма девяти микросателлитных локусов ДНК // Современные проблемы селекции и технологии возделывания сои: сб. статей 2-й международной конференции по сое. - Краснодар, 910 сентября 2008 г. - С. 129-136.
- Saghai-Maroof M.A., Soliman K.M., Jorgensen R.A., Allard R.W. Ribosomal DNA spacer-length polymorphisms in barley: Mendelian inheritance, chromosomal location, and population dynamics // PNAS USA. - 1984. - 81. - P. 8014-8018.
- Botstein D., White R.L., Skolnick M., Davis R. W. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms // Am. J. Hum. Genet. - 1980. - V. 32. - P. 314-331.
- Pejic I., Ajmorne-Marsan P., Morgante M. [et al.]. Comparative analysis of genetic similarity among maize inbred lines detected by RFLPs, RAPDs, SSRs and AFLPs // Theor. Appl. Genet. - 1998. - V. 83. - P. 194-200.
