Проектирование электронной базы данных для зоологической коллекции Республики Казахстан

Автор: Калимолдаев Максат Нурадилович, Мазакова Айгерим Талгатовна, Ященко Роман Васильевич, Мазаков Талгат Жакупович, Абдилдаева А. А.

Журнал: Проблемы информатики @problem-info

Рубрика: Прикладные информационные технологии

Статья в выпуске: 4 (53), 2021 года.

Бесплатный доступ

В последние годы исследования в области биологии и генетики привели к увеличению биологической информации, хранящейся в базах данных. Такое же увеличение объема информации произошло в области зоологии, но развитие баз данных в этой области не рассматривалось. В статье описана разработанная электронная база хранения зоологической коллекции Института зоологии Министерства образования и науки Республики Казахстан. Создание базы и банка данных но государственной научной зоологической коллекции позволит использовать ее в научных, образовательных и прикладных целях, которая будет использована для учета, контроля состояния и долговременного сохранения единой национальной зоологической коллекции и управления ценными зоологическими коллекционными материалами. Государственная зоологическая научная коллекция является важнейшим источником информации для различных направлений биологических исследований. Она является не только основой для проведения научных изысканий но систематике, молекулярной генетике животных, но и документальным подтверждением корректности выполненных фаунистических работ. При решении этой важной в теоретическом и практическом отношении проблемы особую актуальность приобретает инвентаризация образцов видового разнообразия. На основе MySQL разработана электронная база данных е удобным интерфейсом для ввода данных из государственной зоологической коллекции Республики Казахстан. Разработанная ЭБД включает информационно-поисковую систему и обеспечит дальнейшее формирование виртуальной научной зоологической коллекции. Электронная база данных предназначена для зоологов, а также для специалистов других профилей, нуждающихся в зоологической информации.

Еще

Базы данных, биологическая систематика, зоологическая коллекция, интерфейс, субд, mysql, phpmy admin

Короткий адрес: https://sciup.org/143178549

IDR: 143178549

Список литературы Проектирование электронной базы данных для зоологической коллекции Республики Казахстан

Kashvap, Н., et al. Big data analytics in bioin- formaties: A machine learning perspective. arXiv 1506.05101, 2015.
Turner, V., Gantz, .J., and Minton, S. The digital universe of opportunities: Rich data and the increasing value of the internet of things. Tech. rep., 2014.
Ragunath, P. K., Venkatesan, P., and Ravimohan, R. New curriculum design model for bioinformatics postgraduate program using systems biology approach // Journal of Computer Science & Systems Biology. 2009. N 2. P. 300-305.
Benson, D., Karsch-Mizrachi, I., Lipman, D., et al. GenBank // Nucleic Acids Res. 2000. N 28. P. 15-18.
Burge, S. W., et al. Rfam 11.0: 10 years of RNA families // Nucleic Acids Research 41, Dl. 2012. 1)220 1)232.
Ponten, F., Schwenk, J. M., Asplund, A., and Edqvist, P.-H. D. The human protein atlas as a proteomic resource for biomarker discovery // Journal of Internal Medicine. 2011. 270, 5. P. 428-446.
de Lorenzo, V., et al. The power of synthetic biology for bioproduction, remediation and pollu tion control // KM BO reports. 2018. 19, 4. e45658.
Duigou, T., du Lac, M., Carbonell, P., and Faulon, J.-L. RetroRules: a database of reaction rules for engineering biology // Nucleic Acids Research 47, Dl. 2018. 1)1229 1)1235.
Nielsen, J., and Keasling, J. D. Engineering cellular metabolism // Cell 164. 2016. P. 1185-1197.
Rose, P. W., et al. The rcsb protein data bank: redesigned web site and web services. Nucleic Acids Research 39. 2011. D392-D401.
Bourne, P. Will a biological database be deferent from a biological journal? // PLOS Computational Biology. 2005. 1, 3.
Singh, S., et al. Comparative modeling study of the 3-d structure of small delta anti-gen protein of hepatitis delta virus // Journal of Computer Science k, Systems Biology. 2010. 3. P. 1-4.
Hoskeri, J., Krishna, V., and Amruthavalli, C. Functional annotation of conserved hypothetical proteins in rickettsia massiliae mtu5 // Journal of Computer Science k, Systems Biology. 2010. 3. P. 50-52.
Altschul, S., Gish, W., Miller, W., et al. Basic Local Alignment Search Tool // Journal of Molecular Biology. 1990. 215. P. 403-410.
Benham, S., et al. Taxus baccata in Europe: Distribution, habitat, usage and threats. Publications Once of the EU: Luxembourg, 2016.
Benson, D., Karsch-Mizrachi, I., Lipman, D., et al. GenBank // Nucleic Acids Res. 2000. 28. P. 15-18.
Benson, D., Karsch-Mizrachi, I., Lipman, D., et al. GenBank // Nucleic Acids Res. 2014. 42. P. 7-32.
Dalmaris, E., et al. Dataset of targeted metabolite analysis for Five taxanes of hellenic taxus baccata 1 // Populations. 2020. Data 5, 1.
Birnev, E., and Clamp, M. Biological database design and implementation // Briefings in Bioinformatics. 2004. 5, 1. P. 31-38.
Bourne, P. Will a biological database be different from a biological journal // PLOS Computational Biology. 2005. 1, 3.
Bradley, A. R., Rose, A. S., Pavelka, A., et al. An efficient file format for the transmission, visualization, and analysis of macromolecular structures // PLOS Computational Biology. 2017. 13. P. 1-16.
Duggirala, S. Newsql databases and scalable in-memorv analytics. In A Deep Dive into NoSQL Databases: The Use Cases and Applications //P. Raj and G. C. Deka, Eds., vol. 109 of Advances in Computers. Elsevier, 2018. P. 49.
Srinivasa, K., and Hirivannaiah, S. Comparative study of different in-memorv (no/new) SQL databases. In A Deep Dive into NoSQL Databases: The Use Cases and Applications //P. Raj and G. C. Deka, Eds., vol. 109 of Advances in Computers. Elsevier. 2018. P. 133-156.
Raj, P. A detailed analysis of NoSQL and NEWTSQL databases for bigdata analytics and distributed computing. In A Deep Dive into NoSQL Databases: The Use Cases and Applications //P. Raj and G. C. Deka, Eds., of Advances in Computers. Elsevier, Vol. 109. 2018. P. 1-48.
Microsoft. Microsoft SQL Server. 2017: (RTM) 14.0.1000.169 (X64) Aug 22 2017 17:04:49 Copyright (C) 2017 Microsoft Corporation Express Edition (64-bit) on Windows 10 Home 10.0 [X64] (Build 18362:).

Еще

Статья научная