Анализ генетического разнообразия и структуры популяций западной расы лиственницы сибирской Larix sibirica Ledeb. Урала на основе полиморфизма межмикросателлитных маркеров
Автор: Васильева Юлия Сергеевна, Пришнивская Яна Викторовна, Чертов Никита Валерьевич, Жуланов Андрей Александрович
Журнал: Бюллетень науки и практики @bulletennauki
Рубрика: Биологические науки
Статья в выпуске: 12 т.4, 2018 года.
Бесплатный доступ
Сохранение генетического разнообразия вида возможно только при условии сохранения генофонда его популяций. Особенно важны исследования закономерностей распределения генетической изменчивости для видов, занимающих обширные ареалы и имеющих хозяйственное значение, таких как виды рода Larix Mill. Целью данного исследования является анализ генетического разнообразия и структуры некоторых популяций L. sibirica Урала на основе полиморфизма межмикросателлитных маркеров. С использованием ISSR-маркеров проведен анализ генетического разнообразия и структуры 6 природных популяций лиственницы сибирской L. sibirica на Урале. В результате анализа выявлено 120 ISSR-маркеров, из которых 116 были полиморфными (Р95=0,967). Определены основные параметры генетического разнообразия популяций и показано, что уральские популяции лиственницы сибирской характеризуются более высоким генетическим разнообразием. При этом самые высокие показатели генетического разнообразия отмечены в популяции VSN (P95=0,923; HE=0,236; ne=1,388), а наименее разнообразной по всем показателям оказалась популяция ISH (P95=0,826; HE=0,191; ne=1,321)...
Генетическое разнообразие, генетическая структура, issr-маркеры, урал
Короткий адрес: https://sciup.org/14114922
IDR: 14114922 | DOI: 10.5281/zenodo.2255147
Список литературы Анализ генетического разнообразия и структуры популяций западной расы лиственницы сибирской Larix sibirica Ledeb. Урала на основе полиморфизма межмикросателлитных маркеров
- Янбаев Ю. А. Эколого-популяционные аспекты адаптации лесообразующих видов к условиям природной и техногенной среды: автореф. дисс. … д-ра биол. наук. Тольятти, 2002. 35 с.
- Путенихин В. П. Популяционная структура и сохранение генофонда хвойных видов на Урале: автореф. дисс.... д-ра биол. наук. Красноярск, 2000. 48 с.
- Петрова Е. А., Горошкевич С. Н., Белоконь М. М. Генетическое разнообразие кедра сибирского Pinus sibirica Du Tour: распределение вдоль широтного и долготного профилей//Генетика. 2014. Т. 50. №5. С. 538-553.
- Орешкова Н. В., Белоконь М. М., Жамъянсурен С. Генетическое разнообразие, популяционная структура и дифференциация лиственниц сибирской, Гмелина и Каяндера по данным SSR-маркеров//Генетика. 2013. Т. 49. №2. С.204-213.
- Биоразнообразие лиственниц Азиатской России/под ред. Л.И. Милютина, С.П. Ефремова. Новосибирск: Гео, 2010. 159 с.
- Ларионова A. Я., Яхнева Н. В., Абаимов А. П. Генетическое разнообразие и дифференциация популяций лиственницы Гмелина в Эвенкии (Средняя Сибирь//Генетика. 2004. Т. 40. №10. С. 1370-1377.
- Орешкова Н. В. Генетическая дифференциация сибирских видов лиственниц по данным изоферментного анализа//Растительный мир Азиатской России. 2012. №2 (10). C. 33-42.
- Семериков В. Л., Семерикова С. А., Полежаева М. А. Нуклеотидное разнообразие и неравновесие по сцеплению потенциально адаптивно значимых генов Larix sibirica//Генетика. 2013. Т. 49. №9. С. 1055-1064.
- Путенихин В. П., Фарукшина Г. Г., Шигапов З. Х. Лиственница Сукачева на Урале: изменчивость и популяционно-генетическая структура. М.: Наука, 2004. 276 с.
- Семериков В. Л., Ирошников А. И., Ласко М. Структура изменчивости митохондриальной ДНК и послеледниковая история лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.)//Экология. 2007. №3. С. 163-171.
- Дылис Н. В. Сибирская лиственница. Материалы к систематике, географии и истории. М.: Изд-во МОИП, 1947. 137 с.
- Шигапов З. Х., Шигапова А. И., Уразбахтина К. А.Генетическая изменчивость и популяционная структура лиственницы Сукачева на Урале//Вестник ОГУ. 2009. №6. С. 438-440.
- Rogers S. O., Bendich A. J. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummified plant tissues//Plant Molecular Biology. 1985. V. 5. №2. P. 69-76.
- Zietkiewicz E., Rafalski A., Labuda D. Genome fingerprinting by simple sequence repeat (SSR)-anchored polymerase chain reaction amplification//Genomics. 1994. V. 20. P. 176-183.
- Нечаева Ю.С. Молекулярно-генетический анализ природных популяций западной расы Larix sibirica Ledeb. (Larix sukaczewii Dyl.) на Среднем и Северном Урале: автореф. дисс.... канд. биол. наук. Уфа, 2015. 28 с.
- Yeh F. C., Young R. C., Mao J. POPGENE, the Microsoft Windows-based user-friendly software for population genetic analysis of co-dominant and dominant markers and quantitative traits. Department of Edmonton. Alta: Renewable Resources, Univ. of Alberta, 1999. 238 p.
- Nei M. Molecular evolutionary genetics. New York: Columbia University Press, 1987. 512 p.
- Nei M. Analysis of Gene Diversity in Subdivided Populations//Proceedings of the National Academy of Sciences. 1973. V. 70. №12. P. 3321-3323.
- Assoumane A., Zoubeirou A. M., Rodier-Goud M., Favreau B., Bezançon G., Verhaegen D. Highlighting the occurrence of tetraploidy in Acacia senegal (L.) Willd. and genetic variation patterns in its natural range revealed by DNA microsatellite markers//Tree Genetics & Genomes. 2013. V. 9. №1. P. 93-106.
- Nei M., Li W. H. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases//Proceedings of the National Academy of Sciences. 1979. V. 76. N№10. P. 5269-5273.
- Животовский Л. А. Популяционная биометрия. М.: Наука, 1991. 271 с.
- Адрианова И. Ю. Генетическая изменчивость и дифференциация лиственниц Камчатки, Сахалина и Курил//Сибирский лесной журнал. 2014. №4. С. 110-116.
- Абаимов А.П., Журавлев Ю.Н., Муратова Е.Н. и др. Популяционно-генетический анализ лиственниц Сибири и Дальнего Востока//Структурно-функциональная организация и динамика лесов: материалы всерос. науч. конф. Красноярск: Изд-во Сибирский федеральный ун-т, 2004. С. 294-296.
- Лисина А. Н. Генетическая изменчивость популяций лиственницы сибирской на основе данных ISSR-PCR анализа//Молодежь и наука: сборник материалов IХ Всероссийской научно-технической конференции Красноярск: Сибирский федеральный ун-т, 2013. Режим доступа: http://conf.sfu-kras.ru/sites/mn2013/section093.html (дата обращения 16.03.18).
- Полежаева М. А., Семериков В.Л. Генетическая изменчивость cpSSR маркеров в роде Larix на Дальнем Востоке//Вестник СВНЦ ДВО РАН. 2009. №2. С. 75-83.
- Zhang L., Zhang H.G., Li X.F.Analysis of genetic diversity in Larix gmelinii (Pinaceae) with RAPD and ISSR markers//Genet. Mol. Res. 2013. V. 12. №1. P. 196-207.
