Полиморфизм гена CAPN1 крупного рогатого скота калмыцкой и казахской белоголовой пород
Автор: Убушиева В.С., Убушиева А.В., Чимидова Н.В., Бадмаева К.Е., Горлов И.Ф.
Журнал: Вестник Омского государственного аграрного университета @vestnik-omgau
Рубрика: Ветеринария и зоотехния
Статья в выпуске: 2 (54), 2024 года.
Бесплатный доступ
Целью исследования было изучение полиморфизма гена CAPN1 у крупного рогатого скота калмыцкой и казахской белоголовой пород, принадлежащих СПК «Плодовитое» Малодербетовского района Республики Калмыкия) и КФХ «Шапиевой Н.Ш.» Приволжского района Астраханской области. У крупного рогатого скота калмыцкой породы было отобрано 60 образцов, казахской белоголовой - 51. Экстракция ДНК из образцов крови проведена на системе автоматического выделения нуклеиновых кислот Auto-Pure mini, Allsheng. Генотипирование - на приборе для проведения полимеразной цепной реакции в режиме реального времени Rotor-Gene Q. По результатам исследования среди калмыцкого скота с гомозиготными генотипами СС и CG выявлено 14 и 36 гол. соответственно, с гетерозиготным - 10 гол. В стаде крупного рогатого скота казахской белоголовой породы получены следующие результаты: с генотипом CC - 4 гол., с генотипом CG - 9 гол., с генотипом GG - 38 гол. Анализ генетической структуры по гену CAPN1 показал, что частота встречаемости желательного аллеля С у калмыцкого скота составила 32%, у скота казахской белоголовой породы - 17%, частота аллеля G у калмыцкой породы - 68%, казахской белоголовой - 83%. Частота встречаемости генотипа CC: у калмыцкой породы - 23%, у казахской белоголовой - 8%. С наибольшей частотой в обоих исследованных поголовьях встречается генотип GG (60 - 74%). Показатель наблюдаемой гетерозиготности у крупного рогатого скота калмыцкой (0,17) и казахской белоголовой пород (0,18) практически на одном уровне. Индекс фиксации у крупного рогатого скота калмыцкой и казахской белоголовой пород составляет 0,6 и 0,3 соответственно, свидетельствуя о значительном недостатке гетерозигот. В обоих исследованных поголовьях отмечено превышение ожидаемой гетерозиготности над наблюдаемой.
Калмыцкий скот, казахский белоголовый скот, полиморфизм генов, capn1, генотип
Короткий адрес: https://sciup.org/142241276
IDR: 142241276 | УДК: 636.082:636.082.11
Polymorphism of gene CAPN1 of cattle of Kalmyk and Kazakh white-headed breeds
The aim of the research is studying of polymorphism of gene CAPN1 in cattle of Kalmyk and Kazakh white-headed breeds, belonging to the agricultural productive cooperative “Plodovitoe” of Maloderbetovsky district of the Republic of Kalmykia and the farm “Shapieva N.S.” of the Privolzhsky district of the Asrakhan region. They were taken 60 samples from Kalmyk cattle, 51 samples from Kazakh white-headed cattle. Extraction of DNA of blood samples was performed on the system of automatic extraction of nucleic acids Auto-Pure mini, Allsheng. Genotyping was performed with a device Roto-Gene Q used to carry out polymerase chain reaction on a real time. As a result of the given research among the animals of the Kalmyk cattle 14 and 36 heads with homozygous genotypes CC and CG were revealed, respectively, and 10 heads with heterozygous were revealed. In a herd of cattle of the Kazakh white-headed breed the following results: with genotype CC - 4 heads, with genotype CG - 9 heads, with genotype GG - 38 heads were obtained. Analysis of the genetic structure of the CAPN1 gene showed that the frequency of occurrence of the desired C allele in Kalmyk cattle was 2%, in the cattle of the Kazakh white-headed breed - 17%, the frequency of the G allele in the Kalmyk breed - 68%, Kazakh white-headed - 83%. The frequency of occurrence of the CC genotype was: in the Kalmyk breed - 23%, in the Kazakh white-headed 8%. The GG gene type is found with the highest frequency in both studied livestock (60-74%). The indicator of observed heterozygosity in cattle of Kalmyk (0,17) and Kazakh white-headed breeds (0,18) is almost at the same level. The fixation index in cattle of the Kalmyk and Kazakh white-headed breeds is 0,6 and 0.3, respectively, what indicates a significant lack of heterozygotes. In both of the livestock studied by us, there is an exceeding of the expected heterozygosity over the observed one.
Список литературы Полиморфизм гена CAPN1 крупного рогатого скота калмыцкой и казахской белоголовой пород
- Колпаков В.И. Влияние некоторых полиморфных генов на мясную продуктивность и качество мяса у крупного рогатого скота (обзор) // Животноводство и кормопроизводство. 2020. № 4. С. 47–64.
- Анализ полиморфизма генов CAPN1 и GH у скота казахской белоголовой породы в связи с особенностями мясной продуктивности / М.И. Селионова, В.Р. Плахтюкова, И.И. Дмитрик [и др.] // Главный зоотехник. 2020. № 6.
- Габидулин В.М., Алимова С.А., Салихов А.А. Результаты полиморфизма гена cаpn1, ассоциированного с показателями продуктивности скота абердин-ангусской породы // Известия ОГАУ. 2019. № 5 (79). С. 238-240.
- Макаев Ш.А., Герасимов Н.П. Влияние генотипа быков-отцов казахской белоголовой породы по генам CAPN1, CAST и TG5 на качественные показатели мяса у потомков // Животноводство и кормопроизводство. 2020. № 3. С. 102–113.
- Суржикова Е.С., Дубовскова М.П., Герасимов Н.П. Полиморфизм генов CAPN1 (C.316 C > G), TG5 (C. 422C > T), GH (C. 2141C > G), LEP (C. 73C > T) у молодняка мясного скота герефордской породы став-ропольской популяции // Животноводство и кормопроиз-водство. 2021. № 4. С. 67–78.
- Гуринович Г.В., Хренов В.А., Патракова И.С. Сравнительная оценка качества говядины в зависимости от условий созревания // Ползуновский вестник. 2022. № 1. С. 73–78.
- Исследование полиморфизма RS17872000 в генах кальпаина (CAPN1) и RS109221039 кальпастатина (CASТ) у крупного рогатого скота мясного направления продуктивности / Е.Л. Романишко, А.И. Киреева, М.Е. Михайлова [и др.] // Молекулярная и прикладная гене-тика. 2022. Т. 32. С. 88–96.
- Dzhulamanov, K., Gerasimov, N., Dubovskova, M., & Baktygalieva, A. (2019). Polymorphisms of CAPN1, CAST, GDF5, TG5 and GH genes in Russian Hereford cattle. Bulgarian Journal of Agricultural Science, 25(2), 375–379.
- Тюлебаев С.Д., Кадышева М.Д. Влияние поли-морфных генов на качественные показатели мясной про-дукции // Вестник РГАТУ. 2021. № 2. С. 50–56.
- Gill J.L., Bishop S.C., McCorquodale C., Williams J.L., Wiener P. Association of selected SNP with carcass and taste panel assessed meat quality traits in a com-mercial population of Aberdeen Angus-sired beef cattle. Genet Sel Evol. 2009 Jun 25;41(1):36. doi: 10.1186/1297-9686-41-36. PMID: 19555501; PMCID: PMC2714298.
- Juszczuk-Kubiak E., Sakowski T., Flisikowski K., Wiciñska K., Oprz'dek J., Rosochacki S.J. Bovine μ-calpain (CAPN1) gene: new SNP within intron 14. J. Appl. Genet. 45(4), 2004, pp. 457–460.
- Полиморфизм генов мясной продуктивности и его использование в селекции крупного рогатого скота / М.И. Селионова, Л.Н. Чижова, Г.Т. Бобрышова [и др.] // Материалы 83-й Междунар. науч.-практ. конф. «Инновационные технологии в сельском хозяйстве, ветеринарии и пищевой промышленности». Сб. тр. конф. 2018. С. 302–308.
- Евстафьева Л.В., Евстафьев Д.М. Полиморфизм гена кальпаина и его связь со скоростью роста телочек абердин-ангусской породы // Материалы Между-нар. науч. конф. молодых ученых и специалистов, посвящ. 135-летию со дня рождения А.Н. Костякова: сб. ст. 2022. Т. 1.С 284–288.
- ДНК-генотипирование по генам CAPN1, GH, LEP ремонтного молодняка крупного рогатого скота мясного направления продуктивности / Е.С. Суржикова, Д.Д. Евлагина, Т.Н. Михайленко [и др.] // Сельскохозяйственный журнал. 2023. № 2 (16). С. 108–116.
- ДНК-анализ полиморфизма генов миостатина, лептина и кальпаина 1 у российской популяции крупного рогатого скота абердин-ангусской породы / Е.Н. Коновалова, М.И. Селионова., Е.А. Гладырь [и др.] // Сельскохозяйственная биология. 2023. Т. 58. № 4. С. 622–637.
- Сонич Н.А. Технологические свойства говядины герефорд х черно-пестрых быков в зависимости от генотипов по генам миостатина (MSTN), тиреоглобулина (TG5) и кальпаина (CAPN1) // Животноводство и ветеринарная медицина. 2021. № 3. C. 22-25.
- Каюмов Ф.Г., Третьякова Р.Ф., Третьякова Н.А. Полиморфизм генов CAPN1, GH, TG5 и LEP у молодняка нового мясного типа адучи // Известия ОГАУ. 2021. №5 (91). С. 206–210.
