Полиморфизм гена бета-казеина в стадах крупного рогатого скота Республики Татарстан
Автор: Тюлькин С.В., Загидуллин Л.Р., Гильманов Х.Х., Шайдуллин С.Ф., Ахметов Т.М., Вафин Р.Р.
Рубрика: Биологические науки
Статья в выпуске: 4 т.228, 2016 года.
Бесплатный доступ
В данной работе изучен полиморфизм гена бета-казеина в стадах крупного рогатого скота, а именно определена частота наиболее распространённых аллельных вариантов А и В. Встречаемость желательного аллеля В гена CSN2 среди разных пород крупного рогатого скота Республики Татарстан составила 0,05-0,10. При этом встречаемость этого аллеля была минимальной и укладывалась в пределы по другим породам крупного рогатого скота.
Полиморфизм, генотип, аллель, бета-казеин, пцр, днк
Короткий адрес: https://sciup.org/14288891
IDR: 14288891
Текст научной статьи Полиморфизм гена бета-казеина в стадах крупного рогатого скота Республики Татарстан
В молоке коров αs 1 -, β- , κ -казеинам приходится более 70% белка сырной массы. Поэтому изученное влияние этих белков в отдельности на сыродельческие свойства молока вполне объяснимо [3].
Общеизвестно, что маркеры молочной продуктивности, качества и технологических свойств молока ассоциируются с аллельными вариантами генов молочных белков, также не исключение и ген бета-казеина.В настоящее время известно 11 полиморфных вариантов такого важного белка молока, как бета-казеин [2]. Присутствие в геноме у коров B аллеля бета-казеина оказывает улучшающее влияние на технологические свойства молока, в частности на сыродельческие [8]. Остаётся малоизученным вопрос генетического полиморфизма гена молочного белка – бета-казеина (CSN2) у крупного рогатого скота Республики Татарстан.
В связи с этим целью настоящих исследований являлось определение в трёх различных популяциях аллельного полиморфизма CSN2 -гена посредством использования ДНК-анализа.
Материал и методика исследований. Для проведения ДНК-анализа у 70 чистопородных и помесных по голштинской породе быков-производителей в ГУП ГПП «Элита» Высокогорского района, 158 коров-первотёлок в ООО им. Тукая Балтасинского района, 164 чёрно-пёстро × голштинских коров-первотёлок в ОАО «Племзавод «Бирю-линский» Высокогорского района Республики Татарстан из яремной вены взята кровь, которую отбирали в пробирки с 100 мМ ЭД-ТА, так чтобы конечная концентрация достигла 10 мМ. Пробы ДНК из крови экстрагировали комбинированным щелочным способом. Определение аллельного полиморфизма и генотипов по гену CSN2 к проводили методом аллель-специфичной ПЦР с использованием двух пар праймеров: O-bcas-F: 5/-AACATCCCTCCTCTTACTCAAA-CCCCTG-3/ и O-bcas-R: 5/-
ATATCTCTCTGGGGATAGGGCACTGCTT-3/ и I-bcas-F: 5/-
AATATCCAGTTGAGCCCTTTACTGAATGC
-
-3/ и I-bcas-R: 5/-CAACAT-
- CAGTGAGAGTCAGGCTCAGC-3/ [7]. Ам
-
3. q B = (2nBB+nAB) : 2N ,
плификацию проводили при следующем режиме: ×1:94 0С – 4 мин; ×40:94 0С – 10 сек, 63 0С – 10 сек, 72 0С – 10 сек; ×1:72 0С – 7 мин; хранение: 10 0С. Далее проводили горизонтальный электрофорез и визуализацию фрагментов ДНК в УФ-трансиллюминаторе по общепринятым методикам.
Частоту встречаемости генотипов определяли по общепринятым формулам:
1. р = n / N, где р – частота генотипа, n –число особей, имеющих определенный генотип, N – число особей. 2. РА = (2nAA+nAB) : 2N,
где P А – частота аллеля А , q B – частота аллеля В , N – общее число аллелей.
По закону Харди-Вайнберга определяли ожидаемые результаты частот генотипов [5].
Результаты собственных исследований. Обобщённые результаты исследования аллельного полиморфизма и частоты генотипов CSN2-гена в трёх популяциях крупного рогатого скота представлены в таблице 1.
Таблица 1 - Частота аллелей и генотипов CSN2 -гена у крупного рогатого скота
Показатели |
n |
Частота генотипов |
Частота аллелей |
χ2 |
||||||
АА |
АВ |
ВВ |
||||||||
n \ |
% |
n \ |
% |
n \ |
% |
А \ |
В |
|||
Чистопородные и помесные по голштинской породе быки-производители |
||||||||||
О |
70 |
61 |
87,1 |
9 |
12,9 |
0 |
0 |
0,94 |
0,06 |
0,14 |
Е |
62 |
88,6 |
8 |
11,4 |
0 |
0 |
||||
Чёрно-пёст |
о × голштинские первотёлки |
|||||||||
О |
158 |
141 |
89,2 |
17 |
10,8 |
0 |
0 |
0,95 |
0,05 |
0,29 |
Е |
143 |
90,5 |
15 |
9,5 |
0 |
0 |
||||
Первотёлки холмогорской породы татарстанского типа |
||||||||||
О |
164 |
131 |
79,9 |
33 |
20,1 |
0 |
0 |
0,90 |
0,10 |
2,58 |
Е |
133 |
81,1 |
29 |
17,7 |
2 |
1,2 |
О – фактически наблюдаемый показатель, Е – теоретически ожидаемый показатель
После проведения анализа крупного рогатого скота на уровне генома распределение генотипов по CSN2 -гену было следующим: среди чистопородных и помесных по голштинской породе быков-производителей с
АА -генотипом 61 (87,1%) и с АВ -генотипом 9 (12,9%) особей; среди чёрно-пёстро × голштинских и холмогорской породы татарстанского типа первотёлок с АА -генотипом 131141 (79,9-89,2%) и с АВ -генотипом 17-33
(10,8-20,1%) животных соответственно. При этом ВВ -генотип CSN2 -гена не выявлен ни у быков-производителей и ни у коров-первотёлок.
Исследования полиморфизма гена CSN2 крупного рогатого скота по А и В аллелям в других стадах и популяциях показали, что встречаемость аллелей соответственно составляет у крупного рогатого скота джерсей-ской породы 0,95 и 0,04 (аллеля С – 0,01) [9], голштинской породы 0,819 и 0,181 [1], бестужевской породы 0,72-0,85 и 0,15-0,28, симментальской породы 0,64-0,65 и 0,35-0,36 [4], молочного направления 0,897 и 0,103 и мясного направления 0,838 и 0,162 [6].
Заключение. 1. Анализ фактического и гипотетического разделения генотипов CSN2 -гена по закону Харди-Вайнберга в поголовьях быков-производителей и первотёлок показал, что разница между АА -, АВ -, ВВ -генотипами соответствовал минимальным значениям – 02,4%. Значение вариабельности хи-квадрат (χ2) по CSN2 -гену в трёх стадах крупного рогатого скота составило 0,14; 0,29 и 2,58 соответственно, что достаточно ниже достоверных значений. Результаты исследований показали, что генное равновесие по гену бета-казеина находится в сбалансированном состоянии. 2. Частота встречаемости желательного В аллельного варианта CSN2 -гена у крупного рогатого скота различается в зависимости от породы. В проанализированных стадах крупного рогатого скота Республики Татарстан преобладает А аллельный вариант CSN2 -гена (0,90-0,95), частота встречаемости ценного аллеля В гена составляет всего 0,05-0,10; 3. Для увеличения частоты встречаемости В аллеля в популяциях крупного рогатого скота необходимо интенсивнее использовать в селекционной работе методы ДНК-анализа и его достижения.
Список литературы Полиморфизм гена бета-казеина в стадах крупного рогатого скота Республики Татарстан
- Беган, М.А. Полиморфизм генов лептина (LEP), тиреоглобулина (TG) и бета-казениа (CSN2) у голштинских коров/М.А. Беган, Я.А. Хабибрахманова, Л.А. Калашникова, В.Г. Труфанов. -сб. науч. тр. Всероссийского научно-исследовательского института овцеводства и козоводства. -2014. -Т. 3. -№ 7. -С. 487-491.
- Гроклод Ф. Полиморфизм белков молока; некоторые биохимические и генетические аспекты/Ф. Гроклод. -Матер. 16-й междунар. конф. по группам крови и биохимическому полиморфизму животных. -Л., 1979. -Т.1. -С. 55-93.
- Закирова, Г.М. Белковый состав и технологические свойства молока у помесных коров холмогорская х голштинская разного генотипа: дисс. канд. биол. наук: 06.02.01/Закирова Галима Мухтаровна.-Казань, 2002. -143 с.
- Костюнина, О.В. Характеристика аллелофонда башкирских популяций крупного рогатого скота по генам CSN2 и CSN3/О.В. Костюнина, Е.Н. Коновалова, И.Ю. Долматова, Ю.А. Ракина, Е.А. Гладырь//Достижения науки и техники АПК. -2013. -№ 3. -С. 64-67.
- Петухов, В.Л. Ветеринарная генетика с основами вариационной статистики/В.Л. Петухов, А.И. Жигачев, Г.А. Назарова. -М.: Агропромиздат, 1985. -368 с.
- Хаертдинов, Р.А. Генетическая структура по белкам молока, у мясных пород скота, разводимых в условиях Республики Татарстан/Р.А. Хаертдинов, И.Н. Камалдинов, Р.Р. Исламов//Учёные записки Казанской ГАВМ им. Н.Э. Баумана. -2014. Т. 219 -№ 3. -С. 319-324.
- Rincon, G. Single nucleotide polymorphism genotyping of bovine milk protein genes using the tetra-primer ARMS-PCR/G. Rincon, J.F. Medrano//J. Anim. Breed. Genet. -2003. -V. 120 -P. 331-337.
- Tong, P.S. Effect of genetic variants of milk proteins on the yield of Cheddar cheese/P.S. Tong, S. Vink, N.Y. Farkye, J.F. Medrano. -IDF Seminar on cheese yield and factors affecting its control. -Brussels, Belgium. -1994. -P.179-187.
- Zepeda-Batista, J.L. Polymorphism of three milk protein genes in Mexican Jersey cattle/J.L. Zepeda-Batista, B. Alarcón-Zúñiga, A. Ruíz-Flores, //Electronic Journal of Biotechnology. -2015. -V. 18. P. 1-4 DOI: rg/10.1016/j.ejbt.2014.10.002]