Анализ антибиотикорезистентности бактерий кишечной микрофлоры

Автор: Ступина А.Н., Коленчукова О.А., Коломейцев А.В., Кравчук В.Ю.

Журнал: Ученые записки Казанской государственной академии ветеринарной медицины им. Н.Э. Баумана @uchenye-zapiski-ksavm

Рубрика: Ветеринария

Статья в выпуске: 2 т.262, 2025 года.

Бесплатный доступ

На сегодняшний момент имеется мало информации об уровнях и изменениях патогенных бактерий, входящих в состав фекалий крупного рогатого скота и их антибиотикорезистентности, на молочных фермах. Необходим мониторинг антибиотикорезистентности бактерий, выделяемых из отходов животноводческих ферм. Цель исследования: изучение состава фекальной микрофлоры и анализ ее антибиотикорезистентности. С помощью рутинных бактериологических методов, а также масс-спектрометрии проводилось определение видового состава фекальной микрофлоры крупного рогатого скота (КРС), а диско-диффузионным методом – анализ ее антибиотикорезистентности. В ходе работы получены данные о количественном и качественном составе кишечного микробиома крупного рогатого скота и выявлена специфика антибиотикорезистентности к таким препаратам как ампициллин в двух дозировках (2 мкг и 10 мкг), амоксициллин + клавулановая кислота 20\10 мкг, бензилпенициллин 1 МЕ, тетрациклин 30 мкг, эритромицин 15 мкг. Эти группы антибиотиков наиболее часто используются в животноводстве. Исследование поможет определить антибиотики, к которым резистентны бактерии кишечной микрофлоры КРС, поскольку, вследствие их избыточного использования, устойчивость к ним появляется не только у болезнетворных бактерий, но и у так называемых условно патогенных микроорганизмов, которых гораздо больше, и в норме они не опасны, но при ослаблении иммунитета способны вызывать различные заболевания. Выявлена высокая резистентность бактерий кишечной микрофлоры к наиболее популярным препаратам, которые используются в животноводстве, в частности на молочных фермах для лечения скота. Антимикробные препараты — это инструмент, используемый на животноводческих фермах для обеспечения здоровья животных, и этот инструмент должен использоваться рационально.

Еще

Кишечный микробиом, антибиотики, навоз, антибиотикорезистентность, крупный рогатый скот

Короткий адрес: https://sciup.org/142246127

IDR: 142246127   |   УДК: 579.62:615.015.8   |   DOI: 10.31588/2413_4201_1883_2_262_64

Analysis of antibiotic resistance of intestinal microflora bacteria

Currently, there is little information on the levels and changes in pathogenic bacteria of cattle feces and their antibiotic resistance on dairy farms. Monitoring of antibiotic resistance of bacteria isolated from livestock farm waste is necessary. The purpose of the study is to investigate the composition of fecal microflora and analyze its antibiotic resistance. Using routine bacteriological methods, as well as mass spectrometry, the species composition of fecal microflora of cattle was determined, and the disk diffusion method was used to analyze its antibiotic resistance. In the course of the work, data were obtained on the quantitative and qualitative composition of the intestinal microbiome of cattle and the specificity of antibiotic resistance to such drugs as ampicillin in two dosages (2 μg and 10 μg), amoxicillin + clavulanic acid 20/10 μg, benzylpenicillin 1 ME, tetracycline 30 μg, erythromycin 15 μg was revealed. These groups of antibiotics are most often used in animal husbandry. The study will help to determine the antibiotics to which the bacteria of the intestinal microflora of cattle are resistant, since, due to their excessive use, resistance to them appears not only in pathogenic bacteria, but also in the so-called opportunistic microorganisms, of which there are many more, and normally they are not dangerous, but with weakened immunity they can cause various diseases. High resistance of intestinal microflora bacteria to the most popular drugs used in animal husbandry, in particular on dairy farms for the treatment of cattle, has been revealed. Antimicrobial drugs are a tool used on livestock farms to ensure animal health, and this tool should be used rationally.

Еще

Текст научной статьи Анализ антибиотикорезистентности бактерий кишечной микрофлоры

Болезнетворные микроорганизмы и остатки антибиотиков являются основными вредными композициями в навозе (фекалиях, накопленных в естественных условиях) [6]. Согласно статистике ВОЗ, ежегодно в мире насчитывается около 1,5 миллиарда пациентов с диареей, и 70% этих случаев были вызваны пищей, зараженной микроорганизмами [7, 8]. Патогенные микроорганизмы могут выживать в воде, почве и других областях окружающей среды в течение длительного времени, а затем влиять на здоровье человека через сельскохозяйственные культуры или продукты животного происхождения [4, 9]. В настоящее время в фекалиях идентифицировано более 150 патогенов.

Опасности накопленного коровьего навоза уделяется меньше внимания, при этом он широко используется для выращивания сельскохозяйственных культур или овощей [10, 11]. На сегодняшний момент имеется мало информации об уровнях и изменениях патогенных бактерий, входящих в состав фекалий крупного рогатого скота и их антибиотикорезистент-ности, на молочных фермах [5, 7]. Таким образом, необходим мониторинг антибиотико-резистентности бактерий, выделяемых из отходов животноводческих ферм.

Цель работы - изучение состава фекальной микрофлоры и анализ ее антибиотикорезистентности.

Результаты и обсуждение. Для бактериологического исследования отбирали пробы свежих фекалий крупного рогатого скота (КРС) животноводческой фермы ООО ОПХ «Солянское», Рыбинского района Красноярского края, в 7 точках: дойная база, септик-1, база КРС, септик-2, база КРС, септик-3, база №17, база №15, д. Рябинки база «решетка» и база 9. Отбирали 1,0 г навоза в трёх повторностях и далее делали смешанную пробу.

Для подсчета количества колоний и выделения чистой культуры предварительно разводили образцы в стерильно физиологическом растворе 0,8% в пробирках до 10-кратного и полученные последовательные 10-кратные разведения засевали на чашки Петри с различными селективными, обогащенными и дифференциально-диагностическими средами (агар Сабуро – для выявления грибов, среда обогащения магниевая, агар Плоскирева, агар Левина, желточносолевой агар, агар Эндо, кровяной агар, агар для лактобактерий, агар для бифидобактерий, среда Вильсон-Блер - для обнаружения клостридий, лактозный ТТХ агар с тергитолом 7 – для выделения энтерококков). Питательные среды подбирали для выделения кишечной микрофлоры, подбор питательных сред проводился для выделения аэробных и анаэробных микроорганизмов (более 20 видов патогенной, условно-патогенной и сапрофитной микрофлоры). Количественное содержание микроорганизмов в 1,0 г биоматериала определяли путем подсчета выросших на чашках Петри колоний (для каждого разведения отдельно). Далее все серийные разведения помещали в термостат при температуре 37ºС на 18–24 часов. Далее оценено наличие и осуществлен подсчет микроорганизмов и высев колоний на среду Олькеницкого, магниевую среду, висмут-сульфидный агар и агар Левина, посевы инкубировали при 37ºС в течении 18–24 часов. Далее оценивали рост на дифференциальнодиагностических средах и проводили окраску по Граму и микроскопирование для выделения чистой и изолированной культуры, с последующей идентификацией до вида. Для видовой идентификации бактерий и грибов в навозе был применен метод масс-спектрометрии.

Далее определяли антибиотикорезистент-ность микроорганизмов к антибактериальным препаратам диско-диффузионным методом. Антибактериальные препараты наносились диспенсером на чашки Петри с Мюллер-Хинтон агаром. Агар предварительно подсушили при комнатной температуре с нанесенным на него инокулюмом исследуемой культуры 0,5 по стандарту МакФарланда. Далее инкубировали при 37°С в течении 18-24 часов, по истечении времени оценивали зону задержки роста антибактериального препарата и исследуемого микроорганизма на аппарате ADAGIO, который автоматически считывает зоны задержки роста. Для определения анти-биотикорезистентности микроорганизмов, выделенных из отходов молочной фермы, были использованы диски с такими антимикробными препаратами, как ампициллин в двух дозировках (2 мкг и 10 мкг), амоксициллин + клавулановая кислота 20\10 мкг, бензилпенициллин 1 МЕ, тетрациклин 30 мкг, эритромицин 15 мкг.

Результаты и обсуждение. В результате микробиологического анализа смешанных частей свежих фекалий, полученных с разных септиков, было установлено, что наибольшее количество представителей кишечной микрофлоры относятся к сапрофитным бактериям, бифидобактерии и лактобактерии, количество которых превышало 108 – 1010 на 1 мл образца (табл. 1 и 2).

Таблица 1 – Количественный и качественный состав кишечной микрофлоры крупного рогатого скота, уровень антибиотикорезистентности к полусинтетическим пенициллинам

Виды микроорганизмов

КОЕ/ мл

Бензил-пенициллин (˂18 –

R)

Ампициллин 2 мкг (<14 - R)

Ампициллин 10 мкг (<14 - R)

Амоксициллин + кла-вулановая кислота (<19 - R)

Proteus mirabillis

10 3

0 (R)

0 (R)

0 (R)

16 (R)

Klebsiella pneumoniae

10 3

-

-

-

-

Escherichia coli

10 6

0 (R)

14 (R)

20 (S)

23 (S)

Acinetobacter calcoaceticus

10 5

-

-

-

-

Acinetobacter lwoffii

10 5

0 (R)

12 (R)

19 (S)

22 (S)

Pseudomonas aeruginosa

10 6

0 (R)

0 (R)

0 (R)

0 (R)

Bacillus subtilis

10 6

13 (R)

19(R)

25 (S)

32 (S)

a-streptococcus

108

-

-

-

-

Enterococcus faecalis

10 5

24 (S)

25 (S)

25 (S)

30 (S)

Staphylococcus epidermidis

10 2

-

-

-

-

Staphylococcus saprophyticus

10 3

0 (R)

0 (R)

0 (R)

Staphylococcus aureus

10 3

-

-

-

Bifidobacterium spp.

1010

-

-

-

Lactobacillus spp.

108

-

-

-

Clostridium spp.

10 5

-

-

-

Penicillum spp.

10 4

-

-

-

Candida spp.

10 3

-

-

-

Carcina spp

10 5

-

-

-

Таблица 2 – Количественный и качественный состав кишечной микрофлоры крупного рогатого скота, уровень антибиотикорезистентности к макролидам и тетрациклинам

Виды микроорганизмов

КОЕ/ мл

Эритромицин (<24 - R)

Тетрациклин (<22 - R)

Proteus mirabillis

10 3

0 (R)

0 (R)

Klebsiella pneumoniae

10 3

-

-

Escherichia coli

10 6

0 (R)

18 (R)

Acinetobacter calcoaceticus

10 5

-

-

Acinetobacter lwoffii

10 5

17 (R)

23 (S)

Pseudomonas aeruginosa

10 6

0 (R)

0 (R)

Bacillus subtilis

10 6

0 (R)

12 (R)

a-streptococcus

10 8

-

-

Enterococcus faecalis

10 5

20 (R)

25 (S)

Staphylococcus epidermidis

10 2

-

-

Staphylococcus saprophyticus

10 3

0 (R)

0 (R)

Staphylococcus aureus

10 3

-

-

Bifidobacterium spp.

1010

-

-

Lactobacillus spp.

10 8

-

-

Clostridium spp.

10 5

-

-

Penicillum spp.

10 4

-

-

Candida spp.

10 3

-

-

Carcina spp

10 5

-

-

Также было выявлено высокое значение а-гемолитических (зеленящих) стрептококков, из которых чаще всего выявлялись S. dysgalactiae и S. equi, которые являются зоонозами и вызывают инфекционные заболевания у коров. Такие микроорганизмы, как гемолитические E. coli, P. aeruginosa и B. subtilis выявлялись в концентрации 106 KOE/мл, немногим меньше, в количестве 105 KOE/мл представлены бактерии E. faecalis, A. calcoaceticus и А. Iwoffii , а также клостридии и сарцины.

Данные бактерии относятся к условно -патогенным и способны при попадании в молочную продукцию вызывать различного рода инфекционные заболевания у человека. Исследование кишечной микрофлоры показало низкое количество, в диапазоне 102–103 KOE/мл, таких микроорганизмов как P. mirabillis, K. pneumoniae, S. epidermidis, S. saprophyticus, S. aureus, а также грибов родов Candida и Penicillum.

Несмотря на то, что молочные коровы используют антибиотики реже, чем другие мясные животные, в коровьем навозе также обнаруживаются лекарственные препараты и бактерии, резистентные к широкому спектру антибиотиков. Распространение таких бактерий может ограничивать терапевтический потенциал антибиотиков, тем самым создавая потенциальную угрозу для здоровья людей и скота [7]. Таким образом особый интерес представляет изучение антибиотикорезистент-ности бактерий, выделенных из кишечной микрофлоры КРС. Противомикробные препараты уже несколько десятилетий широко используются в традиционном животноводстве. Показано, что беспорядочное применение антибиотиков в животноводстве создаёт благоприятные условия для быстрой эволюции патогенности и вирулентности микроорганизмов и формирования у них антибиотикорезистент-ности. Наличие в комбикормах даже остаточных количеств антибиотиков может вызвать различные нарушения здоровья людей [3, 9]. Анализ антибиотикорезистентно-сти бактерий кишечной микрофлоры показал, что штаммы P. mirabillis и P. aeruginosa были резистентны ко всем исследуемым классам антибиотиков (макролиды, пенициллины, в том числе и комбинированного состава (амоксициллин + клавулановая кислота) и тетрациклины). Штаммы бактерии S. saprophyticus были чувствительны только к комбинированному антибактериальному препарату – амоксициллин + клавулановая кислота 20\10 мкг. Это комбинированное антибактериальное средство, сочетание бактерицидного антибиотика широкого спектра действия из группы полусинтетических пенициллинов — амоксициллина и ингибитора бета-лактамаз — клавулановой кислоты. E. coli и B. subtilis чувствительны к таким препаратам как амоксициллин + клавулановая кислота и ампициллин в дозировке 10 мкг (относящийся к группе полусинтетических пенициллинов), но проявляли устойчивость к таким антибиотикам, как эритромицин (группа макролидов) и тетрациклин (группа тетрациклинов), а также к некоторым препаратам, относящимся к по-лусинтетическим пенициллинам. Штаммы бактерий вида A. lwoffii проявляли устойчивость в отношении эритромицина, бензилпенициллина и ампициллина в дозировке 2 мкг, но были чувствительны к ампициллину в дозировке 10 мкг, комбинированному препарату и тетрациклину. Наибольшую чувствительность проявляли штаммы бактерии E. faecalis, которые были резистентны только к эритромицину и чувствительны к антибиотикам группы полусинтетических пенициллинов и тетрациклинов, несмотря на то что одной из отличительных особенностей этого класса бактерий является изначальная природная устойчивость к целому ряду антибактериальных препаратов.

В результате анализа антибиотикорези-стентности фекальной микрофлоры показано, что к эритромицину были устойчивы все выделенные штаммы, относящиеся к условно -патогенным бактериям. При этом к данному препарату природную устойчивость проявляют только грамотрицательные палочки: Escherichia coli и Pseudomonas aeruginosa. К бензилпенициллину, ампициллину в дозировке 2 мкг и тетрациклину были устойчивы большинство выделенных штаммов бактерий. Наибольшее количество изученных микроорганизмов были чувствительны к ампициллину в дозировке 10 мкг и комбинированному препарату амоксициллин + клавулановая кислота.

Выводы. Таким образом, выявлена высокая резистентность бактерий кишечной микрофлоры к наиболее популярным препаратам, которые используются в животноводстве, в частности на молочных фермах для лечения КРС. Изученные микроорганизмы вырабатывают устойчивость к препаратам в связи с нерациональным использованием антибиотиков. Антимикробные препараты - это инструмент, используемый на животноводческих фермах для обеспечения здоровья животных, и этот инструмент должен использоваться рационально.