О поиске универсальных параметров для моделей морфогенеза
Автор: Назаров Максим Николаевич
Журнал: Владикавказский математический журнал @vmj-ru
Статья в выпуске: 3 т.15, 2013 года.
Бесплатный доступ
Параметры моделей морфогенеза можно считать универсальными в том случае, если они обладают биологическим смыслом и их значения могут быть свободно переносимы между моделями разных классов. В рамках данной работы в качестве основного управляющего активностью клеток механизма был выбран обмен химическими межклеточными сигналами. Для данного случая получен набор универсальных параметров, и на его основе построены две модели морфогенеза: дискретная имитационная и усредненная количественная.
Моделирование морфогенеза, межклеточный сигнальный обмен, согласование моделей разных классов
Короткий адрес: https://sciup.org/14318431
IDR: 14318431 | УДК: 517.958:57+519.710.22
The search for universal parameters for the models of morphogenesis
The parameters of models of morphogenesis can be considered universal in case they have biological meaning and their values can be freely exchanged between models of different classes. In the scope of this work exchange of chemical intercellular signals was chosen as the main mechanism controlling the activity of cells. For this case a set of universal parameters was obtained and it two models of morphogenesis, the discrete imitational and the average quantitative one, were built on this base.
Список литературы О поиске универсальных параметров для моделей морфогенеза
- Лазарева Г. Г., Миронова В. В., Омельянчук Н. А., Шваб И. В., Вшивков В. А., Горпинченко Д. Н., Николаев С. В., Колчанов Н. А. Математическое моделирование морфогенеза растений//Сиб. журн. вычисл. мат.-2008.-Т. 11, вып. 2.-С. 151-166.
- Diaz J., Alvarez-Buyalla E. R. {A model of the ethylene signaling pathway and its gene response in Arabidopsis thaliana: pathway cross-talk and noise-filtering properties//Chaos.-2006.-Vol. 16, \No 2.-P. 100-115.
- Mendoza L., Thieffry D., Alvarez-Buylla E. R. Genetic control of flower morphogenesis in Arabidopsis thaliana: a logical analysis//Chaos.-1999.-Vol. 15, \No 7.-P. 593-606.
- Lexa M., Genkov T., Malbeck J., Machakova I., Brzobohaty B. Dynamics of Endogenous Cytokinin Pools in Tobacco Seedlings: a Modelling Approach//Annals of Botany.-2003.-Vol. 91, \No 5.-P. 585-597.
- Dumais J., Shaw S. L., Steele C. R., Long S. R., Ray P. M. An anisotropic-viscoplastic model of plant cell morphogenesis by tip growth//Int. J. Dev. Biol.-2006.-Vol. 50, \No 2-3.-P. 209-222.
- Geitmann A., Ortega J. K. E. Mechanics and modeling of plant cell growth//Trends in Plant Science.-2009.-Vol. 14, \No 9.-P. 467-478.
- Mjolsness E., Sharp D. H. and Reinitz J. A connectionist model of development//J. Theor. Biol.-1991.-Vol. 152, \No 4.-P. 429-453.
- Urdy S. Principles of morphogenesis: the contribution of cellular automata models//Acta Zoologica.-2009.-Vol. 90, \No 2.-P. 205-208.
- Belousov L. V. The Dynamic Architecture of a Developing Organism: Dordrecht.-Kluwer Acad. Publ., 1998.-248 p.
- Belousov L. V. Morphomechanics: goals, basic experiments and models//Int. J. Dev. Biol.-2006.-Vol.50, \No 2.-P. 81-92.