Полнопрофильный анализ микробиома целинного светлого солонца Джаныбекского стационара
Автор: Чернов Т.И., Тхакахова А.К., Лебедева М.П., Кутовая О.В.
Журнал: Бюллетень Почвенного института им. В.В. Докучаева @byulleten-esoil
Статья в выпуске: 77, 2015 года.
Бесплатный доступ
Проведено исследование структуры микробиома целинного светлого гидрометаморфизованного мелкого солонца с использованием молекулярно-генетических (анализ прокариотного метагенома) и культуральных методов. Выявлена резкая дифференциация прокариотного разнообразия (по количеству OTU, индексу Шеннона и Chao1) по профилю. Отмечаются общие черты микробиомов солонцового горизонта и нижней части профиля (низкое биоразнообразие, доминирование некоторых представителей филума Proteobacteria ). Необычно высокую (почти 20% сообщества) долю в надсолонцовом горизонте почвы занимают археи группы Thaumarchaeota.
Солонцы, метагеном, почвенные микроорганизмы, пиросеквенирование, 16s ррнк, биоразнообразие
Короткий адрес: https://sciup.org/14313605
IDR: 14313605
Список литературы Полнопрофильный анализ микробиома целинного светлого солонца Джаныбекского стационара
- Андронов Е.Е., Пинаев А.Г., Першина Е.В., Чижевская Е.П. Выделение ДНК из образцов почвы (методические указания). СПб: ВНИИСХМ РАСХН, 2011. 27 с.
- Классификация и диагностика почв России. Смоленск: Ойкумена, 2004. 342 с.
- Лебедева М.П., Конюшкова М.В. Временные изменения микропризнаков в целинных и мелиорированных солонцах Джаныбекского стационара//Почвоведение. 2011. № 7. С. 1-14
- Классификация и диагностика почв России. 2004. Ойкумена. 342 с.
- Першина Е.В., Тамазян Г.С., Дольник А.С., Пинаев А.Г., Сергалиев Н.Х., Андронов Е.Е. Изучение структуры микробного сообщества засоленных почв с использованием высокопроизводительного секвенирования//Экологическая генетика. 2012. Т. Х. № 2. С. 31-38.
- Роде А.А., Польский М.Н. Почвы Джаныбекского стационара, их морфологическое строение, механический и химический состав и физические свойства//Тр. Почв. ин-та им. В.В. Докучаева. М.: Изд-во АН СССР, 1961. Т. 56. С. 3-214.
- Сапанов М.К. Синхронность изменения уровней Каспийского моря и грунтовых вод в Северном Прикаспии во второй половине XX в.//Известия РАН. Сер. географическая. 2007. № 5. С. 82-87.
- Bates S., Berg-Lyons D., Caporaso J.G., Walters W. A., Knight R., Fierer N. Examining the global distribution of dominant archaeal populations in soil//ISME J. 2011. № 5. P. 908-917.
- Caporaso J.G., Kuczynski J., Stombaugh J. et al. QIIME allows analysis of high throughput community sequencing data//Nature methods. 2010. V. 7(5). P. 335-336.
- Microbiology of extreme soils/Eds. Dion P., Nautiyal C.S. Berlin/Heidelberg: Springer, 2008. 369 p.
- World Reference Base for Soil Resources. 2006, FAO, Rome. 128 р.
