Исследование влияния природы лигандов на связывание молекулярного водорода с половинной моделью активного центра [NiFе]-гидрогеназы

Еремина Анастасия Денисовна Кузубов Александр Александрович Варганов Сергей Александрович Лыхин Александр Олегович Сержантова Мария Викторовна

Журнал: Сибирский аэрокосмический журнал @vestnik-sibsau

Рубрика: Технологические процессы и материалы

Статья в выпуске: 4 (50), 2013 года.

Бесплатный доступ

Для описания половинной модели активного центра [NiFe]-гидрогеназы подобран функционал плотности. Методом связанных кластеров с учетом однократных и двукратных, а также трехкратных возбуждений по теории возмущения определены энергии связывания молекулярного водорода с двухвалентным атомом железа комплекса [FeCO(SCH 3) 2(CN) 2H 2] 2-. Показано, что атом железа в комплексах [Fe(SCH 3) 2(CO) 3H 2], [Fe(SCH 3) 2(CN) 3H 2] 3-, [FeCN(SCH 3) 2(CO) 2H 2] 1-, [FeCO(SCH 3) 2(CN) 2H 2] 2- находится в октаэдрическом поле лигандов. Исследовано связывание H 2 с атомом железа в зависимости от природы лигандов. Определено, что все смоделированные структуры являются комплексами Кубаса.

[nife]-гидрогеназа \ теория функционала плотности (dft)

Похожие статьи в разделе Физическая химия

Определение активного пространства метода самосогласованного поля для описания активных центров металлопротеинов
Определение активного пространства метода самосогласованного поля для описания активных центров металлопротеинов

Лыхин Александр Олегович, Кузубов Александр Александрович, Варганов Сергей Александрович, Сержантова Мария Викторовна, Елисеева Наталья Сергеевна

Квантово-химическое изучение процесса связывания молекулярного водорода активным центром [NiFe]-гидрогеназы
Квантово-химическое изучение процесса связывания молекулярного водорода активным центром [NiFe]-гидрогеназы

Калякин Данил Сергеевич, Варганов Сергей Александрович, Лыхин Александр Олегович, Кузубов Александр Александрович, Краснов Павел Олегович

Исследование взаимодействия водорода с границами зерен в α-FE
Исследование взаимодействия водорода с границами зерен в α-FE

Верховых Анастасия Владимировна, Окишев Константин Юрьевич, Мирзоев Александр Аминулаевич, Мирзаев Джалал Аминулович

DFT моделирование взаимодействия водорода с вакансией в ОЦК-железе
DFT моделирование взаимодействия водорода с вакансией в ОЦК-железе

Верховых Анастасия Владимировна, Мирзоев Александр Аминулаевич

Особенности термического поведения двойного комплекса [Ni(NH3)6]3[Fe(CN)6]2
Особенности термического поведения двойного комплекса [Ni(NH3)6]3[Fe(CN)6]2

Домонов Денис Петрович, Печенюк София Ивановна

Короткий адрес: https://sciup.org/148177146

IDS: 148177146   |   УДК: 544.1,

Influence of the ligands on the molecular hydrogen binding with a half-model of the [NiFe]-hydrogenase active site

The density functional for the characterization of the half-model [NiFe]-hydrogenase active site is defined. The binding energy of the molecular hydrogen with ferrous iron in [FeCO(SCH 3) 2(CN) 2H 2] 2- complex is determined by the coupled cluster with the full treatment singles and doubles and estimate to the connected triples contribution using many-body perturbation theory. The results show that ligands in [Fe(SCH 3) 2(CO) 3P 2], [Fe(SCH 3) 2(CN) 3H 2] 3-, [FeCN(SCH 3) 2(CO) 2H 2] 1, [FeCO(SCH 3) 2(CN) 2H 2] 2- complexes form a distorted octahedral coordination with ferrous iron. The substitution of the CO by CN ligand in complex [FeCO(SCH 3) 2(CN) 2H 2] 2- leads to the stabilization of molecular hydrogen in the vertex of octahedron and elongation H-H bond. It is determined that all modeled structures are Cubas complexes.