Влияние генотипов гена Стеарил-Коа-Десатуразы на энергию роста коров-первотелок голштинской породы

Автор: Сафина Н.Ю., Юльметьева Ю.Р., Ахметов Т.М., Шакиров Ш.К., Зиннатова Ф.Ф.

Журнал: Ученые записки Казанской государственной академии ветеринарной медицины им. Н.Э. Баумана @uchenye-zapiski-ksavm

Статья в выпуске: 3 т.231, 2017 года.

Бесплатный доступ

Представленное исследование посвящено влиянию полиморфизма гена Стеарил-КоА Десатуразы на энергию роста коров-первотелок голштинской породы. Тестирование ДНК проб крови показало, что ген SCD1 полиморфен для исследуемой популяции. В группе коров-первотелок (258 гол.) методом ПЦР-ПДРФ были идентифицированы все возможные генотипы. Частота встречаемости аллелей и генотипов составила: C - 0,61 и T - 0,39; СС - 38,4% (99 гол.), CT - 45,7% (118 гол.) и TT - 15,9% (41 гол.). Животные с генотипом SCD1TT выгодно отличались по живой массе от животных с генотипами SCD1CT SCD1CC, что подтверждает вероятность использования гена Стеарил-КоА Десатуразы в качестве гена-кандидата для селекционного отбора молодняка крупного рогатого скота.

Еще

Ген, полиморфизм, пцр-пдрф, стеарил-коа десатураза, крупный рогатый скот, первотелки, рост

Короткий адрес: https://sciup.org/14288971

IDR: 14288971

Текст научной статьи Влияние генотипов гена Стеарил-Коа-Десатуразы на энергию роста коров-первотелок голштинской породы

Эффективное использование молекулярных маркеров в селекции может оказаться экономически выгодным с целью улучшения производства молока, мяса, получения потомства, а так же выявления восприимчивости или резистентности к различным заболеваниям. Разработка технологий для идентификации полиморфизма в локусах различных генов дает представление о продвижении в области биотехнологии и генетике для улучшения здоровья животных и качества производимой ими продукции.

Стеарил-КоА Десатураза (SCD1) представляет собой фермент, ограничивающий скорость биосинтеза мононенасыщенных жирных кислот (MUFA) у крупного рогатого скота [6]. Ряд исследований подтверждают гипотезу о том, что регулирование гена SCD1 и его полиморфизм могут оказывать значительное влияние на миристиновую, линолевую, γ-линоленовую, содержание α-линоленовой, конъюгированной линолевой кислоты (CLA) и общее содержание жирных кислот, а так же качество и количество жира в мясе и молоке [4, 7]. Возраст, вид и порода животного влияют на экспрессию и активность гена SCD1, который специфически влияет на концентрацию мононенасыщенных жирных кислот. Высокая экспрессия SCD1 (высокий уровень содержания олеатов) способствует накоплению жира, что приводит к ожирению, в то время как снижение уровня SCD1 (низкий уровень олеатов) способствует сжиганию жира и худобе [8].

Цель данного исследования в том, что бы оценить частоты встречаемости генотипов и аллелей гена Стеарил-КоА-Десатуразы у коров первотелок и определить его влияние на энергию роста в разных стадиях физического развития.

Материалы и методики исследова- ний. В исследовании по генуSCD1–Fsp4HI было    идентифицировано258     коров- первотелок голштинской породы СХПК «Племзавода им. Ленина» Антинского района Республики Татарстан. Молекулярногенетические анализы проводились на базе «ТатНИИСХ» г. Казань.

Выделение ДНК из проб крови осуществлялось с применением готового набора «АмплиПрайм ДНК-сорб В» (ИнтерЛабСер-вис, Россия), в соответствии с инструкцией изготовителя. Генотипирование животных выполнялось по средствам метода полимеразной цепной реакции.Для амплификации использовалась реакционная смесь общим объемом 20 мкл, содержащая 2 мкл очищенной ДНК, 2 мкл смеси dNTPs, 2 мкл буфера, 0,2 мкл Taq ДНК полимеразы (СибЭнзим, Россия) и праймеры (Евроген, Россия) с оли-гонуклеотидной последовательностью:

16    SCD    –    F878:    5’    –

ATGTATGGATACCGCCCTTATGAC – 3’

16    SCD    –    F878:    3’    –

TTCTGGCACGTAACCTAATACCCTAAGC – 3’.

Амплификацию смеси ПЦР проводили при следующих температурно-временных режимах: 1 цикл 94° С – 5 мин.; 40 циклов 94° С – 15 сек., 65° С – 15 сек., 72° С – 15 сек.; 1 цикл 72° С – 7 мин, в аппарате «T100 Thermal Cycler» (Bio-Rad, США). Расщепление полученныхПЦР-проб выполнялось эндонуклеазой ристрикции Fsp4HI (СибЭнзим, Россия) при температуре 37° С в течение 16 ч. Электрофоретическое разделение ПДРФ-продуктов с последующей визуализацией в УФ-трансиллюминаторе (Bio-Rad, США) выполнялось в 2% агарозном геле в 10хТБЕ буфере в течение 30 мин. в присутствии эти-диума бромида.

В работе так же была использована электронная картотека «СЕЛЭКС», содержащая данные об исследуемой популяции. Расчеты были выполнены с применением статистических формул программы MSExcel. Уровень достоверности полученных результатов подвергался проверке по критерию

Стьюдента. Генетическое равновесие по изучаемому гену SCD1 тестировалось согласно закону Харди-Вайнберга и метода хи-квадрат (χ2).

Частота аллелей вычислялось по формуле Г.Н. Шангина-Березовского (1983) [1]:

f = -, где f – частота аллели, n – количество голов заданного генотипа,

N – количество голов в изучаемой популяции.

Абсолютный среднесуточный и относительный прирост вычисляли по формулам:

A = W i - W o иА = ^^ * 1000, где

A – прирост,

W 1 –живая масса конечная,

W0 – живая масса начальная, t – интервал между взвешиваниями (сут.), а коэффициент, демонстрирующий энергию роста, по формуле С. Броди:

И/х- Wq -« ПАЛ/ s;;?;;^ * 100% ■ где

К

K – относительный прирост (%),

W 1 –живая масса конечная,

W 0 – живая масса начальная.

Результаты исследований. В ходе иден-      возможные генотипы: СС – 38,4% (99 гол.), тификации полиморфизма Стеарил-КоА Де-      CT – 45,7% (118 гол.) и TT – 15,9% (41 гол.).

сатуразы было установлено, что исследуемая      Частота встречаемости аллелей составила:C – популяция голштинских коров-первотелок       0,61 и T – 0,39 (табл. 1).

демонстрирует по гену SCD1– Fsp4HI все

Таблица 1 -Частота встречаемости аллелей и генотипов гена SCD1

Хозяйство

N

Генотипы

Частота аллелей

CC

CT

TT

n

%

n

%

n

%

C

T

СХПК ПЗ им Лени-

Н*

258

99

38,4

118

45,7

41

15,9

0,61

0,39

0,07

на

О**

98

38,1

123

47,4

37

14,5

Примечание: *Н – наблюдаемое распределение, **О - ожидаемое распределение

Преобладание аллеля C над аллелем T по локусу SCD1 так же было замечено другими авторами [3, 10]. Avilés С. и др., исследовавшие французский скот Шароле, описывали схожую вариабельность по аллелям C (0,61) и T (0,39) и генотипам CC, CT и TT – 39, 44 и 17% соответственно. В своем опыте F. Signorelli и др., при изучении частоты встречаемости аллелей гена SCD1 у разных пород, так же идентифицировали у голштинского крупного рогатого скота превосходство аллеля C (0,65) над аллелем T (0,35) [9]. В то же время Сулимовой и др. в своей работе отмечается отсутствие генотипа TT– 0% среди изучаемой популяции голштинского скота и подавляющее большинство гетерозиготныхCT особей - 61,8%, над гомозиготными CC - 38,2% [2].

Рисунок 1 –Динамика роста коров-первотелок с различными генотипами SCD1

Эти различия в изменчивости и частоте встречаемости аллеля подтверждают важность подробных анализов в каждой конкретной популяции, поскольку аллельные частоты сильно варьируются даже в пределах пород.

Данные, проиллюстрированные на рисунке 1, демонстрируют динамику роста коров-первотелок во время контрольных взвешиваний на разных этапах развития.

По представленным показателям можно проследить, что животные с генотипом SCD1TT при рождении имели наименьшую живую массу – 29,9 кг, отставая от животных с генотипами SCD1CT и SCD1CC на 1,5 кг и

1,2 кг (P≤0,001) соответственно. Однако на протяжении последующих контрольных измерений (6, 12 и 18 мес.) эта группа животных обладала наилучшими показателями живой массы. Разница между массой первотелок TT и минимальной массой первотелок CCсоставляла: в 6 мес. – 1 кг (0,6%), в 12 мес. – 11 кг (3,5%), в 18 мес. – 13,8 кг (3,2%) (P≤0,001). Коровы-первотелки SCD1CTпри рождении имели наибольшую живую массу, однако при последующих измерениях их результаты были средними по исследуемой популяции. Худшие показатели динамики роста продемонстрировали особи с генотипом CCSCD1-гена (рис. 2).

Возрастные периоды, мес

Рисунок 2 – Коэффициент энергии роста коров-первотелок с различными генотипами SCD1

Судя по коэффициенту энергии роста, наибольшим потенциалом в физическом раз- витии обладают животные с генотипом SCD1TT, а наименьшим SCD1CC. Такое заключение можно сделать, оценив данные о

среднесуточном и относительном приросте изучаемого поголовья (рис. 3).

Рисунок 3 – Среднесуточный и относительный прирост коров-первотелок с различными генотипами SCD1

В возрастной период от 6 до 12 мес. хорошо заметно превосходство в привесах у коров-первотелок: генотипа TT (805 г) по сравнению с CT (761 г) и CC (749 г) – в среднесуточном; 145 кг, 137 кг, 134,8 кг соответственно – в относительном. В процентном соотношении масса животных TTвысоко достовернопревалировала над CT на 5,52%, а над CC на 7,03% (P≤0,001). К возрасту 18 мес. живая масса коров-первотелок SCD1TT достигла 426,2 кг, что на 7,1 кг (1,67%) (P≤0,001) больше живой массы коров-первотелок SCD1CT и на 13,8 кг (3,24%) (P≤0,001)больше живой массы коров-первотелок SCD1CC.

Хотелось бы отметить, что полиморфизм гена SCD1 мало освещен отечественными исследователями. В основном к его изучению подходят в разрезе оказываемого влияния на качественный состав молочного жира и мраморности (нежности) мяса. В гене SCD описана замена Т на С, приводящая к замене аминокислоты валин (Val.) на аланин (Ala.) [5]. Однако информация, опубликованная J. Ntambi, об экспрессии гена SCD1 и существующей в связи с этим ассоциацией с ожирением и худобой [8], дает нам возмож- ность предположить о возможной взаимосвязи этого гена с энергией роста, физическим развитием и хозяйственно-полезной скороспелостью крупного рогатого скота.

Заключение. Исследование гена Стеа-рил-КоА Десатуразы в популяции коров-первотелок голштинской породы показало, что ген полиморфен в изучаемом поголовье и вероятно оказывает воздействие на энергию роста. Эти результаты указывают на возможное использование SCD1 как гена-кандидата в программах селекции, но требуют дополнительного исследования и детального рассмотрения на больших популяциях крупного рогатого скота.

Резюме

Представленное исследование посвящено влиянию полиморфизма гена Стеарил-КоА Десатуразы на энергию роста коров-первотелок голштинской породы. Тестирование ДНК проб крови показало, что ген SCD1 полиморфен для исследуемой популяции. В группе коров-первотелок (258 гол.) методом ПЦР-ПДРФ были идентифицированы все возможные генотипы. Частота встречаемости аллелей и генотипов составила: C – 0,61 и T – 0,39; СС – 38,4% (99 гол.), CT – 45,7% (118 гол.) и TT – 15,9% (41 гол.). Животные с генотипом SCD1TT выгодно отличались по живой массе от животных с генотипами SCD1CTи SCD1CC, что подтверждает вероятность использования гена Стеарил-КоА Десатуразы в качестве гена-кандидата для селекционного отбора молодняка крупного рогатого скота.

Список литературы Влияние генотипов гена Стеарил-Коа-Десатуразы на энергию роста коров-первотелок голштинской породы

  • Меркурьева, Е.К. Генетика с основами биометрии/Е.К. Меркурьева, Г.Н. Шангин-Березовский -М.: Колос, 1983. -400 c.
  • Сулимова, Г.Е. Оценка генетического потенциала отечественного скота по признакам высокого качества мяса на основе ДНК-маркерных систем/Г.Е. Сулимова, А.А. Федюнин, Е.А. Климов, Ю.А. Столповский//Проблемы биологии продуктивных животных. -2011. -№ 1. -С. 62-64.
  • Associations between DGAT1, FABP4, LEP, RORC, and SCD1 gene polymorphisms and fat deposition in Spanish commercial beef//C. Avilés, O. Polvillo, F. Pena, M. Juârez, A. L. Martinez, and A. Molina/Journal Dairy Science. 2013. Vol. 91. PP. 4571-4577.
  • Horecky C., Knoll A. Association of single nucleotide polymorphism in TG, LEP and SCD1 genes with carcass traits in highland and galloway cattle/Mendel University, Faculty of Agronomy. 2013. PP. 732-736.
  • Kelsey, J.A., Corl, B.A., Collier, R.J., Bauman, D.E. The effect of breed, parity and stage of lactation on conjugated linoleic acid (CLA) in milk fat from dairy cows. Journal Dairy Science. 2003. Vol. 86. PP. 2588-2597.
  • Milanesi E., Nicoloso L., Crepaldi P. Stearoyl CoA desaturase gene polymorphism in Italian cattle breeds/Italian Journal of Animal Science. 2007. Vol. 6 (1). PP. 167-167.
  • Moioli B., Contarini G., Avalli A., Catillo G., Orru L., et al. Effect of stearoyl-coenzyme Adesaturase polymorphism on fatty acid composition of milk. Journal Dairy Science. 2007.Vol. 90. PP. 3553-3558.
  • Ntambi, J.M. Stearoyl-CoA Desaturase Genes in Lipid Metabolism/New York: Springer Science Business Media, 2013. p. 27-36. ISBN 978-1-4614-7969-7.
  • Signorelli F. et al. Exploring polymorphisms and effects on milk traits of the DGAT1, SCD1 and GHR genes in four cattle breeds//Federica Signorellia, Luigi Orrùb, Francesco Napolitanoa, Giovanna De Matteisa, Maria Carmela Scatàa, GennaroCatilloa, CinziaMarchitellic, Bianca Moiolia/Livestock Science. 2009. № 125. PP. 74-79.
  • The association of CAPN1, CAST, SCD, and FASN polymorphisms with beef quality traits in commercial crossbred cattle in the Czech Republic//K. Kaplanovâ, A. Dufek, E. Drackovâ, J. Simeonovovâ, J. Subrt, I. Vrtkovâ, J. Dvorâk/Czech Journal Animal Science. 2013. Vol. 58(11): 489-496.
Еще
Статья научная