Аспекты медикаментозного лечения ВПГ-типа 1
Автор: Рунтала Ашиш
Журнал: Саратовский научно-медицинский журнал @ssmj
Рубрика: Глазные болезни
Статья в выпуске: 2 т.6, 2010 года.
Бесплатный доступ
Альфа-транспорт-индуцирующий фактор является вирионом вируса простого герпеса типа 1, покрытого протеином между капсидом и оболочкой, связанным с клеточными протеинами и обеспечивающий транспортную функцию. Альфа-транспорт-индуцирующий фактор стимулирует быструю расшифровку генетического ап¬парата ВПГ типа 1 в течение вирусной репликации. Наличие или отсутствие функционального альфа транспорт индуцирующего протеина в условиях эксперимента всегда связано с вирусной активностью. Его роль после перенесенной латентной вирусной инфекции ВПГ типа 1 - значительна. До настоящего времени не было раз¬работано лекарственных препаратов на основе протеина для лечения ВПГ типа 1. Поэтому его структурные особенности важны для создания нового препарата. Сравнительный анализ белка заключался в его поэтапном изучении. Четыре различные молекулярные лиганды, т.е. Аденозин -3'-5'-Дифосфат, Р1-(5'-Аденозил) Р4-(5'-(2'-Ди-окситимидил)) Тетрафосфат, 9-Гидроксиметилгуанин, 9-(4-Гидроксибутил)-1\12-Фенилгуанин - были взяты для изучения. В результате исследования Р1-(5'-Аденозил) Р4-(5'-(2'-Диокси-Тимидил) Тетрафосфат - оказался лучшей лигандой, т.к. показал наименьшую энергию - 9.238 ккал/моль. Доказано, что лучшая лиганда связывает различные части транспорт индуцирующего протеина и таким образом может быть выделен для успешной борьбы с ВПГ типа 1, с подобным эффектом множества лекарственных молекул в основе протеина
Короткий адрес: https://sciup.org/14917076
IDR: 14917076
Список литературы Аспекты медикаментозного лечения ВПГ-типа 1
- http://www.bionewsonline.com/5/what_is_protein.htm
- http://www.biosino.org/bioinformatics/0918-2-11.htm
- http://pathmicro.med.sc.edu/virol/herpes.htm
- http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/cgibin/pdbsum/GetPage.pl?doc=TRUE&pdbcode=n/a&template=doc_ procheckgf.html
- http://www.cgl.ucsf.edu/chimera/
- http://en.wikipedia.org/wiki/Protein_structure_prediction
- http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/Blast.cgi?CMD= Web&PAGE_TYPE=BlastHome
- http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/330316
- http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?cmd=Retrieve&d b=protein&dopt=GenPept&RID=Y8UF7YY4011&log%24=protto p&blast_rank=1&list_uids=5821769
- http://www.rcsb.org/pdb/explore/pubmed.do?structureId= 2Q9T
- http://hoppscore.lbl.gov/
- http://swift.cmbi.kun.nl/gv/whatcheck/
- ArgusLab 4.0.1, Mark A. Thompson, Planaria Software LLC, Seattle, WA, http://www.arguslab.com
- Ace C.I., Mckee T.A., Ryan J.M. et al. A herpes simplex virus type 1 mutant containing a nontransinducing a-TIF protein establishes latent infection in vivo in the absence of viral replication and reactivates efficiently from explanted trigeminal ganglia. J Virol. 1990, Vol. 64, suppl. 4. P.1630-1638.
- Laskowski R.A. MacArthur M.W. Moss D.S. et al. PROCHECk: a program to check the stereochemical quality of protein structures. J. Appl. Cryst. 1993. Vol. 26. P. 283-291.
- Naz A. Bano k. Bano F. et al. Conformational analysis (geometry optimization) of nucleosidic antitumor antibiotic show-domycin by Arguslab 4 software. Pak J Pharm Sci. 2009. Vol. 22. suppl. 1. P. 78-82.
- Pettersen E.F. Goddard, T.D. Huang C.C. et al. UCSF Chimera. A Visualization System for Exploratory Research and Analysis. J. Comput. Chem. 2004. Vol. 25 suppl. 13. P. 16051612.
- Hooft R.W.W., Vriend G., Sander C. et al. Errors in protein structures. Nature. 996. Vol. 381. P. 272-272.
- Shin J.M., Cho D.H., PDB-Ligand: a ligand database based on PDB for the automated and customized classification of ligand-binding structures. Nucleic Acids Res. 2005. Vol. 33. P. D238-41.
- Todd P., Margolis Y.I., Yang L. et al. Herpes Simplex Virus Type 2 (HSV-2) Establishes Latent Infection in a Different Population of Ganglionic Neurons than HSV-1: Role of Latency-Associated Transcripts//J Virol. 2007. Vol. 81. Suppl. 4. P. 18721878.