Разработка проблемно-ориентированных архитектур и приложений для экзофлопных вычислений в биологии и фармацевтике

Бесплатный доступ

Рассмотрены проблемы, возникающие при оптимизации кластерных архитектур вы- числительных систем для решения прикладных задач биоинформатики. Модель много- процессорной ЭВМ строится на основе параллельной распределённой системы симуля- ции Graphite. Описаны текущее состояние и ближайшие планы развития «Лаборатории суперкомпьютерных технологий в области биоинформатики».

Короткий адрес: https://sciup.org/142185788

IDR: 142185788

Список литературы Разработка проблемно-ориентированных архитектур и приложений для экзофлопных вычислений в биологии и фармацевтике

  • Uhlig R., Fishtein R., Gershon O. et al. SoftSDV: A presilicon software development environment for the IA-64 architecture//Intel Technology Journal. -1999. -P. 112-126.
  • Magnusson P.S., Christensson M., Eskilson J.et al. Simics: A full system simulation platform//Computer. -2002, Feb. -V. 35. -P. 50-58.
  • Khan O. EM2: A scalable shared-memory multicore architecture: Tech. rep./Khan O., Liz M., Devadas S.: Massachusetts Institute of Technology. -2010, Jun.
  • Rajwar R. Speculation-based techniques for transactional lock-free execution of lock-based programs: Ph.D. thesis/University of Wisconsin. -Madison. -2002.
  • Yen L., Bobba J., Marty M.R. et al. LogTM-SE: Decoupling hardware transactional memory from caches//The 13th Annual International Symposium on High Performance Computer Architecture (HPCA-13). -2007, Feb.
  • Miller J.E., Kasture H., Kurian G. et al. Graphite: a distributed parallel simulator for multicores//The 16th IEEE International Symposium on High-Performance Computer Architecture (HPCA). -2010, Jan.
Статья обзорная