Палеогенетический анализ жителей Подола Московского кремля XIV в. (по материалам раскопок в Тайницком саду)
Автор: Альборова Ирина Эдуардовна, Мустафин Харис Харрасович, Медникова Мария Борисовна, Бужилова Александра Петровна, Энговатова Ася Викторовна
Журнал: Вестник ВолГУ. Серия: История. Регионоведение. Международные отношения @hfrir-jvolsu
Рубрика: Археология Евразийских степей
Статья в выпуске: 5 т.26, 2021 года.
Бесплатный доступ
В статье представлены результаты палеогенетических исследований средневековых останков трех человек, найденных в закрытом археологическом комплексе, датируемом второй половиной XIV в., на территории Тайницкого сада в Московском Кремле (сооружение № 32 из раскопок 2007 г. под руководством Н.А. Макарова). Люди погибли одновременно в результате пожара, вероятно, во время разорения Москвы войсками Тохтамыша в августе 1382 года. Комплекс содержал останки двух взрослых и ребенка 3-4 лет, оставшихся непогребенными. Целью данной работы было генетическое исследование древней ДНК останков людей, погибших в XIV в., уточнение их половой принадлежности, определение родства и предположительного происхождения. Для проведения генетической экспертизы были отобраны зубы (постоянные для взрослых, молочный для ребенка). Алгоритм лабораторного исследования включал комплекс мер по защите археологической ДНК от контаминации, пробоподготовку и выделение ДНК из зубных остатков, анализ STR маркеров Y-хромосомы у мужских индивидуумов, анализ Alu-маркеров аутосомных хромосом, таргетное NGS секвенирование гипервариабельных сегментов митохондриальной ДНК. С помощью методов молекулярно-генетических исследований удалось подтвердить, что в огне погибли мужчина, молодая женщина и ребенок (мальчик). По результату анализа аутосомных маркеров с высокой долей вероятности (99,9 %) выявлено близкое биологическое родство женщины и ребенка (мать - сын). Мужчина не был родственником ни женщине, ни ребенку. Выявленные у всех трех индивидуумов гаплогруппы митохондриальной ДНК и STR маркеров Y-хромосомы у мужчин в целом характерны для славянского населения современной Европы. Митохондриальная гаплогруппа J1c, обнаруженная у матери и ребенка, в наше время распространена у жителей Европы. У мужчины выявлена митохондриальная гаплогруппа К2, которая встречается главным образом в Северо-Западной Европе. Вклад авторов. И.Э. Альборова и Х.Х. Мустафин производили палеогенетический анализ. А.В. Энговатова исследовала археологический контекст. А.П. Бужилова и М.Б. Медникова исследовали антропологические материалы, производили отбор образцов для анализа древней ДНК. Все авторы принимали участие в подготовке текста статьи.
Археология средневековья, московский кремль, палеоантропология, генетические исследования, древняя днк, y-хромосома, мтднк, секвенирование
Короткий адрес: https://sciup.org/149139469
IDR: 149139469 | DOI: 10.15688/jvolsu4.2021.5.3
Список литературы Палеогенетический анализ жителей Подола Московского кремля XIV в. (по материалам раскопок в Тайницком саду)
- Антропологические находки из средневековых слоев Тайницкого сада (по материалам раскопок в Московском Кремле в 2007 г.) / А. П. Бужи-лова, М. Б. Медникова, А. В. Энговатова, В. Ю. Коваль // Российская археология. - 2019. - № 3. -С. 171-191.
- Археология Московского Кремля. Раскопки 2016-2017 гг. / ред.: Н. А. Макаров, В. Ю. Коваль. - М. : ИА РАН, 2018. - 164 с.
- Балановский, О. П. Генофонд Европы / О. П. Балановский. - М. : Товарищество научных изданий КМК, 2015. - 354 с.
- Два необычных захоронения эпохи позднего средневековья в бахчисарайском районе республики Крым / С. В. Сиротин, Д. С. Богачук, А. А. Во-лошинов, А. А. Тарасова, Х. Х. Мустафин, И. Э. Аль-борова // Краткие сообщения Института археологии. - 2019. - № 256. - С. 293-307.
- Дубровин, Г. Е. Усадебная застройка раскопа 1 в Тайницком саду Московского Кремля (предварительная публикация) / Г. Е. Дубровин, В. Ю. Коваль // Археология Подмосковья : материалы научного семинара. - М. : ИА РАН, 2014. -Вып. 10. - С. 94-110.
- Исторический контекст в свете естественнонаучных исследований (по материалам раскопок ИА РАН в Московском Кремле в 2007 г.) / А. В. Энговатова, А. Е. Черкинский, В. Ю. Коваль, А. Ю. Сергеев, Е. Ю. Лебедева, М. Б. Медникова // Российская археология. - 2021. - № 2. - С. 167-185.
- Орфинская, О. В. Исследование текстиля XV века из раскопок 2007 года / О. В. Орфинская // «Московский Кремль», государственный историко-культурный музей-заповедник : материалы и исследования. - М. : ФГУ «Гос. ист.-культур. музей-заповедник "Московский Кремль"», 2016. -Вып. 27. - С. 268-281.
- Панова, Т. Д. Отчет об охранных археологических раскопках на территории Тайницкого сада в Московском Кремле в 2007 году / Т. Д. Панова, В. Ю. Коваль // Архив ИА РАН. - Р-1. - Ф-1. -№ 29009. - М. : ИА РАН, 2008.
- Пежемский, Д. В. Опыт антропологического исследования останков из камерных погребений Старовознесенского некрополя Пскова / Д. В. Пе-жемский // Древнерусский некрополь Пскова X -начала XI века. - СПб. : Нестор-История, 2016. -Т. 2. - С. 560-578.
- Подол Московского Кремля по материалам археологических исследований / В. Ю. Коваль, Т. Д. Панова, Н. А. Кренке, Г. Е. Дубровин, А. С. Алешинская, А. А. Карпухин // Вестник РФФИ. Гуманитарные и общественные науки. -2017. - № 4 (89). - С. 35-47.
- Стасюк, И. В. «Славянская колонизация» водской земли: историография, проблемы, новые подходы / И. В. Стасюк, Х. Х. Мустафин, И. Э. Аль-борова // Stratum plus. Археология и культурная антропология. - 2020. - № 5. - С. 347-361.
- Ancient DNA Analysis of 8000 B.C. Near Eastern Farmers Supports an Early Neolithic Pioneer Maritime Colonization of Mainland Europe through Cyprus and the Aegean Islands / E. Fernández, A. Pérez-Pérez, C. Gamba, E. Prats, P. Cuesta, J. Anfruns, M. Molist, E. Arroyo-Pardo, D. Turbón // PLoS Genet. -2014. - № 10 (6). - P. 1-16.
- Complete mitochondrial genome sequence of a Middle Pleistocene cave bear reconstructed from ultrashort DNA fragments / J. Dabney, M. Knapp, I. Glocke [et al.] // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 2013. - № 110. - Р. 15758-15763. -DOI: https://doi.org/10. 1073/pnas.1314445110.
- Early farmers from across Europe directly descended from Neolithic Aegeans / Z. Hofmanová, S. Kreutzer, G. Hellenthal, Ch. Sell, Y. Diekmann, D. Díez-del-Molino, L. van Dorp, S. López, A. Kousathanas, V. Link, V. Kirsanow, L. M. Cassidy, R. Martiniano, M. Strobel, M. Scheu, K. Kotsakis, P. Halstead, S. Triantaphyllou, N. Kyparissi-Apostolika, D. Urem-Kotsou, C. Ziota, F. Adaktylou, Sh. Gopalan, D. M. Bobo, L. Winkelbach, J. Blöcher, Unterländer, C. Leuenberger, C. Qilingiroglu, B. Horejs, M. F. Gerritsen, S. J. Shennan, D. G. Bradley, M. Currat, Krishna R. Veeramah, D. Wegmann, M. G. Thomas, C. Papageorgopoulou, J. Burger // PNAS. - 2016. - № 113 (25). - P. 6886-6891. -DOI: https://doi.org/10.1073/pnas. 1523951113.
- Genome-wide patterns of selection in 230 ancient Eurasians / I. Mathieson, I. Lazaridis, N. Rohland [et al.] // Nature. - 2015. - № 528. - P. 499503. - DOI: https://doi.org/10.1038/nature16152.
- Haplogroup analysis for a Medieval Russian burial оf 16th-17th centures in Radonezh (Moscow Area) / Kh. Kh. Mustafin, I. E. Alborova, A. S. Semenov, V. I. Vishnevsky // Studia Slavica et Balcanica Petropolitana. - 2018. - № 2. - P. 169-180. - DOI: https:// doi.org/10.21638/spbu19.2018.209.
- Kling, D. Familias 3 - extensions and new functionality / D. Kling, A. O. Tillmar, T. Egeland // Forensic Sci Int Genet. - 2014. - № 13. - P. 121127. - DOI: https://doi.org/10.1016/jisigen.2014.07.004.
- McLaren, W. The Ensembl Variant Effect Predictor / W. McLaren, L. Gil, S. E. Hunt [et al.] // Genome Biol. - 2016. - № 17. - P. 122. - DOI: https://doi.org/ 10.1186/s13059-016-0974-4.
- Mitochondrial DNA analysis of a Viking age mass grave in Swede Forensic Sci Int Genet / M. M. Bus, M. Lembring, A. Kjellström, C. Strobl, B. Zimmermann, W. Parson, M. Allen. - 2019. - № 42. - Р. 268-274. -DOI: https://doi.org/10.1016/j.fsigen. 2019.06.002.
- Mitochondrial DNA Signals of Late Glacial Recolonization of Europe from Near Eastern Refugia / M. Pala [et al.] // The American Journal of Human Genetics. - May 4, 2012. - № 90 (5). - P. 915-924. -DOI: https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2012.04.003.
- Schmieder, R. Quality control and preprocessing of metagenomic datasets / R. Schmieder, R. Edwards // Bioinformatics OxfordAcademic. - 2011. - № 27. - P. 863864. - DOI: https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btr026.
- The Genome Analysis Toolkit: A MapReduce framework for analyzing next-generation DNA sequencing data / A. McKenna, M. Hanna, E. Banks [et al.] // Genome Res. - 2010. - №20. - P. 1297-1303. -DOI: https://doi.org/10.1101/gr. 107524.110.
- The mitochondrial lineage U8a reveals a Paleolithic settlement in the Basque country / A. González [et al.] // BMC Genomics. - 2006. - № 7 (124). - P. 1-7.
- The phylogenetic and geographic structure of Y-chromosome haplogroup R1a / P. A. Underhill, G. D. Poznik, S. Rootsi [et al.] // European Journal of Human Genetics. - 2015. - № 23. - P. 124-131. -DOI: https://doi.org/10.1038/ejhg.2014.50.